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"headers": [
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["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
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"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
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"branch attributes":{
"0":{
"Node101":{
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"Node1037":{
"Global MG94xREV":0.001106624150111892,
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"amino-acid": [
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"Node1062":{
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"Nucleotide GTR":0.001089823769147383,
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"Node1085":{
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"Node1104":{
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"Node1142":{
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"Node151":{
"Global MG94xREV":0.001106647158637786,
"Nucleotide GTR":0.001090098119622272,
"amino-acid": [
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"Node233":{
"Global MG94xREV":0.001106252596900286,
"Nucleotide GTR":0.001089709458245637,
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"Node279":{
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"Node332":{
"Global MG94xREV":0.001107344001171917,
"Nucleotide GTR":0.001090784541423657,
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"Node361":{
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"Node391":{
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"Nucleotide GTR":0.001089821318139263,
"amino-acid": [
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"Node447":{
"Global MG94xREV":0.001106369320004282,
"Nucleotide GTR":0.001089824435847298,
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"Node481":{
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"Nucleotide GTR":0.001090539549239819,
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"Node487":{
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"Node498":{
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"Node506":{
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"Node512":{
"Global MG94xREV":0.001106527548342918,
"Nucleotide GTR":0.001089980298005413,
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"Node523":{
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"Node529":{
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"Node539":{
"Global MG94xREV":0.001106640386734935,
"Nucleotide GTR":0.001090091448987908,
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"Node547":{
"Global MG94xREV":0.001106687362378007,
"Nucleotide GTR":0.001090137722147138,
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"Node555":{
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"Node566":{
"Global MG94xREV":0.001107339189064572,
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"Node606":{
"Global MG94xREV":0.001106654112282405,
"Nucleotide GTR":0.001090104969280598,
"amino-acid": [
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"Node612":{
"Global MG94xREV":0.001106599372260866,
"Nucleotide GTR":0.001090051047853084,
"amino-acid": [
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"Node618":{
"Global MG94xREV":0.001106360963959811,
"Nucleotide GTR":0.001089816204760907,
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"Node624":{
"Global MG94xREV":0.001106554733956502,
"Nucleotide GTR":0.001090007077079499,
"amino-acid": [
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"Node635":{
"Global MG94xREV":0.001106768469727537,
"Nucleotide GTR":0.001090217616599963,
"amino-acid": [
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"Node644":{
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"Node659":{
"Global MG94xREV":0.001106832297319857,
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"Node670":{
"Global MG94xREV":0.001106383255165493,
"Nucleotide GTR":0.001089838162619118,
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"Node676":{
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"Node690":{
"Global MG94xREV":0.001106309568966977,
"Nucleotide GTR":0.001089765578339823,
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"Node696":{
"Global MG94xREV":0.001105897411901625,
"Nucleotide GTR":0.001089359584759644,
"amino-acid": [
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"Node702":{
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"Node719":{
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"Node722":{
"Global MG94xREV":0.001106550672365009,
"Nucleotide GTR":0.001090003076225917,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
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"Node739":{
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"Node743":{
"Global MG94xREV":0.001106297150643771,
"Nucleotide GTR":0.001089753345722885,
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"Node755":{
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"Node761":{
"Global MG94xREV":0.001106571707786516,
"Nucleotide GTR":0.001090023797079217,
"amino-acid": [
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"Node77":{
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"Node782":{
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"Node797":{
"Global MG94xREV":0.001106125331214418,
"Nucleotide GTR":0.001089584095718138,
"amino-acid": [
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"Node807":{
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"Node824":{
"Global MG94xREV":0.001106847033490568,
"Nucleotide GTR":0.001090295005503626,
"amino-acid": [
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"Node83":{
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"Node836":{
"Global MG94xREV":0.001106626796964857,
"Nucleotide GTR":0.001090078062442169,
"amino-acid": [
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"Node845":{
"Global MG94xREV":0.00110678507236706,
"Nucleotide GTR":0.001090233970960052,
"amino-acid": [
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"Node855":{
"Global MG94xREV":0.001106739587795458,
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"Node869":{
"Global MG94xREV":0.001106519664863364,
"Nucleotide GTR":0.001089972532417105,
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"Node876":{
"Global MG94xREV":0.001105932963607191,
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"Node883":{
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"Node952":{
"Global MG94xREV":0.001106127132687367,
"Nucleotide GTR":0.001089585870251475,
"amino-acid": [
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"Node976":{
"Global MG94xREV":0.001106106005268894,
"Nucleotide GTR":0.001089565058776949,
"amino-acid": [
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"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":{
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"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":{
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"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106709316659601,
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"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106518120056354,
"Nucleotide GTR":0.00108997101071147,
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"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":{
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"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106269818759431,
"Nucleotide GTR":0.001089726422565407,
"amino-acid": [
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"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106410971892598,
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"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":{
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"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":{
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"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":{
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"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":{
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"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001106411684024436,
