{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162250502094417],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162878788909532],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878782990243],
[228.8042866578186, 617.2210313971323, 0, 2, 0.2704461459662338, 0, 0.003240330284068302, 0.004777135960704524, 0.5322488259355219, 1, 0.002328503947286449],
[229.1072461114427, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001162802389480542],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250504424656],
[227.463592184066, 612.4822043632513, 0, 1, 0.2708074653377375, 0, 0.001632700497869354, 0.002407048534459663, 0.7291925346622625, 1, 0.00116357509325093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163524932714491],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 0, 1, 0.2712096470004069, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194026, 0.7287903529995932, 1, 0.001163705374927972],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162226005470314],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.001162250500989759],
[229.522699958073, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2713930893654866, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7286069106345134, 1, 0.00116309188963648],
[229.4846168193512, 616.5407012355997, 0, 1, 0.2712502946684224, 0, 0.001621952935136181, 0.002391203677941485, 0.7287497053315777, 1, 0.001162011029137531],
[229.2894322089835, 616.7995821329553, 0, 1, 0.2709991836820119, 0, 0.001621272174896583, 0.002390200050552886, 0.7290008163179881, 1, 0.001162226005470314],
[229.3023247189013, 616.8295802162204, 1, 0, 0.2710006836776629, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710006836776629, 0.001162708431981483],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163024514237454],
[229.5480488451535, 616.3771420754913, 1, 0, 0.2713573863373542, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713573863373542, 0.001162275074734408],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162226005470314],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162912494443817],
[228.8931735736104, 617.0955135668897, 0, 1, 0.2705629248392021, 0, 0.001620494685206629, 0.002389053817412635, 0.7294370751607979, 1, 0.001165171661495114],
[228.9906122368979, 616.9564193434156, 0, 1, 0.2706914306550856, 0, 0.001620860029407314, 0.002389592435012115, 0.7293085693449144, 1, 0.001162275070624034],
[229.0035047468157, 616.9018712733111, 1, 0, 0.270720001596688, 0.004366745395908205, 0, -0.006437780915297054, 1, 0.270720001596688, 0.001162855187628393],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162940518195471],
[230.3215199301586, 615.6255116501549, 0, 1, 0.2722647061009187, 0, 0.001624364132213345, 0.002394758444047366, 0.7277352938990813, 1, 0.001163024556122287],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163162713231741],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001162912502445591],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.2716450360548079, 0.004351446728635407, 0, -0.006415226481898994, 1, 0.2716450360548079, 0.001162299598481902],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162221161907544],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250492990255],
[230.082098505246, 616.2803869216979, 0, 1, 0.2718481767173105, 0, 0.001622638041419702, 0.002392213712591349, 0.7281518232826895, 1, 0.001165494308531582],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.00116294052056464],
[229.4060660835283, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2711232902878403, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7288767097121598, 1, 0.001162684845989538],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162250497474379],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.00116309550783279],
[229.522699958073, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2713930893654866, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7286069106345134, 1, 0.001163522868077797],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162912496031231],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116306391909228],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162299601579473],
[229.3931735736104, 616.5320173470343, 0, 1, 0.2711743024509712, 0, 0.001621975780435615, 0.002391237358181427, 0.7288256975490288, 1, 0.00116222602215137],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162708450371441],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163614884833542],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163947850830472],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878783922663],
[229.4757577880627, 616.3929873176133, 0, 1, 0.2712900306529163, 0, 0.001622341623891192, 0.002391776711819611, 0.7287099693470837, 1, 0.00116517171565962],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902381585205],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162226005470314],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162878783922663],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171720575741],
[229.3023247189013, 616.6447068614121, 1, 0, 0.2710599081960743, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162011019141942],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250482527559],
[229.3931735736104, 616.5955135668897, 0, 1, 0.2711539492909475, 0, 0.001621808751437692, 0.002390991111607003, 0.7288460507090525, 1, 0.001162804318798384],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.2716450360548079, 0.004351446728635407, 0, -0.006415226481898994, 1, 0.2716450360548079, 0.001162055487038551],
[229.4271160170424, 616.5199155632711, 0, 1, 0.2712074248767676, 0, 0.001622007618499023, 0.002391284296223014, 0.7287925751232325, 1, 0.001162684802455385],
[229.4846168193512, 616.4624147609622, 0, 1, 0.2712753969839589, 0, 0.001622158911971555, 0.002391507344315304, 0.728724603016041, 1, 0.001162708405955713],
[229.4060660835283, 616.298555290484, 1, 0, 0.271260272541509, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.271260272541509, 0.001165171721685136],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001162902385915667],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162250501121763],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.001163514623049198],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.00116309914124935],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001162855164909738],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162708441155084],
[228.9906122368979, 616.9564193434156, 1, 0, 0.2706914306550856, 0.004366991250128058, 0, -0.006438143371877646, 1, 0.2706914306550856, 0.001163024551410683],
[229.6263995138441, 616.3206320664694, 0, 1, 0.2714429993150742, 0, 0.001622532084715527, 0.002392057503335682, 0.7285570006849258, 1, 0.001162034624879122],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250501121763],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163095557351927],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163522865427762],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001163162713231741],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001162878783922663],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171725613365],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162925970966648],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001162682700044675],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162888901205028],
[229.3023247189013, 616.7229933360497, 1, 0, 0.2710348258206708, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710348258206708, 0.001162708390267054],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162855164909738],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.00116270843542647],
[229.4060660835283, 616.2037981247922, 0, 1, 0.2712906693659535, 0, 0.001622839721279164, 0.002392511044043616, 0.7287093306340465, 1, 0.00116302448424702],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162275119197415],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116291249469699],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001163242602878548],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.001162940542803645],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162225979702757],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708444906376],
[229.1795371685334, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709281010209356, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290718989790644, 1, 0.001163091863473339],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116227510871249],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162684802455385],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250514190548],
[229.8215199301586, 616.1255116501549, 1, 0, 0.271673652546341, 0.004351202621512093, 0, -0.006414866601018091, 1, 0.271673652546341, 0.001163947495114931],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163613666396754],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162925979697191],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162221189201936],
[228.9060660835283, 617.0409654967852, 0, 1, 0.2705914880461356, 0, 0.001620637941266818, 0.002389265016153727, 0.7294085119538645, 1, 0.00116291249469699],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001162593712541313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162833910802337],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001161527324851597],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162262087690986],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162855154874237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001164004054773627],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163097770953393],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250501121763],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116270843542647],
[229.4401157436208, 616.5852023113302, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211685, 0.002391031096543877, 0.7288023055017863, 1, 0.001163091875225224],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162275086140076],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162684784065429],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163091899710135],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162011031775572],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.00116222602398731],
[229.9695623033838, 616.4563121267552, 0, 1, 0.2716948633667562, 0, 0.001622174970599346, 0.002391531019139032, 0.7283051366332438, 1, 0.001162250510016],
[229.4060660835283, 616.7833757030864, 0, 1, 0.2711048551955084, 0, 0.001621314774997098, 0.002390262854790188, 0.7288951448044916, 1, 0.001163515035577979],
[229.2492288730679, 616.6978027072456, 0, 1, 0.2709971432192479, 0, 0.001621539748658247, 0.002390594527697783, 0.7290028567807521, 1, 0.001163099993065851],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250495626295],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001162925988528522],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163063911114065],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116285514656358],
[229.5098074481552, 616.4372241321583, 1, 0, 0.2713051750053522, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053522, 0.001162912502495273],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162968559760214],
[229.4401157436208, 616.5852023113302, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211685, 0.002391031096543877, 0.7288023055017863, 1, 0.001163091895150804],
[228.9060660835283, 617.0409654967852, 0, 1, 0.2705914880461356, 0, 0.001620637941266818, 0.002389265016153727, 0.7294085119538645, 1, 0.001162912484128694],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 1, 0, 0.2712096470004069, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2712096470004068, 0.001163947844253564],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163614884894196],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162708380408153],
[229.3720164234358, 616.4967286822402, 0, 1, 0.271167385898364, 0, 0.001622068623360738, 0.002391374234128452, 0.7288326141016359, 1, 0.001162827636583558],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162020644141602],
[227.1408596387799, 612.9311386220936, 0, 1, 0.2703826101917567, 0, 0.001631504645445263, 0.002405285519853742, 0.7296173898082432, 1, 0.001163579806287508],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163456413536256],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.001162479013140761],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162888657983797],
[227.6068099786874, 612.095285258672, 0, 1, 0.2710566179001251, 0, 0.001633732564330077, 0.002408570083613957, 0.7289433820998749, 1, 0.001162039938918584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.3768417651215, 0, 1, 0.2712351644313197, 0, 0.001622384119974876, 0.002391839362707562, 0.7287648355686802, 1, 0.001162093559198631],
[229.4060660835283, 616.2037981247922, 0, 1, 0.2712906693659535, 0, 0.001622839721279164, 0.002392511044043616, 0.7287093306340465, 1, 0.001162517678952679],
[229.6072461114426, 616.113256553876, 0, 1, 0.2714930587443808, 0, 0.001623078207395388, 0.002392862638017707, 0.7285069412556192, 1, 0.001163455031545899],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001163857146355408],
[227.322844455437, 612.7074982452498, 0, 1, 0.2706126587339654, 0, 0.001632100150339155, 0.002406163457469354, 0.7293873412660346, 1, 0.001164127526809835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163415538931096],
[227.4838734028031, 612.5464692978837, 1, 0, 0.2708043529373539, 0.004395916005128466, 0, -0.006480786397481052, 1, 0.2708043529373538, 0.001162279586499284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3023247189013, 616.6447068614121, 1, 0, 0.2710599081960743, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162829074493766],
[227.8122889601682, 612.2180537405187, 0, 1, 0.2711953097167354, 0, 0.001633404950883461, 0.002408087091499006, 0.7288046902832646, 1, 0.001163476859694412],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5518176017414, 612.5201806591322, 0, 1, 0.2708718039320698, 0, 0.00163259927031939, 0.002406899297274946, 0.7291281960679302, 1, 0.001164365193024379],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001163031421124162],
[227.4964788054822, 612.6171750155779, 1, 0, 0.2707925026224342, 0.004395672430846882, 0, -0.006480427302155067, 1, 0.2707925026224343, 0.001163371792259459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163880428825642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163142965169624],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.0469752987593, 612.0250229621142, 0, 1, 0.2714612268601557, 0, 0.001633920121697217, 0.002408846594637437, 0.7285387731398443, 1, 0.001162644245985743],
[229.6325949985231, 616.3144365817903, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162079852402802],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116413941087543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163611011923054],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[226.9962775245984, 612.6226629062854, 0, 1, 0.2703563087894447, 0, 0.001632326161843237, 0.002406496660442208, 0.7296436912105553, 1, 0.001163463285608498],
[229.1072461114427, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001163610512569372],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163750536112662],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163605504755672],
[227.4248251620304, 612.6471730988432, 0, 1, 0.270720635413212, 0, 0.00163226085732491, 0.00240640038366313, 0.729279364586788, 1, 0.00116382378015248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162849700351594],
[227.8778829920201, 612.1941152688535, 0, 1, 0.2712599437474115, 0, 0.001633468821504167, 0.00240818125431954, 0.7287400562525885, 1, 0.001162906136609],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162155689206982],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164065673747403],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163555431322983],
[226.6743241406008, 613.8507319502625, 0, 1, 0.2696818167382468, 0, 0.001629060532066003, 0.002401682226086589, 0.7303181832617531, 1, 0.001163452391133335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.9462694194438, 617.2272910758645, 0, 1, 0.270566559992054, 0, 0.00162014871095045, 0.002388543756426322, 0.729433440007946, 1, 0.001165494667382368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164046845027386],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163308177180901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164137981327308],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163144025395477],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.1150746189443, 613.0402347623026, 0, 1, 0.2703251078496531, 0, 0.001631214304209144, 0.002404857477204276, 0.7296748921503469, 1, 0.00116334517308493],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.001163255481788914],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163917161533048],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163301826084635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.7510189404155, 612.320979320458, 0, 1, 0.2711089280584381, 0, 0.001633130390387376, 0.002407682313990466, 0.728891071941562, 1, 0.001162562989097011],
[229.4846168193512, 616.4624147609622, 0, 1, 0.271275396983959, 0, 0.001622158911971555, 0.002391507344315304, 0.728724603016041, 1, 0.001162114509166241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.0469752987593, 612.1083340824875, 0, 1, 0.2714343083384311, 0, 0.001633697736690578, 0.002408518738116896, 0.7285656916615689, 1, 0.00116317231396862],
[229.6325949985231, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714369571237377, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285630428762624, 1, 0.001168351192492145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8778829920201, 612.1941152688535, 0, 1, 0.2712599437474115, 0, 0.001633468821504167, 0.00240818125431954, 0.7287400562525885, 1, 0.001162670638140968],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162256349970472],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.001163214101060436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.354496043857, 612.7591577772032, 1, 0, 0.2706234983919001, 0.004398417525937551, 0, -0.006484474325551931, 1, 0.2706234983919, 0.001163450702063372],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163556375000131],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162883675955283],
[228.8426770803333, 617.1876656203535, 0, 1, 0.2704899168862251, 0, 0.001620252729767162, 0.002388697108704127, 0.7295100831137749, 1, 0.001163477985425033],
[229.2512980286457, 617.1944985186715, 0, 1, 0.270839903705317, 0, 0.001620234792111887, 0.002388670663678296, 0.729160096294683, 1, 0.00116288231290776],
[228.9061733001888, 617.124169400498, 0, 1, 0.2705649688278053, 0, 0.001620419438395104, 0.002388942882965294, 0.7294350311721947, 1, 0.001163506499599876],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162967676261163],
[228.5840604441633, 617.4462822565235, 0, 1, 0.2701842344264868, 0, 0.001619574088850925, 0.002387696605779688, 0.7298157655735132, 1, 0.00116359010027995],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 0, 1, 0.2705898496535296, 0, 0.001620474712336148, 0.002389024371921141, 0.7294101503464705, 1, 0.001163989853317],
[228.7852404720777, 617.2451022286091, 1, 0, 0.2704220273492231, 0.004370911331240557, 0, -0.006443922647077915, 1, 0.270422027349223, 0.00116395366087686],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 0, 1, 0.2705898496535296, 0, 0.001620474712336148, 0.002389024371921141, 0.7294101503464705, 1, 0.001163407975941838],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.0692059953282, 616.9611367053586, 1, 0, 0.2707576719578361, 0.004365492933259632, 0, -0.006435934441686832, 1, 0.2707576719578361, 0.001162883675955283],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162857772964331],
[228.9272232337029, 617.287992821792, 0, 1, 0.2705307336599462, 0, 0.001619989391707956, 0.002388308876146898, 0.7294692663400537, 1, 0.001162857772964331],
[228.7852404720777, 617.2451022286091, 1, 0, 0.2704220273492231, 0.004370911331240557, 0, -0.006443922647077915, 1, 0.270422027349223, 0.001163449942910524],
[229.1120965885111, 616.9182461121757, 0, 1, 0.2708083682402483, 0, 0.001620960323838708, 0.002389740296524018, 0.7291916317597517, 1, 0.001162883669540925],
[228.8426770803333, 617.1876656203535, 0, 1, 0.2704899168862251, 0, 0.001620252729767162, 0.002388697108704127, 0.7295100831137749, 1, 0.001163477963577921],
[229.1120965885111, 616.9182461121758, 0, 1, 0.2708083682402483, 0, 0.001620960323838708, 0.002389740296524018, 0.7291916317597518, 1, 0.001162882278263817],
[229.0692059953282, 616.9611367053587, 1, 0, 0.270757671957836, 0.004365492933259632, 0, -0.006435934441686832, 1, 0.270757671957836, 0.001162939670764562],
[228.6671532606696, 614.5353837717555, 0, 2, 0.2711888819327358, 0, 0.003254491202320776, 0.004798013039856948, 0.5311656458184558, 1, 0.002333709580127572],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 9.096843351111913e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.493986777940317e-05],
[228.5222638253178, 614.5080788753691, 1, 0, 0.2710724065912457, 0.004375941246426646, 0, -0.006451338122232686, 1, 0.2710724065912458, 0.001162826217009187],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.713441706529938e-05],
[228.1537521486978, 614.876590551989, 0, 1, 0.270635279173697, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.729364720826303, 1, 0.001163440806249086],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.438254085741196e-05],
[228.2636471891478, 614.9086782731642, 0, 1, 0.2707200417945296, 0, 0.001626257744171509, 0.00239755014766642, 0.7292799582054704, 1, 0.001162709203779867],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.48229409500197e-05],
[228.1537521486977, 614.876590551989, 0, 1, 0.2706352791736969, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.7293647208263031, 1, 0.001166328401344039],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.44004960550572e-05],
[228.8802810636926, 614.1500616369942, 0, 1, 0.2714970855384208, 0, 0.001628266546671895, 0.002400511673752119, 0.7285029144615791, 1, 0.001162956361743167],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.461951764837481e-05],
[228.2382983020674, 614.7920443986194, 1, 0, 0.2707355675608251, 0.004381385628263519, 0, -0.00645936463495721, 1, 0.2707355675608252, 0.001164006317517622],
[228.581461091607, 614.222352694085, 0, 1, 0.2712155039556224, 0, 0.001628074907423717, 0.002400229144915952, 0.7287844960443777, 1, 0.001164553032595859],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.401547307074554e-05],
[228.3386255035059, 614.6917171971809, 0, 1, 0.2708545753786424, 0, 0.001626831746748948, 0.002398396384967508, 0.7291454246213576, 1, 0.001165698120817544],
[228.7828424004052, 614.2891558604683, 1, 0, 0.2713680953374666, 0.004370957146558422, 0, -0.006443990191427823, 1, 0.2713680953374666, 0.001163331277703475],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.385818334140027e-05],
[228.3802810636926, 614.6711115705084, 0, 1, 0.2708972229440187, 0, 0.001626886283048119, 0.002398476786436832, 0.7291027770559813, 1, 0.001162958031778573],
[228.3802810636926, 614.4235327219994, 0, 1, 0.2709768006837296, 0, 0.001627541828630541, 0.002399443240502044, 0.7290231993162704, 1, 0.001165698239878392],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.38601343998061e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 1, 0, 0.2709039870760355, 0.004378661744973996, 0, -0.006455348883575593, 1, 0.2709039870760355, 0.001165698242553617],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 1, 0.2709039870760355, 0, 0.001626941999056675, 0.002398558927121493, 0.7290960129239645, 1, 0.001162958031778573],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.529051381542651e-05],
[228.3802810636926, 614.6084060768076, 0, 1, 0.2709173735633165, 0, 0.001627052266309273, 0.002398721491308318, 0.7290826264366835, 1, 0.001163045332107043],
[228.8802810636926, 614.1500616369942, 0, 1, 0.2714970855384208, 0, 0.001628266546671895, 0.002400511673752119, 0.7285029144615791, 1, 0.001163331233105757],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 1.388181548452466e-05],
[228.6068099786874, 614.4235327219994, 0, 1, 0.271172694978374, 0, 0.001627541828630541, 0.002399443240502044, 0.7288273050216261, 1, 0.001163199396394909],
[228.1954077088844, 614.8349349918024, 0, 1, 0.27068469087109, 0, 0.001626452797470484, 0.002397837709750252, 0.72931530912891, 1, 0.001163618231348626],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.790124795287304e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 1, 0.2709039870760355, 0, 0.001626941999056675, 0.002398558927121493, 0.7290960129239645, 1, 0.00116398956206817],
[228.5222638253178, 614.5080788753689, 1, 0, 0.2710724065912458, 0.004375941246426646, 0, -0.006451338122232686, 1, 0.2710724065912458, 0.001163331233980401],
[228.2320386233352, 614.876590551989, 0, 1, 0.2707030040086025, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.7292969959913975, 1, 0.001165698283674208],
[228.3017303278697, 614.7286123728172, 0, 1, 0.2708108104347638, 0, 0.001626734106519066, 0.002398252436476925, 0.7291891895652363, 1, 0.001163618631908142],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.952865790569179e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 1, 0.2709039870760355, 0, 0.001626941999056675, 0.002398558927121493, 0.7290960129239645, 1, 0.001163540971863762],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.0007499328340762561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.8297845704155, 617.242213690458, 1, 1, 0.2704613614926177, 0.00437006048787447, 0.001620109541797301, -0.004054182260144491, 0.9268506519395595, 0.467773374924795, 0.002313633635784218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1537521486977, 616.876590551989, 0, 1, 0.2708576047251405, 0, 0.001621069781729255, 0.002389901667489098, 0.7291423952748595, 1, 0.001162857786554716],
[226.4302473599913, 612.852498767808, 0, 1, 0.2697901850177106, 0, 0.001631713996451976, 0.002405594160681962, 0.7302098149822893, 1, 0.001162947851021187],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.575265606928, 617.0396232471284, 0, 1, 0.2703065764566706, 0, 0.001620641466649369, 0.002389270213534945, 0.7296934235433294, 1, 0.001163485670603939],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162883688210423],
[228.5840604441633, 617.4462822565235, 0, 1, 0.2701842344264868, 0, 0.001619574088850925, 0.002387696605779688, 0.7298157655735132, 1, 0.001163450442610186],
[229.4272232337029, 616.6031194669839, 0, 1, 0.2711808450053084, 0, 0.001621788746162101, 0.002390961618341486, 0.7288191549946916, 1, 0.001162857772964331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6507166633862, 612.462937157674, 0, 1, 0.2709760942795897, 0, 0.001632751860285315, 0.002407124256754246, 0.7290239057204102, 1, 0.001162835273393023],
[229.1537521486978, 616.876590551989, 0, 1, 0.2708576047251405, 0, 0.001621069781729255, 0.002389901667489098, 0.7291423952748595, 1, 0.001163275429746019],
[229.1537521486978, 616.876590551989, 0, 1, 0.2708576047251405, 0, 0.001621069781729255, 0.002389901667489098, 0.7291423952748595, 1, 0.001163424235681879],
[228.9272232337029, 617.1447750271706, 0, 1, 0.2705765274164252, 0, 0.001620365334788703, 0.002388863119403841, 0.7294234725835748, 1, 0.001163989731285566],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163618631908142],
[228.6878018087903, 617.3841964520832, 0, 1, 0.2702935474508847, 0, 0.001619736957548787, 0.002387936718930269, 0.7297064525491153, 1, 0.001164056762602736],
[227.2125132822317, 612.9011405388285, 1, 1, 0.2704544941613659, 0.004401166051791573, 0.001631584498473695, -0.004083123161706636, 0.9268543665879196, 0.4677633549106516, 0.002329386876322692],
[227.3885457039495, 613.1405619637411, 0, 1, 0.2705302453295279, 0, 0.00163094739124295, 0.002404463974253218, 0.7294697546704721, 1, 0.001164224700902715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163867927799239],
[226.8440016056117, 613.2696522154486, 0, 1, 0.2700158491340604, 0, 0.001630604084822199, 0.00240395784638836, 0.7299841508659396, 1, 0.00116433128877068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.0705305206065, 612.8007130941527, 1, 0, 0.2703635018426248, 0.004403918014844514, 0, -0.00649258355549312, 1, 0.2703635018426247, 0.001164624997108043],
[227.0705305206065, 613.0431233004538, 0, 1, 0.2702854899308318, 0, 0.001631206618249427, 0.002404846145990684, 0.7297145100691682, 1, 0.001164269889204738],
[226.9285477589812, 613.0431233004538, 1, 0, 0.2701621442456053, 0.004406673421548051, 0, -0.006496645781036777, 1, 0.2701621442456053, 0.001164269934047486],
[226.973091857319, 613.1822175239279, 0, 1, 0.2701561119984815, 0, 0.001630836595421943, 0.002404300630811523, 0.7298438880015186, 1, 0.001168870219989064],
[228.7852404720777, 617.2451022286091, 1, 0, 0.2704220273492231, 0.004370911331240557, 0, -0.006443922647077915, 1, 0.270422027349223, 0.001163705480917036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.2125132822317, 611.9011405388285, 1, 0, 0.2716448092996234, 0.004381880667355407, 0, -0.006460094458413614, 1, 0.2716448092996233, 0.001162867979778848],
[229.4272232337029, 616.6031194669839, 0, 1, 0.2711808450053084, 0, 0.001621788746162101, 0.002390961618341486, 0.7288191549946916, 1, 0.001162699715033078],
[228.7006943187081, 617.3296483819788, 0, 1, 0.2703220945819186, 0, 0.001619880079664083, 0.002388147720199834, 0.7296779054180813, 1, 0.001163921765066247],
[228.7006943187081, 617.1031194669839, 0, 1, 0.270394494079044, 0, 0.001620474712336148, 0.002389024371921141, 0.7296055059209561, 1, 0.001164623773435859],
[227.3755459773711, 612.738107843689, 0, 1, 0.2706485544464213, 0, 0.001632018618066925, 0.002406043256528251, 0.7293514455535788, 1, 0.001162192049787483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163224335908887],
[228.9482731672171, 617.0820695334697, 0, 1, 0.2706147304792538, 0, 0.001620529990048206, 0.002389105866436499, 0.7293852695207462, 1, 0.001162597858956957],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.00116388270066078],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001164614157663481],
[229.3426770803333, 616.6876656203535, 1, 0, 0.271080912238004, 0.004360287464725649, 0, -0.006428260152726763, 1, 0.271080912238004, 0.00116458638519465],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001164141027776408],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.001159914118283241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8014001980235, 611.9008513532336, 0, 1, 0.2712883046070028, 0, 0.001634251689286713, 0.002409335416243979, 0.7287116953929972, 1, 0.001163749374624378],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.001162991360214436],
[227.1408596387799, 612.9311386220936, 0, 1, 0.2703826101917567, 0, 0.001631504645445263, 0.002405285519853742, 0.7296173898082432, 1, 0.001163881425390459],
[227.4840224283196, 612.3614469175591, 1, 0, 0.2708641419539926, 0.00439591312534972, 0, -0.006480782151896991, 1, 0.2708641419539926, 0.001163653079443496],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.2765396990656, 612.8320894762586, 1, 0, 0.2705323238045622, 0.004399926192664183, 0, -0.006486698514273663, 1, 0.2705323238045622, 0.00116290902511994],
[227.5220637581855, 612.1711115705084, 1, 0, 0.2709585720630909, 0.004395178135615092, 0, -0.006479698575352555, 1, 0.2709585720630909, 0.001163730424087708],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162978151212036],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001162855154874237],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708390933838],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165494362234529],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162902386023809],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878794670563],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902399758058],
[229.6325949985231, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714369571237377, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285630428762624, 1, 0.001168205523684174],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162708390933838],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162708394899607],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162818514813722],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162206822158854],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001165931142781222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116360273643904],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116503512504053],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162684797392735],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116291249469699],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162299597668406],
[229.8215199301586, 616.1255116501549, 1, 0, 0.271673652546341, 0.004351202621512093, 0, -0.006414866601018091, 1, 0.271673652546341, 0.001165171660477571],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.00116270843542647],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162275112135123],
[228.9906122368978, 616.9564193434156, 1, 0, 0.2706914306550855, 0.004366991250128059, 0, -0.006438143371877647, 1, 0.2706914306550855, 0.001168205461896278],
[229.3023247189013, 616.8295802162204, 1, 0, 0.2710006836776629, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710006836776629, 0.001162708404811976],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162912502495273],
[228.7529322218511, 610.8243526488461, 0, 1, 0.2724620310053781, 0, 0.00163713184594473, 0.002413581557450979, 0.7275379689946219, 1, 0.001162678147641978],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8658627476127, 615.854639917706, 0, 1, 0.2717988531946217, 0, 0.001623759788728109, 0.002393867475922872, 0.7282011468053783, 1, 0.00116541467817679],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163332897438315],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162878789668831],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162925989366394],
[229.1795371685334, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709281010209356, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290718989790644, 1, 0.001168177394403442],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.001162225987624341],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162878778392717],
[229.4060660835283, 616.298555290484, 0, 1, 0.271260272541509, 0, 0.001622590206346766, 0.002392143190568261, 0.728739727458491, 1, 0.001162244759435255],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162925979697191],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5620154302994, 1, 0, 0.2711757938585754, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711757938585755, 0.001162034587561129],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.00116306393428017],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 2, 0.2711825416007133, 0, 0.003243904479872601, 0.004782405306052207, 0.5311748876675961, 1, 0.002327920833453586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116270840686716],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162011030164601],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001163091899710135],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162855149194584],
[229.4060660835283, 616.356092141977, 0, 1, 0.2712418188168237, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961479, 0.7287581811831763, 1, 0.001162912498949736],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001165494287223482],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.00116227507528574],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162708406723757],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162275091241378],
[229.3277796088908, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711150884056373, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288849115943627, 1, 0.001167846951451964],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162855149194584],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162878781868737],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171728423999],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902380355511],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162708398407994],
[229.5643555182597, 616.3826760620537, 1, 0, 0.2713696566668135, 0.004356076960390566, 0, -0.00642205271400648, 1, 0.2713696566668136, 0.001165520656969706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.037118274153, 612.993224426534, 0, 1, 0.2702725208047027, 0, 0.001631339401729143, 0.002405041905274562, 0.7297274791952972, 1, 0.001163595104364055],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162940278491309],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.00116360814930532],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001162855155785126],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878781996917],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.00116309189610358],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162011030115199],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163779655716799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163377064411992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.8478275017203, 0, 1, 0.2708027282447292, 0, 0.001631726433748667, 0.002405612496669983, 0.7291972717552708, 1, 0.001162511873481214],
[229.4060660835283, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2711232902878403, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7288767097121598, 1, 0.001162936055798832],
[229.4060660835283, 616.3768417651215, 0, 1, 0.2712351644313197, 0, 0.001622384119974876, 0.002391839362707562, 0.7287648355686802, 1, 0.001162708439933345],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.5939174687696, 611.4780807921039, 0, 1, 0.272112292686826, 0, 0.001635381596515459, 0.002411001209537102, 0.727887707313174, 1, 0.001162806663717305],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162471175815309],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 1, 0, 0.2712096470004069, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2712096470004068, 0.001165171649325612],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162275074185467],
[228.2241707591533, 611.8478275017203, 0, 1, 0.2716721557576321, 0, 0.001634393316526385, 0.002409544213656693, 0.728327844242368, 1, 0.001163989989742543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163376996068309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164227596124811],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163578704466825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.2662706261815, 612.8057276346919, 0, 1, 0.2705318961906488, 0, 0.001631838533656989, 0.002405777762694212, 0.7294681038093511, 1, 0.001163627498169742],
[229.2422426622342, 616.7047889180792, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173444, 0, -0.006431076468604374, 1, 0.2709888847697555, 0.001163594566494112],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163904341641091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163377051221323],
[227.1408596387799, 612.9311386220936, 0, 1, 0.2703826101917567, 0, 0.001631504645445263, 0.002405285519853742, 0.7296173898082432, 1, 0.001164171912152511],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162830056926202],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164042234898409],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163605063978963],
[227.7504904180445, 611.9932603795016, 0, 1, 0.2712142724512551, 0, 0.001634004922505016, 0.00240897161429683, 0.7287857275487449, 1, 0.001162611414636942],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4843525581657, 616.298555290484, 0, 1, 0.2713277253874599, 0, 0.001622590206346766, 0.002392143190568261, 0.7286722746125401, 1, 0.001162954895635841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164077057727283],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163377009158606],
[227.5939174687696, 612.8478275017203, 0, 1, 0.2708027282447292, 0, 0.001631726433748667, 0.002405612496669983, 0.7291972717552708, 1, 0.001162227001135313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2711232902878403, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7288767097121598, 1, 0.001162936256530352],
[227.5939174687696, 612.3089884853647, 0, 1, 0.2709764615116097, 0, 0.001633162371948263, 0.00240772946358671, 0.7290235384883903, 1, 0.001163437940451888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 0, 1, 0.2712096470004069, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194026, 0.7287903529995932, 1, 0.001163602483818403],
[227.6620167889546, 612.5665544211938, 0, 1, 0.2709524819669746, 0, 0.001632475675961263, 0.002406717085277715, 0.7290475180330254, 1, 0.001163822401377239],
[227.8228874780444, 612.3640281719174, 0, 1, 0.2711573856179401, 0, 0.001633015582226943, 0.002407513055259501, 0.7288426143820599, 1, 0.001163696479428837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4401157436208, 616.5852023113301, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211686, 0.002391031096543878, 0.7288023055017863, 1, 0.001163640364559458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164009217632829],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.00116359241070908],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250503547881],
[227.963664178386, 612.1083340824875, 0, 1, 0.2713620554551502, 0, 0.001633697736690578, 0.002408518738116896, 0.7286379445448499, 1, 0.001161999381000441],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162076569202606],
[227.3099519455191, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2706753884126116, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7293246115873884, 1, 0.001163479832502292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001163602790812115],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163673416239711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163368995570732],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8132127961918, 615.2587854646818, 0, 1, 0.2702179805119077, 0, 0.001625332337586594, 0.002396185844435727, 0.7297820194880923, 1, 0.001160063276313568],
[227.8677608662963, 615.1625818343905, 0, 1, 0.2702960371940011, 0, 0.001625586518962255, 0.002396560577528887, 0.7297039628059989, 1, 0.001163540884812295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.2422426622342, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173445, 0, -0.006431076468604376, 1, 0.2709888847697555, 0.00115978683070182],