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"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2":{
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"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2":{
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"epi_isl_432938_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001106336101128877,
"Nucleotide GTR":0.001089791713734081,
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"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
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"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1":{
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"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1":{
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"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6":{
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"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":{
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"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2":{
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"epi_isl_438598_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001106124427816551,
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"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4":{
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"epi_isl_440058_England_20200330_null_1":{
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"epi_isl_440327_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
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"epi_isl_440996_England_20200402_null_2":{
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"epi_isl_441703_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105673811686888,
"Nucleotide GTR":0.001089139328310487,
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"epi_isl_442236_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106567317332247,
"Nucleotide GTR":0.001090019472280745,
"amino-acid": [
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"epi_isl_442833_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106792588338218,
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},
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001106241518093599,
"Nucleotide GTR":0.001089698545113805,
"amino-acid": [
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"epi_isl_443044_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106212683284518,
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"epi_isl_443341_England_20200413_null_2":{
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"epi_isl_444143_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106270026727198,
"Nucleotide GTR":0.001089726627423179,
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"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107198829574064,
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"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3":{
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"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":{
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"Nucleotide GTR":0.001089726641907625,
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"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
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"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":{
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"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002212973122638532,
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"epi_isl_449330_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106359883699307,
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"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1":{
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"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107387537223687,
"Nucleotide GTR":0.001090827426427968,
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"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2":{
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"epi_isl_453454_England_20200501_null_1":{
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"epi_isl_453622_England_20200507_null_1":{
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"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1":{
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"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1":{
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"Nucleotide GTR":0.001092567519532206,
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"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1":{
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"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106442784981466,
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"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1":{
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"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001106442970677802,
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"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4":{
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"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4":{
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"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1":{
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"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1":{
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"epi_isl_457132_England_20200326_null_1":{
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"epi_isl_457289_England_20200417_null_2":{
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"epi_isl_457652_England_20200424_null_1":{
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"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1":{
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"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002213657246978873,
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"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1":{
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"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9":{
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"Nucleotide GTR":0.001089726641907625,
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"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1":{
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"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1":{
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"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2":{
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"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
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"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106874600328115,
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"epi_isl_465178_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106466450880176,
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"epi_isl_465264_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107347708458978,
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"epi_isl_465845_England_20200327_null_1":{
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"epi_isl_466186_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001106241518093599,
"Nucleotide GTR":0.001089698545113805,
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"epi_isl_466222_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107513702792944,
"Nucleotide GTR":0.001090951705290235,
"amino-acid": [
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"epi_isl_466361_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001107716636347643,
"Nucleotide GTR":0.001091151604133024,
"amino-acid": [
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"epi_isl_466613_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106674589338342,
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"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106124021199733,
"Nucleotide GTR":0.001089582805293695,
"amino-acid": [
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"epi_isl_467897_New_York_20200316_null_1":{