[229.8850161500141, 616.0620154302994, 0, 1, 0.2717487118792367, 0, 0.001623213207361165, 0.002393061665010227, 0.7282512881207633, 1, 0.001168205452983828],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162275074816716],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163919481811503],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162861819095502],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116339646938115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163602954764779],
[227.6620167889546, 613.2408891651797, 0, 1, 0.2707352004339156, 0, 0.001630680565611542, 0.002404070600057597, 0.7292647995660844, 1, 0.001163804677891102],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4401157436208, 616.9223696833232, 0, 1, 0.2710896568482483, 0, 0.001620949489176924, 0.0023897243232596, 0.7289103431517517, 1, 0.00116336896787131],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164016873854823],
[227.4073906088066, 612.6229520918803, 1, 0, 0.2707133052809673, 0.004397394461643648, 0, -0.006482966048061656, 1, 0.2707133052809673, 0.001163540881780204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584104, 1, 0, 0.2710147027688186, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.00116312860653033],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164014334566695],
[228.1484655388741, 611.8818771618128, 0, 1, 0.2715955054735043, 0, 0.001634302366722244, 0.002409410128689454, 0.7284044945264957, 1, 0.001163576354396753],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163011100053502],
[226.9962775245984, 612.6226629062854, 0, 1, 0.2703563087894447, 0, 0.001632326161843237, 0.002406496660442208, 0.7296436912105553, 1, 0.001163483216712097],
[227.5474114315145, 612.2147467939909, 2, 0, 0.2709664983146455, 0.008789377068356346, 0, -0.01295795353698325, 0.9999999999999998, 0.07342284320890102, 0.002338228587938702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1072461114426, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001163328248192564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.2487927403127, 611.7815499603742, 1, 0, 0.27171493830389, 0.004381184180622318, 0, -0.006459067645858379, 1, 0.2717149383038899, 0.0011625784229104],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162472557980473],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163126803697783],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163772458434332],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.00116352988078164],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162975182237806],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163862274322881],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001163673001762567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162918461350429],
[227.3099519455191, 612.8057276346919, 0, 1, 0.2705698244545339, 0, 0.001631838533656989, 0.002405777762694212, 0.7294301755454662, 1, 0.001164114085031248],
[227.5493733704318, 612.5246506495927, 1, 0, 0.2708682412075246, 0.004394650643014875, 0, -0.006478920906519877, 1, 0.2708682412075246, 0.00116396971025485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2710077058921217, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710077058921216, 0.001162890565568092],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164073921546616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6913561320571, 612.3608272282986, 1, 0, 0.2710443001543688, 0.004391910246342497, 0, -0.006474880809880786, 1, 0.2710443001543688, 0.001163672967840879],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163005199749278],
[227.3864347395157, 612.6855635213578, 0, 1, 0.2706749364462256, 0, 0.001632158581071481, 0.00240624960040175, 0.7293250635537745, 1, 0.001162678599030116],
[227.5413100110588, 612.4890326896282, 0, 1, 0.2708727273821042, 0, 0.001632682295728124, 0.002407021699508961, 0.7291272726178958, 1, 0.001162020996883456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3023247189013, 616.6447068614121, 1, 0, 0.2710599081960743, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162223697880199],
[227.4248251620304, 612.6471730988432, 0, 1, 0.270720635413212, 0, 0.00163226085732491, 0.00240640038366313, 0.729279364586788, 1, 0.001164111025856121],
[227.6642465869431, 612.3660961137439, 0, 1, 0.2710190751622202, 0, 0.001633010067582604, 0.002407504925160568, 0.7289809248377799, 1, 0.001163672906778758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001163273386974499],
[229.3850161500141, 616.5620154302993, 0, 1, 0.271157658324659, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.728842341675341, 1, 0.001163729831901943],
[228.1537521486978, 614.876590551989, 0, 1, 0.270635279173697, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.729364720826303, 1, 0.001163418449385526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6878018087903, 615.3841964520833, 0, 1, 0.2700692257345456, 0, 0.001625001106244471, 0.002395697518550075, 0.7299307742654544, 1, 0.00116071832759543],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001159923079297434],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001162529429393066],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.00116263097454279],
[227.8333388936823, 612.2180537405188, 1, 0, 0.2712135720402191, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.2712135720402191, 0.001162041372197546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162470405909167],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162855159043411],
[227.6360173357978, 612.4359809250757, 0, 1, 0.2709720331198427, 0, 0.001632823725492931, 0.002407230205789539, 0.7290279668801574, 1, 0.001162697150594698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5322759711709, 612.498066729516, 0, 1, 0.2708619729611879, 0, 0.001632658214481529, 0.002406986197143769, 0.7291380270388121, 1, 0.001162226077233438],
[229.4271160170424, 616.5199155632711, 0, 1, 0.2712074248767676, 0, 0.001622007618499023, 0.002391284296223014, 0.7287925751232325, 1, 0.001162416745024683],
[226.9075918896904, 613.1644063711832, 0, 1, 0.2701049342906763, 0, 0.001630883967838543, 0.002404370470752221, 0.7298950657093237, 1, 0.001164087143885639],
[226.5747222575122, 613.0401665965442, 0, 1, 0.2698555317030543, 0, 0.001631214485588712, 0.002404857744607527, 0.7301444682969457, 1, 0.001166048650531318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001163199900272986],
[227.4901761041426, 612.3710742898049, 0, 1, 0.2708663794137847, 0, 0.001632996792279495, 0.002407485353721144, 0.7291336205862153, 1, 0.001163033527976092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 1, 0, 0.2712096470004069, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2712096470004068, 0.001165862758071767],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162708429562397],
[227.6620167889546, 612.8948018845213, 0, 1, 0.270846671791015, 0, 0.001631601372576848, 0.002405428122186887, 0.729153328208985, 1, 0.001164273009538984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4401157436208, 616.7493260429939, 0, 1, 0.2711450940101415, 0, 0.001621404284972481, 0.002390394817054759, 0.7288549059898586, 1, 0.001163372795409942],
[229.5098074481552, 616.4372241321582, 1, 0, 0.2713051750053523, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053523, 0.001162962093227513],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163091927604242],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162940546681273],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001162817773031414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162949831535756],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162768041952534],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116394909252771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163292201174317],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163830714317413],
[227.9075918896904, 612.1644063711832, 0, 1, 0.2712953084515461, 0, 0.001633548095237759, 0.002408298125554965, 0.7287046915484539, 1, 0.0011641037747817],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163437612651033],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163224037189399],
[227.5939174687696, 612.5613919124773, 0, 1, 0.2708950534828932, 0, 0.001632489434043339, 0.002406737368465808, 0.7291049465171068, 1, 0.001164040141937781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5826210569719, 0, 1, 0.2711691888681591, 0, 0.00162184266284664, 0.002391041106328824, 0.7288308111318409, 1, 0.001163190284379422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.8333388936823, 611.2386593671913, 0, 1, 0.2723972937646007, 0, 0.001636022173458873, 0.002411945595721135, 0.7276027062353994, 1, 0.001162313709423474],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.00116207089653752],
[227.8333388936823, 612.1124576536349, 0, 1, 0.2712476683974305, 0, 0.001633686731084065, 0.002408502512833042, 0.7287523316025695, 1, 0.001163035907388621],
[227.5939174687696, 612.3089884853647, 0, 1, 0.2709764615116097, 0, 0.001633162371948263, 0.00240772946358671, 0.7290235384883903, 1, 0.001163999460661471],
[227.8333388936823, 612.0279115002654, 0, 1, 0.2712749740350732, 0, 0.001633912410217857, 0.002408835225800889, 0.7287250259649267, 1, 0.001163753333096561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 0, 1, 0.2712096470004069, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194026, 0.7287903529995932, 1, 0.001162952027830075],
[227.8359382462386, 612.3509774037232, 1, 1, 0.2711729187903225, 0.004389123189684098, 0.001633050385972847, -0.004063207558088308, 0.9264652481147373, 0.4688110856953821, 0.002327361272987555],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.478357140619, 616.5469609143319, 0, 1, 0.2712428957424108, 0, 0.001621936467770455, 0.002391179400525885, 0.7287571042575891, 1, 0.001162230973970419],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116432730219572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116335761341483],
[228.4691261706285, 611.5612165300583, 1, 0, 0.2719772305320581, 0.004376959008689716, 0, -0.006452838583074677, 1, 0.2719772305320581, 0.001163885592669352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163704369459707],
[228.2241707591533, 611.8478275017203, 0, 1, 0.2716721557576321, 0, 0.001634393316526385, 0.002409544213656693, 0.728327844242368, 1, 0.001163688743345823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163458721171916],
[228.7966151287598, 612.0646352651879, 0, 1, 0.2720979412733877, 0, 0.001633814375775415, 0.002408690696132823, 0.7279020587266123, 1, 0.00116243244857704],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7301408784711, 616.6323445484728, 0, 1, 0.2714323293317812, 0, 0.001621711882032797, 0.002390848299523959, 0.7285676706682188, 1, 0.001162703436315999],
[229.4060660835283, 616.3768417651215, 0, 1, 0.2712351644313197, 0, 0.001622384119974876, 0.002391839362707562, 0.7287648355686802, 1, 0.001162708431617583],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163125376872804],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163351977304274],
[226.800320286274, 613.3133335347862, 0, 1, 0.2699638545983937, 0, 0.001630487950158484, 0.002403786632027575, 0.7300361454016062, 1, 0.001164380021653447],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.2662706261815, 612.8057276346921, 0, 1, 0.2705318961906488, 0, 0.001631838533656989, 0.002405777762694212, 0.7294681038093512, 1, 0.001164065508164654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.2422426622342, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173444, 0, -0.006431076468604374, 1, 0.2709888847697555, 0.001163450263816775],
[228.2997687627719, 611.730573937915, 1, 0, 0.2717756218528858, 0.004380205925828632, 0, -0.00645762542986681, 1, 0.2717756218528857, 0.001163782157766849],
[228.463592184066, 611.5667505166209, 0, 1, 0.2719706426907847, 0, 0.001635144486117419, 0.0024106516437491, 0.7280293573092153, 1, 0.001168267418588859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163598606781634],
[229.3337750264375, 616.5349700792385, 0, 1, 0.2711221762872754, 0, 0.001621968012408895, 0.002391225905978555, 0.7288778237127247, 1, 0.00116324258062338],
[229.4906122368979, 616.4564193434157, 0, 1, 0.2712824842096632, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194025, 0.7287175157903367, 1, 0.001162011039117806],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163344246822758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.322844455437, 612.7074982452499, 0, 1, 0.2706126587339654, 0, 0.001632100150339155, 0.002406163457469353, 0.7293873412660346, 1, 0.001164309764282925],
[227.6913561320571, 612.3389865686298, 1, 0, 0.2710513472644717, 0.004391910246342497, 0, -0.006474880809880786, 1, 0.2710513472644718, 0.001163556144561558],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163208833140963],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164182900442203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163291080210845],
[227.6913561320571, 612.3389865686298, 1, 0, 0.2710513472644717, 0.004391910246342497, 0, -0.006474880809880786, 1, 0.2710513472644718, 0.00116374365912809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163441972176583],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162268789625304],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.4228433787016, 611.5814038304394, 0, 4, 0.2719305814674408, 0, 0.006540421234110967, 0.009642375540927534, 0.2809901901327796, 1, 0.004704274679481926],
[227.9483958563803, 612.1236024044933, 1, 3, 0.2713438804391547, 0.004386957829832914, 0.004900970961119042, 0.0007577963968100051, 0.7017989399869555, 0.7181029918797776, 0.004682616602060087],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162716641501704],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163456830630466],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163602175120283],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163679675548638],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116285515150674],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250500278585],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163162713231741],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163515639887639],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163099122546509],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.001162684793950556],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902392433793],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163091895677444],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001162912492203283],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162250502739603],
[229.5098074481552, 616.4372241321582, 1, 0, 0.2713051750053523, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053523, 0.001163096357230096],
[229.4401157436208, 616.5852023113302, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211685, 0.002391031096543877, 0.7288023055017863, 1, 0.001163522260622199],
[229.4477216437149, 616.4993099365986, 0, 1, 0.2712317829345458, 0, 0.001622061831833747, 0.002391364221554124, 0.7287682170654542, 1, 0.001165171701393877],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.2716450360548079, 0.004351446728635407, 0, -0.006415226481898994, 1, 0.2716450360548079, 0.001162275072729934],
[229.5909394383364, 616.356092141977, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961479, 0.7285989182922745, 1, 0.001162684803112206],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162708387565756],
[229.8215199301586, 616.1255116501549, 1, 0, 0.271673652546341, 0.004351202621512093, 0, -0.006414866601018091, 1, 0.271673652546341, 0.001163947845407265],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163614892149774],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162250502094417],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162925978134732],
[229.8850161500141, 616.0620154302994, 0, 1, 0.2717487118792367, 0, 0.001623213207361165, 0.002393061665010227, 0.7282512881207633, 1, 0.001167533098293924],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163162713231741],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250501121763],
[229.4401157436208, 616.9223696833232, 0, 1, 0.2710896568482483, 0, 0.001620949489176924, 0.0023897243232596, 0.7289103431517517, 1, 0.001163514626215639],
[229.5098074481552, 616.4372241321583, 1, 0, 0.2713051750053522, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053522, 0.001163099096672428],
[229.3023247189013, 616.7229933360497, 1, 0, 0.2710348258206708, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710348258206708, 0.001162708444906376],
[229.4060660835283, 616.6255116501549, 1, 0, 0.271155441618447, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.271155441618447, 0.001165494381077241],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162237457016865],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162266966263658],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163026822586162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.001163676267029463],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163274082811856],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.00116305081028297],
[229.4477216437149, 616.4993099365986, 0, 1, 0.2712317829345458, 0, 0.001622061831833747, 0.002391364221554124, 0.7287682170654542, 1, 0.001182820579225507],
[229.1795371685334, 616.6841832914067, 0, 3, 0.2709414431959755, 0, 0.004864726680662063, 0.007171941971301723, 0.3875138549586662, 1, 0.003491651287011734],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001162307060319257],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162310605739374],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001162965494058853],
[227.5469752987593, 612.5250229621142, 0, 2, 0.2708660397797208, 0, 0.003265172727684145, 0.004813760539171882, 0.5316363319465077, 1, 0.002351719314083414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163720156286184],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.00116225049545305],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162244723198968],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162275074734408],
[229.5480488451535, 616.3771420754912, 1, 0, 0.2713573863373542, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713573863373542, 0.00116222602215137],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.9178850470519, 612.239450093346, 0, 1, 0.2712800037732989, 0, 0.001633347867158076, 0.002408002934424449, 0.7287199962267011, 1, 0.001163450112750823],
[229.4906122368978, 616.5199155632711, 0, 1, 0.2712621234556368, 0, 0.001622007618499023, 0.002391284296223014, 0.7287378765443633, 1, 0.00116264684576439],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708390267054],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.00116270843542647],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171647262667],
[229.5698895048223, 616.3771420754912, 1, 0, 0.2713761984316711, 0.00435597195327741, 0, -0.006421897904708535, 1, 0.2713761984316712, 0.00116227510871249],
[229.2422426622342, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173444, 0, -0.006431076468604374, 1, 0.2709888847697555, 0.001162855155785126],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001162855151248508],
[229.7048860556139, 616.4686744396945, 1, 0, 0.2714630860377579, 0.004353411967727538, 0, -0.006418123783567458, 1, 0.2714630860377579, 0.001162250502739603],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163091904455215],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162011033971122],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250495626295],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250495626295],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001163085644823359],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162872725241459],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162855187628393],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001162912502495273],
[229.4401157436208, 616.9223696833232, 0, 1, 0.2710896568482483, 0, 0.001620949489176924, 0.0023897243232596, 0.7289103431517517, 1, 0.001163091935879356],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162902392598734],
[229.4189585934461, 616.4864174266808, 0, 1, 0.2712111367264646, 0, 0.001622095753827262, 0.002391414231880502, 0.7287888632735353, 1, 0.001163091853433264],
[229.3931735736104, 616.5320173470343, 0, 1, 0.2711743024509712, 0, 0.001621975780435615, 0.002391237358181427, 0.7288256975490288, 1, 0.001162275074816716],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250501921172],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001163614870547045],
[229.3215199301586, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711096944019334, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288903055980666, 1, 0.001163947840068441],
[229.4846168193512, 616.4624147609622, 0, 1, 0.2712753969839589, 0, 0.001622158911971555, 0.002391507344315304, 0.728724603016041, 1, 0.001162684788031197],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.271645036054808, 0.004351446728635406, 0, -0.006415226481898993, 1, 0.2716450360548079, 0.001162250495626295],
[229.3720164234358, 616.1595613102475, 0, 1, 0.2712755176314432, 0, 0.001622956232105732, 0.002392682812971662, 0.7287244823685568, 1, 0.001162244727199698],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.00116227510871249],
[229.1072461114426, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001162878783022754],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163515639898494],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163099124065823],
[229.6263995138441, 616.3206320664694, 0, 1, 0.2714429993150742, 0, 0.001622532084715527, 0.002392057503335682, 0.7285570006849258, 1, 0.001162684843578034],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250495626295],
[229.1795371685334, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2709873255363514, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7290126744636487, 1, 0.001163242573165569],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162299617719026],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162878739899246],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162055490093391],
[229.3644105233416, 616.5826210569719, 0, 1, 0.2711333002668808, 0, 0.00162184266284664, 0.002391041106328824, 0.7288666997331192, 1, 0.001162804271784372],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708439032879],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163947840954107],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163614880266701],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162855152110415],
[229.4846168193512, 616.5407012355997, 0, 1, 0.2712502946684223, 0, 0.001621952935136181, 0.002391203677941485, 0.7287497053315777, 1, 0.001162708442900626],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171715365233],
[229.3023247189013, 616.8295802162204, 1, 0, 0.2710006836776629, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710006836776629, 0.001162034574737871]
],
"NAMES": [
["epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_463457_Washington_20200501_null_2"],
["epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1"],
["epi_isl_466897_Bavaria_20200424_null_2"],
["epi_isl_464959_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_441065_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_491576_Scotland_20200406_null_13"],
["Node1136"],
["epi_isl_463913_Quebec_20200411_null_2"],
["epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2"],
["epi_isl_440892_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1"],
["epi_isl_478621_England_20200329_null_5"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_476756_Minnesota_20200518_null_2"],
["epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1"],
["epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1"],
["epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1"],
["epi_isl_475581_California_20200402_null_1"],
["epi_isl_424010_England_20200320_null_6"],
["epi_isl_440980_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1"],
["epi_isl_471957_England_20200401_null_10"],
["epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1"],
["epi_isl_487458_Bamako_20200412_null_1"],
["epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1"],
["epi_isl_469336_England_20200515_null_5"],
["epi_isl_490520_England_20200423_null_16"],
["epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_478783_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1"],
["epi_isl_463027_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_481017_Catalunya_20200408_null_1"],
["epi_isl_483705_Sylhet_20200624_null_2"],
["epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_459205_England_20200503_null_3"],
["epi_isl_471243_Wisconsin_20200403_null_1"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1"],
["epi_isl_463285_Louisiana_20200404_null_3"],
["epi_isl_485968_USA_20200415_null_7"],
["epi_isl_490164_Jashore_20200707_null_2"],
["epi_isl_443642_England_20200415_null_3"],
["epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1"],
["epi_isl_474861_Andalusia_20200316_null_3"],
["epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1"],
["epi_isl_423187_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_444916_Denmark_20200328_null_4"],
["epi_isl_480277_Istanbul_20200504_null_1"],
["epi_isl_479268_England_20200424_null_7"],
["epi_isl_473820_Scotland_20200411_null_1"],
["epi_isl_478672_Egypt_20200602_null_2"],
["epi_isl_476753_Minnesota_20200514_null_1"],
["epi_isl_433999_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1"],
["epi_isl_478470_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_486090_Washington_20200328_null_61"],
["epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1"],
["epi_isl_474204_Wales_20200510_null_4"],
["epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1"],
["epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_2"],
["epi_isl_480661_Victoria_20200515_null_3"],
["epi_isl_475631_California_20200325_null_1"],
["epi_isl_481550_Uusimaa_20200513_null_1"],
["epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4"],
["epi_isl_489437_England_20200422_null_26"],
["epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1"],
["epi_isl_466999_Vaud_20200505_null_2"],
["epi_isl_465801_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_470289_England_20200418_null_2"],
["Node1017"],
["epi_isl_490256_WC_20200423_null_1"],
["epi_isl_477142_Dakar_20200617_null_1"],
["epi_isl_475118_Uppsala_20200401_null_1"],
["epi_isl_469070_Stockholm_20200526_null_1"],
["epi_isl_485877_Louisiana_20200424_null_12"],
["epi_isl_488355_England_20200307_null_1"],
["epi_isl_480806_Florida_20200401_null_1"],
["epi_isl_486829_Moscow_20200401_null_1"],
["epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1"],
["epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1"],
["epi_isl_440194_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_481887_England_20200418_null_2"],
["epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3"],
["epi_isl_480935_Florida_20200514_null_3"],
["epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1"],
["epi_isl_467405_New_York_20200508_null_2"],
["epi_isl_420241_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5"],
["epi_isl_477830_Scotland_20200408_null_2"],
["epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1"],
["Node237"],
["epi_isl_477007_Heverlee_20200513_null_2"],
["epi_isl_487729_Scotland_20200417_null_59"],
["Node240"],
["epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2"],
["epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1"],
["epi_isl_465574_England_20200501_null_1"],
["Node247"],
["epi_isl_481655_Uusimaa_20200402_null_2"],
["epi_isl_476048_Michigan_20200429_null_9"],
["epi_isl_464972_England_20200312_null_7"],
["epi_isl_481093_Madrid_20200603_null_2"],
["epi_isl_423168_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_442949_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_479702_Egypt_20200602_null_1"],
["epi_isl_444935_Denmark_20200328_null_1"],
["epi_isl_482417_Oregon_20200507_null_1"],
["epi_isl_467543_New_Mexico_20200401_null_1"],
["epi_isl_476204_S_o_Paulo_20200325_null_1"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2"],
["epi_isl_467629_New_Mexico_20200401_null_1"],
["epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1"],
["epi_isl_487376_Barishal_20200706_null_5"],
["epi_isl_457264_England_20200507_null_4"],
["epi_isl_470374_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_485102_Louisiana_20200427_null_1"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["epi_isl_489263_Northern_Ireland_20200502_null_2"],
["epi_isl_489482_England_20200423_null_27"],
["epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_474846_Andalusia_20200401_null_2"],
["epi_isl_474658_Wales_20200429_null_2"],
["epi_isl_490867_Wales_20200615_null_397"],
["Node307"],
["epi_isl_435645_California_20200313_null_1"],
["epi_isl_474781_Wales_20200502_null_5"],
["Node310"],
["epi_isl_453312_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_472124_England_20200527_null_6"],
["Node314"],
["epi_isl_475656_California_20200331_null_1"],
["epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1"],
["epi_isl_444415_England_20200420_null_5"],
["epi_isl_479122_England_20200423_null_1"],
["epi_isl_489828_Florida_20200516_null_45"],
["Node320"],
["epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2"],
["epi_isl_490292_FS_20200612_null_8"],
["Node325"],
["epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1"],
["epi_isl_453757_England_20200422_null_1"],
["epi_isl_466451_England_20200414_null_54"],
["Node772"],
["epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_2"],
["epi_isl_483927_England_20200315_null_4"],
["Node689"],
["epi_isl_483444_California_20200402_null_5"],
["Node688"],
["epi_isl_462050_England_20200419_null_2"],
["epi_isl_491679_Scotland_20200422_null_3"],
["Node674"],
["epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1"],
["epi_isl_490042_New_South_Wales_20200701_null_32"],
["Node671"],
["epi_isl_473885_Scotland_20200514_null_5"],
["epi_isl_484425_England_20200412_null_1"],
["Node632"],
["epi_isl_465196_England_20200416_null_4"],
["epi_isl_484854_Wisconsin_20200610_null_16"],
["Node601"],
["epi_isl_473033_Wales_20200523_null_1"],
["epi_isl_490859_Wales_20200613_null_22"],
["Node576"],
["epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_480300_Smolyan_20200414_null_3"],
["Node566"],
["epi_isl_486838_Karnataka_20200101_null_1"],
["epi_isl_492073_Mazowieckie_20200418_null_57"],
["Node563"],
["epi_isl_473690_Scotland_20200516_null_2"],
["epi_isl_478047_Scotland_20200423_null_27"],
["Node560"],
["epi_isl_477273_Minnesota_20200520_null_3"],
["epi_isl_490429_England_20200101_null_7"],
["Node557"],
["epi_isl_475731_Utah_20200512_null_7"],
["epi_isl_485716_Keur_Massar_20200612_null_1"],
["Node554"],
["epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1"],
["epi_isl_481970_England_20200605_null_1"],
["Node551"],
["epi_isl_433038_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_4"],
["Node548"],
["epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3"],
["epi_isl_491973_Muscat_20200515_null_4"],
["Node545"],
["epi_isl_459037_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_480246_Istanbul_20200426_null_1"],
["Node542"],
["epi_isl_476065_Michigan_20200531_null_2"],
["epi_isl_478594_England_20200327_null_1"],
["Node539"],
["epi_isl_471587_Telangana_20200418_null_8"],
["epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1"],
["Node529"],
["epi_isl_442215_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_464970_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1"],
["epi_isl_439605_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_469146_Singapore_20200606_null_1"],
["epi_isl_490223_California_20200401_null_4"],
["epi_isl_480704_Victoria_20200615_null_2"],
["epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1"],
["epi_isl_476020_Missouri_20200619_null_1"],
["epi_isl_492165_South_Australia_20200320_null_6353"],
["epi_isl_440451_England_20200311_null_2"],
["epi_isl_463038_Odisha_20200511_null_1"],
["epi_isl_465469_England_20200428_null_1"],
["epi_isl_465638_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_422000_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_490230_England_20200615_null_1"],
["epi_isl_487704_Scotland_20200413_null_1"],
["epi_isl_487626_England_20200423_null_1"],
["epi_isl_462343_Singapore_20200420_null_1"],
["epi_isl_468776_Aragon_20200324_null_1"],
["Node424"],
["epi_isl_482696_Singapore_20200518_null_4"],
["Node423"],
["epi_isl_463333_Washington_20200422_null_2"],
["Node422"],
["epi_isl_443056_England_20200411_null_2"],
["Node421"],
["epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1"],
["Node420"],
["epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["Node419"],
["epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9"],
["epi_isl_459069_England_20200410_null_1"],
["Node418"],
["epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1"],
["epi_isl_487625_England_20200422_null_2"],
["Node417"],
["epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1"],
["epi_isl_467991_South_Australia_20200325_null_10"],
["Node416"],
["epi_isl_466387_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_489414_England_20200422_null_3"],
["Node415"],
["epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1"],
["epi_isl_462936_Wyoming_20200325_null_1"],
["Node414"],
["epi_isl_439717_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_476962_Scherpenheuvel_Zchem_20200411_null_5"],
["Node413"],
["epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2"],
["epi_isl_468333_Galicia_20200429_null_1"],
["epi_isl_421929_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_470120_England_20200421_null_1"],
["Node412"],
["epi_isl_440751_England_20200403_null_1"],
["Node411"],
["epi_isl_473148_Wales_20200516_null_1"],
["epi_isl_475280_England_20200331_null_2"],
["Node459"],
["epi_isl_490226_England_20200618_null_107"],
["epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_423110_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_443445_England_20200416_null_1"],
["Node470"],
["epi_isl_466449_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_433005_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_439498_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1"],
["epi_isl_474023_Wales_20200423_null_1"],
["Node481"],
["epi_isl_488726_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_416589_Japan_20200216_null_1"],
["epi_isl_484203_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_487608_England_20200502_null_4"],
["epi_isl_463013_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_452914_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_463067_Odisha_20200514_null_17"],
["Node515"],
["epi_isl_470878_NW_20200428_null_1"],
["epi_isl_490064_Singapore_20200509_null_112"],
["epi_isl_466295_England_20200408_null_2"],
["epi_isl_479182_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_482949_Minnesota_20200518_null_2"],
["epi_isl_488554_England_20200319_null_11"],
["Node501"],
["epi_isl_482688_Singapore_20200602_null_2"],
["epi_isl_490054_Singapore_20200628_null_1"],
["Node512"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_440938_England_20200426_null_1"],
["epi_isl_470392_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_472298_England_20200504_null_12"],
["Node525"],
["epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1"],
["epi_isl_439926_England_20200324_null_4"],
["epi_isl_482744_Serbia_20200403_null_1"],
["epi_isl_475937_Singapore_20200519_null_1"],
["epi_isl_488033_England_20200428_null_6"],
["Node379"],
["epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1"],
["epi_isl_479863_Kansai_20200217_null_9"],
["Node367"],
["epi_isl_470880_GP_20200428_null_1"],
["epi_isl_442797_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_492132_South_Australia_20200420_null_196"],
["epi_isl_440918_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_473318_England_20200506_null_2"],
["Node370"],
["epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_439428_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_477767_England_20200429_null_23"],
["epi_isl_471891_Michigan_20200421_null_4"],
["epi_isl_465623_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_466064_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_429053_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_481262_Bavaria_20200327_null_13"],
["epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3"],
["epi_isl_477762_England_20200613_null_1"],
["epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1"],
["epi_isl_488649_England_20200331_null_8"],
["Node198"],
["epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1"],
["epi_isl_487462_Bamako_20200413_null_1"],
["epi_isl_457247_England_20200513_null_1"],
["epi_isl_474341_Wales_20200413_null_2"],
["epi_isl_488698_England_20200403_null_6"],
["epi_isl_466751_British_Columbia_20200401_null_3"],
["epi_isl_485222_Louisiana_20200423_null_3"],
["epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1"],
["epi_isl_484987_Wisconsin_20200622_null_2"],
["epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1"],
["epi_isl_475856_Austria_20200321_null_1"],
["Node143"],
["epi_isl_476257_S_o_Paulo_20200328_null_1"],
["epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3"],
["epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3"],
["epi_isl_475593_California_20200404_null_1"],
["epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1"],
["epi_isl_492154_South_Australia_20200322_null_10"],
["epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_482995_Minnesota_20200311_null_2"],
["epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6"],
["epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1"],
["epi_isl_474748_Wales_20200502_null_3"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_492174_South_Australia_20200314_null_52816"],
["epi_isl_488126_England_20200510_null_3"],
["epi_isl_461522_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_482701_Dhaka_20200521_null_11"],
["epi_isl_483508_California_20200623_null_2"],
["epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1"],
["epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_476762_Minnesota_20200601_null_1"],
["epi_isl_489712_Florida_20200530_null_1"],
["epi_isl_467394_New_York_20200426_null_1"],
["epi_isl_475696_California_20200326_null_2"],
["epi_isl_448528_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_472230_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_484637_Scotland_20200417_null_3"],
["epi_isl_488992_Scotland_20200403_null_3"],
["epi_isl_441093_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_475607_California_20200328_null_3"],
["epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3"],
["epi_isl_475923_Innsbruck_20200401_null_2"],
["Node131"],
["epi_isl_475918_Innsbruck_20200319_null_5"],
["epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1"],
["epi_isl_487924_Scotland_20200408_null_20"],
["epi_isl_490371_England_20200518_null_9"],
["epi_isl_490405_England_20200627_null_9"],
["epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1"],
["epi_isl_489903_Minnesota_20200705_null_5"],
["Node570"],
["epi_isl_461579_England_20200526_null_9"],
["epi_isl_487912_Scotland_20200410_null_1"],
["Node573"],
["epi_isl_487372_Barishal_20200706_null_2"],
["epi_isl_467850_Massachusetts_20200314_null_1"],
["epi_isl_468095_Oregon_20200423_null_1"],
["Node587"],
["epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1"],
["epi_isl_475666_California_20200401_null_1"],
["epi_isl_458431_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_488446_England_20200413_null_86"],
["Node581"],
["epi_isl_489372_Northern_Ireland_20200424_null_30"],
["epi_isl_492080_North_Macedonia_20200626_null_2"],
["Node584"],
["epi_isl_484494_England_20200619_null_2"],
["epi_isl_484551_Scotland_20200410_null_1"],
["Node598"],
["epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3"],
["epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24"],
["Node592"],
["epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2"],
["epi_isl_485902_Louisiana_20200410_null_13"],
["Node595"],
["epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1"],
["epi_isl_488250_England_20200326_null_10"],
["Node616"],
["epi_isl_464846_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_472236_England_20200330_null_3"],
["Node613"],
["epi_isl_440617_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1"],
["Node607"],
["epi_isl_484513_England_20200608_null_2"],
["epi_isl_491720_England_20200630_null_31"],
["Node610"],
["epi_isl_440086_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1"],
["Node629"],
["epi_isl_490656_Scotland_20200409_null_2"],
["epi_isl_441893_England_20200430_null_1"],
["epi_isl_475759_Rangpur_20200607_null_11"],
["Node621"],
["epi_isl_458750_England_20200418_null_4"],
["epi_isl_464058_Ontario_20200415_null_1"],
["Node626"],
["epi_isl_474647_Wales_20200430_null_1"],
["epi_isl_444410_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_484671_Scotland_20200601_null_9"],
["Node651"],
["epi_isl_440722_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_492002_Muscat_20200527_null_27"],
["Node648"],
["epi_isl_488790_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_490295_GP_20200615_null_5"],
["Node638"],
["epi_isl_478091_Scotland_20200522_null_4"],
["epi_isl_490659_Scotland_20200409_null_16"],
["Node645"],
["epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1"],
["epi_isl_491059_Suceava_20200416_null_5"],
["Node641"],
["epi_isl_471721_Michigan_20200427_null_1"],
["epi_isl_487246_Utah_20200512_null_5"],
["epi_isl_468091_Oregon_20200422_null_1"],
["epi_isl_478719_England_20200617_null_5"],
["Node668"],
["epi_isl_442599_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_480995_Catalunya_20200404_null_1"],
["Node665"],
["epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8"],
["epi_isl_489543_Scotland_20200327_null_53"],
["Node657"],
["epi_isl_478576_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1"],
["epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5"],
["Node660"],
["epi_isl_479874_Hokkaido_20200312_null_4"],
["epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2"],
["epi_isl_480221_Kanto_20200401_null_63"],
["Node678"],
["epi_isl_478475_England_20200323_null_4"],
["epi_isl_467300_Sarajevo_20200408_null_1"],
["epi_isl_487459_Bamako_20200412_null_29"],
["Node683"],
["epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1"],
["epi_isl_468210_Basel_Stadt_20200417_null_1"],
["Node69"],
["epi_isl_489942_Wisconsin_20200704_null_5"],
["epi_isl_483542_Bahrain_20200311_null_4"],
["epi_isl_473234_Wales_20200521_null_4"],
["epi_isl_487110_Osun_State_20200511_null_302"],
["Node695"],
["epi_isl_484426_England_20200412_null_13"],
["epi_isl_481090_Madrid_20200412_null_1"],
["epi_isl_490809_Wales_20200619_null_40"],
["Node700"],
["epi_isl_482361_Oregon_20200420_null_2"],
["epi_isl_468122_Oregon_20200506_null_1"],
["epi_isl_489282_Northern_Ireland_20200505_null_42"],
["Node706"],
["epi_isl_478906_England_20200421_null_10"],
["epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2"],
["epi_isl_482384_Oregon_20200427_null_1"],
["Node711"],
["epi_isl_465973_England_20200331_null_4"],
["epi_isl_442367_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_488438_England_20200422_null_68"],
["Node724"],
["epi_isl_463259_British_Columbia_20200301_null_3"],
["epi_isl_475418_England_20200523_null_3"],
["epi_isl_490645_England_20200507_null_154"],
["Node718"],
["epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1"],
["epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2"],
["epi_isl_487465_Bamako_20200414_null_87"],
["epi_isl_487973_Scotland_20200412_null_1"],
["Node730"],
["epi_isl_486431_Latvia_20200316_null_1"],
["epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1"],
["epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2"],
["epi_isl_488447_England_20200310_null_65"],
["Node735"],
["epi_isl_475514_Uppsala_20200504_null_21"],
["epi_isl_449538_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_490442_England_20200607_null_12"],
["epi_isl_490709_Scotland_20200703_null_12"],
["Node752"],
["epi_isl_470026_Northern_Ireland_20200407_null_2"],
["epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1"],
["epi_isl_489375_Northern_Ireland_20200417_null_107"],
["Node744"],
["epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1"],
["epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5"],
["Node749"],
["epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1"],
["epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_491992_Muscat_20200521_null_6"],
["Node758"],
["epi_isl_483073_South_Australia_20200303_null_3"],
["epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_478034_Scotland_20200420_null_1"],
["epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1"],
["epi_isl_463666_Washington_20200505_null_3"],
["Node763"],
["epi_isl_475507_England_20200523_null_1"],
["epi_isl_432822_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_490367_England_20200615_null_7"],
["Node768"],
["epi_isl_467653_New_Mexico_20200403_null_1"],
["epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1"],
["epi_isl_456685_England_20200101_null_4"],
["Node778"],
["epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1"],
["epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1"],
["epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2"],
["Node783"],
["epi_isl_477685_Washington_20200317_null_24"],
["epi_isl_490222_California_20200401_null_1"],
["Node786"],
["epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1"],
["epi_isl_477169_Tbilisi_20200501_null_1"],
["epi_isl_449373_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_490309_GP_20200618_null_20"],
["Node797"],
["epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1"],
["epi_isl_474128_Wales_20200511_null_1"],
["Node791"],
["epi_isl_443052_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_453430_England_20200405_null_20"],
["Node794"],
["epi_isl_477239_Karnataka_20200617_null_1"],
["epi_isl_487252_Utah_20200513_null_2"],
["Node812"],
["epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1"],
["epi_isl_489744_Florida_20200421_null_21"],
["Node806"],
["epi_isl_472829_Wales_20200517_null_1"],
["epi_isl_485325_Louisiana_20200410_null_13"],
["Node809"],
["epi_isl_488135_England_20200505_null_3"],
["epi_isl_487384_Barishal_20200706_null_8"],
["epi_isl_490621_England_20200419_null_17"],
["epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3"],
["epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1"],
["Node819"],
["epi_isl_489341_Northern_Ireland_20200417_null_24"],
["Node818"],
["epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1"],
["epi_isl_490045_New_South_Wales_20200705_null_31"],
["Node823"],
["epi_isl_467570_New_Mexico_20200403_null_2"],
["epi_isl_485816_Virginia_20200524_null_3"],
["epi_isl_490622_England_20200426_null_6"],
["epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2"],
["epi_isl_469041_Gujarat_20200608_null_1"],
["Node840"],
["epi_isl_488348_England_20200423_null_15"],
["Node839"],
["epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1"],
["epi_isl_481625_Uusimaa_20200428_null_22"],
["Node833"],
["epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_481275_Maryland_20200406_null_11"],
["Node836"],
["epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_448342_England_20200423_null_1"],
["epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_479662_South_Korea_20200311_null_1"],
["Node848"],
["epi_isl_487873_Scotland_20200427_null_1"],
["epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_485603_Vienna_20200414_null_1"],
["epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_478103_Scotland_20200526_null_1"],
["epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3"],
["epi_isl_467089_Canary_Islands_20200318_null_4"],
["epi_isl_472313_England_20200505_null_3"],
["epi_isl_448409_England_20200429_null_6"],
["epi_isl_487386_Barishal_20200706_null_3"],
["epi_isl_491461_Lambayeque_20200401_null_3"],
["epi_isl_492077_North_Macedonia_20200627_null_4"],
["epi_isl_449717_England_20200415_null_2"],
["epi_isl_482348_Oregon_20200416_null_1"],
["epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2"],
["epi_isl_489569_England_20200421_null_4"],
["epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1"],
["epi_isl_478724_England_20200406_null_38"],
["epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_480882_Florida_20200423_null_1"],
["epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1"],
["epi_isl_442426_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_458337_England_20200501_null_3"],
["epi_isl_468817_Aragon_20200323_null_2"],
["epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_464093_Taoyuan_20200402_null_1"],
["epi_isl_487589_England_20200420_null_22"],
["epi_isl_489986_Vaud_20200630_null_15"],
["epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1"],
["epi_isl_479116_England_20200422_null_5"],
["epi_isl_444848_Denmark_20200331_null_2"],
["epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5"],
["epi_isl_490581_England_20200503_null_11"],
["epi_isl_453410_England_20200409_null_5"],
["epi_isl_473490_England_20200604_null_1"],
["Node913"],
["epi_isl_490247_England_20200528_null_6"],
["epi_isl_438405_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1"],
["epi_isl_488367_England_20200310_null_44"],
["Node920"],
["epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1"],
["epi_isl_459207_England_20200507_null_10"],
["epi_isl_491412_Wisconsin_20200629_null_60"],
["Node923"],
["epi_isl_476096_Zurich_20200527_null_3"],
["epi_isl_438715_England_20200425_null_3"],
["epi_isl_475704_California_20200326_null_2"],
["epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1"],
["epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1"],
["epi_isl_469188_Connecticut_20200401_null_1"],
["Node933"],
["epi_isl_478799_England_20200416_null_5"],
["epi_isl_476019_Missouri_20200619_null_2"],
["epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1"],
["epi_isl_473433_England_20200526_null_1"],
["epi_isl_449465_England_20200402_null_3"],
["epi_isl_491334_Wisconsin_20200627_null_30"],
["epi_isl_476023_MP_20200331_null_1"],
["epi_isl_490311_GP_20200619_null_1"],
["epi_isl_490344_England_20200608_null_9"],
["epi_isl_475032_Gujarat_20200611_null_1"],
["epi_isl_482191_England_20200420_null_12"],
["epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_477908_Scotland_20200413_null_3"],
["epi_isl_453245_England_20200405_null_3"],
["epi_isl_469183_Connecticut_20200401_null_3"],
["epi_isl_483525_California_20200617_null_3"],
["epi_isl_486427_Brazil_20200313_null_2"],
["epi_isl_483236_California_20200516_null_3"],
["epi_isl_488869_England_20200528_null_5"],
["epi_isl_479180_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_448292_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1"],
["epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1"],
["epi_isl_469307_England_20200418_null_2"],
["epi_isl_482005_England_20200602_null_5"],
["epi_isl_487449_Bamako_20200406_null_1"],
["epi_isl_489572_England_20200423_null_19"],
["epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_442943_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4"],
["epi_isl_467695_England_20200520_null_1"],
["epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1"],
["epi_isl_468076_Dhaka_20200516_null_2"],
["epi_isl_489353_Northern_Ireland_20200504_null_3"],
["epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_448295_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_489116_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1"],
["epi_isl_478960_England_20200418_null_2"],
["epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2"],
["epi_isl_467664_New_Mexico_20200404_null_2"],
["epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1"],
["epi_isl_480432_Montevideo_20200507_null_17"]
],
"RESOLVED": [
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162250502094417],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162878788909532],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878782990243],
[228.8042866578186, 617.2210313971323, 0, 2, 0.2704461459662338, 0, 0.003240330284068302, 0.004777135960704524, 0.5322488259355219, 1, 0.002328503947286449],
[229.1072461114427, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001162802389480542],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250504424656],
[227.463592184066, 612.4822043632513, 0, 1, 0.2708074653377375, 0, 0.001632700497869354, 0.002407048534459663, 0.7291925346622625, 1, 0.00116357509325093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163524932714491],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 0, 1, 0.2712096470004069, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194026, 0.7287903529995932, 1, 0.001163705374927972],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162226005470314],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.001162250500989759],
[229.522699958073, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2713930893654866, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7286069106345134, 1, 0.00116309188963648],
[229.4846168193512, 616.5407012355997, 0, 1, 0.2712502946684224, 0, 0.001621952935136181, 0.002391203677941485, 0.7287497053315777, 1, 0.001162011029137531],
[229.2894322089835, 616.7995821329553, 0, 1, 0.2709991836820119, 0, 0.001621272174896583, 0.002390200050552886, 0.7290008163179881, 1, 0.001162226005470314],
[229.3023247189013, 616.8295802162204, 1, 0, 0.2710006836776629, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710006836776629, 0.001162708431981483],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163024514237454],
[229.5480488451535, 616.3771420754913, 1, 0, 0.2713573863373542, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713573863373542, 0.001162275074734408],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162226005470314],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162912494443817],
[228.8931735736104, 617.0955135668897, 0, 1, 0.2705629248392021, 0, 0.001620494685206629, 0.002389053817412635, 0.7294370751607979, 1, 0.001165171661495114],
[228.9906122368979, 616.9564193434156, 0, 1, 0.2706914306550856, 0, 0.001620860029407314, 0.002389592435012115, 0.7293085693449144, 1, 0.001162275070624034],
[229.0035047468157, 616.9018712733111, 1, 0, 0.270720001596688, 0.004366745395908205, 0, -0.006437780915297054, 1, 0.270720001596688, 0.001162855187628393],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162940518195471],
[230.3215199301586, 615.6255116501549, 0, 1, 0.2722647061009187, 0, 0.001624364132213345, 0.002394758444047366, 0.7277352938990813, 1, 0.001163024556122287],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163162713231741],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001162912502445591],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.2716450360548079, 0.004351446728635407, 0, -0.006415226481898994, 1, 0.2716450360548079, 0.001162299598481902],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162221161907544],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250492990255],
[230.082098505246, 616.2803869216979, 0, 1, 0.2718481767173105, 0, 0.001622638041419702, 0.002392213712591349, 0.7281518232826895, 1, 0.001165494308531582],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.00116294052056464],
[229.4060660835283, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2711232902878403, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7288767097121598, 1, 0.001162684845989538],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162250497474379],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.00116309550783279],
[229.522699958073, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2713930893654866, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7286069106345134, 1, 0.001163522868077797],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162912496031231],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116306391909228],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162299601579473],
[229.3931735736104, 616.5320173470343, 0, 1, 0.2711743024509712, 0, 0.001621975780435615, 0.002391237358181427, 0.7288256975490288, 1, 0.00116222602215137],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162708450371441],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163614884833542],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163947850830472],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878783922663],
[229.4757577880627, 616.3929873176133, 0, 1, 0.2712900306529163, 0, 0.001622341623891192, 0.002391776711819611, 0.7287099693470837, 1, 0.00116517171565962],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902381585205],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162226005470314],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162878783922663],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171720575741],
[229.3023247189013, 616.6447068614121, 1, 0, 0.2710599081960743, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162011019141942],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250482527559],
[229.3931735736104, 616.5955135668897, 0, 1, 0.2711539492909475, 0, 0.001621808751437692, 0.002390991111607003, 0.7288460507090525, 1, 0.001162804318798384],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.2716450360548079, 0.004351446728635407, 0, -0.006415226481898994, 1, 0.2716450360548079, 0.001162055487038551],
[229.4271160170424, 616.5199155632711, 0, 1, 0.2712074248767676, 0, 0.001622007618499023, 0.002391284296223014, 0.7287925751232325, 1, 0.001162684802455385],
[229.4846168193512, 616.4624147609622, 0, 1, 0.2712753969839589, 0, 0.001622158911971555, 0.002391507344315304, 0.728724603016041, 1, 0.001162708405955713],
[229.4060660835283, 616.298555290484, 1, 0, 0.271260272541509, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.271260272541509, 0.001165171721685136],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001162902385915667],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162250501121763],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.001163514623049198],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.00116309914124935],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001162855164909738],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162708441155084],
[228.9906122368979, 616.9564193434156, 1, 0, 0.2706914306550856, 0.004366991250128058, 0, -0.006438143371877646, 1, 0.2706914306550856, 0.001163024551410683],
[229.6263995138441, 616.3206320664694, 0, 1, 0.2714429993150742, 0, 0.001622532084715527, 0.002392057503335682, 0.7285570006849258, 1, 0.001162034624879122],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250501121763],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163095557351927],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163522865427762],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001163162713231741],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001162878783922663],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171725613365],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162925970966648],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001162682700044675],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162888901205028],
[229.3023247189013, 616.7229933360497, 1, 0, 0.2710348258206708, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710348258206708, 0.001162708390267054],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162855164909738],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.00116270843542647],
[229.4060660835283, 616.2037981247922, 0, 1, 0.2712906693659535, 0, 0.001622839721279164, 0.002392511044043616, 0.7287093306340465, 1, 0.00116302448424702],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162275119197415],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116291249469699],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001163242602878548],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.001162940542803645],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162225979702757],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708444906376],
[229.1795371685334, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709281010209356, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290718989790644, 1, 0.001163091863473339],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116227510871249],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162684802455385],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250514190548],
[229.8215199301586, 616.1255116501549, 1, 0, 0.271673652546341, 0.004351202621512093, 0, -0.006414866601018091, 1, 0.271673652546341, 0.001163947495114931],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163613666396754],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162925979697191],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162221189201936],
[228.9060660835283, 617.0409654967852, 0, 1, 0.2705914880461356, 0, 0.001620637941266818, 0.002389265016153727, 0.7294085119538645, 1, 0.00116291249469699],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001162593712541313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162833910802337],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001161527324851597],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162262087690986],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162855154874237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001164004054773627],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163097770953393],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250501121763],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116270843542647],
[229.4401157436208, 616.5852023113302, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211685, 0.002391031096543877, 0.7288023055017863, 1, 0.001163091875225224],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162275086140076],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162684784065429],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163091899710135],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162011031775572],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.00116222602398731],
[229.9695623033838, 616.4563121267552, 0, 1, 0.2716948633667562, 0, 0.001622174970599346, 0.002391531019139032, 0.7283051366332438, 1, 0.001162250510016],
[229.4060660835283, 616.7833757030864, 0, 1, 0.2711048551955084, 0, 0.001621314774997098, 0.002390262854790188, 0.7288951448044916, 1, 0.001163515035577979],
[229.2492288730679, 616.6978027072456, 0, 1, 0.2709971432192479, 0, 0.001621539748658247, 0.002390594527697783, 0.7290028567807521, 1, 0.001163099993065851],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250495626295],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001162925988528522],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163063911114065],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116285514656358],
[229.5098074481552, 616.4372241321583, 1, 0, 0.2713051750053522, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053522, 0.001162912502495273],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162968559760214],
[229.4401157436208, 616.5852023113302, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211685, 0.002391031096543877, 0.7288023055017863, 1, 0.001163091895150804],
[228.9060660835283, 617.0409654967852, 0, 1, 0.2705914880461356, 0, 0.001620637941266818, 0.002389265016153727, 0.7294085119538645, 1, 0.001162912484128694],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 1, 0, 0.2712096470004069, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2712096470004068, 0.001163947844253564],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163614884894196],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162708380408153],
[229.3720164234358, 616.4967286822402, 0, 1, 0.271167385898364, 0, 0.001622068623360738, 0.002391374234128452, 0.7288326141016359, 1, 0.001162827636583558],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162020644141602],
[227.1408596387799, 612.9311386220936, 0, 1, 0.2703826101917567, 0, 0.001631504645445263, 0.002405285519853742, 0.7296173898082432, 1, 0.001163579806287508],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163456413536256],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.001162479013140761],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162888657983797],
[227.6068099786874, 612.095285258672, 0, 1, 0.2710566179001251, 0, 0.001633732564330077, 0.002408570083613957, 0.7289433820998749, 1, 0.001162039938918584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.3768417651215, 0, 1, 0.2712351644313197, 0, 0.001622384119974876, 0.002391839362707562, 0.7287648355686802, 1, 0.001162093559198631],
[229.4060660835283, 616.2037981247922, 0, 1, 0.2712906693659535, 0, 0.001622839721279164, 0.002392511044043616, 0.7287093306340465, 1, 0.001162517678952679],
[229.6072461114426, 616.113256553876, 0, 1, 0.2714930587443808, 0, 0.001623078207395388, 0.002392862638017707, 0.7285069412556192, 1, 0.001163455031545899],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001163857146355408],
[227.322844455437, 612.7074982452498, 0, 1, 0.2706126587339654, 0, 0.001632100150339155, 0.002406163457469354, 0.7293873412660346, 1, 0.001164127526809835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163415538931096],
[227.4838734028031, 612.5464692978837, 1, 0, 0.2708043529373539, 0.004395916005128466, 0, -0.006480786397481052, 1, 0.2708043529373538, 0.001162279586499284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3023247189013, 616.6447068614121, 1, 0, 0.2710599081960743, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162829074493766],
[227.8122889601682, 612.2180537405187, 0, 1, 0.2711953097167354, 0, 0.001633404950883461, 0.002408087091499006, 0.7288046902832646, 1, 0.001163476859694412],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5518176017414, 612.5201806591322, 0, 1, 0.2708718039320698, 0, 0.00163259927031939, 0.002406899297274946, 0.7291281960679302, 1, 0.001164365193024379],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001163031421124162],
[227.4964788054822, 612.6171750155779, 1, 0, 0.2707925026224342, 0.004395672430846882, 0, -0.006480427302155067, 1, 0.2707925026224343, 0.001163371792259459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163880428825642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163142965169624],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.0469752987593, 612.0250229621142, 0, 1, 0.2714612268601557, 0, 0.001633920121697217, 0.002408846594637437, 0.7285387731398443, 1, 0.001162644245985743],
[229.6325949985231, 616.3144365817903, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162079852402802],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116413941087543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163611011923054],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[226.9962775245984, 612.6226629062854, 0, 1, 0.2703563087894447, 0, 0.001632326161843237, 0.002406496660442208, 0.7296436912105553, 1, 0.001163463285608498],
[229.1072461114427, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001163610512569372],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163750536112662],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163605504755672],
[227.4248251620304, 612.6471730988432, 0, 1, 0.270720635413212, 0, 0.00163226085732491, 0.00240640038366313, 0.729279364586788, 1, 0.00116382378015248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162849700351594],
[227.8778829920201, 612.1941152688535, 0, 1, 0.2712599437474115, 0, 0.001633468821504167, 0.00240818125431954, 0.7287400562525885, 1, 0.001162906136609],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162155689206982],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164065673747403],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163555431322983],
[226.6743241406008, 613.8507319502625, 0, 1, 0.2696818167382468, 0, 0.001629060532066003, 0.002401682226086589, 0.7303181832617531, 1, 0.001163452391133335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.9462694194438, 617.2272910758645, 0, 1, 0.270566559992054, 0, 0.00162014871095045, 0.002388543756426322, 0.729433440007946, 1, 0.001165494667382368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164046845027386],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163308177180901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164137981327308],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163144025395477],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.1150746189443, 613.0402347623026, 0, 1, 0.2703251078496531, 0, 0.001631214304209144, 0.002404857477204276, 0.7296748921503469, 1, 0.00116334517308493],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.001163255481788914],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163917161533048],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163301826084635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.7510189404155, 612.320979320458, 0, 1, 0.2711089280584381, 0, 0.001633130390387376, 0.002407682313990466, 0.728891071941562, 1, 0.001162562989097011],
[229.4846168193512, 616.4624147609622, 0, 1, 0.271275396983959, 0, 0.001622158911971555, 0.002391507344315304, 0.728724603016041, 1, 0.001162114509166241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.0469752987593, 612.1083340824875, 0, 1, 0.2714343083384311, 0, 0.001633697736690578, 0.002408518738116896, 0.7285656916615689, 1, 0.00116317231396862],
[229.6325949985231, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714369571237377, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285630428762624, 1, 0.001168351192492145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8778829920201, 612.1941152688535, 0, 1, 0.2712599437474115, 0, 0.001633468821504167, 0.00240818125431954, 0.7287400562525885, 1, 0.001162670638140968],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162256349970472],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.001163214101060436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.354496043857, 612.7591577772032, 1, 0, 0.2706234983919001, 0.004398417525937551, 0, -0.006484474325551931, 1, 0.2706234983919, 0.001163450702063372],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163556375000131],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162883675955283],
[228.8426770803333, 617.1876656203535, 0, 1, 0.2704899168862251, 0, 0.001620252729767162, 0.002388697108704127, 0.7295100831137749, 1, 0.001163477985425033],
[229.2512980286457, 617.1944985186715, 0, 1, 0.270839903705317, 0, 0.001620234792111887, 0.002388670663678296, 0.729160096294683, 1, 0.00116288231290776],
[228.9061733001888, 617.124169400498, 0, 1, 0.2705649688278053, 0, 0.001620419438395104, 0.002388942882965294, 0.7294350311721947, 1, 0.001163506499599876],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162967676261163],
[228.5840604441633, 617.4462822565235, 0, 1, 0.2701842344264868, 0, 0.001619574088850925, 0.002387696605779688, 0.7298157655735132, 1, 0.00116359010027995],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 0, 1, 0.2705898496535296, 0, 0.001620474712336148, 0.002389024371921141, 0.7294101503464705, 1, 0.001163989853317],
[228.7852404720777, 617.2451022286091, 1, 0, 0.2704220273492231, 0.004370911331240557, 0, -0.006443922647077915, 1, 0.270422027349223, 0.00116395366087686],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 0, 1, 0.2705898496535296, 0, 0.001620474712336148, 0.002389024371921141, 0.7294101503464705, 1, 0.001163407975941838],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.0692059953282, 616.9611367053586, 1, 0, 0.2707576719578361, 0.004365492933259632, 0, -0.006435934441686832, 1, 0.2707576719578361, 0.001162883675955283],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162857772964331],
[228.9272232337029, 617.287992821792, 0, 1, 0.2705307336599462, 0, 0.001619989391707956, 0.002388308876146898, 0.7294692663400537, 1, 0.001162857772964331],
[228.7852404720777, 617.2451022286091, 1, 0, 0.2704220273492231, 0.004370911331240557, 0, -0.006443922647077915, 1, 0.270422027349223, 0.001163449942910524],
[229.1120965885111, 616.9182461121757, 0, 1, 0.2708083682402483, 0, 0.001620960323838708, 0.002389740296524018, 0.7291916317597517, 1, 0.001162883669540925],
[228.8426770803333, 617.1876656203535, 0, 1, 0.2704899168862251, 0, 0.001620252729767162, 0.002388697108704127, 0.7295100831137749, 1, 0.001163477963577921],
[229.1120965885111, 616.9182461121758, 0, 1, 0.2708083682402483, 0, 0.001620960323838708, 0.002389740296524018, 0.7291916317597518, 1, 0.001162882278263817],
[229.0692059953282, 616.9611367053587, 1, 0, 0.270757671957836, 0.004365492933259632, 0, -0.006435934441686832, 1, 0.270757671957836, 0.001162939670764562],
[228.6671532606696, 614.5353837717555, 0, 2, 0.2711888819327358, 0, 0.003254491202320776, 0.004798013039856948, 0.5311656458184558, 1, 0.002333709580127572],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 9.096843351111913e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.493986777940317e-05],
[228.5222638253178, 614.5080788753691, 1, 0, 0.2710724065912457, 0.004375941246426646, 0, -0.006451338122232686, 1, 0.2710724065912458, 0.001162826217009187],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.713441706529938e-05],
[228.1537521486978, 614.876590551989, 0, 1, 0.270635279173697, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.729364720826303, 1, 0.001163440806249086],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.438254085741196e-05],
[228.2636471891478, 614.9086782731642, 0, 1, 0.2707200417945296, 0, 0.001626257744171509, 0.00239755014766642, 0.7292799582054704, 1, 0.001162709203779867],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.48229409500197e-05],
[228.1537521486977, 614.876590551989, 0, 1, 0.2706352791736969, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.7293647208263031, 1, 0.001166328401344039],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.44004960550572e-05],
[228.8802810636926, 614.1500616369942, 0, 1, 0.2714970855384208, 0, 0.001628266546671895, 0.002400511673752119, 0.7285029144615791, 1, 0.001162956361743167],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.461951764837481e-05],
[228.2382983020674, 614.7920443986194, 1, 0, 0.2707355675608251, 0.004381385628263519, 0, -0.00645936463495721, 1, 0.2707355675608252, 0.001164006317517622],
[228.581461091607, 614.222352694085, 0, 1, 0.2712155039556224, 0, 0.001628074907423717, 0.002400229144915952, 0.7287844960443777, 1, 0.001164553032595859],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.401547307074554e-05],
[228.3386255035059, 614.6917171971809, 0, 1, 0.2708545753786424, 0, 0.001626831746748948, 0.002398396384967508, 0.7291454246213576, 1, 0.001165698120817544],
[228.7828424004052, 614.2891558604683, 1, 0, 0.2713680953374666, 0.004370957146558422, 0, -0.006443990191427823, 1, 0.2713680953374666, 0.001163331277703475],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.385818334140027e-05],
[228.3802810636926, 614.6711115705084, 0, 1, 0.2708972229440187, 0, 0.001626886283048119, 0.002398476786436832, 0.7291027770559813, 1, 0.001162958031778573],
[228.3802810636926, 614.4235327219994, 0, 1, 0.2709768006837296, 0, 0.001627541828630541, 0.002399443240502044, 0.7290231993162704, 1, 0.001165698239878392],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.38601343998061e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 1, 0, 0.2709039870760355, 0.004378661744973996, 0, -0.006455348883575593, 1, 0.2709039870760355, 0.001165698242553617],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 1, 0.2709039870760355, 0, 0.001626941999056675, 0.002398558927121493, 0.7290960129239645, 1, 0.001162958031778573],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.529051381542651e-05],
[228.3802810636926, 614.6084060768076, 0, 1, 0.2709173735633165, 0, 0.001627052266309273, 0.002398721491308318, 0.7290826264366835, 1, 0.001163045332107043],
[228.8802810636926, 614.1500616369942, 0, 1, 0.2714970855384208, 0, 0.001628266546671895, 0.002400511673752119, 0.7285029144615791, 1, 0.001163331233105757],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 1.388181548452466e-05],
[228.6068099786874, 614.4235327219994, 0, 1, 0.271172694978374, 0, 0.001627541828630541, 0.002399443240502044, 0.7288273050216261, 1, 0.001163199396394909],
[228.1954077088844, 614.8349349918024, 0, 1, 0.27068469087109, 0, 0.001626452797470484, 0.002397837709750252, 0.72931530912891, 1, 0.001163618231348626],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.790124795287304e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 1, 0.2709039870760355, 0, 0.001626941999056675, 0.002398558927121493, 0.7290960129239645, 1, 0.00116398956206817],
[228.5222638253178, 614.5080788753689, 1, 0, 0.2710724065912458, 0.004375941246426646, 0, -0.006451338122232686, 1, 0.2710724065912458, 0.001163331233980401],
[228.2320386233352, 614.876590551989, 0, 1, 0.2707030040086025, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.7292969959913975, 1, 0.001165698283674208],
[228.3017303278697, 614.7286123728172, 0, 1, 0.2708108104347638, 0, 0.001626734106519066, 0.002398252436476925, 0.7291891895652363, 1, 0.001163618631908142],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 0, 0.2709039870760355, 0, 0, 0, 1, 1, 2.952865790569179e-05],
[228.3802810636926, 614.6500616369942, 0, 1, 0.2709039870760355, 0, 0.001626941999056675, 0.002398558927121493, 0.7290960129239645, 1, 0.001163540971863762],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.0007499328340762561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.8297845704155, 617.242213690458, 1, 1, 0.2704613614926177, 0.00437006048787447, 0.001620109541797301, -0.004054182260144491, 0.9268506519395595, 0.467773374924795, 0.002313633635784218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1537521486977, 616.876590551989, 0, 1, 0.2708576047251405, 0, 0.001621069781729255, 0.002389901667489098, 0.7291423952748595, 1, 0.001162857786554716],
[226.4302473599913, 612.852498767808, 0, 1, 0.2697901850177106, 0, 0.001631713996451976, 0.002405594160681962, 0.7302098149822893, 1, 0.001162947851021187],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.575265606928, 617.0396232471284, 0, 1, 0.2703065764566706, 0, 0.001620641466649369, 0.002389270213534945, 0.7296934235433294, 1, 0.001163485670603939],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001162883688210423],
[228.5840604441633, 617.4462822565235, 0, 1, 0.2701842344264868, 0, 0.001619574088850925, 0.002387696605779688, 0.7298157655735132, 1, 0.001163450442610186],
[229.4272232337029, 616.6031194669839, 0, 1, 0.2711808450053084, 0, 0.001621788746162101, 0.002390961618341486, 0.7288191549946916, 1, 0.001162857772964331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6507166633862, 612.462937157674, 0, 1, 0.2709760942795897, 0, 0.001632751860285315, 0.002407124256754246, 0.7290239057204102, 1, 0.001162835273393023],
[229.1537521486978, 616.876590551989, 0, 1, 0.2708576047251405, 0, 0.001621069781729255, 0.002389901667489098, 0.7291423952748595, 1, 0.001163275429746019],
[229.1537521486978, 616.876590551989, 0, 1, 0.2708576047251405, 0, 0.001621069781729255, 0.002389901667489098, 0.7291423952748595, 1, 0.001163424235681879],
[228.9272232337029, 617.1447750271706, 0, 1, 0.2705765274164252, 0, 0.001620365334788703, 0.002388863119403841, 0.7294234725835748, 1, 0.001163989731285566],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163618631908142],
[228.6878018087903, 617.3841964520832, 0, 1, 0.2702935474508847, 0, 0.001619736957548787, 0.002387936718930269, 0.7297064525491153, 1, 0.001164056762602736],
[227.2125132822317, 612.9011405388285, 1, 1, 0.2704544941613659, 0.004401166051791573, 0.001631584498473695, -0.004083123161706636, 0.9268543665879196, 0.4677633549106516, 0.002329386876322692],
[227.3885457039495, 613.1405619637411, 0, 1, 0.2705302453295279, 0, 0.00163094739124295, 0.002404463974253218, 0.7294697546704721, 1, 0.001164224700902715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163867927799239],
[226.8440016056117, 613.2696522154486, 0, 1, 0.2700158491340604, 0, 0.001630604084822199, 0.00240395784638836, 0.7299841508659396, 1, 0.00116433128877068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.0705305206065, 612.8007130941527, 1, 0, 0.2703635018426248, 0.004403918014844514, 0, -0.00649258355549312, 1, 0.2703635018426247, 0.001164624997108043],
[227.0705305206065, 613.0431233004538, 0, 1, 0.2702854899308318, 0, 0.001631206618249427, 0.002404846145990684, 0.7297145100691682, 1, 0.001164269889204738],
[226.9285477589812, 613.0431233004538, 1, 0, 0.2701621442456053, 0.004406673421548051, 0, -0.006496645781036777, 1, 0.2701621442456053, 0.001164269934047486],
[226.973091857319, 613.1822175239279, 0, 1, 0.2701561119984815, 0, 0.001630836595421943, 0.002404300630811523, 0.7298438880015186, 1, 0.001168870219989064],
[228.7852404720777, 617.2451022286091, 1, 0, 0.2704220273492231, 0.004370911331240557, 0, -0.006443922647077915, 1, 0.270422027349223, 0.001163705480917036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.2125132822317, 611.9011405388285, 1, 0, 0.2716448092996234, 0.004381880667355407, 0, -0.006460094458413614, 1, 0.2716448092996233, 0.001162867979778848],
[229.4272232337029, 616.6031194669839, 0, 1, 0.2711808450053084, 0, 0.001621788746162101, 0.002390961618341486, 0.7288191549946916, 1, 0.001162699715033078],
[228.7006943187081, 617.3296483819788, 0, 1, 0.2703220945819186, 0, 0.001619880079664083, 0.002388147720199834, 0.7296779054180813, 1, 0.001163921765066247],
[228.7006943187081, 617.1031194669839, 0, 1, 0.270394494079044, 0, 0.001620474712336148, 0.002389024371921141, 0.7296055059209561, 1, 0.001164623773435859],
[227.3755459773711, 612.738107843689, 0, 1, 0.2706485544464213, 0, 0.001632018618066925, 0.002406043256528251, 0.7293514455535788, 1, 0.001162192049787483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001163224335908887],
[228.9482731672171, 617.0820695334697, 0, 1, 0.2706147304792538, 0, 0.001620529990048206, 0.002389105866436499, 0.7293852695207462, 1, 0.001162597858956957],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.00116388270066078],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001164614157663481],
[229.3426770803333, 616.6876656203535, 1, 0, 0.271080912238004, 0.004360287464725649, 0, -0.006428260152726763, 1, 0.271080912238004, 0.00116458638519465],
[228.9272232337029, 617.1031194669839, 1, 0, 0.2705898496535296, 0.004368200451980055, 0, -0.006439926067203282, 1, 0.2705898496535295, 0.001164141027776408],
[229.1666446586156, 616.8220424818846, 0, 1, 0.2708861810353689, 0, 0.001621213139492123, 0.002390113016167845, 0.7291138189646311, 1, 0.001159914118283241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8014001980235, 611.9008513532336, 0, 1, 0.2712883046070028, 0, 0.001634251689286713, 0.002409335416243979, 0.7287116953929972, 1, 0.001163749374624378],
[229.5098074481552, 616.2523507773501, 1, 0, 0.2713644790276383, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713644790276383, 0.001162991360214436],
[227.1408596387799, 612.9311386220936, 0, 1, 0.2703826101917567, 0, 0.001631504645445263, 0.002405285519853742, 0.7296173898082432, 1, 0.001163881425390459],
[227.4840224283196, 612.3614469175591, 1, 0, 0.2708641419539926, 0.00439591312534972, 0, -0.006480782151896991, 1, 0.2708641419539926, 0.001163653079443496],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.2765396990656, 612.8320894762586, 1, 0, 0.2705323238045622, 0.004399926192664183, 0, -0.006486698514273663, 1, 0.2705323238045622, 0.00116290902511994],
[227.5220637581855, 612.1711115705084, 1, 0, 0.2709585720630909, 0.004395178135615092, 0, -0.006479698575352555, 1, 0.2709585720630909, 0.001163730424087708],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162978151212036],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001162855154874237],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708390933838],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165494362234529],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162902386023809],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878794670563],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902399758058],
[229.6325949985231, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714369571237377, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285630428762624, 1, 0.001168205523684174],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162708390933838],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162708394899607],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162818514813722],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162206822158854],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001165931142781222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116360273643904],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116503512504053],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162684797392735],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116291249469699],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162299597668406],
[229.8215199301586, 616.1255116501549, 1, 0, 0.271673652546341, 0.004351202621512093, 0, -0.006414866601018091, 1, 0.271673652546341, 0.001165171660477571],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.00116270843542647],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162275112135123],
[228.9906122368978, 616.9564193434156, 1, 0, 0.2706914306550855, 0.004366991250128059, 0, -0.006438143371877647, 1, 0.2706914306550855, 0.001168205461896278],
[229.3023247189013, 616.8295802162204, 1, 0, 0.2710006836776629, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710006836776629, 0.001162708404811976],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162912502495273],