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"epi_isl_468160_Rawalpindi_20200602_null_1":{
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"epi_isl_468346_California_20200426_null_7":{
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"epi_isl_469128_Singapore_20200417_null_1":{
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"epi_isl_469294_Kanto_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106435445904107,
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"epi_isl_470120_England_20200421_null_1":{
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"epi_isl_470588_Minas_Gerais_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106687146108682,
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"epi_isl_471418_Vrancea_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003321562254069954,
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"epi_isl_471808_Michigan_20200422_null_2":{
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"epi_isl_472003_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106688670651401,
"Nucleotide GTR":0.00109013901085633,
"amino-acid": [
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"epi_isl_472438_Wales_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106241530041722,
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"epi_isl_472639_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_473698_Scotland_20200516_null_1":{
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"Nucleotide GTR":0.001091105704748566,
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"epi_isl_473776_Scotland_20200510_null_1":{
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"epi_isl_473991_Wales_20200425_null_1":{
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"epi_isl_474616_Wales_20200429_null_8":{
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"epi_isl_474810_Castilla_La_Mancha_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001110455181820387,
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"epi_isl_475128_Orebro_20200312_null_1":{
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"epi_isl_475278_England_20200427_null_3":{
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"epi_isl_475589_California_20200322_null_1":{
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"epi_isl_475592_California_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106442913958096,
"Nucleotide GTR":0.001089896929261338,
"amino-acid": [
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"epi_isl_475634_California_20200325_null_3":{
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"epi_isl_475739_Utah_20200512_null_2":{
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"epi_isl_475743_Utah_20200512_null_1":{
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"epi_isl_476126_Zurich_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001106718669570821,
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"epi_isl_476531_Connecticut_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001109283984406681,
"Nucleotide GTR":0.001092695513732949,
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"epi_isl_476838_Thessaloniki_20200330_null_3":{
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"epi_isl_477791_England_20200518_null_3":{
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"epi_isl_477840_Scotland_20200408_null_1":{
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"epi_isl_478278_England_20200418_null_1":{
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"epi_isl_478995_England_20200423_null_2":{
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"epi_isl_479554_Maharashtra_20200615_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106443252477734,
"Nucleotide GTR":0.00108989726271868,
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"epi_isl_479806_Kanto_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106241143477448,
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"epi_isl_480231_Istanbul_20200413_null_1":{
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"epi_isl_480590_Victoria_20200415_null_1":{
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"epi_isl_480604_Victoria_20200508_null_1":{
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"epi_isl_480822_Florida_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001106683331034533,
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"epi_isl_481046_Madrid_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106017574809353,
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"epi_isl_481110_Odisha_20200519_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106017574809353,
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"epi_isl_482129_England_20200423_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001106442813068107,
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"epi_isl_482471_New_Brunswick_20200317_null_34":{
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"epi_isl_482980_Minnesota_20200609_null_1":{
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"epi_isl_483233_California_20200513_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_483548_Bahrain_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106717988033566,
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"epi_isl_483691_Sylhet_20200614_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106376690405613,
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"epi_isl_484047_England_20200326_null_9":{
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"epi_isl_484220_England_20200625_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001107177245204585,
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"epi_isl_484397_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106645374050309,
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"epi_isl_484779_Michigan_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106064320256266,
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"epi_isl_484817_Wisconsin_20200614_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106443291330796,
"Nucleotide GTR":0.001089897300990725,
"amino-acid": [
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"epi_isl_485224_Louisiana_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001107599565111965,
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"epi_isl_485326_Louisiana_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106017574809353,
"Nucleotide GTR":0.001089477950725471,
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"epi_isl_485880_Louisiana_20200423_null_2":{
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"epi_isl_486023_Washington_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00110673131230225,
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"epi_isl_486430_Latvia_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106674313427543,
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"epi_isl_486839_Karnataka_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106354506768588,
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"epi_isl_487274_Bahrain_20200624_null_1":{
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"epi_isl_487427_North_Rhine_Westphalia_20200525_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
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"epi_isl_487759_Scotland_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106683092253983,
"Nucleotide GTR":0.001090133515879464,
"amino-acid": [
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"epi_isl_488373_England_20200413_null_11":{
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"epi_isl_488432_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001107155905862362,
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"epi_isl_488528_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001107701200067821,
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"epi_isl_488758_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106017574809353,
"Nucleotide GTR":0.001089477950725471,
"amino-acid": [
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"epi_isl_489136_England_20200512_null_1":{
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"epi_isl_489140_England_20200520_null_14":{