[228.7529322218511, 610.8243526488461, 0, 1, 0.2724620310053781, 0, 0.00163713184594473, 0.002413581557450979, 0.7275379689946219, 1, 0.001162678147641978],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8658627476127, 615.854639917706, 0, 1, 0.2717988531946217, 0, 0.001623759788728109, 0.002393867475922872, 0.7282011468053783, 1, 0.00116541467817679],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163332897438315],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162878789668831],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162925989366394],
[229.1795371685334, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709281010209356, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290718989790644, 1, 0.001168177394403442],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.001162225987624341],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162878778392717],
[229.4060660835283, 616.298555290484, 0, 1, 0.271260272541509, 0, 0.001622590206346766, 0.002392143190568261, 0.728739727458491, 1, 0.001162244759435255],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162925979697191],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5620154302994, 1, 0, 0.2711757938585754, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711757938585755, 0.001162034587561129],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.00116306393428017],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 2, 0.2711825416007133, 0, 0.003243904479872601, 0.004782405306052207, 0.5311748876675961, 1, 0.002327920833453586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.00116270840686716],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162011030164601],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001163091899710135],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162855149194584],
[229.4060660835283, 616.356092141977, 0, 1, 0.2712418188168237, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961479, 0.7287581811831763, 1, 0.001162912498949736],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001165494287223482],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.00116227507528574],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162708406723757],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162275091241378],
[229.3277796088908, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711150884056373, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288849115943627, 1, 0.001167846951451964],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162855149194584],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162878781868737],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171728423999],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902380355511],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162708398407994],
[229.5643555182597, 616.3826760620537, 1, 0, 0.2713696566668135, 0.004356076960390566, 0, -0.00642205271400648, 1, 0.2713696566668136, 0.001165520656969706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.037118274153, 612.993224426534, 0, 1, 0.2702725208047027, 0, 0.001631339401729143, 0.002405041905274562, 0.7297274791952972, 1, 0.001163595104364055],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162940278491309],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.00116360814930532],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001162855155785126],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162878781996917],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.00116309189610358],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162011030115199],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163779655716799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163377064411992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.8478275017203, 0, 1, 0.2708027282447292, 0, 0.001631726433748667, 0.002405612496669983, 0.7291972717552708, 1, 0.001162511873481214],
[229.4060660835283, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2711232902878403, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7288767097121598, 1, 0.001162936055798832],
[229.4060660835283, 616.3768417651215, 0, 1, 0.2712351644313197, 0, 0.001622384119974876, 0.002391839362707562, 0.7287648355686802, 1, 0.001162708439933345],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.5939174687696, 611.4780807921039, 0, 1, 0.272112292686826, 0, 0.001635381596515459, 0.002411001209537102, 0.727887707313174, 1, 0.001162806663717305],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162471175815309],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 1, 0, 0.2712096470004069, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2712096470004068, 0.001165171649325612],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162275074185467],
[228.2241707591533, 611.8478275017203, 0, 1, 0.2716721557576321, 0, 0.001634393316526385, 0.002409544213656693, 0.728327844242368, 1, 0.001163989989742543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163376996068309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164227596124811],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163578704466825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.2662706261815, 612.8057276346919, 0, 1, 0.2705318961906488, 0, 0.001631838533656989, 0.002405777762694212, 0.7294681038093511, 1, 0.001163627498169742],
[229.2422426622342, 616.7047889180792, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173444, 0, -0.006431076468604374, 1, 0.2709888847697555, 0.001163594566494112],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163904341641091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163377051221323],
[227.1408596387799, 612.9311386220936, 0, 1, 0.2703826101917567, 0, 0.001631504645445263, 0.002405285519853742, 0.7296173898082432, 1, 0.001164171912152511],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162830056926202],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164042234898409],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163605063978963],
[227.7504904180445, 611.9932603795016, 0, 1, 0.2712142724512551, 0, 0.001634004922505016, 0.00240897161429683, 0.7287857275487449, 1, 0.001162611414636942],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4843525581657, 616.298555290484, 0, 1, 0.2713277253874599, 0, 0.001622590206346766, 0.002392143190568261, 0.7286722746125401, 1, 0.001162954895635841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164077057727283],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163377009158606],
[227.5939174687696, 612.8478275017203, 0, 1, 0.2708027282447292, 0, 0.001631726433748667, 0.002405612496669983, 0.7291972717552708, 1, 0.001162227001135313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2711232902878403, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7288767097121598, 1, 0.001162936256530352],
[227.5939174687696, 612.3089884853647, 0, 1, 0.2709764615116097, 0, 0.001633162371948263, 0.00240772946358671, 0.7290235384883903, 1, 0.001163437940451888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 0, 1, 0.2712096470004069, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194026, 0.7287903529995932, 1, 0.001163602483818403],
[227.6620167889546, 612.5665544211938, 0, 1, 0.2709524819669746, 0, 0.001632475675961263, 0.002406717085277715, 0.7290475180330254, 1, 0.001163822401377239],
[227.8228874780444, 612.3640281719174, 0, 1, 0.2711573856179401, 0, 0.001633015582226943, 0.002407513055259501, 0.7288426143820599, 1, 0.001163696479428837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4401157436208, 616.5852023113301, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211686, 0.002391031096543878, 0.7288023055017863, 1, 0.001163640364559458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164009217632829],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.00116359241070908],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250503547881],
[227.963664178386, 612.1083340824875, 0, 1, 0.2713620554551502, 0, 0.001633697736690578, 0.002408518738116896, 0.7286379445448499, 1, 0.001161999381000441],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162076569202606],
[227.3099519455191, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2706753884126116, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7293246115873884, 1, 0.001163479832502292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.5409654967852, 1, 0, 0.271060197195689, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.271060197195689, 0.001163602790812115],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163673416239711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163368995570732],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.8132127961918, 615.2587854646818, 0, 1, 0.2702179805119077, 0, 0.001625332337586594, 0.002396185844435727, 0.7297820194880923, 1, 0.001160063276313568],
[227.8677608662963, 615.1625818343905, 0, 1, 0.2702960371940011, 0, 0.001625586518962255, 0.002396560577528887, 0.7297039628059989, 1, 0.001163540884812295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.2422426622342, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173445, 0, -0.006431076468604376, 1, 0.2709888847697555, 0.00115978683070182],
[229.8850161500141, 616.0620154302994, 0, 1, 0.2717487118792367, 0, 0.001623213207361165, 0.002393061665010227, 0.7282512881207633, 1, 0.001168205452983828],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.001162275074816716],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163919481811503],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162861819095502],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116339646938115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163602954764779],
[227.6620167889546, 613.2408891651797, 0, 1, 0.2707352004339156, 0, 0.001630680565611542, 0.002404070600057597, 0.7292647995660844, 1, 0.001163804677891102],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4401157436208, 616.9223696833232, 0, 1, 0.2710896568482483, 0, 0.001620949489176924, 0.0023897243232596, 0.7289103431517517, 1, 0.00116336896787131],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164016873854823],
[227.4073906088066, 612.6229520918803, 1, 0, 0.2707133052809673, 0.004397394461643648, 0, -0.006482966048061656, 1, 0.2707133052809673, 0.001163540881780204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584104, 1, 0, 0.2710147027688186, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.00116312860653033],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164014334566695],
[228.1484655388741, 611.8818771618128, 0, 1, 0.2715955054735043, 0, 0.001634302366722244, 0.002409410128689454, 0.7284044945264957, 1, 0.001163576354396753],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163011100053502],
[226.9962775245984, 612.6226629062854, 0, 1, 0.2703563087894447, 0, 0.001632326161843237, 0.002406496660442208, 0.7296436912105553, 1, 0.001163483216712097],
[227.5474114315145, 612.2147467939909, 2, 0, 0.2709664983146455, 0.008789377068356346, 0, -0.01295795353698325, 0.9999999999999998, 0.07342284320890102, 0.002338228587938702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.1072461114426, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001163328248192564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.2487927403127, 611.7815499603742, 1, 0, 0.27171493830389, 0.004381184180622318, 0, -0.006459067645858379, 1, 0.2717149383038899, 0.0011625784229104],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162472557980473],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163126803697783],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163772458434332],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.00116352988078164],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162975182237806],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001163862274322881],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001163673001762567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162918461350429],
[227.3099519455191, 612.8057276346919, 0, 1, 0.2705698244545339, 0, 0.001631838533656989, 0.002405777762694212, 0.7294301755454662, 1, 0.001164114085031248],
[227.5493733704318, 612.5246506495927, 1, 0, 0.2708682412075246, 0.004394650643014875, 0, -0.006478920906519877, 1, 0.2708682412075246, 0.00116396971025485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2710077058921217, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710077058921216, 0.001162890565568092],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001164073921546616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6913561320571, 612.3608272282986, 1, 0, 0.2710443001543688, 0.004391910246342497, 0, -0.006474880809880786, 1, 0.2710443001543688, 0.001163672967840879],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163005199749278],
[227.3864347395157, 612.6855635213578, 0, 1, 0.2706749364462256, 0, 0.001632158581071481, 0.00240624960040175, 0.7293250635537745, 1, 0.001162678599030116],
[227.5413100110588, 612.4890326896282, 0, 1, 0.2708727273821042, 0, 0.001632682295728124, 0.002407021699508961, 0.7291272726178958, 1, 0.001162020996883456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3023247189013, 616.6447068614121, 1, 0, 0.2710599081960743, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.001162223697880199],
[227.4248251620304, 612.6471730988432, 0, 1, 0.270720635413212, 0, 0.00163226085732491, 0.00240640038366313, 0.729279364586788, 1, 0.001164111025856121],
[227.6642465869431, 612.3660961137439, 0, 1, 0.2710190751622202, 0, 0.001633010067582604, 0.002407504925160568, 0.7289809248377799, 1, 0.001163672906778758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001163273386974499],
[229.3850161500141, 616.5620154302993, 0, 1, 0.271157658324659, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.728842341675341, 1, 0.001163729831901943],
[228.1537521486978, 614.876590551989, 0, 1, 0.270635279173697, 0, 0.001626342611453587, 0.002397675265327141, 0.729364720826303, 1, 0.001163418449385526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6878018087903, 615.3841964520833, 0, 1, 0.2700692257345456, 0, 0.001625001106244471, 0.002395697518550075, 0.7299307742654544, 1, 0.00116071832759543],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001159923079297434],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001162529429393066],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.00116263097454279],
[227.8333388936823, 612.2180537405188, 1, 0, 0.2712135720402191, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.2712135720402191, 0.001162041372197546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162470405909167],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162855159043411],
[227.6360173357978, 612.4359809250757, 0, 1, 0.2709720331198427, 0, 0.001632823725492931, 0.002407230205789539, 0.7290279668801574, 1, 0.001162697150594698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.5322759711709, 612.498066729516, 0, 1, 0.2708619729611879, 0, 0.001632658214481529, 0.002406986197143769, 0.7291380270388121, 1, 0.001162226077233438],
[229.4271160170424, 616.5199155632711, 0, 1, 0.2712074248767676, 0, 0.001622007618499023, 0.002391284296223014, 0.7287925751232325, 1, 0.001162416745024683],
[226.9075918896904, 613.1644063711832, 0, 1, 0.2701049342906763, 0, 0.001630883967838543, 0.002404370470752221, 0.7298950657093237, 1, 0.001164087143885639],
[226.5747222575122, 613.0401665965442, 0, 1, 0.2698555317030543, 0, 0.001631214485588712, 0.002404857744607527, 0.7301444682969457, 1, 0.001166048650531318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001163199900272986],
[227.4901761041426, 612.3710742898049, 0, 1, 0.2708663794137847, 0, 0.001632996792279495, 0.002407485353721144, 0.7291336205862153, 1, 0.001163033527976092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 1, 0, 0.2712096470004069, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2712096470004068, 0.001165862758071767],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162708429562397],
[227.6620167889546, 612.8948018845213, 0, 1, 0.270846671791015, 0, 0.001631601372576848, 0.002405428122186887, 0.729153328208985, 1, 0.001164273009538984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4401157436208, 616.7493260429939, 0, 1, 0.2711450940101415, 0, 0.001621404284972481, 0.002390394817054759, 0.7288549059898586, 1, 0.001163372795409942],
[229.5098074481552, 616.4372241321582, 1, 0, 0.2713051750053523, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053523, 0.001162962093227513],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163091927604242],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001162940546681273],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.001162817773031414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162949831535756],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162768041952534],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116394909252771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163292201174317],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163830714317413],
[227.9075918896904, 612.1644063711832, 0, 1, 0.2712953084515461, 0, 0.001633548095237759, 0.002408298125554965, 0.7287046915484539, 1, 0.0011641037747817],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163437612651033],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163224037189399],
[227.5939174687696, 612.5613919124773, 0, 1, 0.2708950534828932, 0, 0.001632489434043339, 0.002406737368465808, 0.7291049465171068, 1, 0.001164040141937781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5826210569719, 0, 1, 0.2711691888681591, 0, 0.00162184266284664, 0.002391041106328824, 0.7288308111318409, 1, 0.001163190284379422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.8333388936823, 611.2386593671913, 0, 1, 0.2723972937646007, 0, 0.001636022173458873, 0.002411945595721135, 0.7276027062353994, 1, 0.001162313709423474],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.00116207089653752],
[227.8333388936823, 612.1124576536349, 0, 1, 0.2712476683974305, 0, 0.001633686731084065, 0.002408502512833042, 0.7287523316025695, 1, 0.001163035907388621],
[227.5939174687696, 612.3089884853647, 0, 1, 0.2709764615116097, 0, 0.001633162371948263, 0.00240772946358671, 0.7290235384883903, 1, 0.001163999460661471],
[227.8333388936823, 612.0279115002654, 0, 1, 0.2712749740350732, 0, 0.001633912410217857, 0.002408835225800889, 0.7287250259649267, 1, 0.001163753333096561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.4564193434156, 0, 1, 0.2712096470004069, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194026, 0.7287903529995932, 1, 0.001162952027830075],
[227.8359382462386, 612.3509774037232, 1, 1, 0.2711729187903225, 0.004389123189684098, 0.001633050385972847, -0.004063207558088308, 0.9264652481147373, 0.4688110856953821, 0.002327361272987555],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.478357140619, 616.5469609143319, 0, 1, 0.2712428957424108, 0, 0.001621936467770455, 0.002391179400525885, 0.7287571042575891, 1, 0.001162230973970419],
[227.5939174687696, 612.4780807921039, 0, 1, 0.2709219185259562, 0, 0.00163271149019198, 0.002407064740159424, 0.7290780814740438, 1, 0.00116432730219572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116335761341483],
[228.4691261706285, 611.5612165300583, 1, 0, 0.2719772305320581, 0.004376959008689716, 0, -0.006452838583074677, 1, 0.2719772305320581, 0.001163885592669352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163704369459707],
[228.2241707591533, 611.8478275017203, 0, 1, 0.2716721557576321, 0, 0.001634393316526385, 0.002409544213656693, 0.728327844242368, 1, 0.001163688743345823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163458721171916],
[228.7966151287598, 612.0646352651879, 0, 1, 0.2720979412733877, 0, 0.001633814375775415, 0.002408690696132823, 0.7279020587266123, 1, 0.00116243244857704],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7301408784711, 616.6323445484728, 0, 1, 0.2714323293317812, 0, 0.001621711882032797, 0.002390848299523959, 0.7285676706682188, 1, 0.001162703436315999],
[229.4060660835283, 616.3768417651215, 0, 1, 0.2712351644313197, 0, 0.001622384119974876, 0.002391839362707562, 0.7287648355686802, 1, 0.001162708431617583],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163125376872804],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163351977304274],
[226.800320286274, 613.3133335347862, 0, 1, 0.2699638545983937, 0, 0.001630487950158484, 0.002403786632027575, 0.7300361454016062, 1, 0.001164380021653447],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.2662706261815, 612.8057276346921, 0, 1, 0.2705318961906488, 0, 0.001631838533656989, 0.002405777762694212, 0.7294681038093512, 1, 0.001164065508164654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.2422426622342, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173444, 0, -0.006431076468604374, 1, 0.2709888847697555, 0.001163450263816775],
[228.2997687627719, 611.730573937915, 1, 0, 0.2717756218528858, 0.004380205925828632, 0, -0.00645762542986681, 1, 0.2717756218528857, 0.001163782157766849],
[228.463592184066, 611.5667505166209, 0, 1, 0.2719706426907847, 0, 0.001635144486117419, 0.0024106516437491, 0.7280293573092153, 1, 0.001168267418588859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163598606781634],
[229.3337750264375, 616.5349700792385, 0, 1, 0.2711221762872754, 0, 0.001621968012408895, 0.002391225905978555, 0.7288778237127247, 1, 0.00116324258062338],
[229.4906122368979, 616.4564193434157, 0, 1, 0.2712824842096632, 0, 0.001622174688463938, 0.002391530603194025, 0.7287175157903367, 1, 0.001162011039117806],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163344246822758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.322844455437, 612.7074982452499, 0, 1, 0.2706126587339654, 0, 0.001632100150339155, 0.002406163457469353, 0.7293873412660346, 1, 0.001164309764282925],
[227.6913561320571, 612.3389865686298, 1, 0, 0.2710513472644717, 0.004391910246342497, 0, -0.006474880809880786, 1, 0.2710513472644718, 0.001163556144561558],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163208833140963],
[227.3099519455191, 612.7620463153544, 0, 1, 0.270583893304501, 0, 0.001631954860803105, 0.002405949260826872, 0.7294161066954989, 1, 0.001164182900442203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001163291080210845],
[227.6913561320571, 612.3389865686298, 1, 0, 0.2710513472644717, 0.004391910246342497, 0, -0.006474880809880786, 1, 0.2710513472644718, 0.00116374365912809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163441972176583],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162268789625304],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.4228433787016, 611.5814038304394, 0, 4, 0.2719305814674408, 0, 0.006540421234110967, 0.009642375540927534, 0.2809901901327796, 1, 0.004704274679481926],
[227.9483958563803, 612.1236024044933, 1, 3, 0.2713438804391547, 0.004386957829832914, 0.004900970961119042, 0.0007577963968100051, 0.7017989399869555, 0.7181029918797776, 0.004682616602060087],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162716641501704],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163456830630466],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163602175120283],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163679675548638],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.00116285515150674],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250500278585],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163162713231741],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163515639887639],
[229.2211927287201, 616.7258388515934, 0, 1, 0.2709640014937011, 0, 0.001621466034019431, 0.002390485852093433, 0.7290359985062989, 1, 0.001163099122546509],
[229.7492288730679, 616.1978027072456, 0, 1, 0.2715881967738256, 0, 0.001622855511016968, 0.002392534322449724, 0.7284118032261744, 1, 0.001162684793950556],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250495626295],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162902392433793],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163091895677444],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001162912492203283],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162250502739603],
[229.5098074481552, 616.4372241321582, 1, 0, 0.2713051750053523, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053523, 0.001163096357230096],
[229.4401157436208, 616.5852023113302, 0, 1, 0.2711976944982138, 0, 0.001621835873211685, 0.002391031096543877, 0.7288023055017863, 1, 0.001163522260622199],
[229.4477216437149, 616.4993099365986, 0, 1, 0.2712317829345458, 0, 0.001622061831833747, 0.002391364221554124, 0.7287682170654542, 1, 0.001165171701393877],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.2716450360548079, 0.004351446728635407, 0, -0.006415226481898994, 1, 0.2716450360548079, 0.001162275072729934],
[229.5909394383364, 616.356092141977, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961479, 0.7285989182922745, 1, 0.001162684803112206],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162708387565756],
[229.8215199301586, 616.1255116501549, 1, 0, 0.271673652546341, 0.004351202621512093, 0, -0.006414866601018091, 1, 0.271673652546341, 0.001163947845407265],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163614892149774],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162250502094417],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001162925978134732],
[229.8850161500141, 616.0620154302994, 0, 1, 0.2717487118792367, 0, 0.001623213207361165, 0.002393061665010227, 0.7282512881207633, 1, 0.001167533098293924],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163162713231741],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250501121763],
[229.4401157436208, 616.9223696833232, 0, 1, 0.2710896568482483, 0, 0.001620949489176924, 0.0023897243232596, 0.7289103431517517, 1, 0.001163514626215639],
[229.5098074481552, 616.4372241321583, 1, 0, 0.2713051750053522, 0.004357112278201417, 0, -0.006423579056543008, 1, 0.2713051750053522, 0.001163099096672428],
[229.3023247189013, 616.7229933360497, 1, 0, 0.2710348258206708, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710348258206708, 0.001162708444906376],
[229.4060660835283, 616.6255116501549, 1, 0, 0.271155441618447, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.271155441618447, 0.001165494381077241],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162237457016865],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162266966263658],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.001163026822586162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.6068099786874, 612.4235327219994, 0, 1, 0.2709507007174699, 0, 0.001632856914487535, 0.002407279135474393, 0.7290492992825301, 1, 0.001163676267029463],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163274082811856],
[229.1795371685334, 616.76749441178, 0, 1, 0.2709147601598686, 0, 0.001621356522612649, 0.002390324402230738, 0.7290852398401314, 1, 0.00116305081028297],
[229.4477216437149, 616.4993099365986, 0, 1, 0.2712317829345458, 0, 0.001622061831833747, 0.002391364221554124, 0.7287682170654542, 1, 0.001182820579225507],
[229.1795371685334, 616.6841832914067, 0, 3, 0.2709414431959755, 0, 0.004864726680662063, 0.007171941971301723, 0.3875138549586662, 1, 0.003491651287011734],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 1, 0, 0.2712203682562239, 0.004389173265228962, 0, -0.006470845748712632, 1, 0.271220368256224, 0.001162307060319257],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162310605739374],
[227.8333388936823, 612.1970038070046, 0, 1, 0.2712203682562239, 0, 0.001633461114284137, 0.002408169891762413, 0.728779631743776, 1, 0.001162965494058853],
[227.5469752987593, 612.5250229621142, 0, 2, 0.2708660397797208, 0, 0.003265172727684145, 0.004813760539171882, 0.5316363319465077, 1, 0.002351719314083414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163720156286184],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.00116225049545305],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162244723198968],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162275074734408],
[229.5480488451535, 616.3771420754912, 1, 0, 0.2713573863373542, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713573863373542, 0.00116222602215137],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[227.9178850470519, 612.239450093346, 0, 1, 0.2712800037732989, 0, 0.001633347867158076, 0.002408002934424449, 0.7287199962267011, 1, 0.001163450112750823],
[229.4906122368978, 616.5199155632711, 0, 1, 0.2712621234556368, 0, 0.001622007618499023, 0.002391284296223014, 0.7287378765443633, 1, 0.00116264684576439],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708390267054],
[229.3023247189013, 616.6447068614123, 1, 0, 0.2710599081960742, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710599081960743, 0.00116270843542647],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171647262667],
[229.5698895048223, 616.3771420754912, 1, 0, 0.2713761984316711, 0.00435597195327741, 0, -0.006421897904708535, 1, 0.2713761984316712, 0.00116227510871249],
[229.2422426622342, 616.7047889180793, 1, 0, 0.2709888847697554, 0.004362197771173444, 0, -0.006431076468604374, 1, 0.2709888847697555, 0.001162855155785126],
[229.264083321903, 616.6829482584105, 1, 0, 0.2710147027688185, 0.004361782209889061, 0, -0.006430463817244336, 1, 0.2710147027688186, 0.001162855151248508],
[229.7048860556139, 616.4686744396945, 1, 0, 0.2714630860377579, 0.004353411967727538, 0, -0.006418123783567458, 1, 0.2714630860377579, 0.001162250502739603],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001163091904455215],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162011033971122],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250495626295],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162250495626295],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001163085644823359],
[229.6325949985231, 616.3144365817905, 0, 1, 0.2714503230415579, 0, 0.001622548395176674, 0.002392081549430879, 0.7285496769584421, 1, 0.001162872725241459],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162855187628393],
[229.3850161500141, 616.5620154302994, 0, 1, 0.2711576583246589, 0, 0.001621896865154917, 0.002391121015403925, 0.7288423416753411, 1, 0.001162912502495273],
[229.4401157436208, 616.9223696833232, 0, 1, 0.2710896568482483, 0, 0.001620949489176924, 0.0023897243232596, 0.7289103431517517, 1, 0.001163091935879356],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162902392598734],
[229.4189585934461, 616.4864174266808, 0, 1, 0.2712111367264646, 0, 0.001622095753827262, 0.002391414231880502, 0.7287888632735353, 1, 0.001163091853433264],
[229.3931735736104, 616.5320173470343, 0, 1, 0.2711743024509712, 0, 0.001621975780435615, 0.002391237358181427, 0.7288256975490288, 1, 0.001162275074816716],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001162250501921172],
[229.3215199301586, 616.6255116501549, 0, 1, 0.2710825989917633, 0, 0.001621729852408952, 0.002390874792789346, 0.7289174010082367, 1, 0.001163614870547045],
[229.3215199301586, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711096944019334, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288903055980666, 1, 0.001163947840068441],
[229.4846168193512, 616.4624147609622, 0, 1, 0.2712753969839589, 0, 0.001622158911971555, 0.002391507344315304, 0.728724603016041, 1, 0.001162684788031197],
[229.8086274202408, 616.1800597202594, 1, 0, 0.271645036054808, 0.004351446728635406, 0, -0.006415226481898993, 1, 0.2716450360548079, 0.001162250495626295],
[229.3720164234358, 616.1595613102475, 0, 1, 0.2712755176314432, 0, 0.001622956232105732, 0.002392682812971662, 0.7287244823685568, 1, 0.001162244727199698],
[229.5480488451535, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2713048449443451, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.2713048449443451, 0.00116227510871249],
[229.1072461114426, 616.613256553876, 1, 0, 0.2709018468742367, 0.004364768103028827, 0, -0.006434865843038722, 1, 0.2709018468742367, 0.001162878783022754],
[229.7211927287201, 616.2258388515934, 0, 1, 0.2715550550482788, 0, 0.001622781676704134, 0.002392425470413032, 0.7284449449517212, 1, 0.001163515639898494],
[229.5629032939886, 616.3841282863249, 0, 1, 0.2713679399821786, 0, 0.001622364941128848, 0.002391811087825988, 0.7286320600178214, 1, 0.001163099124065823],
[229.6263995138441, 616.3206320664694, 0, 1, 0.2714429993150742, 0, 0.001622532084715527, 0.002392057503335682, 0.7285570006849258, 1, 0.001162684843578034],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162250495626295],
[229.1795371685334, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2709873255363514, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7290126744636487, 1, 0.001163242573165569],
[229.5480488451535, 616.39898273516, 1, 0, 0.271350380432608, 0.004356386408122211, 0, -0.006422508924873028, 1, 0.271350380432608, 0.001162299617719026],
[229.0629032939886, 616.8841282863249, 0, 1, 0.2707768864276009, 0, 0.001621049973806188, 0.002389872465175353, 0.7292231135723991, 1, 0.001162878739899246],
[229.5909394383364, 616.3560921419771, 0, 1, 0.2714010817077254, 0, 0.00162243873752391, 0.002391919883961478, 0.7285989182922745, 1, 0.001162055490093391],
[229.3644105233416, 616.5826210569719, 0, 1, 0.2711333002668808, 0, 0.00162184266284664, 0.002391041106328824, 0.7288666997331192, 1, 0.001162804271784372],
[229.9060660835283, 616.0409654967852, 0, 1, 0.271773595155291, 0, 0.001623268672065638, 0.002393143435203712, 0.728226404844709, 1, 0.001162708439032879],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163947840954107],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001163614880266701],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 0, 1, 0.2711825416007133, 0, 0.0016219522399363, 0.002391202653026104, 0.7288174583992868, 1, 0.001162855152110415],
[229.4846168193512, 616.5407012355997, 0, 1, 0.2712502946684223, 0, 0.001621952935136181, 0.002391203677941485, 0.7287497053315777, 1, 0.001162708442900626],
[229.4060660835283, 616.5409654967852, 1, 0, 0.2711825416007133, 0.004359082639235413, 0, -0.006426483909359202, 1, 0.2711825416007132, 0.001165171715365233],
[229.3023247189013, 616.8295802162204, 1, 0, 0.2710006836776629, 0.004361054783137881, 0, -0.006429391390612728, 1, 0.2710006836776629, 0.001162034574737871]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.547718960508178, 2.452281039491823, 0, 3, 0.1825729868360593, 0, 1.223350811627071, 1.803554774497661, 0.5461940397631522, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9991427739442363, 2.000857226055765, 1, 2, 0.3330475913147453, 1.000857961522736, 0.9995715706025388, -0.00189649319225612, 0.7411216484036962, 0.7033225510252534, 0.6782997826987582],
[0.6862823985274246, 2.155723264709409, 1, 3, 0.2414781952776969, 1.457126107482471, 1.391644302917703, -0.09653814763766387, 0.7525769865306601, 0.6689662462667857, 0.6782997826987582],
[0.8436518129617119, 1.999065421230909, 1, 1, 0.29677654984961, 1.185323121027162, 0.5002337539229995, -1.010009710423893, 0.911923679459362, 0.5054767791585819, 0.6782997826987582],
[0.9994116808827932, 2.000588319117208, 1, 1, 0.3331372269609309, 1.000588665440339, 0.4998529634728979, -0.7382218227686275, 0.8890195880127811, 0.555294041934643, 0.6782997826987582],
[0.9577996535703466, 2.042200346429655, 1, 1, 0.3192665511901153, 1.044059680197571, 0.4896679220274756, -0.8173255724251169, 0.8980688692911694, 0.5366019716714001, 0.6782997826987582],
[0.4790358831872166, 2.364378268613716, 0, 3, 0.1684720753337356, 0, 1.26883250443634, 1.870607269529151, 0.5749505785137177, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116176636846, 1.999971974245625, 1, 1, 0.3332501285711484, 1.000388533235761, 0.5000070065367754, -0.7376996712399242, 0.8889443518073128, 0.5554446089496099, 0.6782997826987582],
[0.9958774256385463, 2.004122574361455, 0, 3, 0.3319591418795153, 0, 1.496914429475875, 2.206862610983136, 0.2981323309673832, 1, 0.6782997826987582],
[0.8306642826156847, 2.168465514507688, 1, 2, 0.2769684337811653, 1.203855782568492, 0.9223111857760231, -0.4150739893683652, 0.8123587954559923, 0.6220174291047045, 0.6782997826987582],
[0.8301768073967724, 2.169823192603231, 1, 0, 0.2767256024655905, 1.204562680009998, 0, -1.775855913173659, 1, 0.2767256024655905, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.026475440511197, 1.890284881296768, 1, 0, 0.3519231363771885, 0.9742074291636127, 0, -1.436249065697063, 1, 0.3519231363771885, 0.6782997826987582],
[1.233067903939141, 1.314117545019669, 0, 1, 0.484090353312583, 0, 0.7609669346474119, 1.121874065210142, 0.5159096466874169, 1, 0.6782997826987582],
[0.9998188798363458, 2.000181120163656, 1, 2, 0.3332729599454484, 1.00018115297411, 0.9999094481185579, -0.0004005675108306501, 0.7408212349458679, 0.7036231985630784, 0.6782997826987582],
[0.9994116689416908, 2.000588331058311, 1, 1, 0.3331372229805634, 1.000588677395504, 0.4998529604893777, -0.7382218447923488, 0.8890195906647984, 0.5552940366259251, 0.6782997826987582],
[0.6305700664688141, 2.369429933531189, 0, 1, 0.2101900221562711, 0, 0.4220424439855405, 0.6222063676717631, 0.7898099778437289, 1, 0.6782997826987582],
[1.025962883727059, 1.890409031741459, 1, 0, 0.3517942544588787, 0.9746941296426408, 0, -1.436966595750061, 1, 0.3517942544588787, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.111111111111111, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.830907693260793, 0, 0, 0.3532435912271467, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.99929415374507, 2.000705846254931, 1, 2, 0.3330980512483565, 1.00070634482578, 0.9996472013833254, -0.001561468055084123, 0.7410543948036674, 0.7033898835287244, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9992944182138194, 2.000705581786182, 0, 2, 0.3330981394046063, 0, 0.9996473335244297, 1.473754465241199, 0.4447580916655981, 1, 0.6782997826987582],
[1.233779769986007, 1.313550551918298, 1, 0, 0.4843422776295739, 0.8105174232280868, 0, -1.194925081655301, 1, 0.4843422776295738, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.111111111111111, 0.6782997826987582],
[0.4789012922078072, 1.690904093973073, 0, 1, 0.2207116339824059, 0, 0.5913995971529801, 0.8718852817554688, 0.7792883660175941, 1, 0.6782997826987582],
[0.5473306388023121, 2.452669361197688, 0, 1, 0.1824435462674374, 0, 0.4077190410662119, 0.6010897415358383, 0.8175564537325626, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6867032562457407, 1.482389050493468, 0, 1, 0.3165855386200968, 0, 0.674586742034497, 0.9945259592307576, 0.6834144613799031, 1, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9988339916512298, 2.0007770638636, 0, 4, 0.3329878351444459, 0, 1.999223237933266, 2.947403624366407, 0.1979406619598302, 1, 0.6782997826987582],
[1.025206229615477, 1.891625919083078, 0, 2, 0.3514793369487882, 0, 1.057291497131449, 1.558737779518065, 0.4205790504043834, 1, 0.6782997826987582],
[0.8272505217284081, 2.172749478271595, 4, 0, 0.2757501739094691, 4.835294623498862, 0, -7.128551043110504, 1, 0.005781801534551878, 0.6782997826987582],
[0.5478146235032667, 2.452113951875841, 1, 2, 0.1826092220992422, 1.825435023265743, 0.8156227806909306, -1.488740330355204, 0.9121402369995584, 0.4538785928039704, 0.6782997826987582],
[0.5484959024501853, 2.451504097549815, 0, 2, 0.1828319674833951, 0, 0.8158256810579773, 1.20275091024214, 0.6677635933670589, 1, 0.6782997826987582],
[0.9302598229627079, 2.002762851730361, 1, 68, 0.3171676206219771, 1.074968493012181, 33.95309631454813, 48.47138191718624, 1.221351744211657e-10, 0.9999999999963045, 0.6782997826987582],
[1.746583881583694, 7.375532622023967, 0, 1, 0.1914669562587746, 0, 0.1355834285125274, 0.7977171254311459, 0.8085330437412254, 1, 0.1699642945978475],
[2.518505697790566, 4.651021428664989, 0, 1, 0.351279192249274, 0, 0.2150065346585677, 1.090507764015315, 0.648720807750726, 1, 0.1971618559292974],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6871347462068883, 1.828637280657671, 1, 2, 0.2731307681575876, 1.455318633674379, 1.093710612353204, -0.5331094459185015, 0.8169500885918212, 0.6159667239971427, 0.6782997826987582],
[0.5471854540855127, 2.452425242594295, 1, 2, 0.182418823446382, 1.827533960439896, 0.8155192522338837, -1.491987369035413, 0.9123106849023579, 0.4534968720689813, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 3, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 1.499999999999999, -0.7371371961975934, 0.7901234567901234, 0.5390946502057614, 0.6782997826987582],
[0.5471854592301783, 2.452814540769823, 1, 0, 0.182395153076726, 1.827533943257329, 0, -2.694286493777281, 1, 0.182395153076726, 0.6782997826987582],
[1.233089920697953, 1.314169150207773, 1, 0, 0.4840850052442857, 0.8109708653153054, 0, -1.195593579712922, 1, 0.4840850052442857, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 2, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0.9999999999999993, -1.474274392395187, 0.8888888888888888, 0.4074074074074074, 0.6782997826987582],
[0.5476721993499259, 2.452327800650075, 1, 0, 0.1825573997833086, 1.825909734302702, 0, -2.691891964107576, 1, 0.1825573997833086, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 4, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1.474274392395187, 0.4609053497942386, 0.8683127572016461, 0.6782997826987582],
[0.001667017516047011, 2.998332982483953, 0, 3, 0.0005556725053490035, 0, 1.000555981448954, 1.475094061608027, 0.9983339086281764, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 0.7371371961975937, 0.6666666666666666, 1, 0.6782997826987582],
[0.6315202104266449, 2.368479789573358, 0, 2, 0.2105067368088814, 0, 0.8444235027060401, 1.244911946376164, 0.623299612624161, 1, 0.6782997826987582],
[0.6304986035001436, 2.36950139649986, 0, 2, 0.2101662011667143, 0, 0.8440594307960005, 1.244375204482202, 0.6238374297794194, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 0.7371371961975937, 0.6666666666666666, 1, 0.6782997826987582],
[0.001982703604044313, 2.998017296395956, 0, 3, 0.0006609012013481041, 0, 1.000661338280612, 1.475249386487006, 0.9980186064784743, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116382822963, 1.999953112818704, 1, 1, 0.3332522286493017, 1.000388512601125, 0.5000117220701313, -0.737692688828735, 0.8889429521002736, 0.5554474093988768, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.5475737502380938, 2.452426249761907, 1, 1, 0.1825245834126979, 1.826238017372425, 0.407759458657354, -2.091226615275263, 0.966684776450021, 0.3317339432754169, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.999709917920638, 0, 3, 0.3333655677923644, 0, 1.500217593119454, 2.211732380556754, 0.2962533190956754, 1, 0.6782997826987582],
[0.003380682155611917, 2.996619317844388, 0, 3, 0.001126894051870639, 0, 1.001128165374721, 1.475937617717526, 0.9966231260839689, 1, 0.6782997826987582],
[0.002394052600487548, 2.997605947399512, 0, 2, 0.0007980175334958493, 0, 0.6671991032493925, 0.9836345525496125, 0.9984046017649921, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854489626844, 2.452814551037316, 1, 0, 0.1823951496542281, 1.82753397754953, 0, -2.694286544333395, 1, 0.1823951496542281, 0.6782997826987582],
[0.9999639108967977, 2.000036089103204, 1, 1, 0.3333213036322657, 1.000036090405673, 0.499990977886999, -0.7372037044286511, 0.8888969085448868, 0.5555395158094184, 0.6782997826987582],
[0.6868639782840743, 2.156831818458437, 0, 1, 0.2415391896246024, 0, 0.4636430116812421, 0.6835370193346384, 0.7584608103753976, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.4790791446684979, 2.364482194844933, 1, 1, 0.1684785687621123, 2.087337783597232, 0.4229255784544327, -2.453800292432035, 0.9716149718678704, 0.3085721093920948, 0.6782997826987582],
[0.5468838270196406, 2.452404306258658, 0, 1, 0.1823378757618337, 0, 0.4077631071874854, 0.601154707090004, 0.8176621242381663, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.001280351265136, 1.998719648734866, 4, 1, 0.3337601170883784, 3.994885143752125, 0.5003202928599678, -5.151947472234617, 0.9958583614390064, 0.04547858459892007, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.026474799082306, 1.890285456352967, 1, 0, 0.3519229244739976, 0.9742080379313991, 0, -1.436249963187822, 1, 0.3519229244739976, 0.6782997826987582],
[0.5476722768692674, 2.452327723130733, 1, 0, 0.1825574256230891, 1.825909475857413, 0, -2.691891583088304, 1, 0.1825574256230891, 0.6782997826987582],
[1.025785019835654, 1.890903859791006, 0, 0, 0.3516950426220831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 4, 1, 0.3333333333333334, 3.999999999999997, 0.4999999999999997, -5.159960373383155, 0.9958847736625515, 0.04526748971193417, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9961140886352321, 2.003885911364769, 1, 2, 0.3320380295450772, 1.003901070579267, 0.9980608120738157, -0.008610143559554442, 0.7424661302999596, 0.7019732741889451, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 1, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0.4999999999999997, -2.211411588592781, 0.9629629629629628, 0.2592592592592594, 0.6782997826987582],
[0.9996828722162118, 2.00031712778379, 1, 1, 0.3332276240720704, 1.000317228385723, 0.4999207306233133, -0.7377217426953568, 0.888959350555283, 0.5554145986994237, 0.6782997826987582],
[0.9994116638269311, 2.000172974117688, 0, 2, 0.3331833518495914, 0, 0.9999135204205205, 1.474146897765696, 0.4446444422505459, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 1.474274392395187, 0.4444444444444444, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854489588084, 2.000316941598888, 1, 1, 0.2147929089240302, 1.827533977562475, 0.4999207771547857, -1.957266144366878, 0.9538640062759535, 0.3834498241240135, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854643674384, 2.452814535632562, 1, 1, 0.1823951547891461, 1.827533926099495, 0.4076949094490373, -2.093232303571335, 0.9667320075094437, 0.3315223170877355, 0.6782997826987582],
[0.001622025598321432, 2.998377974401679, 0, 1, 0.0005406751994404773, 0, 0.3335136558957509, 0.491690642401206, 0.9994593248005595, 1, 0.6782997826987582],
[0.9998189197700954, 2.000181080229906, 1, 2, 0.3332729732566982, 1.000181113025893, 0.9999094680818171, -0.0004004791848744597, 0.7408212171991422, 0.703623216314626, 0.6782997826987582],
[0.5471854592371752, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2148196383788421, 1.82753394323396, 0, -2.694286493742829, 1, 0.2148196383788421, 0.6782997826987582],
[0.005278905835985841, 2.994721094164014, 0, 2, 0.001759635278661947, 0, 0.6678418247019783, 0.9845821003286028, 0.99648382575899, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000022106999941, 1.999906465522212, 1, 2, 0.3333486390841582, 0.9999778934887675, 1.000046769426171, 0.0001015420307658024, 0.7407203328387153, 0.7037241109029417, 0.6782997826987582],
[0.001126206134236124, 2.998873793865764, 0, 2, 0.0003754020447453746, 0, 0.6669170286829096, 0.9832186972395008, 0.9992493368372044, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6305702386615734, 2.36942976133843, 0, 1, 0.2101900795538576, 0, 0.4220424746564869, 0.6222064128891538, 0.7898099204461424, 1, 0.6782997826987582],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9994116809079725, 2.000588319092029, 1, 1, 0.333137226969324, 1.00058866541513, 0.4998529634791889, -0.7382218227221879, 0.8890195880071889, 0.5552940419458372, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.025242972009087, 1.891731610037516, 1, 1, 0.3514747705788226, 0.9753785466486834, 0.5286162131530743, -0.6586502677592956, 0.8764654856465641, 0.5794150268042092, 0.6782997826987582],
[0.5473304748431412, 2.45266952515686, 0, 1, 0.1824434916143804, 0, 0.407719013810491, 0.6010897013534269, 0.8175565083856197, 1, 0.6782997826987582],
[0.005610484439263855, 2.994208533105399, 0, 7, 0.001870274308700132, 0, 2.337846520242213, 3.446627258143294, 0.9869813077398074, 1, 0.6782997826987582],
[0.9992555054156803, 2.000744494584321, 1, 3, 0.3330851684718933, 1.000745049269466, 1.499441836836485, 0.7352159034798001, 0.5930337745073408, 0.8021748502156514, 0.6782997826987582],
[0.5554543855117335, 2.465497096305516, 1, 2, 0.183867363926547, 1.800327850645579, 0.8111954392470989, -1.468436768984769, 0.9110104617039545, 0.4563965113556724, 0.6735955080192763],
[1.010511820164737, 2.021023640329474, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6712437887051929],
[0.5486843607172831, 2.456556184027852, 0, 1, 0.1825758545939674, 0, 0.407073938101577, 0.6011870339613726, 0.8174241454060326, 1, 0.6771169621195328],
[1.025795565147763, 1.896133002766049, 0, 1, 0.3510679817474651, 0, 0.5273891644421649, 0.7788745430203295, 0.6489320182525349, 1, 0.6771169621195328],
[1.001357758594789, 2.003882786150346, 1, 2, 0.3332038629472541, 0.9986440824139667, 0.9980623686289529, -0.0008591038440285364, 0.7409133511552581, 0.7035310429949329, 0.6771169621195328],
[0.9998003146188355, 2.005225427221523, 1, 3, 0.332709401020482, 1.00019972526338, 1.496091142309548, 0.7323571034078267, 0.593701804621196, 0.8017286217101077, 0.6771169621195328],
[0.5472582136489628, 2.452527358020016, 1, 2, 0.1824324441111592, 1.827290984510371, 0.8154852966103702, -1.491679215750769, 0.9122984960536924, 0.453524185363767, 0.6782997826987582],
[0.4790358024219796, 2.364659601786628, 0, 2, 0.1684553843963095, 0, 0.8457876975142182, 1.246923143848099, 0.6914664477394895, 1, 0.6782997826987582],
[1.827079323969613, 1.172532339825129, 1, 2, 0.6091052872018159, 0.547321611536463, 1.705709882849184, 1.707782164847274, 0.3389396399529273, 0.9402718052361014, 0.6782997826987582],
[0.6864602241844948, 2.156388713560298, 0, 2, 0.2414691175005091, 0, 0.927476566457217, 1.367354951474489, 0.5753690997054565, 1, 0.6782997826987582],
[0.8303216618377552, 2.169678338162248, 1, 2, 0.2767738872792515, 1.204352537047745, 0.9217956251035958, -0.4165664196735206, 0.8125925004931855, 0.6217122350648454, 0.6782997826987582],
[0.5473323106775096, 2.369499793084393, 0, 2, 0.1876461487007096, 0, 0.8440600019620965, 1.244376046537751, 0.6599187797207896, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854540862762, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2148196367910564, 1.827533960437346, 0, -2.694286519105341, 1, 0.2148196367910564, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.83094375511933, 1, 0, 0.3532390914484446, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3532390914484447, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.999611639387978, 1.999999783791567, 0, 2, 0.3332470438215641, 0, 1.000000108104228, 1.474274551770484, 0.4445595045726834, 1, 0.6782997826987582],
[0.9991427739520266, 2.000857226047975, 1, 1, 0.333047591317342, 1.000857961514932, 0.4997857853032153, -0.7387178781306637, 0.8890793019177168, 0.5551744845524008, 0.6782997826987582],
[1.233090023759861, 1.314168863483342, 1, 0, 0.4840850806077215, 0.8109707975341999, 0, -1.195593479784974, 1, 0.4840850806077215, 0.6782997826987582],
[1.828657618505531, 1.170176661559853, 2, 0, 0.6097894874223129, 1.093698448392159, 0, -1.61241161546691, 1, 0.3718432189707671, 0.6782997826987582],
[0.9564976235833522, 2.04350237641665, 1, 0, 0.3188325411944505, 1.04548090381414, 0, -1.541325724231363, 1, 0.3188325411944506, 0.6782997826987582],
[0.998834415854721, 2.00116558414528, 0, 1, 0.3329448052849068, 0, 0.4997087736880658, 0.7367078487035179, 0.6670551947150931, 1, 0.6782997826987582],
[0.002570175020189382, 2.997429824979811, 0, 1, 0.0008567250067297939, 0, 0.3336191532046077, 0.4918461743821202, 0.9991432749932702, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.111111111111111, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[0.8431144600753417, 2.000446785504639, 1, 1, 0.2964994903436229, 1.186078578121693, 0.4998883285704283, -1.011632713224693, 0.912088052225972, 0.5050870329132175, 0.6782997826987582],
[0.9996830591146854, 2.000316940885316, 0, 1, 0.3332276863715616, 0, 0.4999207773331221, 0.7370204002485187, 0.6667723136284384, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 1, 0.1823140566701093, 0, 0.4076544742543676, 0.6009945523385377, 0.8176859433298906, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116082995529, 2.000388391700449, 1, 2, 0.3332038694331841, 1.000388542607171, 0.9998058418544818, -0.0008590607981190601, 0.7409133425090315, 0.7035310516461987, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.6359443214711731, 2.364055678528826, 0, 0, 0.2119814404903911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8436703013340455, 1.999178285504132, 1, 0, 0.2967693408787478, 1.185297145601498, 0, -1.7474532291394, 1, 0.2967693408787477, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9992226432160706, 2.000777356783931, 1, 2, 0.3330742144053567, 1.000777961537608, 0.9996114726202316, -0.001719724739901085, 0.7410861654672949, 0.7033580774970992, 0.6782997826987582],
[0.001397411104460845, 2.998602588895539, 0, 2, 0.0004658037014869483, 0, 0.6669773471837928, 0.9833076232607406, 0.9990686095701143, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9998555322190438, 2.000144467780958, 1, 2, 0.3332851774063478, 1.000144488654912, 0.9999277713268793, -0.0003195008071063292, 0.7408049463241715, 0.703639491162958, 0.6782997826987582],
[1.026474749018829, 1.888908202357972, 2, 1, 0.3520891650045742, 1.948416170891421, 0.5294063516435974, -2.092009839074391, 0.9563526399014904, 0.2846056201438358, 0.6782997826987582],
[0.9988226303756472, 2.001177369624354, 0, 2, 0.3329408767918822, 0, 0.9994116615337423, 1.473407020060323, 0.4449678738551828, 1, 0.6782997826987582],
[1.000567963739693, 1.999432036260309, 2, 1, 0.3335226545798975, 1.99886471732001, 0.5001420312692283, -2.209528477346401, 0.9628998200314548, 0.2595117234169744, 0.6782997826987582],
[0.9980605240792609, 2.001939475920741, 1, 4, 0.3326868413597535, 1.001943244797231, 1.998062403040583, 1.468552966772423, 0.4621829889622207, 0.8676730070330568, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6861477506870965, 2.157279300038002, 1, 0, 0.2413101297999268, 1.457412050099439, 0, -2.148625264629776, 1, 0.2413101297999268, 0.6782997826987582],
[0.9996114505853867, 2.000388549414615, 0, 1, 0.3332038168617953, 0, 0.4999028815140116, 0.7369940169006732, 0.6667961831382047, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000950502348837, 0, 1, 0.2146645249008464, 0, 0.4997624872909846, 0.7367870372928244, 0.7853354750991536, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989672, 0, 4, 0.1823140566701094, 0, 1.630617897017471, 2.403978209354151, 0.4470397358326083, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854540850896, 2.452814545914912, 1, 1, 0.1823951513616965, 1.827533960441309, 0.4076949077399552, -2.093232356720248, 0.9667320087597437, 0.3315223114831368, 0.6782997826987582],
[0.6865252166474528, 1.482567090091756, 1, 1, 0.3165034583887785, 1.456610734392767, 0.67450573176969, -1.153037377531375, 0.8998255608279428, 0.5328324776054997, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 0.7371371961975938, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.6782997826987582],
[0.630498478933429, 2.369501521066574, 0, 2, 0.2101661596444761, 0, 0.844059386423077, 1.244375139064337, 0.6238374953707552, 1, 0.6782997826987582],
[0.9997098827407467, 1.99999995849675, 2, 2, 0.3332688612070318, 2.000580402903406, 1.000000020751625, -1.475130034939362, 0.8889461891322914, 0.4072927902950544, 0.6782997826987582],
[0.002204831899117015, 2.997795168100883, 0, 3, 0.0007349439663723383, 0, 1.000735484506272, 1.475358698368789, 0.9977967881318096, 1, 0.6782997826987582],
[0.000965537341488414, 2.042169248817562, 0, 1, 0.0004725764291368932, 0, 0.4896753785608175, 0.721915871198633, 0.9995274235708631, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9992226171707969, 2.000777382829205, 0, 2, 0.3330742057235987, 0, 0.9996114596077121, 1.473701577244427, 0.4447900150712088, 1, 0.6782997826987582],
[0.3142626418923986, 2.685737358107601, 0, 1, 0.1047542139641329, 0, 0.3723372268629464, 0.5489272388994797, 0.8952457860358671, 1, 0.6782997826987582],
[0.9570570206294178, 2.042942979370584, 1, 0, 0.3190190068764724, 1.044869823265431, 0, -1.540424823826711, 1, 0.3190190068764724, 0.6782997826987582],
[0.9996115167884527, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3332469925501189, 1.000388634189405, 0.4999999999999997, -0.7377101496310441, 0.8889464419563009, 0.5554404270565388, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9996098687270362, 2.000173159561518, 2, 1, 0.3332273898813732, 2.000780567069552, 0.4999567138573254, -2.21262617428666, 0.9629982662241238, 0.2591180125497056, 0.6782997826987582],
[0.8306641581158319, 2.169335841884171, 1, 0, 0.276888052705277, 1.203855963002264, 0, -1.774814018386487, 1, 0.2768880527052771, 0.6782997826987582],
[0.8306642677907751, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2934520625574139, 1.20385580405377, 0, -1.774813784052793, 1, 0.293452062557414, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.830907693260793, 0, 0, 0.3532435912271467, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996115671203324, 2.000317005401204, 1, 2, 0.3332117891994097, 1.000388583818399, 0.9998415224185225, -0.0008065186129060869, 0.7409027848094046, 0.7035416153107237, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 1, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 0.4999999999999997, -3.685685980987969, 0.9876543209876543, 0.1111111111111112, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9992765330935457, 2.000588678980708, 0, 2, 0.3331071439715109, 0, 0.9997057471198887, 1.473840582909152, 0.444746081421835, 1, 0.6782997826987582],
[0.9990486023491457, 2.000951397650856, 2, 1, 0.3330162007830484, 2.001904607340658, 0.4997622636781751, -2.214569990994092, 0.9630685732718982, 0.2588365164957239, 0.6782997826987582],
[0.9999639031319133, 2.000036096868088, 1, 1, 0.3333213010439709, 1.000036098171118, 0.499990975945848, -0.7372037187388371, 0.8888969102703546, 0.5555395123582962, 0.6782997826987582],
[0.004378917715325175, 2.995621082284675, 1, 4, 0.001459639238441725, 228.3669310570136, 1.335282363866031, -334.706945931568, 0.9999787566614655, 0.007276921800750791, 0.6782997826987582],
[0.54733031210547, 2.452669687894531, 0, 1, 0.1824434373684899, 0, 0.4077189867578295, 0.6010896614703808, 0.81755656263151, 1, 0.6782997826987582],
[1.026197689382875, 1.89035098571178, 2, 3, 0.351853441756658, 1.948942217169423, 1.587006869452024, -0.5335920148424089, 0.7619457987781958, 0.5751421797935385, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 0.7371371961975938, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.6782997826987582],
[0.8434270507250977, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2966234180370537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9988340673968276, 2.001165932603174, 0, 2, 0.3329446891322757, 0, 0.9994173733501163, 1.473415440844938, 0.4449627877568365, 1, 0.6782997826987582],
[0.6308869673479945, 2.369113032652009, 0, 2, 0.2102956557826646, 0, 0.8441977957299825, 1.244579192361177, 0.6236329512757317, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996115671095773, 2.000388432890424, 0, 2, 0.3332038557031922, 0, 0.999805821267491, 1.473988119662302, 0.4446170980490893, 1, 0.6782997826987582],
[0.5473303301160219, 2.452669669883979, 0, 1, 0.1824434433720073, 0, 0.4077189897518095, 0.601089665884329, 0.8175565566279928, 1, 0.6782997826987582],
[0.001126075604402888, 2.998873924395597, 0, 2, 0.0003753585348009625, 0, 0.6669169996544908, 0.9832186544436464, 0.9992494238244277, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.999611567098915, 2.000388432901087, 0, 1, 0.3332038556996381, 0, 0.4999029106310808, 0.7369940598272228, 0.6667961443003618, 1, 0.6782997826987582],
[0.4791960062457984, 2.03723152016325, 1, 1, 0.1904271039864251, 2.086828744326097, 0.4908622265572775, -2.35289256826669, 0.9637375180673432, 0.3445917260401935, 0.6782997826987582],
[0.5471854592378916, 2.000316894466939, 1, 1, 0.2147929160662483, 1.827533943231567, 0.4999207889340394, -1.957266076387847, 0.9538640032077575, 0.3834498353402542, 0.6782997826987582],
[0.8297359917230168, 2.04382306587091, 2, 2, 0.2887485432151748, 2.410405261373357, 0.9785582878465872, -2.110935326899068, 0.9245560605069842, 0.3285119156059773, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[0.6302532903836685, 2.369746709616335, 0, 0, 0.2100844301278893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8301768079734443, 2.169823192026559, 1, 0, 0.2767256026578145, 1.204562679173264, 0, -1.775855911940083, 1, 0.2767256026578144, 0.6782997826987582],
[0.8297913548717335, 2.169820090962893, 2, 1, 0.2766329472518892, 2.410244440675275, 0.4608677024260724, -2.873916206331657, 0.9788304458616464, 0.1872382542390922, 0.6782997826987582],
[0.3136744209207511, 2.686325579079248, 0, 0, 0.1045581403069171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996828511350996, 2.000317148864902, 1, 2, 0.333227617045033, 1.000317249480213, 0.9998414507094128, -0.0007014579437239664, 0.7408816846135111, 0.7035627262995879, 0.6782997826987582],
[0.9996116176549628, 2.000388382345039, 0, 2, 0.3332038725516541, 0, 0.9998058465303703, 1.473988156906719, 0.4446170755801108, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 1, 0.1823140566701093, 0, 0.4076544742543676, 0.6009945523385377, 0.8176859433298906, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[1.000325305620654, 1.999674694379347, 1, 1, 0.333441768540218, 0.9996748001686785, 0.5000813396352836, -0.7365378454724802, 0.8888165869927718, 0.5557001240732077, 0.6782997826987582],
[0.4806843654054426, 1.692682252083295, 0, 2, 0.2211704005838001, 0, 1.181556666963613, 1.741938737268264, 0.6065755449267984, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.3151226434105723, 2.684877356589427, 1, 2, 0.1050408811368575, 3.173367642442321, 0.744912982744426, -3.580208517885377, 0.9692171952102158, 0.2831808609506693, 0.6782997826987582],
[0.0008248743308594908, 2.999175125669141, 0, 1, 0.0002749581102864969, 0, 0.3334250112443473, 0.4915599558616189, 0.9997250418897135, 1, 0.6782997826987582],
[1.830395395580114, 1.169216242701799, 1, 0, 0.6102107926973204, 0.5463300456364326, 0, -0.8054403960778872, 1, 0.6102107926973204, 0.6782997826987582],
[0.999611576447727, 2.000388423552275, 0, 1, 0.3332038588159088, 0, 0.4999029129673764, 0.7369940632715635, 0.6667961411840913, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8292022299821222, 2.17079777001788, 3, 0, 0.2764007433273739, 3.617935277459011, 0, -5.333829332901, 1, 0.02111629010831306, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854489623001, 2.3697517926442, 1, 2, 0.1875890372810826, 1.827533977550813, 0.8439702445665728, -1.450042824827285, 0.9076334432473518, 0.4637993631048588, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.5471854592300628, 2.369465996155879, 1, 0, 0.187607421592875, 1.827533943257714, 0, -2.694286493777849, 1, 0.187607421592875, 0.6782997826987582],
[0.8306642727313106, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2934520637905962, 1.203855796893607, 0, -1.774813773496747, 1, 0.2934520637905962, 0.6782997826987582],
[0.547013725215229, 2.452986274784772, 0, 1, 0.1823379084050763, 0, 0.407666365800494, 0.6010120837404779, 0.8176620915949238, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9998550479882018, 2.0001449520118, 3, 1, 0.3332850159960671, 3.00043491907779, 0.4999637646232453, -3.686380591935168, 0.9876614775554675, 0.1110681670360045, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5481092788206673, 2.368794216107069, 0, 1, 0.1879079235133373, 0, 0.4221557082503448, 0.6223733502769374, 0.8120920764866627, 1, 0.6782997826987582],
[1.230700440444606, 1.317651451559106, 0, 2, 0.4829397558109347, 0, 1.517852082683556, 2.23773045694407, 0.2673512961208558, 1, 0.6782997826987582],
[1.000567957641877, 1.999432042358124, 2, 1, 0.3335226525472921, 1.998864729501801, 0.5001420297439081, -2.209528497554444, 0.96289982070976, 0.2595117207060644, 0.6782997826987582],
[0.8305400779418131, 2.169325665549331, 1, 1, 0.2768590826919001, 1.204035815439672, 0.460972741843615, -1.095478861337129, 0.9233490483309994, 0.4770672137148, 0.6782997826987582],
[0.999564929660509, 2.000435070339492, 1, 1, 0.3331883098868362, 1.00043525970808, 0.499891256070756, -0.7379392068294706, 0.8889855501547534, 0.5553621699284261, 0.6782997826987582],
[0.830420570884939, 2.000036090516132, 2, 1, 0.2933874883899061, 2.408418180041827, 0.4999909775337798, -2.813545354408, 0.9747463144900297, 0.2077212840112714, 0.6782997826987582],
[0.5471854540864798, 2.452814545913521, 1, 0, 0.1823951513621599, 1.827533960436666, 0, -2.694286519104338, 1, 0.1823951513621599, 0.6782997826987582],
[0.8430375340765818, 2.000524056584173, 0, 2, 0.2964724016688824, 0, 0.9997380403487534, 1.473888191989515, 0.4949510816135503, 1, 0.6782997826987582],
[1.829502037508199, 1.170426549548011, 3, 0, 0.6098485295289862, 1.639790466746915, 0, -2.417501094018729, 1, 0.2268119554959775, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.54718545923008, 2.000000000000001, 1, 0, 0.214819638376655, 1.827533943257657, 0, -2.694286493777764, 1, 0.214819638376655, 0.6782997826987582],
[0.5475739413294013, 2.452426058670599, 1, 1, 0.1825246471098004, 1.826237380055372, 0.4077594904296832, -2.091225628853922, 0.966684753197443, 0.3317340474170435, 0.6782997826987582],
[0.8301770433184773, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2933304279597528, 1.204562337694484, 0, -1.775855408506663, 1, 0.2933304279597528, 0.6782997826987582],
[1.233089920702108, 1.314169150196213, 1, 0, 0.4840850052473243, 0.8109708653125726, 0, -1.195593579708893, 1, 0.4840850052473243, 0.6782997826987582],
[0.9996104862274428, 2.000389513772559, 0, 1, 0.3332034954091474, 0, 0.4999026405182898, 0.7369936616068519, 0.6667965045908526, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.4790207094281568, 1.690071597311053, 1, 0, 0.2208392459554971, 2.087592415772119, 0, -3.077684040331244, 1, 0.2208392459554971, 0.6782997826987582],
[0.4788428498253265, 2.036336737572391, 0, 0, 0.1903811768450109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8432491916541086, 2.000312077082293, 1, 0, 0.2965468692112355, 1.185889070392597, 0, -1.748325888701141, 1, 0.2965468692112355, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000950657580352, 0, 1, 0.2146645118223139, 0, 0.4997624485199697, 0.7367869801337099, 0.7853354881776862, 1, 0.6782997826987582],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5473705525067145, 2.452495238875502, 2, 2, 0.1824650136279958, 3.653831925814946, 0.815495976627063, -4.184486006902387, 0.9790257856686386, 0.1544870908559672, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.831089027478283, 2, 0, 0.3532209656051415, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.1247650505430284, 0.6782997826987582],
[0.4806184300374773, 1.690612376638672, 0, 3, 0.2213575952218719, 0, 1.774504931736448, 2.616107180038017, 0.4720784274705039, 1, 0.6782997826987582],
[0.9994621947283381, 1.516133208694981, 0, 3, 0.3973064163530555, 0, 1.978717953538043, 2.917173208673749, 0.2189221495888612, 1, 0.6782997826987582],
[1.823780122825302, 1.171278337061771, 2, 3, 0.6089297244949491, 1.09662342240122, 2.561304094059912, 2.159341207262594, 0.3021273752738332, 0.9196405689958698, 0.6782997826987582],
[1.000525909906361, 1.99947409009364, 2, 4, 0.3335086366354536, 1.998948733058976, 2.000526048233349, 0.002325395370314114, 0.6800377641759829, 0.6491802062605361, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.999564932015779, 1, 1, 0.3333816812320101, 0.9999999999999993, 0.5001087906617222, -0.7369768089108844, 0.8888566546189185, 0.5556200170829386, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.4791349389833026, 2.364963678811645, 0, 1, 0.1684663590725907, 0, 0.4228394748550571, 0.6233814098726398, 0.8315336409274092, 1, 0.6782997826987582],
[0.5470618852232928, 2.452803635615292, 0, 2, 0.1823621363768222, 0, 0.8153934424099527, 1.202113671871954, 0.6685316760302743, 1, 0.6782997826987582],
[0.8296898093859555, 2.170310190614047, 1, 0, 0.2765632697953183, 1.205269714883071, 0, -1.776898276581561, 1, 0.2765632697953182, 0.6782997826987582],
[0.3166286862939401, 2.682205515660293, 0, 2, 0.105583925275897, 0, 0.7456550172322083, 1.099300097466438, 0.7999801147248722, 1, 0.6782997826987582],
[0.5483503419910467, 2.451649658008954, 1, 2, 0.1827834473303488, 1.823651639149206, 0.8157772434843932, -1.485883412279409, 0.911984146822441, 0.4542277324753176, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.831009441752914, 2.168601637386937, 1, 1, 0.2770390626744881, 1.20335576198824, 0.4611266462036582, -1.094249378691333, 0.9232493577524412, 0.4773274831014171, 0.6782997826987582],
[0.6858405717249887, 2.157305146095595, 1, 2, 0.2412259658118123, 1.458064805767986, 0.9270825704095249, -0.7828135124057339, 0.8535039620329987, 0.5631449285791739, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8306641390803668, 2.169335860919636, 1, 0, 0.276888046360122, 1.203855990589778, 0, -1.774814059058052, 1, 0.276888046360122, 0.6782997826987582],
[0.6311678469646858, 2.368832153035318, 1, 2, 0.2103892823215617, 1.58436461047413, 0.8442978948243707, -1.091061407546452, 0.8858342448142389, 0.5076894941981316, 0.6782997826987582],
[0.6857922066309495, 2.15763484409415, 1, 0, 0.2411850891184518, 1.458167634935136, 0, -2.149739204004327, 1, 0.2411850891184518, 0.6782997826987582],
[1.024903981932956, 1.891856452896154, 0, 1, 0.3513843542632269, 0, 0.5285813299783643, 0.7792739190852934, 0.6486156457367731, 1, 0.6782997826987582],
[1.026474813668469, 1.890285443276126, 1, 0, 0.3519229292926997, 0.9742080240879439, 0, -1.43624994277877, 1, 0.3519229292926997, 0.6782997826987582],
[0.997280586001612, 2.00271941399839, 1, 5, 0.3324268620005371, 1.002726829376365, 2.496605348233779, 2.202386845700738, 0.3529589738749039, 0.9114898414819265, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116270229197, 2.000388372977082, 0, 1, 0.3332038756743064, 0, 0.4999029256062652, 0.7369940819047536, 0.6667961243256936, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.999583787297279, 2, 0, 0.3333795856061191, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.1111419480989078, 0.6782997826987582],
[0.6861478573522009, 2.157279193372898, 1, 0, 0.241310167312795, 1.457411823537472, 0, -2.148624930615269, 1, 0.2413101673127951, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369429753101659, 0, 1, 0.1875419817602345, 0, 0.4220424761236193, 0.6222064150521095, 0.8124580182397656, 1, 0.6782997826987582],
[0.9563215508758529, 2.043678449124148, 2, 3, 0.3187738502919508, 2.091346784110729, 1.467941300298831, -0.9190707408626148, 0.8112119387990806, 0.5100352291950958, 0.6782997826987582],
[0.6864583648186279, 2.15764005392961, 1, 1, 0.2413623805327933, 1.456752588722863, 0.4634693345531596, -1.464372066017355, 0.9417442012635433, 0.4244689623291296, 0.6782997826987582],
[0.9994113916743591, 2.000588608325642, 1, 1, 0.3331371305581196, 1.000588954989451, 0.4998528912133177, -0.7382223561739172, 0.8890196522435023, 0.5552939133597415, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 5, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 2.499999999999998, -0.7371371961975941, 0.7413504039018441, 0.5317786922725195, 0.6782997826987582],
[0.9996830591144371, 2.000316940885565, 1, 1, 0.3332276863714788, 1.000317041368935, 0.4999207773330599, -0.7377213981183122, 0.8889593090355113, 0.555414681778469, 0.6782997826987582],
[1.000199994039509, 1.999411573072086, 1, 1, 0.3334431714445708, 0.9998000459501087, 0.5001471500254971, -0.736625469547753, 0.8888156514169867, 0.5557019943061281, 0.6782997826987582],
[0.479079144704241, 1.690725806560887, 1, 1, 0.2207936452651695, 2.0873377834415, 0.5914619603719804, -2.205331420154468, 0.9512501662105186, 0.3928374567408573, 0.6782997826987582]
],
"RESOLVED": [
[0.547718960508178, 2.452281039491823, 0, 3, 0.1825729868360593, 0, 1.223350811627071, 1.803554774497661, 0.5461940397631522, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9991427739442363, 2.000857226055765, 1, 2, 0.3330475913147453, 1.000857961522736, 0.9995715706025388, -0.00189649319225612, 0.7411216484036962, 0.7033225510252534, 0.6782997826987582],
[0.6862823985274246, 2.155723264709409, 1, 3, 0.2414781952776969, 1.457126107482471, 1.391644302917703, -0.09653814763766387, 0.7525769865306601, 0.6689662462667857, 0.6782997826987582],
[0.8436518129617119, 1.999065421230909, 1, 1, 0.29677654984961, 1.185323121027162, 0.5002337539229995, -1.010009710423893, 0.911923679459362, 0.5054767791585819, 0.6782997826987582],
[0.9994116808827932, 2.000588319117208, 1, 1, 0.3331372269609309, 1.000588665440339, 0.4998529634728979, -0.7382218227686275, 0.8890195880127811, 0.555294041934643, 0.6782997826987582],
[0.9577996535703466, 2.042200346429655, 1, 1, 0.3192665511901153, 1.044059680197571, 0.4896679220274756, -0.8173255724251169, 0.8980688692911694, 0.5366019716714001, 0.6782997826987582],
[0.4790358831872166, 2.364378268613716, 0, 3, 0.1684720753337356, 0, 1.26883250443634, 1.870607269529151, 0.5749505785137177, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116176636846, 1.999971974245625, 1, 1, 0.3332501285711484, 1.000388533235761, 0.5000070065367754, -0.7376996712399242, 0.8889443518073128, 0.5554446089496099, 0.6782997826987582],
[0.9958774256385463, 2.004122574361455, 0, 3, 0.3319591418795153, 0, 1.496914429475875, 2.206862610983136, 0.2981323309673832, 1, 0.6782997826987582],
[0.8306642826156847, 2.168465514507688, 1, 2, 0.2769684337811653, 1.203855782568492, 0.9223111857760231, -0.4150739893683652, 0.8123587954559923, 0.6220174291047045, 0.6782997826987582],
[0.8301768073967724, 2.169823192603231, 1, 0, 0.2767256024655905, 1.204562680009998, 0, -1.775855913173659, 1, 0.2767256024655905, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.026475440511197, 1.890284881296768, 1, 0, 0.3519231363771885, 0.9742074291636127, 0, -1.436249065697063, 1, 0.3519231363771885, 0.6782997826987582],
[1.233067903939141, 1.314117545019669, 0, 1, 0.484090353312583, 0, 0.7609669346474119, 1.121874065210142, 0.5159096466874169, 1, 0.6782997826987582],
[0.9998188798363458, 2.000181120163656, 1, 2, 0.3332729599454484, 1.00018115297411, 0.9999094481185579, -0.0004005675108306501, 0.7408212349458679, 0.7036231985630784, 0.6782997826987582],
[0.9994116689416908, 2.000588331058311, 1, 1, 0.3331372229805634, 1.000588677395504, 0.4998529604893777, -0.7382218447923488, 0.8890195906647984, 0.5552940366259251, 0.6782997826987582],
[0.6305700664688141, 2.369429933531189, 0, 1, 0.2101900221562711, 0, 0.4220424439855405, 0.6222063676717631, 0.7898099778437289, 1, 0.6782997826987582],
[1.025962883727059, 1.890409031741459, 1, 0, 0.3517942544588787, 0.9746941296426408, 0, -1.436966595750061, 1, 0.3517942544588787, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.111111111111111, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.830907693260793, 0, 0, 0.3532435912271467, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.99929415374507, 2.000705846254931, 1, 2, 0.3330980512483565, 1.00070634482578, 0.9996472013833254, -0.001561468055084123, 0.7410543948036674, 0.7033898835287244, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9992944182138194, 2.000705581786182, 0, 2, 0.3330981394046063, 0, 0.9996473335244297, 1.473754465241199, 0.4447580916655981, 1, 0.6782997826987582],
[1.233779769986007, 1.313550551918298, 1, 0, 0.4843422776295739, 0.8105174232280868, 0, -1.194925081655301, 1, 0.4843422776295738, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.111111111111111, 0.6782997826987582],
[0.4789012922078072, 1.690904093973073, 0, 1, 0.2207116339824059, 0, 0.5913995971529801, 0.8718852817554688, 0.7792883660175941, 1, 0.6782997826987582],
[0.5473306388023121, 2.452669361197688, 0, 1, 0.1824435462674374, 0, 0.4077190410662119, 0.6010897415358383, 0.8175564537325626, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6867032562457407, 1.482389050493468, 0, 1, 0.3165855386200968, 0, 0.674586742034497, 0.9945259592307576, 0.6834144613799031, 1, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9988339916512298, 2.0007770638636, 0, 4, 0.3329878351444459, 0, 1.999223237933266, 2.947403624366407, 0.1979406619598302, 1, 0.6782997826987582],
[1.025206229615477, 1.891625919083078, 0, 2, 0.3514793369487882, 0, 1.057291497131449, 1.558737779518065, 0.4205790504043834, 1, 0.6782997826987582],
[0.8272505217284081, 2.172749478271595, 4, 0, 0.2757501739094691, 4.835294623498862, 0, -7.128551043110504, 1, 0.005781801534551878, 0.6782997826987582],
[0.5478146235032667, 2.452113951875841, 1, 2, 0.1826092220992422, 1.825435023265743, 0.8156227806909306, -1.488740330355204, 0.9121402369995584, 0.4538785928039704, 0.6782997826987582],
[0.5484959024501853, 2.451504097549815, 0, 2, 0.1828319674833951, 0, 0.8158256810579773, 1.20275091024214, 0.6677635933670589, 1, 0.6782997826987582],
[0.9302598229627079, 2.002762851730361, 1, 68, 0.3171676206219771, 1.074968493012181, 33.95309631454813, 48.47138191718624, 1.221351744211657e-10, 0.9999999999963045, 0.6782997826987582],
[1.746583881583694, 7.375532622023967, 0, 1, 0.1914669562587746, 0, 0.1355834285125274, 0.7977171254311459, 0.8085330437412254, 1, 0.1699642945978475],
[2.518505697790566, 4.651021428664989, 0, 1, 0.351279192249274, 0, 0.2150065346585677, 1.090507764015315, 0.648720807750726, 1, 0.1971618559292974],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6871347462068883, 1.828637280657671, 1, 2, 0.2731307681575876, 1.455318633674379, 1.093710612353204, -0.5331094459185015, 0.8169500885918212, 0.6159667239971427, 0.6782997826987582],
[0.5471854540855127, 2.452425242594295, 1, 2, 0.182418823446382, 1.827533960439896, 0.8155192522338837, -1.491987369035413, 0.9123106849023579, 0.4534968720689813, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 3, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 1.499999999999999, -0.7371371961975934, 0.7901234567901234, 0.5390946502057614, 0.6782997826987582],
[0.5471854592301783, 2.452814540769823, 1, 0, 0.182395153076726, 1.827533943257329, 0, -2.694286493777281, 1, 0.182395153076726, 0.6782997826987582],
[1.233089920697953, 1.314169150207773, 1, 0, 0.4840850052442857, 0.8109708653153054, 0, -1.195593579712922, 1, 0.4840850052442857, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 2, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0.9999999999999993, -1.474274392395187, 0.8888888888888888, 0.4074074074074074, 0.6782997826987582],
[0.5476721993499259, 2.452327800650075, 1, 0, 0.1825573997833086, 1.825909734302702, 0, -2.691891964107576, 1, 0.1825573997833086, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 4, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1.474274392395187, 0.4609053497942386, 0.8683127572016461, 0.6782997826987582],
[0.001667017516047011, 2.998332982483953, 0, 3, 0.0005556725053490035, 0, 1.000555981448954, 1.475094061608027, 0.9983339086281764, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 0.7371371961975937, 0.6666666666666666, 1, 0.6782997826987582],
[0.6315202104266449, 2.368479789573358, 0, 2, 0.2105067368088814, 0, 0.8444235027060401, 1.244911946376164, 0.623299612624161, 1, 0.6782997826987582],
[0.6304986035001436, 2.36950139649986, 0, 2, 0.2101662011667143, 0, 0.8440594307960005, 1.244375204482202, 0.6238374297794194, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 0.7371371961975937, 0.6666666666666666, 1, 0.6782997826987582],
[0.001982703604044313, 2.998017296395956, 0, 3, 0.0006609012013481041, 0, 1.000661338280612, 1.475249386487006, 0.9980186064784743, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116382822963, 1.999953112818704, 1, 1, 0.3332522286493017, 1.000388512601125, 0.5000117220701313, -0.737692688828735, 0.8889429521002736, 0.5554474093988768, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.5475737502380938, 2.452426249761907, 1, 1, 0.1825245834126979, 1.826238017372425, 0.407759458657354, -2.091226615275263, 0.966684776450021, 0.3317339432754169, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.999709917920638, 0, 3, 0.3333655677923644, 0, 1.500217593119454, 2.211732380556754, 0.2962533190956754, 1, 0.6782997826987582],
[0.003380682155611917, 2.996619317844388, 0, 3, 0.001126894051870639, 0, 1.001128165374721, 1.475937617717526, 0.9966231260839689, 1, 0.6782997826987582],
[0.002394052600487548, 2.997605947399512, 0, 2, 0.0007980175334958493, 0, 0.6671991032493925, 0.9836345525496125, 0.9984046017649921, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854489626844, 2.452814551037316, 1, 0, 0.1823951496542281, 1.82753397754953, 0, -2.694286544333395, 1, 0.1823951496542281, 0.6782997826987582],
[0.9999639108967977, 2.000036089103204, 1, 1, 0.3333213036322657, 1.000036090405673, 0.499990977886999, -0.7372037044286511, 0.8888969085448868, 0.5555395158094184, 0.6782997826987582],
[0.6868639782840743, 2.156831818458437, 0, 1, 0.2415391896246024, 0, 0.4636430116812421, 0.6835370193346384, 0.7584608103753976, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.4790791446684979, 2.364482194844933, 1, 1, 0.1684785687621123, 2.087337783597232, 0.4229255784544327, -2.453800292432035, 0.9716149718678704, 0.3085721093920948, 0.6782997826987582],
[0.5468838270196406, 2.452404306258658, 0, 1, 0.1823378757618337, 0, 0.4077631071874854, 0.601154707090004, 0.8176621242381663, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.001280351265136, 1.998719648734866, 4, 1, 0.3337601170883784, 3.994885143752125, 0.5003202928599678, -5.151947472234617, 0.9958583614390064, 0.04547858459892007, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.026474799082306, 1.890285456352967, 1, 0, 0.3519229244739976, 0.9742080379313991, 0, -1.436249963187822, 1, 0.3519229244739976, 0.6782997826987582],
[0.5476722768692674, 2.452327723130733, 1, 0, 0.1825574256230891, 1.825909475857413, 0, -2.691891583088304, 1, 0.1825574256230891, 0.6782997826987582],
[1.025785019835654, 1.890903859791006, 0, 0, 0.3516950426220831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 4, 1, 0.3333333333333334, 3.999999999999997, 0.4999999999999997, -5.159960373383155, 0.9958847736625515, 0.04526748971193417, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9961140886352321, 2.003885911364769, 1, 2, 0.3320380295450772, 1.003901070579267, 0.9980608120738157, -0.008610143559554442, 0.7424661302999596, 0.7019732741889451, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 1, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0.4999999999999997, -2.211411588592781, 0.9629629629629628, 0.2592592592592594, 0.6782997826987582],
[0.9996828722162118, 2.00031712778379, 1, 1, 0.3332276240720704, 1.000317228385723, 0.4999207306233133, -0.7377217426953568, 0.888959350555283, 0.5554145986994237, 0.6782997826987582],
[0.9994116638269311, 2.000172974117688, 0, 2, 0.3331833518495914, 0, 0.9999135204205205, 1.474146897765696, 0.4446444422505459, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 1.474274392395187, 0.4444444444444444, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854489588084, 2.000316941598888, 1, 1, 0.2147929089240302, 1.827533977562475, 0.4999207771547857, -1.957266144366878, 0.9538640062759535, 0.3834498241240135, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854643674384, 2.452814535632562, 1, 1, 0.1823951547891461, 1.827533926099495, 0.4076949094490373, -2.093232303571335, 0.9667320075094437, 0.3315223170877355, 0.6782997826987582],
[0.001622025598321432, 2.998377974401679, 0, 1, 0.0005406751994404773, 0, 0.3335136558957509, 0.491690642401206, 0.9994593248005595, 1, 0.6782997826987582],
[0.9998189197700954, 2.000181080229906, 1, 2, 0.3332729732566982, 1.000181113025893, 0.9999094680818171, -0.0004004791848744597, 0.7408212171991422, 0.703623216314626, 0.6782997826987582],
[0.5471854592371752, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2148196383788421, 1.82753394323396, 0, -2.694286493742829, 1, 0.2148196383788421, 0.6782997826987582],
[0.005278905835985841, 2.994721094164014, 0, 2, 0.001759635278661947, 0, 0.6678418247019783, 0.9845821003286028, 0.99648382575899, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000022106999941, 1.999906465522212, 1, 2, 0.3333486390841582, 0.9999778934887675, 1.000046769426171, 0.0001015420307658024, 0.7407203328387153, 0.7037241109029417, 0.6782997826987582],
[0.001126206134236124, 2.998873793865764, 0, 2, 0.0003754020447453746, 0, 0.6669170286829096, 0.9832186972395008, 0.9992493368372044, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6305702386615734, 2.36942976133843, 0, 1, 0.2101900795538576, 0, 0.4220424746564869, 0.6222064128891538, 0.7898099204461424, 1, 0.6782997826987582],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9994116809079725, 2.000588319092029, 1, 1, 0.333137226969324, 1.00058866541513, 0.4998529634791889, -0.7382218227221879, 0.8890195880071889, 0.5552940419458372, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.025242972009087, 1.891731610037516, 1, 1, 0.3514747705788226, 0.9753785466486834, 0.5286162131530743, -0.6586502677592956, 0.8764654856465641, 0.5794150268042092, 0.6782997826987582],
[0.5473304748431412, 2.45266952515686, 0, 1, 0.1824434916143804, 0, 0.407719013810491, 0.6010897013534269, 0.8175565083856197, 1, 0.6782997826987582],
[0.005610484439263855, 2.994208533105399, 0, 7, 0.001870274308700132, 0, 2.337846520242213, 3.446627258143294, 0.9869813077398074, 1, 0.6782997826987582],
[0.9992555054156803, 2.000744494584321, 1, 3, 0.3330851684718933, 1.000745049269466, 1.499441836836485, 0.7352159034798001, 0.5930337745073408, 0.8021748502156514, 0.6782997826987582],
[0.5554543855117335, 2.465497096305516, 1, 2, 0.183867363926547, 1.800327850645579, 0.8111954392470989, -1.468436768984769, 0.9110104617039545, 0.4563965113556724, 0.6735955080192763],
[1.010511820164737, 2.021023640329474, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6712437887051929],
[0.5486843607172831, 2.456556184027852, 0, 1, 0.1825758545939674, 0, 0.407073938101577, 0.6011870339613726, 0.8174241454060326, 1, 0.6771169621195328],