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"epi_isl_489402_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106075710327141,
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"epi_isl_489616_Scotland_20200328_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001106614498683209,
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"epi_isl_489668_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107490458816926,
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"epi_isl_490477_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106376690405613,
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"epi_isl_490647_Scotland_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106157141657985,
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"amino-acid": [
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"epi_isl_490860_Wales_20200514_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_491061_Suceava_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106955169484725,
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"amino-acid": [
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"epi_isl_491650_Scotland_20200408_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GTA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_492011_Muscat_20200531_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001107492770273586,
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"epi_isl_492074_South_Carolina_20200619_null_1":{
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"epi_isl_492081_North_Macedonia_20200627_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002231885463233289,
"Nucleotide GTR":0.002198509369217313,
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"epi_isl_492383_England_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0011061244429804,
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"epi_isl_492613_England_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001106075725417279,
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"epi_isl_493060_Utah_20200522_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001106579996785289,
"Nucleotide GTR":0.001090031962122526,
"amino-acid": [
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"codon": [
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"epi_isl_493385_Norway_20200630_null_1":{
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"epi_isl_493570_England_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106336616669787,
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"epi_isl_493585_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106075710327141,
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"epi_isl_493715_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107154041294468,
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"epi_isl_494245_Wales_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106270041431535,
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"epi_isl_494426_California_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106075710327141,
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"amino-acid": [
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"epi_isl_494434_California_20200424_null_4":{
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"epi_isl_494478_California_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106241216980306,
"Nucleotide GTR":0.001089698248503422,
"amino-acid": [
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"epi_isl_495029_Gujarat_20200615_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_495204_Telangana_20200609_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001107467973795891,
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"epi_isl_495372_Florida_20200325_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001106075469772758,
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"epi_isl_495574_Michigan_20200418_null_2":{
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"epi_isl_495640_Kinshasa_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107333379432953,
"Nucleotide GTR":0.001090774078524457,
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"epi_isl_495755_Washington_20200514_null_5":{
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"epi_isl_495949_Washington_20200523_null_1":{
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"epi_isl_496270_Washington_20200528_null_5":{
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"epi_isl_496307_Washington_20200528_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106979375297219,
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"epi_isl_496571_Maharashtra_20200521_null_3":{
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"epi_isl_497100_Washington_20200615_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106442913958096,
"Nucleotide GTR":0.001089896929261338,
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"epi_isl_497503_Washington_20200605_null_4":{
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"epi_isl_497568_Washington_20200608_null_3":{
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"epi_isl_497640_Washington_20200608_null_13":{
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"epi_isl_497714_Washington_20200610_null_42":{
"Global MG94xREV":0.001106706544392326,
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"epi_isl_498588_Singapore_20200706_null_1":{
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"epi_isl_498730_Mississippi_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107000892762614,
"Nucleotide GTR":0.001090446563931111,
"amino-acid": [
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"epi_isl_499391_Wales_20200603_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001106718306345655,
"Nucleotide GTR":0.001090168203372054,
"amino-acid": [
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"epi_isl_499796_England_20200505_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001106323713053879,
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"epi_isl_500018_England_20200518_null_14":{
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"epi_isl_500057_England_20200310_null_4":{
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"original name":"epi_isl_500057_England_20200310_null_4",
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"epi_isl_500300_Basque_Country_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001106683390259442,
"Nucleotide GTR":0.001090133809428485,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
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"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAT", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_500781_Norway_20200702_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_500852_Virginia_20200418_null_6":{
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"epi_isl_501025_Northern_Ireland_20200523_null_14":{
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"epi_isl_501115_Washington_20200629_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001106718380454596,
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"epi_isl_501915_Latvia_20200616_null_21":{
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"epi_isl_506978_South_Korea_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106676788473575,
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"epi_isl_507014_Saudi_Arabia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106241530041722,
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"epi_isl_507138_England_20200323_null_25":{
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"epi_isl_507846_Michigan_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110928400474213,
"Nucleotide GTR":0.001092695533764297,
"amino-acid": [
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"epi_isl_507927_Michigan_20200330_null_2":{
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"epi_isl_507996_New_Mexico_20200523_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106137547796231,
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"epi_isl_508050_New_Mexico_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106124427816551,