[1.025795565147763, 1.896133002766049, 0, 1, 0.3510679817474651, 0, 0.5273891644421649, 0.7788745430203295, 0.6489320182525349, 1, 0.6771169621195328],
[1.001357758594789, 2.003882786150346, 1, 2, 0.3332038629472541, 0.9986440824139667, 0.9980623686289529, -0.0008591038440285364, 0.7409133511552581, 0.7035310429949329, 0.6771169621195328],
[0.9998003146188355, 2.005225427221523, 1, 3, 0.332709401020482, 1.00019972526338, 1.496091142309548, 0.7323571034078267, 0.593701804621196, 0.8017286217101077, 0.6771169621195328],
[0.5472582136489628, 2.452527358020016, 1, 2, 0.1824324441111592, 1.827290984510371, 0.8154852966103702, -1.491679215750769, 0.9122984960536924, 0.453524185363767, 0.6782997826987582],
[0.4790358024219796, 2.364659601786628, 0, 2, 0.1684553843963095, 0, 0.8457876975142182, 1.246923143848099, 0.6914664477394895, 1, 0.6782997826987582],
[1.827079323969613, 1.172532339825129, 1, 2, 0.6091052872018159, 0.547321611536463, 1.705709882849184, 1.707782164847274, 0.3389396399529273, 0.9402718052361014, 0.6782997826987582],
[0.6864602241844948, 2.156388713560298, 0, 2, 0.2414691175005091, 0, 0.927476566457217, 1.367354951474489, 0.5753690997054565, 1, 0.6782997826987582],
[0.8303216618377552, 2.169678338162248, 1, 2, 0.2767738872792515, 1.204352537047745, 0.9217956251035958, -0.4165664196735206, 0.8125925004931855, 0.6217122350648454, 0.6782997826987582],
[0.5473323106775096, 2.369499793084393, 0, 2, 0.1876461487007096, 0, 0.8440600019620965, 1.244376046537751, 0.6599187797207896, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854540862762, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2148196367910564, 1.827533960437346, 0, -2.694286519105341, 1, 0.2148196367910564, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.83094375511933, 1, 0, 0.3532390914484446, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3532390914484447, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.999611639387978, 1.999999783791567, 0, 2, 0.3332470438215641, 0, 1.000000108104228, 1.474274551770484, 0.4445595045726834, 1, 0.6782997826987582],
[0.9991427739520266, 2.000857226047975, 1, 1, 0.333047591317342, 1.000857961514932, 0.4997857853032153, -0.7387178781306637, 0.8890793019177168, 0.5551744845524008, 0.6782997826987582],
[1.233090023759861, 1.314168863483342, 1, 0, 0.4840850806077215, 0.8109707975341999, 0, -1.195593479784974, 1, 0.4840850806077215, 0.6782997826987582],
[1.828657618505531, 1.170176661559853, 2, 0, 0.6097894874223129, 1.093698448392159, 0, -1.61241161546691, 1, 0.3718432189707671, 0.6782997826987582],
[0.9564976235833522, 2.04350237641665, 1, 0, 0.3188325411944505, 1.04548090381414, 0, -1.541325724231363, 1, 0.3188325411944506, 0.6782997826987582],
[0.998834415854721, 2.00116558414528, 0, 1, 0.3329448052849068, 0, 0.4997087736880658, 0.7367078487035179, 0.6670551947150931, 1, 0.6782997826987582],
[0.002570175020189382, 2.997429824979811, 0, 1, 0.0008567250067297939, 0, 0.3336191532046077, 0.4918461743821202, 0.9991432749932702, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.111111111111111, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[0.8431144600753417, 2.000446785504639, 1, 1, 0.2964994903436229, 1.186078578121693, 0.4998883285704283, -1.011632713224693, 0.912088052225972, 0.5050870329132175, 0.6782997826987582],
[0.9996830591146854, 2.000316940885316, 0, 1, 0.3332276863715616, 0, 0.4999207773331221, 0.7370204002485187, 0.6667723136284384, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 1, 0.1823140566701093, 0, 0.4076544742543676, 0.6009945523385377, 0.8176859433298906, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116082995529, 2.000388391700449, 1, 2, 0.3332038694331841, 1.000388542607171, 0.9998058418544818, -0.0008590607981190601, 0.7409133425090315, 0.7035310516461987, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.6359443214711731, 2.364055678528826, 0, 0, 0.2119814404903911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8436703013340455, 1.999178285504132, 1, 0, 0.2967693408787478, 1.185297145601498, 0, -1.7474532291394, 1, 0.2967693408787477, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0, 2.04231430034935, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9992226432160706, 2.000777356783931, 1, 2, 0.3330742144053567, 1.000777961537608, 0.9996114726202316, -0.001719724739901085, 0.7410861654672949, 0.7033580774970992, 0.6782997826987582],
[0.001397411104460845, 2.998602588895539, 0, 2, 0.0004658037014869483, 0, 0.6669773471837928, 0.9833076232607406, 0.9990686095701143, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9998555322190438, 2.000144467780958, 1, 2, 0.3332851774063478, 1.000144488654912, 0.9999277713268793, -0.0003195008071063292, 0.7408049463241715, 0.703639491162958, 0.6782997826987582],
[1.026474749018829, 1.888908202357972, 2, 1, 0.3520891650045742, 1.948416170891421, 0.5294063516435974, -2.092009839074391, 0.9563526399014904, 0.2846056201438358, 0.6782997826987582],
[0.9988226303756472, 2.001177369624354, 0, 2, 0.3329408767918822, 0, 0.9994116615337423, 1.473407020060323, 0.4449678738551828, 1, 0.6782997826987582],
[1.000567963739693, 1.999432036260309, 2, 1, 0.3335226545798975, 1.99886471732001, 0.5001420312692283, -2.209528477346401, 0.9628998200314548, 0.2595117234169744, 0.6782997826987582],
[0.9980605240792609, 2.001939475920741, 1, 4, 0.3326868413597535, 1.001943244797231, 1.998062403040583, 1.468552966772423, 0.4621829889622207, 0.8676730070330568, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.6861477506870965, 2.157279300038002, 1, 0, 0.2413101297999268, 1.457412050099439, 0, -2.148625264629776, 1, 0.2413101297999268, 0.6782997826987582],
[0.9996114505853867, 2.000388549414615, 0, 1, 0.3332038168617953, 0, 0.4999028815140116, 0.7369940169006732, 0.6667961831382047, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000950502348837, 0, 1, 0.2146645249008464, 0, 0.4997624872909846, 0.7367870372928244, 0.7853354750991536, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989672, 0, 4, 0.1823140566701094, 0, 1.630617897017471, 2.403978209354151, 0.4470397358326083, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854540850896, 2.452814545914912, 1, 1, 0.1823951513616965, 1.827533960441309, 0.4076949077399552, -2.093232356720248, 0.9667320087597437, 0.3315223114831368, 0.6782997826987582],
[0.6865252166474528, 1.482567090091756, 1, 1, 0.3165034583887785, 1.456610734392767, 0.67450573176969, -1.153037377531375, 0.8998255608279428, 0.5328324776054997, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 0.7371371961975938, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.6782997826987582],
[0.630498478933429, 2.369501521066574, 0, 2, 0.2101661596444761, 0, 0.844059386423077, 1.244375139064337, 0.6238374953707552, 1, 0.6782997826987582],
[0.9997098827407467, 1.99999995849675, 2, 2, 0.3332688612070318, 2.000580402903406, 1.000000020751625, -1.475130034939362, 0.8889461891322914, 0.4072927902950544, 0.6782997826987582],
[0.002204831899117015, 2.997795168100883, 0, 3, 0.0007349439663723383, 0, 1.000735484506272, 1.475358698368789, 0.9977967881318096, 1, 0.6782997826987582],
[0.000965537341488414, 2.042169248817562, 0, 1, 0.0004725764291368932, 0, 0.4896753785608175, 0.721915871198633, 0.9995274235708631, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9992226171707969, 2.000777382829205, 0, 2, 0.3330742057235987, 0, 0.9996114596077121, 1.473701577244427, 0.4447900150712088, 1, 0.6782997826987582],
[0.3142626418923986, 2.685737358107601, 0, 1, 0.1047542139641329, 0, 0.3723372268629464, 0.5489272388994797, 0.8952457860358671, 1, 0.6782997826987582],
[0.9570570206294178, 2.042942979370584, 1, 0, 0.3190190068764724, 1.044869823265431, 0, -1.540424823826711, 1, 0.3190190068764724, 0.6782997826987582],
[0.9996115167884527, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3332469925501189, 1.000388634189405, 0.4999999999999997, -0.7377101496310441, 0.8889464419563009, 0.5554404270565388, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9996098687270362, 2.000173159561518, 2, 1, 0.3332273898813732, 2.000780567069552, 0.4999567138573254, -2.21262617428666, 0.9629982662241238, 0.2591180125497056, 0.6782997826987582],
[0.8306641581158319, 2.169335841884171, 1, 0, 0.276888052705277, 1.203855963002264, 0, -1.774814018386487, 1, 0.2768880527052771, 0.6782997826987582],
[0.8306642677907751, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2934520625574139, 1.20385580405377, 0, -1.774813784052793, 1, 0.293452062557414, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.830907693260793, 0, 0, 0.3532435912271467, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996115671203324, 2.000317005401204, 1, 2, 0.3332117891994097, 1.000388583818399, 0.9998415224185225, -0.0008065186129060869, 0.7409027848094046, 0.7035416153107237, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 1, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 0.4999999999999997, -3.685685980987969, 0.9876543209876543, 0.1111111111111112, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9992765330935457, 2.000588678980708, 0, 2, 0.3331071439715109, 0, 0.9997057471198887, 1.473840582909152, 0.444746081421835, 1, 0.6782997826987582],
[0.9990486023491457, 2.000951397650856, 2, 1, 0.3330162007830484, 2.001904607340658, 0.4997622636781751, -2.214569990994092, 0.9630685732718982, 0.2588365164957239, 0.6782997826987582],
[0.9999639031319133, 2.000036096868088, 1, 1, 0.3333213010439709, 1.000036098171118, 0.499990975945848, -0.7372037187388371, 0.8888969102703546, 0.5555395123582962, 0.6782997826987582],
[0.004378917715325175, 2.995621082284675, 1, 4, 0.001459639238441725, 228.3669310570136, 1.335282363866031, -334.706945931568, 0.9999787566614655, 0.007276921800750791, 0.6782997826987582],
[0.54733031210547, 2.452669687894531, 0, 1, 0.1824434373684899, 0, 0.4077189867578295, 0.6010896614703808, 0.81755656263151, 1, 0.6782997826987582],
[1.026197689382875, 1.89035098571178, 2, 3, 0.351853441756658, 1.948942217169423, 1.587006869452024, -0.5335920148424089, 0.7619457987781958, 0.5751421797935385, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 0.7371371961975938, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.6782997826987582],
[0.8434270507250977, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2966234180370537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9988340673968276, 2.001165932603174, 0, 2, 0.3329446891322757, 0, 0.9994173733501163, 1.473415440844938, 0.4449627877568365, 1, 0.6782997826987582],
[0.6308869673479945, 2.369113032652009, 0, 2, 0.2102956557826646, 0, 0.8441977957299825, 1.244579192361177, 0.6236329512757317, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996115671095773, 2.000388432890424, 0, 2, 0.3332038557031922, 0, 0.999805821267491, 1.473988119662302, 0.4446170980490893, 1, 0.6782997826987582],
[0.5473303301160219, 2.452669669883979, 0, 1, 0.1824434433720073, 0, 0.4077189897518095, 0.601089665884329, 0.8175565566279928, 1, 0.6782997826987582],
[0.001126075604402888, 2.998873924395597, 0, 2, 0.0003753585348009625, 0, 0.6669169996544908, 0.9832186544436464, 0.9992494238244277, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.999611567098915, 2.000388432901087, 0, 1, 0.3332038556996381, 0, 0.4999029106310808, 0.7369940598272228, 0.6667961443003618, 1, 0.6782997826987582],
[0.4791960062457984, 2.03723152016325, 1, 1, 0.1904271039864251, 2.086828744326097, 0.4908622265572775, -2.35289256826669, 0.9637375180673432, 0.3445917260401935, 0.6782997826987582],
[0.5471854592378916, 2.000316894466939, 1, 1, 0.2147929160662483, 1.827533943231567, 0.4999207889340394, -1.957266076387847, 0.9538640032077575, 0.3834498353402542, 0.6782997826987582],
[0.8297359917230168, 2.04382306587091, 2, 2, 0.2887485432151748, 2.410405261373357, 0.9785582878465872, -2.110935326899068, 0.9245560605069842, 0.3285119156059773, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.6782997826987582],
[0.6302532903836685, 2.369746709616335, 0, 0, 0.2100844301278893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8301768079734443, 2.169823192026559, 1, 0, 0.2767256026578145, 1.204562679173264, 0, -1.775855911940083, 1, 0.2767256026578144, 0.6782997826987582],
[0.8297913548717335, 2.169820090962893, 2, 1, 0.2766329472518892, 2.410244440675275, 0.4608677024260724, -2.873916206331657, 0.9788304458616464, 0.1872382542390922, 0.6782997826987582],
[0.3136744209207511, 2.686325579079248, 0, 0, 0.1045581403069171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996828511350996, 2.000317148864902, 1, 2, 0.333227617045033, 1.000317249480213, 0.9998414507094128, -0.0007014579437239664, 0.7408816846135111, 0.7035627262995879, 0.6782997826987582],
[0.9996116176549628, 2.000388382345039, 0, 2, 0.3332038725516541, 0, 0.9998058465303703, 1.473988156906719, 0.4446170755801108, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 1, 0.1823140566701093, 0, 0.4076544742543676, 0.6009945523385377, 0.8176859433298906, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[1.000325305620654, 1.999674694379347, 1, 1, 0.333441768540218, 0.9996748001686785, 0.5000813396352836, -0.7365378454724802, 0.8888165869927718, 0.5557001240732077, 0.6782997826987582],
[0.4806843654054426, 1.692682252083295, 0, 2, 0.2211704005838001, 0, 1.181556666963613, 1.741938737268264, 0.6065755449267984, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.3151226434105723, 2.684877356589427, 1, 2, 0.1050408811368575, 3.173367642442321, 0.744912982744426, -3.580208517885377, 0.9692171952102158, 0.2831808609506693, 0.6782997826987582],
[0.0008248743308594908, 2.999175125669141, 0, 1, 0.0002749581102864969, 0, 0.3334250112443473, 0.4915599558616189, 0.9997250418897135, 1, 0.6782997826987582],
[1.830395395580114, 1.169216242701799, 1, 0, 0.6102107926973204, 0.5463300456364326, 0, -0.8054403960778872, 1, 0.6102107926973204, 0.6782997826987582],
[0.999611576447727, 2.000388423552275, 0, 1, 0.3332038588159088, 0, 0.4999029129673764, 0.7369940632715635, 0.6667961411840913, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369746709616335, 0, 0, 0.1875216015773122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8292022299821222, 2.17079777001788, 3, 0, 0.2764007433273739, 3.617935277459011, 0, -5.333829332901, 1, 0.02111629010831306, 0.6782997826987582],
[1.233267749089578, 1.313674420920752, 0, 0, 0.4842150574170971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2147446363134778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5471854489623001, 2.3697517926442, 1, 2, 0.1875890372810826, 1.827533977550813, 0.8439702445665728, -1.450042824827285, 0.9076334432473518, 0.4637993631048588, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.5471854592300628, 2.369465996155879, 1, 0, 0.187607421592875, 1.827533943257714, 0, -2.694286493777849, 1, 0.187607421592875, 0.6782997826987582],
[0.8306642727313106, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2934520637905962, 1.203855796893607, 0, -1.774813773496747, 1, 0.2934520637905962, 0.6782997826987582],
[0.547013725215229, 2.452986274784772, 0, 1, 0.1823379084050763, 0, 0.407666365800494, 0.6010120837404779, 0.8176620915949238, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[0.9998550479882018, 2.0001449520118, 3, 1, 0.3332850159960671, 3.00043491907779, 0.4999637646232453, -3.686380591935168, 0.9876614775554675, 0.1110681670360045, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5481092788206673, 2.368794216107069, 0, 1, 0.1879079235133373, 0, 0.4221557082503448, 0.6223733502769374, 0.8120920764866627, 1, 0.6782997826987582],
[1.230700440444606, 1.317651451559106, 0, 2, 0.4829397558109347, 0, 1.517852082683556, 2.23773045694407, 0.2673512961208558, 1, 0.6782997826987582],
[1.000567957641877, 1.999432042358124, 2, 1, 0.3335226525472921, 1.998864729501801, 0.5001420297439081, -2.209528497554444, 0.96289982070976, 0.2595117207060644, 0.6782997826987582],
[0.8305400779418131, 2.169325665549331, 1, 1, 0.2768590826919001, 1.204035815439672, 0.460972741843615, -1.095478861337129, 0.9233490483309994, 0.4770672137148, 0.6782997826987582],
[0.999564929660509, 2.000435070339492, 1, 1, 0.3331883098868362, 1.00043525970808, 0.499891256070756, -0.7379392068294706, 0.8889855501547534, 0.5553621699284261, 0.6782997826987582],
[0.830420570884939, 2.000036090516132, 2, 1, 0.2933874883899061, 2.408418180041827, 0.4999909775337798, -2.813545354408, 0.9747463144900297, 0.2077212840112714, 0.6782997826987582],
[0.5471854540864798, 2.452814545913521, 1, 0, 0.1823951513621599, 1.827533960436666, 0, -2.694286519104338, 1, 0.1823951513621599, 0.6782997826987582],
[0.8430375340765818, 2.000524056584173, 0, 2, 0.2964724016688824, 0, 0.9997380403487534, 1.473888191989515, 0.4949510816135503, 1, 0.6782997826987582],
[1.829502037508199, 1.170426549548011, 3, 0, 0.6098485295289862, 1.639790466746915, 0, -2.417501094018729, 1, 0.2268119554959775, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.54718545923008, 2.000000000000001, 1, 0, 0.214819638376655, 1.827533943257657, 0, -2.694286493777764, 1, 0.214819638376655, 0.6782997826987582],
[0.5475739413294013, 2.452426058670599, 1, 1, 0.1825246471098004, 1.826237380055372, 0.4077594904296832, -2.091225628853922, 0.966684753197443, 0.3317340474170435, 0.6782997826987582],
[0.8301770433184773, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2933304279597528, 1.204562337694484, 0, -1.775855408506663, 1, 0.2933304279597528, 0.6782997826987582],
[1.233089920702108, 1.314169150196213, 1, 0, 0.4840850052473243, 0.8109708653125726, 0, -1.195593579708893, 1, 0.4840850052473243, 0.6782997826987582],
[0.9996104862274428, 2.000389513772559, 0, 1, 0.3332034954091474, 0, 0.4999026405182898, 0.7369936616068519, 0.6667965045908526, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -1.474274392395187, 1, 0.3333333333333334, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.4790207094281568, 1.690071597311053, 1, 0, 0.2208392459554971, 2.087592415772119, 0, -3.077684040331244, 1, 0.2208392459554971, 0.6782997826987582],
[0.4788428498253265, 2.036336737572391, 0, 0, 0.1903811768450109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.453057829989673, 0, 0, 0.1823140566701093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8432491916541086, 2.000312077082293, 1, 0, 0.2965468692112355, 1.185889070392597, 0, -1.748325888701141, 1, 0.2965468692112355, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.000950657580352, 0, 1, 0.2146645118223139, 0, 0.4997624485199697, 0.7367869801337099, 0.7853354881776862, 1, 0.6782997826987582],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5473705525067145, 2.452495238875502, 2, 2, 0.1824650136279958, 3.653831925814946, 0.815495976627063, -4.184486006902387, 0.9790257856686386, 0.1544870908559672, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.831089027478283, 2, 0, 0.3532209656051415, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.1247650505430284, 0.6782997826987582],
[0.4806184300374773, 1.690612376638672, 0, 3, 0.2213575952218719, 0, 1.774504931736448, 2.616107180038017, 0.4720784274705039, 1, 0.6782997826987582],
[0.9994621947283381, 1.516133208694981, 0, 3, 0.3973064163530555, 0, 1.978717953538043, 2.917173208673749, 0.2189221495888612, 1, 0.6782997826987582],
[1.823780122825302, 1.171278337061771, 2, 3, 0.6089297244949491, 1.09662342240122, 2.561304094059912, 2.159341207262594, 0.3021273752738332, 0.9196405689958698, 0.6782997826987582],
[1.000525909906361, 1.99947409009364, 2, 4, 0.3335086366354536, 1.998948733058976, 2.000526048233349, 0.002325395370314114, 0.6800377641759829, 0.6491802062605361, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.999564932015779, 1, 1, 0.3333816812320101, 0.9999999999999993, 0.5001087906617222, -0.7369768089108844, 0.8888566546189185, 0.5556200170829386, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.4791349389833026, 2.364963678811645, 0, 1, 0.1684663590725907, 0, 0.4228394748550571, 0.6233814098726398, 0.8315336409274092, 1, 0.6782997826987582],
[0.5470618852232928, 2.452803635615292, 0, 2, 0.1823621363768222, 0, 0.8153934424099527, 1.202113671871954, 0.6685316760302743, 1, 0.6782997826987582],
[0.8296898093859555, 2.170310190614047, 1, 0, 0.2765632697953183, 1.205269714883071, 0, -1.776898276581561, 1, 0.2765632697953182, 0.6782997826987582],
[0.3166286862939401, 2.682205515660293, 0, 2, 0.105583925275897, 0, 0.7456550172322083, 1.099300097466438, 0.7999801147248722, 1, 0.6782997826987582],
[0.5483503419910467, 2.451649658008954, 1, 2, 0.1827834473303488, 1.823651639149206, 0.8157772434843932, -1.485883412279409, 0.911984146822441, 0.4542277324753176, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -0.7371371961975937, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.6782997826987582],
[0.831009441752914, 2.168601637386937, 1, 1, 0.2770390626744881, 1.20335576198824, 0.4611266462036582, -1.094249378691333, 0.9232493577524412, 0.4773274831014171, 0.6782997826987582],
[0.6858405717249887, 2.157305146095595, 1, 2, 0.2412259658118123, 1.458064805767986, 0.9270825704095249, -0.7828135124057339, 0.8535039620329987, 0.5631449285791739, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.8306641390803668, 2.169335860919636, 1, 0, 0.276888046360122, 1.203855990589778, 0, -1.774814059058052, 1, 0.276888046360122, 0.6782997826987582],
[0.6311678469646858, 2.368832153035318, 1, 2, 0.2103892823215617, 1.58436461047413, 0.8442978948243707, -1.091061407546452, 0.8858342448142389, 0.5076894941981316, 0.6782997826987582],
[0.6857922066309495, 2.15763484409415, 1, 0, 0.2411850891184518, 1.458167634935136, 0, -2.149739204004327, 1, 0.2411850891184518, 0.6782997826987582],
[1.024903981932956, 1.891856452896154, 0, 1, 0.3513843542632269, 0, 0.5285813299783643, 0.7792739190852934, 0.6486156457367731, 1, 0.6782997826987582],
[1.026474813668469, 1.890285443276126, 1, 0, 0.3519229292926997, 0.9742080240879439, 0, -1.43624994277877, 1, 0.3519229292926997, 0.6782997826987582],
[0.997280586001612, 2.00271941399839, 1, 5, 0.3324268620005371, 1.002726829376365, 2.496605348233779, 2.202386845700738, 0.3529589738749039, 0.9114898414819265, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.9996116270229197, 2.000388372977082, 0, 1, 0.3332038756743064, 0, 0.4999029256062652, 0.7369940819047536, 0.6667961243256936, 1, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 1.999583787297279, 2, 0, 0.3333795856061191, 1.999999999999999, 0, -2.948548784790375, 1, 0.1111419480989078, 0.6782997826987582],
[0.6861478573522009, 2.157279193372898, 1, 0, 0.241310167312795, 1.457411823537472, 0, -2.148624930615269, 1, 0.2413101673127951, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6782997826987582],
[0.5469421700103282, 2.369429753101659, 0, 1, 0.1875419817602345, 0, 0.4220424761236193, 0.6222064150521095, 0.8124580182397656, 1, 0.6782997826987582],
[0.9563215508758529, 2.043678449124148, 2, 3, 0.3187738502919508, 2.091346784110729, 1.467941300298831, -0.9190707408626148, 0.8112119387990806, 0.5100352291950958, 0.6782997826987582],
[0.6864583648186279, 2.15764005392961, 1, 1, 0.2413623805327933, 1.456752588722863, 0.4634693345531596, -1.464372066017355, 0.9417442012635433, 0.4244689623291296, 0.6782997826987582],
[0.9994113916743591, 2.000588608325642, 1, 1, 0.3331371305581196, 1.000588954989451, 0.4998528912133177, -0.7382223561739172, 0.8890196522435023, 0.5552939133597415, 0.6782997826987582],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 5, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 2.499999999999998, -0.7371371961975941, 0.7413504039018441, 0.5317786922725195, 0.6782997826987582],
[0.9996830591144371, 2.000316940885565, 1, 1, 0.3332276863714788, 1.000317041368935, 0.4999207773330599, -0.7377213981183122, 0.8889593090355113, 0.555414681778469, 0.6782997826987582],
[1.000199994039509, 1.999411573072086, 1, 1, 0.3334431714445708, 0.9998000459501087, 0.5001471500254971, -0.736625469547753, 0.8888156514169867, 0.5557019943061281, 0.6782997826987582],
[0.479079144704241, 1.690725806560887, 1, 1, 0.2207936452651695, 2.0873377834415, 0.5914619603719804, -2.205331420154468, 0.9512501662105186, 0.3928374567408573, 0.6782997826987582]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1017":{
"Global MG94xREV":0.001162888901205028,
"Nucleotide GTR":0.001149932323733072,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACG", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1136":{
"Global MG94xREV":0.001163524932714491,
"Nucleotide GTR":0.00115056126876031,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.001162940278491309,
"Nucleotide GTR":0.001149983128588236,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "F", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "TTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node143":{
"Global MG94xREV":0.00116541467817679,
"Nucleotide GTR":0.001152429959216013,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "L", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "TTA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node198":{
"Global MG94xREV":0.00116360273643904,
"Nucleotide GTR":0.001150638205617884,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCT", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node237":{
"Global MG94xREV":0.001162833910802337,
"Nucleotide GTR":0.00114987794601781,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACG", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node240":{
"Global MG94xREV":0.001162262087690986,
"Nucleotide GTR":0.001149312493996969,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"Node247":{
"Global MG94xREV":0.001163097770953393,
"Nucleotide GTR":0.001150138866314091,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "T", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "ACC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node307":{
"Global MG94xREV":0.001163456413536256,
"Nucleotide GTR":0.001150493513003276,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node310":{
"Global MG94xREV":0.001162888657983797,
"Nucleotide GTR":0.001149932083221742,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACC", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"Node314":{
"Global MG94xREV":0.001162093559198631,
"Nucleotide GTR":0.001149145843201156,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "E", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "GAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node320":{
"Global MG94xREV":0.001163415538931096,
"Nucleotide GTR":0.001150453093811343,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.001162829074493766,
"Nucleotide GTR":0.001149873163594014,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAG", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node367":{
"Global MG94xREV":0.001162991360214436,
"Nucleotide GTR":0.00115003364117333,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node370":{
"Global MG94xREV":0.001162978151212036,
"Nucleotide GTR":0.001150020579341879,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node379":{
"Global MG94xREV":0.001159914118283241,
"Nucleotide GTR":0.001146990684996726,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node411":{
"Global MG94xREV":0.0007499328340762561,
"Nucleotide GTR":0.0007415772956809674,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node412":{
"Global MG94xREV":2.952865790569179e-05,
"Nucleotide GTR":2.919965799572484e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node413":{
"Global MG94xREV":2.790124795287304e-05,
"Nucleotide GTR":2.759038018184945e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":1.388181548452466e-05,
"Nucleotide GTR":1.372714824366419e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node415":{
"Global MG94xREV":2.529051381542651e-05,
"Nucleotide GTR":2.500873410180497e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node416":{
"Global MG94xREV":2.38601343998061e-05,
"Nucleotide GTR":2.359429156690773e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node417":{
"Global MG94xREV":2.385818334140027e-05,
"Nucleotide GTR":2.359236224663985e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node418":{
"Global MG94xREV":2.401547307074554e-05,
"Nucleotide GTR":2.374789949854585e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node419":{
"Global MG94xREV":2.461951764837481e-05,
"Nucleotide GTR":2.434521398325008e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node420":{
"Global MG94xREV":2.44004960550572e-05,
"Nucleotide GTR":2.412863266624688e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node421":{
"Global MG94xREV":2.48229409500197e-05,
"Nucleotide GTR":2.454637080031111e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":2.438254085741196e-05,
"Nucleotide GTR":2.411087752030825e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":2.713441706529938e-05,
"Nucleotide GTR":2.683209310597823e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node424":{
"Global MG94xREV":2.493986777940317e-05,
"Nucleotide GTR":2.466199486420953e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node459":{
"Global MG94xREV":0.002313633635784218,
"Nucleotide GTR":0.002287855787691677,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node470":{
"Global MG94xREV":0.001163485670603939,
"Nucleotide GTR":0.001150522444097029,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "R", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CGA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node481":{
"Global MG94xREV":0.001163275429746019,
"Nucleotide GTR":0.001150314545682968,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "L", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "CTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node501":{
"Global MG94xREV":0.001163705480917036,
"Nucleotide GTR":0.00115073980534612,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.001162699715033078,
"Nucleotide GTR":0.001149745245419655,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "V", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "GTG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node515":{
"Global MG94xREV":0.001163867927799239,
"Nucleotide GTR":0.001150900442291353,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.001163224335908887,
"Nucleotide GTR":0.001150264021118839,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACG", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.001163556375000131,
"Nucleotide GTR":0.001150592360724946,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.001162256349970472,
"Nucleotide GTR":0.001149306820204506,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTC", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node542":{
"Global MG94xREV":0.001168351192492145,
"Nucleotide GTR":0.001155333755723859,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "S", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TCT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node545":{
"Global MG94xREV":0.001162114509166241,
"Nucleotide GTR":0.001149166559750182,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.001163301826084635,
"Nucleotide GTR":0.001150340647921083,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "V", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GTC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.001163255481788914,
"Nucleotide GTR":0.001150294819980327,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "F", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTT", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node554":{
"Global MG94xREV":0.001163144025395477,
"Nucleotide GTR":0.001150184605402334,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node557":{
"Global MG94xREV":0.001163308177180901,
"Nucleotide GTR":0.001150346928255241,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node560":{
"Global MG94xREV":0.001165494667382368,
"Nucleotide GTR":0.001152509057204608,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "I", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "ATA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node563":{
"Global MG94xREV":0.001163555431322983,
"Nucleotide GTR":0.001150591427561978,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTT", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node566":{
"Global MG94xREV":0.001162155689206982,
"Nucleotide GTR":0.00114920728097462,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.001163377064411992,
"Nucleotide GTR":0.001150415047964392,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.001162936055798832,
"Nucleotide GTR":0.0011499789529438,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "C", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TGT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node576":{
"Global MG94xREV":0.001162849700351594,
"Nucleotide GTR":0.001149893559644398,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "H", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CAC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node581":{
"Global MG94xREV":0.001163376996068309,
"Nucleotide GTR":0.001150414980382173,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node584":{
"Global MG94xREV":0.001163578704466825,
"Nucleotide GTR":0.001150614441403069,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node587":{
"Global MG94xREV":0.001162471175815309,
"Nucleotide GTR":0.001149519252520865,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "T", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ACG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node592":{
"Global MG94xREV":0.001163377051221323,
"Nucleotide GTR":0.001150415034920688,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"Global MG94xREV":0.001162830056926202,
"Nucleotide GTR":0.001149874135080468,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node598":{
"Global MG94xREV":0.001163594566494112,
"Nucleotide GTR":0.001150630126700158,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATT", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node601":{
"Global MG94xREV":0.001163605504755672,
"Nucleotide GTR":0.001150640943090718,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.001163377009158606,
"Nucleotide GTR":0.001150414993326622,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTT", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node610":{
"Global MG94xREV":0.001162936256530352,
"Nucleotide GTR":0.001149979151438827,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node613":{
"Global MG94xREV":0.001162954895635841,
"Nucleotide GTR":0.001149997582872701,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "G", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "GGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node616":{
"Global MG94xREV":0.001163605063978963,
"Nucleotide GTR":0.001150640507225019,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node621":{
"Global MG94xREV":0.001163640364559458,
"Nucleotide GTR":0.001150675414496483,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node626":{
"Global MG94xREV":0.00116359241070908,
"Nucleotide GTR":0.00115062799493427,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAT", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node629":{
"Global MG94xREV":0.001163602483818403,
"Nucleotide GTR":0.001150637955811873,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "S", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "TCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"Global MG94xREV":0.001163610512569372,
"Nucleotide GTR":0.001150645895108782,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "TTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.001163368995570732,
"Nucleotide GTR":0.001150407069023866,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTT", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.00115978683070182,
"Nucleotide GTR":0.001146864815617341,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "F", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TTT", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node645":{
"Global MG94xREV":0.001160063276313568,
"Nucleotide GTR":0.00114713818115069,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.001163602790812115,
"Nucleotide GTR":0.001150638259385149,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node651":{
"Global MG94xREV":0.001162076569202606,
"Nucleotide GTR":0.001149129042502835,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "V", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "GTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node657":{
"Global MG94xREV":0.00116336896787131,
"Nucleotide GTR":0.001150407041633063,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node660":{
"Global MG94xREV":0.00116312860653033,
"Nucleotide GTR":0.001150169358329798,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.001163602954764779,
"Nucleotide GTR":0.0011506384215111,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "V", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GTT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node668":{
"Global MG94xREV":0.001162861819095502,
"Nucleotide GTR":0.001149905543364709,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "N", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "AAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node671":{
"Global MG94xREV":0.001163611011923054,
"Nucleotide GTR":0.001150646388898808,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node674":{
"Global MG94xREV":0.001162079852402802,
"Nucleotide GTR":0.001149132289122547,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "G", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node678":{
"Global MG94xREV":0.001163011100053502,
"Nucleotide GTR":0.001150053161076723,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node683":{
"Global MG94xREV":0.001163328248192564,
"Nucleotide GTR":0.0011503667756414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node688":{
"Global MG94xREV":0.001163142965169624,
"Nucleotide GTR":0.001150183556989217,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node689":{
"Global MG94xREV":0.001163880428825642,
"Nucleotide GTR":0.001150912804034875,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node69":{
"Global MG94xREV":0.001162472557980473,
"Nucleotide GTR":0.001149520619286339,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCC", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node690":{
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.001162975182237806,
"Nucleotide GTR":0.001150017643447115,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node700":{
"Global MG94xREV":0.001162918461350429,
"Nucleotide GTR":0.001149961554527739,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node706":{
"Global MG94xREV":0.001162890565568092,
"Nucleotide GTR":0.001149933969552274,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node711":{
"Global MG94xREV":0.001163005199749278,
"Nucleotide GTR":0.001150047326512011,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node718":{
"Global MG94xREV":0.001163273386974499,
"Nucleotide GTR":0.001150312525671427,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node724":{
"Global MG94xREV":0.001162223697880199,
"Nucleotide GTR":0.001149274531914538,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node730":{
"Global MG94xREV":0.001159923079297434,
"Nucleotide GTR":0.001146999546169847,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "F", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TTT", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node735":{
"Global MG94xREV":0.001162470405909167,
"Nucleotide GTR":0.001149518491192796,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node744":{
"Global MG94xREV":0.001163199900272986,
"Nucleotide GTR":0.001150239857737846,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node749":{
"Global MG94xREV":0.001165862758071767,
"Nucleotide GTR":0.001152873046732213,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node752":{
"Global MG94xREV":0.001162416745024683,
"Nucleotide GTR":0.00114946542818263,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "T", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ACC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node758":{
"Global MG94xREV":0.001163372795409942,
"Nucleotide GTR":0.001150410826526348,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node763":{
"Global MG94xREV":0.001162949831535756,
"Nucleotide GTR":0.001149992575195379,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node768":{
"Global MG94xREV":0.001163292201174317,
"Nucleotide GTR":0.00115033113024878,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node772":{
"Global MG94xREV":0.001163031421124162,
"Nucleotide GTR":0.001150073255735791,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node778":{
"Global MG94xREV":0.001163437612651033,
"Nucleotide GTR":0.001150474921592169,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node783":{
"Global MG94xREV":0.001163190284379422,
"Nucleotide GTR":0.001150230348981833,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node786":{
"Global MG94xREV":0.00116207089653752,
"Nucleotide GTR":0.00114912343304097,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "V", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "GTG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node791":{
"Global MG94xREV":0.001162230973970419,
"Nucleotide GTR":0.00114928172693663,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "N", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAC", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node794":{
"Global MG94xREV":0.00116335761341483,
"Nucleotide GTR":0.001150395813684708,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node797":{
"Global MG94xREV":0.001162952027830075,
"Nucleotide GTR":0.001149994747019212,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node806":{
"Global MG94xREV":0.001163458721171916,
"Nucleotide GTR":0.001150495794927914,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node809":{
"Global MG94xREV":0.001162703436315999,
"Nucleotide GTR":0.001149748925241098,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "R", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CGG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node812":{
"Global MG94xREV":0.001163704369459707,
"Nucleotide GTR":0.001150738706272334,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATA", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node818":{
"Global MG94xREV":0.001163450263816775,
"Nucleotide GTR":0.00115048743180222,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node819":{
"Global MG94xREV":0.001164065508164654,
"Nucleotide GTR":0.001151095821272518,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node823":{
"Global MG94xREV":0.001163598606781634,
"Nucleotide GTR":0.001150634121971946,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node833":{
"Global MG94xREV":0.001163291080210845,
"Nucleotide GTR":0.001150330021774764,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node836":{
"Global MG94xREV":0.001163441972176583,
"Nucleotide GTR":0.001150479232545125,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node839":{
"Global MG94xREV":0.001163208833140963,
"Nucleotide GTR":0.001150248691078348,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node840":{
"Global MG94xREV":0.001163556144561558,
"Nucleotide GTR":0.001150592132853851,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node848":{
"Global MG94xREV":0.001162716641501704,
"Nucleotide GTR":0.001149761983298379,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAC", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node913":{
"Global MG94xREV":0.001163274082811856,
"Nucleotide GTR":0.001150313213755961,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTT", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node920":{
"Global MG94xREV":0.001162310605739374,
"Nucleotide GTR":0.001149360471471057,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node923":{
"Global MG94xREV":0.001163720156286184,
"Nucleotide GTR":0.001150754317206479,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node933":{
"Global MG94xREV":0.00116264684576439,
"Nucleotide GTR":0.001149692965205325,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "R", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "CGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708404811976,
"Nucleotide GTR":0.001149753838379506,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTG", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116517171565962,
"Nucleotide GTR":0.001152189703718124,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "K", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAA", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001166328401344039,
"Nucleotide GTR":0.001153333501939549,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "D", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GAT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163162713231741,
"Nucleotide GTR":0.001150203085024041,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "N", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "AAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163921765066247,
"Nucleotide GTR":0.00115095367971884,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "F", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TTT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162967676261163,
"Nucleotide GTR":0.00115001022109993,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACC", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416589_Japan_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163989731285566,
"Nucleotide GTR":0.00115102088867787,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "F", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TTT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416589_Japan_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171721685136,
"Nucleotide GTR":0.001152189709676506,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGA", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116222602215137,
"Nucleotide GTR":0.001149276830289341,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TCG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164040141937781,
"Nucleotide GTR":0.001151070737668933,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002327920833453586,
"Nucleotide GTR":0.002301983801467151,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "L", "T", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CTT", "ACT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002327361272987555,
"Nucleotide GTR":0.002301430475464722,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "N", "V", "S", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAT", "GTA", "TCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163091927604242,
"Nucleotide GTR":0.001150133088069875,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "F", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "TTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165494287223482,
"Nucleotide GTR":0.001152508681281344,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "S", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "TCT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163514623049198,
"Nucleotide GTR":0.001150551073962375,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "F", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTT", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "T", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ACT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "A", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GCG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163947844253564,
"Nucleotide GTR":0.001150979468339268,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCA", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162855154874237,
"Nucleotide GTR":0.001149898953394302,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "I", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ATT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163515639898494,
"Nucleotide GTR":0.001150552079482225,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "I", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116398956206817,
"Nucleotide GTR":0.001151020721345847,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "V", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GTT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162593712541313,
"Nucleotide GTR":0.001149640423977511,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACA", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165494362234529,
"Nucleotide GTR":0.001152508755456639,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCT", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162878788909532,
"Nucleotide GTR":0.001149922324105895,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "F", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "TTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420241_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTC", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420241_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163371792259459,
"Nucleotide GTR":0.001150409834552683,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAC", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163455031545899,
"Nucleotide GTR":0.001150492146410661,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "L", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTA", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116503512504053,
"Nucleotide GTR":0.001152054634952873,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCA", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708431981483,
"Nucleotide GTR":0.001149753865246299,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTG", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163602175120283,
"Nucleotide GTR":0.001150637650553179,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "I", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATT", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165698283674208,
"Nucleotide GTR":0.001152710404861622,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "S", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGT", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421929_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162883669540925,
"Nucleotide GTR":0.001149927150358682,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "T", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ACT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162906136609,
"Nucleotide GTR":0.001149949367105072,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163224037189399,
"Nucleotide GTR":0.001150263725727599,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATT", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162827636583558,
"Nucleotide GTR":0.001149871741704593,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "K", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAG", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162225979702757,
"Nucleotide GTR":0.001149276788313678,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTC", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423110_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162947851021187,
"Nucleotide GTR":0.001149990616747141,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "Q", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CAA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423110_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162684784065429,
"Nucleotide GTR":0.001149730480808602,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACG", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423168_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162878783922663,
"Nucleotide GTR":0.001149922319174588,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "L", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CTC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001162855187628393,
"Nucleotide GTR":0.001149898985783521,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "TTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424010_England_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163688743345823,
"Nucleotide GTR":0.001150723254260167,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004704274679481926,
"Nucleotide GTR":0.004651860988654786,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "N", "T", "-", "-", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "AAT", "ACT", "---", "---", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162818514813722,
"Nucleotide GTR":0.001149862721566923,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCG", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116222602215137,
"Nucleotide GTR":0.001149276830289341,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGC", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162855154874237,
"Nucleotide GTR":0.001149898953394302,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "F", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "TTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164273009538984,
"Nucleotide GTR":0.001151301010725538,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162226005470314,
"Nucleotide GTR":0.00114927681379414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCC", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162055490093391,
"Nucleotide GTR":0.001149108198251061,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "T", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ACT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162226005470314,
"Nucleotide GTR":0.00114927681379414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "S", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TCA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163904341641091,
"Nucleotide GTR":0.001150936450420533,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001164380021653447,
"Nucleotide GTR":0.00115140683054145,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "F", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "TTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250502094417,
"Nucleotide GTR":0.001149301037483823,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTC", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165494308531582,
"Nucleotide GTR":0.001152508702352035,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "L", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CTG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162956361743167,
"Nucleotide GTR":0.001149999032645077,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "V", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "GTG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163096357230096,
"Nucleotide GTR":0.001150137468342097,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116309188963648,
"Nucleotide GTR":0.001150133050525139,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116309914124935,
"Nucleotide GTR":0.0011501402213426,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTA", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429053_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708390933838,
"Nucleotide GTR":0.001149753824655995,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "D", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "GAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429053_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163085644823359,
"Nucleotide GTR":0.00115012687528995,
"amino-acid": [
["R", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["CGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162684803112206,
"Nucleotide GTR":0.001149730499643163,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "V", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "GTT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116285515150674,
"Nucleotide GTR":0.001149898950064325,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "V", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GTT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163045332107043,
"Nucleotide GTR":0.001150087011726456,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "C", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TGT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162684802455385,
"Nucleotide GTR":0.00114973049899366,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "V", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "GTG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163024514237454,
"Nucleotide GTR":0.001150066425803652,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCC", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432822_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116394909252771,
"Nucleotide GTR":0.001150980702705499,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432822_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433005_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163450442610186,
"Nucleotide GTR":0.001150487608603565,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "I", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "ATA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433005_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433038_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163917161533048,
"Nucleotide GTR":0.001150949127476899,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "V", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GTC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433038_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433999_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708405955713,
"Nucleotide GTR":0.0011497538395105,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "R", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AGA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433999_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163035907388621,
"Nucleotide GTR":0.001150077692015567,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "D", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "GAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171661495114,
"Nucleotide GTR":0.001152189650157104,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "M", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "ATG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435645_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACC", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435645_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708429562397,
"Nucleotide GTR":0.001149753862854165,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "S", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AGT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163540881780204,
"Nucleotide GTR":0.001150577040126066,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAT", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162817773031414,
"Nucleotide GTR":0.001149861988049343,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "T", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "ACC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162597858956957,
"Nucleotide GTR":0.001149644524194971,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "V", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "GTC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162940518195471,
"Nucleotide GTR":0.001149983365621684,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "T", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "ACT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163947495114931,
"Nucleotide GTR":0.001150979123090638,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTA", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438405_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001182820579225507,
"Nucleotide GTR":0.00116964192866458,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "-", "-", "-", "-", "I", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "---", "---", "---", "---", "ATT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438405_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162244723198968,
"Nucleotide GTR":0.001149295322975185,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACG", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438715_England_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708444906376,
"Nucleotide GTR":0.001149753878027187,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "V", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "GTG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163576354396753,
"Nucleotide GTR":0.001150612117516809,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "I", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATT", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162912498949736,
"Nucleotide GTR":0.001149955658558418,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "Y", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TAT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163418449385526,
"Nucleotide GTR":0.001150455971838316,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "L", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "CTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439428_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162708390933838,
"Nucleotide GTR":0.001149753824655995,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "V", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "GTG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439428_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439498_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162857772964331,
"Nucleotide GTR":0.001149901542314381,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "V", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "GTG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439498_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439605_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163506499599876,
"Nucleotide GTR":0.001150543041022216,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "I", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "ATC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439605_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439717_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163199396394909,
"Nucleotide GTR":0.001150239359473835,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "R", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "CGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439717_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439926_England_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00116388270066078,
"Nucleotide GTR":0.001150915050557872,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCT", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439926_England_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440086_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163437940451888,
"Nucleotide GTR":0.001150475245740761,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "S", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "TCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440086_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440194_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163091863473339,
"Nucleotide GTR":0.0011501330246535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "C", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "TGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440194_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440451_England_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162883675955283,
"Nucleotide GTR":0.001149927156701573,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAC", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440451_England_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440617_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTT", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440617_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163479832502292,
"Nucleotide GTR":0.001150516671041853,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440722_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440751_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163540971863762,
"Nucleotide GTR":0.00115057712920594,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "V", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GTT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440751_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440892_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250500989759,
"Nucleotide GTR":0.001149301036391472,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "T", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ACA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440892_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440918_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116290902511994,
"Nucleotide GTR":0.001149952223433044,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGG", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440918_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440938_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164623773435859,
"Nucleotide GTR":0.001151647866510814,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "Y", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TAT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440938_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440980_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTC", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440980_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441065_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116357509325093,
"Nucleotide GTR":0.001150610870422315,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "S", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "TCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441065_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441093_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162708398407994,
"Nucleotide GTR":0.001149753832046877,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAG", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441093_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162878789668831,
"Nucleotide GTR":0.001149922324856736,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "I", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ATA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163033527976092,
"Nucleotide GTR":0.001150075339113776,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001166048650531318,
"Nucleotide GTR":0.001153056868030836,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "Q", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CAA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441893_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163696479428837,
"Nucleotide GTR":0.001150730904149944,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "K", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AAA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441893_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442215_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162883675955283,
"Nucleotide GTR":0.001149927156701573,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCC", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442215_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442367_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162020996883456,
"Nucleotide GTR":0.001149074089354662,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442367_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442426_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250502094417,
"Nucleotide GTR":0.001149301037483823,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "L", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "CTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442426_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442599_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116339646938115,
"Nucleotide GTR":0.0011504342367289,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "V", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GTT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442599_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442797_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163653079443496,
"Nucleotide GTR":0.001150687987714898,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442797_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442943_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163099124065823,
"Nucleotide GTR":0.001150140204350527,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "I", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATA", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442943_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442949_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163091899710135,
"Nucleotide GTR":0.001150133060486556,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "V", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GTT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442949_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443052_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116432730219572,
"Nucleotide GTR":0.00115135469846893,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443052_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443056_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162709203779867,
"Nucleotide GTR":0.001149754628445524,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "S", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TCA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443056_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162912496031231,
"Nucleotide GTR":0.001149955655672428,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "S", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "AGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "R", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CGA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443445_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443642_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162878783922663,
"Nucleotide GTR":0.001149922319174588,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGT", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443642_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444410_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161999381000441,
"Nucleotide GTR":0.001149052714309668,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "V", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "GTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444410_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444415_England_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001163857146355408,
"Nucleotide GTR":0.001150889780971304,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444415_England_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708444906376,
"Nucleotide GTR":0.001149753878027187,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGG", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171701393877,
"Nucleotide GTR":0.001152189689611328,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "I", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "ATT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163947845407265,
"Nucleotide GTR":0.001150979469480114,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTA", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444848_Denmark_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162237457016865,
"Nucleotide GTR":0.001149288137750816,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCC", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444848_Denmark_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444916_Denmark_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001165171720575741,
"Nucleotide GTR":0.001152189708579471,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCA", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444916_Denmark_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444935_Denmark_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116222602398731,
"Nucleotide GTR":0.001149276832104825,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTC", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444935_Denmark_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171649325612,
"Nucleotide GTR":0.00115218963812319,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCA", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162684845989538,
"Nucleotide GTR":0.001149730542042769,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "C", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TGT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116374365912809,
"Nucleotide GTR":0.001150777558186401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162684788031197,
"Nucleotide GTR":0.001149730484730185,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "R", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AGA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACG", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163024551410683,
"Nucleotide GTR":0.001150066462562706,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTC", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001168267418588859,
"Nucleotide GTR":0.001155250915205583,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "P", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "CCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162678147641978,
"Nucleotide GTR":0.001149723918326292,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "S", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "L", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "TCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "TTA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163407975941838,
"Nucleotide GTR":0.001150445615086761,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "V", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GTT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165698120817544,
"Nucleotide GTR":0.001152710243819461,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "F", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "TTT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002328503947286449,
"Nucleotide GTR":0.002302560418411495,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "T", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "I", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "ACA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163729831901943,
"Nucleotide GTR":0.001150763885019278,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "I", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "ATC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "S", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "TCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116288231290776,
"Nucleotide GTR":0.001149925808840738,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "R", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CGG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162226005470314,
"Nucleotide GTR":0.00114927681379414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "P", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "CCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448292_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163614870547045,
"Nucleotide GTR":0.001150650204531108,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "F", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TTC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448292_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448295_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162804271784372,
"Nucleotide GTR":0.001149848637229355,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "S", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "AGT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448295_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448342_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAC", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448342_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448409_England_20200429_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001162684793950556,
"Nucleotide GTR":0.001149730490583592,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "V", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "GTA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448409_England_20200429_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448528_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162855149194584,
"Nucleotide GTR":0.00114989894777793,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "L", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CTT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448528_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449373_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163753333096561,
"Nucleotide GTR":0.001150787124370267,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449373_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449465_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162855155785126,
"Nucleotide GTR":0.001149898954295042,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATT", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449465_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449538_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162697150594698,
"Nucleotide GTR":0.001149742709553517,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "T", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ACC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449538_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449717_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162912492203283,
"Nucleotide GTR":0.001149955651887132,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "I", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATA", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449717_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163947840068441,
"Nucleotide GTR":0.001150979464200775,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "Y", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TAC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162855164909738,
"Nucleotide GTR":0.00114989896331799,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAT", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "R", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "CGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162268789625304,
"Nucleotide GTR":0.001149319121260241,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "T", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ACG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162226005470314,
"Nucleotide GTR":0.00114927681379414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAC", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116413941087543,
"Nucleotide GTR":0.001151168900580306,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163614892149774,
"Nucleotide GTR":0.001150650225893145,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTT", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116291249469699,
"Nucleotide GTR":0.001149955654353052,
"amino-acid": [
["S", "A", "M", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "ATG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162266966263658,
"Nucleotide GTR":0.001149317318213972,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGC", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162912494443817,
"Nucleotide GTR":0.001149955654102701,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "N", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "AAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171725613365,
"Nucleotide GTR":0.001152189713560966,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCA", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162857786554716,
"Nucleotide GTR":0.001149901555753344,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "G", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GGT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163782157766849,
"Nucleotide GTR":0.001150815627884277,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163162713231741,
"Nucleotide GTR":0.001150203085024041,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "I", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "ATC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163162713231741,
"Nucleotide GTR":0.001150203085024041,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "I", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATA", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163540884812295,
"Nucleotide GTR":0.001150577043124375,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "I", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ATT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163476859694412,
"Nucleotide GTR":0.001150513731356152,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "L", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "CTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164182900442203,
"Nucleotide GTR":0.001151211905598692,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCC", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162684797392735,
"Nucleotide GTR":0.001149730493987417,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAG", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162855155785126,
"Nucleotide GTR":0.001149898954295042,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "I", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ATT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452914_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164224700902715,
"Nucleotide GTR":0.001151253240330359,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "H", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAT", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452914_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163779655716799,
"Nucleotide GTR":0.001150813153711355,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453245_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162855187628393,
"Nucleotide GTR":0.001149898985783521,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "V", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453245_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453312_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162039938918584,
"Nucleotide GTR":0.001149092820343023,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "E", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "GAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453312_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453410_England_20200409_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTT", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453410_England_20200409_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453430_England_20200405_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453430_England_20200405_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011641037747817,
"Nucleotide GTR":0.001151133661533798,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453757_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453757_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162244759435255,
"Nucleotide GTR":0.001149295358807736,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "G", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GGA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162958031778573,
"Nucleotide GTR":0.001150000684073423,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "C", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TGC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171715365233,
"Nucleotide GTR":0.001152189703427017,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTA", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163450702063372,
"Nucleotide GTR":0.001150487865165997,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTT", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116285514656358,
"Nucleotide GTR":0.001149898945176239,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "L", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CTT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163162713231741,
"Nucleotide GTR":0.001150203085024041,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "N", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "AAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001164006317517622,
"Nucleotide GTR":0.001151037290110846,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTT", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162041372197546,
"Nucleotide GTR":0.001149094237652795,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCG", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164042234898409,
"Nucleotide GTR":0.00115107280731039,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163242573165569,
"Nucleotide GTR":0.001150282055181192,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "Y", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TAT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163947840954107,
"Nucleotide GTR":0.001150979465076572,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTA", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTC", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162225987624341,
"Nucleotide GTR":0.001149276796147,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "T", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ACA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162855152110415,