"Nucleotide GTR":0.001089583205829877,
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"epi_isl_508181_Uttarakhand_20200602_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105772299580914,
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"epi_isl_508213_Maharashtra_20200617_null_1":{
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"epi_isl_508280_Maharashtra_20200618_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001107329551925023,
"Nucleotide GTR":0.0010907703082539,
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"epi_isl_508330_Karnataka_20200603_null_6":{
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"epi_isl_508331_Karnataka_20200620_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001115125110196922,
"Nucleotide GTR":0.001098449290075046,
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"codon": [
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"epi_isl_508440_Maharashtra_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105557749235043,
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"epi_isl_508488_West_Bengal_20200610_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106292044913941,
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"epi_isl_508625_Catalunya_20200326_null_1":{
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"epi_isl_508714_Florida_20200610_null_1":{
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"epi_isl_508925_ARA_20200410_null_13":{
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"epi_isl_508958_ARA_20200330_null_1":{
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"epi_isl_509083_Oregon_20200411_null_27":{
"Global MG94xREV":0.001106664882485334,
"Nucleotide GTR":0.001090115578423601,
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"epi_isl_509190_Oregon_20200716_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001106683391789243,
"Nucleotide GTR":0.001090133810935409,
"amino-acid": [
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"epi_isl_509212_Oregon_20200717_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106599603599705,
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"epi_isl_509499_New_South_Wales_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00110701950929139,
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"epi_isl_509513_New_South_Wales_20200321_null_3":{
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"epi_isl_509616_Basque_Country_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106459981509233,
"Nucleotide GTR":0.001089913741580655,
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"codon": [
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"epi_isl_509635_Basque_Country_20200617_null_10":{
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"epi_isl_509856_Wisconsin_20200708_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106357104788961,
"Nucleotide GTR":0.001089812403300928,
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"epi_isl_510048_Andalusia_20200414_null_54":{
"Global MG94xREV":0.001106124427816551,
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"epi_isl_510058_Andalusia_20200603_null_2":{
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"epi_isl_510061_Andalusia_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107266159655134,
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"epi_isl_510126_Madrid_20200504_null_1":{
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"epi_isl_510133_Madrid_20200504_null_3":{
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"epi_isl_510183_Madrid_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106676119009309,
"Nucleotide GTR":0.001090126646914187,
"amino-acid": [
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"epi_isl_510386_Aragon_20200427_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_510460_Andalusia_20200716_null_3":{
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"epi_isl_510761_Aargau_20200720_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_510849_Vastra_Gotaland_20200527_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_510863_Stockholm_20200605_null_19":{
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"epi_isl_511126_Portugal_20200327_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001107062997343236,
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"epi_isl_511344_Portugal_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001109445176425236,
"Nucleotide GTR":0.001092854295251479,
"amino-acid": [
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"epi_isl_511581_Portugal_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106683291356878,
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"epi_isl_511654_Portugal_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106580372296069,
"Nucleotide GTR":0.001090032332017836,
"amino-acid": [
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"epi_isl_511849_California_20200611_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001106136971569535,
"Nucleotide GTR":0.001089595562000888,
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"epi_isl_511939_Maharashtra_20200618_null_58":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_512021_Basel_Landschaft_20200730_null_1":{
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"epi_isl_512059_Gujarat_20200618_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011075641380122,
"Nucleotide GTR":0.001091001386290405,
"amino-acid": [
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"epi_isl_512074_Gujarat_20200706_null_9":{
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"epi_isl_512147_Alaska_20200622_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
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"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "TCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_512153_Alaska_20200623_null_1":{
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"epi_isl_512184_California_20200505_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001106852022994767,
"Nucleotide GTR":0.00109029992039371,
"amino-acid": [
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"epi_isl_512206_California_20200518_null_2":{
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"epi_isl_512224_California_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001106718066058899,
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"epi_isl_512369_England_20200516_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_512378_England_20200513_null_100":{
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"epi_isl_512446_Scotland_20200406_null_700":{
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"epi_isl_512459_Scotland_20200612_null_6":{
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"epi_isl_512486_Wales_20200715_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
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],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_512602_Ukraine_20200526_null_1":{
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"epi_isl_512735_Western_Australia_20200713_null_12":{
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"epi_isl_512756_Western_Australia_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106411296685341,
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"epi_isl_512821_Sierra_Leone_20200427_null_29":{
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"epi_isl_512840_Singapore_20200727_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001106718666077055,
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"epi_isl_512904_Jeddah_20200623_null_1":{
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"epi_isl_513061_Jeddah_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001106674313427543,
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"epi_isl_513120_Madinah_20200611_null_1":{
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"epi_isl_513253_Makkah_20200424_null_8":{
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"epi_isl_513596_Kinshasa_20200514_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
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"epi_isl_513627_Kinshasa_20200522_null_8":{
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"epi_isl_513628_Kinshasa_20200523_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001106852410483017,
"Nucleotide GTR":0.001090300302087377,
"amino-acid": [
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"codon": [
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"epi_isl_513772_California_20200531_null_10":{
"Global MG94xREV":0.00110640616687058,
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"epi_isl_513831_California_20200521_null_18":{
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"epi_isl_513883_California_20200528_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106136504569902,
"Nucleotide GTR":0.001089595101984868,
"amino-acid": [
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"codon": [
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"epi_isl_513925_Pakistan_20200515_null_22":{
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"epi_isl_514109_Kinshasa_20200509_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_514125_Kinshasa_20200515_null_4":{
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"epi_isl_514230_Khulna_20200715_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001106442030124329,
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"epi_isl_514291_Jerusalem_District_20200720_null_1":{
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"epi_isl_514304_Tel_Aviv_District_20200722_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
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"epi_isl_514359_GP_20200720_null_31":{
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"epi_isl_514514_Scotland_20200803_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106269772879158,
"Nucleotide GTR":0.001089726377371239,
"amino-acid": [
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"codon": [
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"epi_isl_514583_Gujarat_20200618_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001107567703524001,
"Nucleotide GTR":0.001091004898482777,
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"epi_isl_514637_Minnesota_20200316_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_514667_Minnesota_20200326_null_14":{
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GTT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_514951_South_Korea_20200621_null_4":{
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"epi_isl_514992_South_Korea_20200629_null_46":{
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"epi_isl_515178_NW_20200708_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001107861758568679,
"Nucleotide GTR":0.001091294556165234,
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"epi_isl_515286_Washington_20200326_null_1":{
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"epi_isl_515306_Nevada_20200315_null_137":{
"Global MG94xREV":0,
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_515397_Nevada_20200429_null_54":{
"Global MG94xREV":0.001106683093783785,
"Nucleotide GTR":0.001090133517386387,
"amino-acid": [
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"codon": [
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"epi_isl_515406_Nevada_20200430_null_35":{
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCT", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_515445_Nevada_20200520_null_28":{
"Global MG94xREV":0.001106157129960144,
"Nucleotide GTR":0.001089615418938599,
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"epi_isl_515457_Nevada_20200527_null_68":{
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"epi_isl_515633_KZN_20200721_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001106683500904505,
"Nucleotide GTR":0.001090133918418938,
"amino-acid": [
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"codon": [
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"epi_isl_515811_KZN_20200718_null_19":{
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"epi_isl_515824_KZN_20200710_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001109383692507415,
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"epi_isl_515857_KZN_20200715_null_2":{
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"epi_isl_516198_Michigan_20200721_null_202":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_516333_Michigan_20200328_null_3":{
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"epi_isl_516404_Michigan_20200707_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001107436589246519,
"Nucleotide GTR":0.001090875744916329,
"amino-acid": [
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"epi_isl_516437_Wisconsin_20200717_null_14":{
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"epi_isl_516519_Wisconsin_20200730_null_49":{
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"epi_isl_516527_Wisconsin_20200726_null_334":{
"Global MG94xREV":0,
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"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_516553_Zurich_20200731_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001107538617673689,
"Nucleotide GTR":0.001090976247588512,
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"codon": [
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"epi_isl_516600_Geneva_20200805_null_8":{
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"epi_isl_516616_Chihuahua_20200630_null_43":{
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"epi_isl_516668_Virginia_20200430_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001106852009091149,
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"epi_isl_516677_Virginia_20200513_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_516684_Virginia_20200513_null_162":{
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"epi_isl_516686_Ancash_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001106316778331055,
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"amino-acid": [
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"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"epi_isl_516766_South_Carolina_20200708_null_151":{
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"epi_isl_516774_South_Carolina_20200707_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001106270041431535,
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"codon": [
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"epi_isl_516778_South_Carolina_20200721_null_415":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_516806_Special_Region_of_Yogyakarta_20200516_null_4":{
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"epi_isl_516811_Singapore_20200811_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106123433606493,
"Nucleotide GTR":0.00108958222648745,
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"epi_isl_516842_England_20200310_null_218":{
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"epi_isl_516895_Tel_Aviv_20200604_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_516902_Haifa_District_20200629_null_1":{
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"epi_isl_516904_Northern_District_20200629_null_44":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
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"epi_isl_516906_Northern_District_20200628_null_1":{
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"epi_isl_516912_Haifa_District_20200705_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
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"epi_isl_516919_Northern_District_20200625_null_8":{
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"epi_isl_516929_Montenegro_20200718_null_272":{
"Global MG94xREV":0.001106530688912862,
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"codon": [
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"epi_isl_516956_Uttar_Pradesh_20200515_null_15":{
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"epi_isl_516985_Uttar_Pradesh_20200525_null_70642":{
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"epi_isl_516987_Ancash_20200316_null_1839":{
"Global MG94xREV":0,
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["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
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"input":{
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