"Nucleotide GTR":0.001149898950661273,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "L", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CTT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165931142781222,
"Nucleotide GTR":0.001152940669518678,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCA", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCT", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162684843578034,
"Nucleotide GTR":0.001149730539658132,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "R", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CGA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456685_England_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456685_England_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162279586499284,
"Nucleotide GTR":0.00114932979783852,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAG", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457247_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162299597668406,
"Nucleotide GTR":0.001149349586048886,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCC", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457247_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457264_England_20200507_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162968559760214,
"Nucleotide GTR":0.001150011094755286,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "S", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "AGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457264_England_20200507_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162034587561129,
"Nucleotide GTR":0.001149087528608869,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCG", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162299598481902,
"Nucleotide GTR":0.001149349586853319,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "CTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458337_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162925978134732,
"Nucleotide GTR":0.001149968987562167,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "F", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "TTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458337_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458431_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163989989742543,
"Nucleotide GTR":0.001151021144255192,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458431_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458750_England_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAT", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458750_England_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459037_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "S", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TCT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459037_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459069_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164553032595859,
"Nucleotide GTR":0.001151577913845137,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "L", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTA", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459069_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459205_England_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116306391909228,
"Nucleotide GTR":0.001150105391620788,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTT", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459205_England_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459207_England_20200507_null_10":{
"Global MG94xREV":0.002351719314083414,
"Nucleotide GTR":0.002325517126192855,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "M", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "ATG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459207_England_20200507_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164077057727283,
"Nucleotide GTR":0.001151107242153204,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTT", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162925988528522,
"Nucleotide GTR":0.001149968997840152,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAT", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164171912152511,
"Nucleotide GTR":0.0011512010397374,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162965494058853,
"Nucleotide GTR":0.001150008063211098,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162307060319257,
"Nucleotide GTR":0.001149356965553003,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116263097454279,
"Nucleotide GTR":0.001149677270816363,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162925979697191,
"Nucleotide GTR":0.001149968989107217,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "S", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "TCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "F", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTT", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "L", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "CTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162925989366394,
"Nucleotide GTR":0.001149968998668688,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "F", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "TTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "F", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "TTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001163804677891102,
"Nucleotide GTR":0.001150837897095708,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461522_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162011030164601,
"Nucleotide GTR":0.001149064233682155,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "S", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AGT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461522_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461579_England_20200526_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "C", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TGT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461579_England_20200526_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462050_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "G", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462050_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162034624879122,
"Nucleotide GTR":0.001149087565511076,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "R", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CGA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462343_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002333709580127572,
"Nucleotide GTR":0.002307708051571716,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "L", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "TTA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462343_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165171647262667,
"Nucleotide GTR":0.001152189636083228,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCA", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462936_Wyoming_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163331233105757,
"Nucleotide GTR":0.001150369727297538,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "T", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ACG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462936_Wyoming_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463013_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002329386876322692,
"Nucleotide GTR":0.002303433510103475,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463013_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463027_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250497474379,
"Nucleotide GTR":0.00114930103291526,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAC", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463027_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463038_Odisha_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162857772964331,
"Nucleotide GTR":0.001149901542314381,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCG", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463038_Odisha_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463067_Odisha_20200514_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463067_Odisha_20200514_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463259_British_Columbia_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001164111025856121,
"Nucleotide GTR":0.001151140831818809,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463259_British_Columbia_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463285_Louisiana_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162708450371441,
"Nucleotide GTR":0.00114975388343136,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "G", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GGT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463285_Louisiana_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463333_Washington_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163440806249086,
"Nucleotide GTR":0.001150478079608061,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "F", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "TTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463333_Washington_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463457_Washington_20200501_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162878782990243,
"Nucleotide GTR":0.001149922318252558,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCT", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463457_Washington_20200501_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463666_Washington_20200505_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463666_Washington_20200505_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003491651287011734,
"Nucleotide GTR":0.003452748301216317,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "A", "C", "C", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "GCT", "TGT", "TGT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463913_Quebec_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163705374927972,
"Nucleotide GTR":0.001150739700537958,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "S", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "TCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463913_Quebec_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464058_Ontario_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164009217632829,
"Nucleotide GTR":0.001151040157913793,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAT", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464058_Ontario_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464093_Taoyuan_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250501121763,
"Nucleotide GTR":0.001149301036522006,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCC", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464093_Taoyuan_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464846_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162611414636942,
"Nucleotide GTR":0.001149657928841423,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "G", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "GGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464846_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464959_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250504424656,
"Nucleotide GTR":0.001149301039788097,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACC", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464959_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464970_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163477985425033,
"Nucleotide GTR":0.001150514844544203,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "F", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "TTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464970_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464972_England_20200312_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001163091875225224,
"Nucleotide GTR":0.001150133036274449,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "N", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAT", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464972_England_20200312_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465196_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163750536112662,
"Nucleotide GTR":0.001150784358549568,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465196_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465469_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162857772964331,
"Nucleotide GTR":0.001149901542314381,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "C", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TGT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465469_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164004054773627,
"Nucleotide GTR":0.001151035052577701,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "P", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "CCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465574_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465623_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162902399758058,
"Nucleotide GTR":0.001149945671889061,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "V", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GTC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465623_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465638_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163449942910524,
"Nucleotide GTR":0.001150487114471416,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAT", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465638_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465801_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACG", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465801_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465973_England_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162678599030116,
"Nucleotide GTR":0.001149724364685194,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465973_England_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466064_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001168205523684174,
"Nucleotide GTR":0.001155189709916325,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "S", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TCT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466064_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466295_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164624997108043,
"Nucleotide GTR":0.001151649076549191,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGA", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466295_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165698242553617,
"Nucleotide GTR":0.001152710364199185,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCT", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466387_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466449_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162883688210423,
"Nucleotide GTR":0.001149927168820169,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCC", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466449_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466451_England_20200414_null_54":{
"Global MG94xREV":0.001164365193024379,
"Nucleotide GTR":0.001151392167128751,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466451_England_20200414_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466751_British_Columbia_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162275112135123,
"Nucleotide GTR":0.001149325373326452,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAC", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466751_British_Columbia_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466897_Bavaria_20200424_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162802389480542,
"Nucleotide GTR":0.00114984677589762,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "TTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466897_Bavaria_20200424_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466999_Vaud_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162925970966648,
"Nucleotide GTR":0.001149968980473946,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "V", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GTT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466999_Vaud_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467089_Canary_Islands_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163515639887639,
"Nucleotide GTR":0.001150552079471492,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "F", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "TTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467089_Canary_Islands_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467300_Sarajevo_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002338228587938702,
"Nucleotide GTR":0.002312176709882784,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTG", "CTG", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467300_Sarajevo_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467394_New_York_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162275091241378,
"Nucleotide GTR":0.001149325352665499,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "S", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TCT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467394_New_York_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467405_New_York_20200508_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163613666396754,
"Nucleotide GTR":0.001150649013797116,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTT", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467405_New_York_20200508_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467543_New_Mexico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163515035577979,
"Nucleotide GTR":0.001150551481894878,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "V", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GTA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467543_New_Mexico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467570_New_Mexico_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116324258062338,
"Nucleotide GTR":0.001150282062555912,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "K", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAA", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467570_New_Mexico_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467629_New_Mexico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163063911114065,
"Nucleotide GTR":0.001150105383731465,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "S", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "TCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467629_New_Mexico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467653_New_Mexico_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163830714317413,
"Nucleotide GTR":0.00115086364343156,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCA", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467653_New_Mexico_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467664_New_Mexico_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162708442900626,
"Nucleotide GTR":0.001149753876043783,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "R", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AGG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467664_New_Mexico_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "V", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GTC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467695_England_20200520_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "P", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CCC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467695_England_20200520_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467850_Massachusetts_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "T", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ACG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467850_Massachusetts_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467991_South_Australia_20200325_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001165698239878392,
"Nucleotide GTR":0.001152710361553766,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "Y", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "TAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467991_South_Australia_20200325_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468076_Dhaka_20200516_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162299617719026,
"Nucleotide GTR":0.001149349605876108,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAC", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468076_Dhaka_20200516_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468091_Oregon_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163919481811503,
"Nucleotide GTR":0.001150951421903472,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "N", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "AAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468091_Oregon_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468095_Oregon_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162806663717305,
"Nucleotide GTR":0.001149851002512053,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "T", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ACG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468095_Oregon_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468122_Oregon_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116396971025485,
"Nucleotide GTR":0.001151001090715786,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468122_Oregon_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468210_Basel_Stadt_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011625784229104,
"Nucleotide GTR":0.001149625304699317,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTA", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCC", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468210_Basel_Stadt_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468333_Galicia_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163331233980401,
"Nucleotide GTR":0.001150369728162438,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAC", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468333_Galicia_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468776_Aragon_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":9.096843351111913e-05,
"Nucleotide GTR":8.995488909164094e-05,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468776_Aragon_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468817_Aragon_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001167533098293924,
"Nucleotide GTR":0.00115452477649857,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "I", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATC", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468817_Aragon_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469041_Gujarat_20200608_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164309764282925,
"Nucleotide GTR":0.001151337355958573,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "F", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "TTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469041_Gujarat_20200608_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469070_Stockholm_20200526_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116302448424702,
"Nucleotide GTR":0.001150066396147362,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "Q", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "CAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469070_Stockholm_20200526_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469146_Singapore_20200606_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116359010027995,
"Nucleotide GTR":0.001150625710247285,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "I", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ATA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469146_Singapore_20200606_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469183_Connecticut_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162912502495273,
"Nucleotide GTR":0.00114995566206445,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "I", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "ATC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469183_Connecticut_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469188_Connecticut_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163450112750823,
"Nucleotide GTR":0.001150487282419402,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "AGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469188_Connecticut_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469307_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "CTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469307_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469336_England_20200515_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162221161907544,
"Nucleotide GTR":0.001149272024196969,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "V", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "GTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469336_England_20200515_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470026_Northern_Ireland_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164087143885639,
"Nucleotide GTR":0.001151117215934452,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470026_Northern_Ireland_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470120_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163618631908142,
"Nucleotide GTR":0.001150653923984187,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "K", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AAA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470120_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470289_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162682700044675,
"Nucleotide GTR":0.001149728420007414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACT", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470289_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470374_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163091895150804,
"Nucleotide GTR":0.001150133055978025,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "N", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAT", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470374_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470392_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162192049787483,
"Nucleotide GTR":0.001149243236435873,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "V", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACG", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "GTC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470392_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470878_NW_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116433128877068,
"Nucleotide GTR":0.001151358640626606,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470878_NW_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470880_GP_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163881425390459,
"Nucleotide GTR":0.00115091378949625,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470880_GP_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471243_Wisconsin_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162299601579473,
"Nucleotide GTR":0.001149349589916377,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGC", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471243_Wisconsin_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471587_Telangana_20200418_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001163214101060436,
"Nucleotide GTR":0.001150253900304161,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTA", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471587_Telangana_20200418_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471721_Michigan_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001168205452983828,
"Nucleotide GTR":0.0011551896400037,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "I", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATC", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471721_Michigan_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471891_Michigan_20200421_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162878794670563,
"Nucleotide GTR":0.00114992232980274,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTT", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471891_Michigan_20200421_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471957_England_20200401_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001163024556122287,
"Nucleotide GTR":0.001150066467221815,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "L", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "CTG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471957_England_20200401_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472124_England_20200527_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "E", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "GAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472124_England_20200527_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472230_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162878781868737,
"Nucleotide GTR":0.001149922317143546,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "F", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TTT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472230_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472236_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "G", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "GGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472236_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472298_England_20200504_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACG", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472298_England_20200504_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472313_England_20200505_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163099122546509,
"Nucleotide GTR":0.001150140202848142,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "I", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "ATT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472313_England_20200505_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472829_Wales_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116243244857704,
"Nucleotide GTR":0.001149480956770473,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "R", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CGG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472829_Wales_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473033_Wales_20200523_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116382378015248,
"Nucleotide GTR":0.001150856786525123,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "H", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CAC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473033_Wales_20200523_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473148_Wales_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473148_Wales_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473234_Wales_20200521_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00116352988078164,
"Nucleotide GTR":0.001150566161697503,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473234_Wales_20200521_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473318_England_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163730424087708,
"Nucleotide GTR":0.001150764470607079,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "CGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473318_England_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473433_England_20200526_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116227510871249,
"Nucleotide GTR":0.001149325369941954,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATC", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473433_England_20200526_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473490_England_20200604_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163676267029463,
"Nucleotide GTR":0.001150710916951376,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "S", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "AGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTT", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473490_England_20200604_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473690_Scotland_20200516_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163452391133335,
"Nucleotide GTR":0.001150489535416823,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "I", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "ATA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473690_Scotland_20200516_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473820_Scotland_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162804318798384,
"Nucleotide GTR":0.00114984868371955,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "V", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "GTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473820_Scotland_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473885_Scotland_20200514_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "TTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473885_Scotland_20200514_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474023_Wales_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162835273393023,
"Nucleotide GTR":0.001149879293426898,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "L", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "E", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "CTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GAA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474023_Wales_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474128_Wales_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "N", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAC", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474128_Wales_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474204_Wales_20200510_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162708441155084,
"Nucleotide GTR":0.00114975387431769,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474204_Wales_20200510_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474341_Wales_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001165171660477571,
"Nucleotide GTR":0.001152189649150898,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTA", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474341_Wales_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474647_Wales_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250503547881,
"Nucleotide GTR":0.001149301038921092,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "T", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ACT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474647_Wales_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474658_Wales_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163579806287508,
"Nucleotide GTR":0.001150615530947578,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474658_Wales_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474748_Wales_20200502_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116306393428017,
"Nucleotide GTR":0.001150105406639459,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "F", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "TTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474748_Wales_20200502_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474781_Wales_20200502_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162479013140761,
"Nucleotide GTR":0.001149527002525063,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACC", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474781_Wales_20200502_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474846_Andalusia_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162020644141602,
"Nucleotide GTR":0.001149073740542958,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAC", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474846_Andalusia_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474861_Andalusia_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162902381585205,
"Nucleotide GTR":0.001149945653918686,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "V", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GTC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474861_Andalusia_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475032_Gujarat_20200611_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "T", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ACT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475032_Gujarat_20200611_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475118_Uppsala_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116270843542647,
"Nucleotide GTR":0.001149753868652902,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAG", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475118_Uppsala_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475280_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTC", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475280_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475418_England_20200523_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163672906778758,
"Nucleotide GTR":0.001150707594139629,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475418_England_20200523_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475507_England_20200523_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162768041952534,
"Nucleotide GTR":0.001149812811060001,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCG", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475507_England_20200523_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475514_Uppsala_20200504_null_21":{
"Global MG94xREV":0.001162855159043411,
"Nucleotide GTR":0.001149898957517024,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475514_Uppsala_20200504_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475581_California_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162275070624034,
"Nucleotide GTR":0.001149325332277867,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "P", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CCA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475581_California_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475593_California_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001168177394403442,
"Nucleotide GTR":0.001155161894044041,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "C", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TGT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475593_California_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475607_California_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001165520656969706,
"Nucleotide GTR":0.001152534757223353,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATT", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475607_California_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475631_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163095557351927,
"Nucleotide GTR":0.001150136677375945,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "I", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATA", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475631_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475656_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162517678952679,
"Nucleotide GTR":0.001149565237533501,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "Q", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "CAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475656_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475666_California_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162275074185467,
"Nucleotide GTR":0.001149325335799623,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCC", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475666_California_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475696_California_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001167846951451964,
"Nucleotide GTR":0.001154835132793967,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "R", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "AGA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475696_California_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475704_California_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162275074734408,
"Nucleotide GTR":0.001149325336342445,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTC", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475704_California_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475731_Utah_20200512_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475731_Utah_20200512_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475759_Rangpur_20200607_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475759_Rangpur_20200607_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475856_Austria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "L", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "TTA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475856_Austria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475918_Innsbruck_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00116360814930532,
"Nucleotide GTR":0.001150643558175546,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "I", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ATA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475918_Innsbruck_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475923_Innsbruck_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163595104364055,
"Nucleotide GTR":0.001150630658577308,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "F", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "I", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "TTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ATA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475923_Innsbruck_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475937_Singapore_20200519_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116458638519465,
"Nucleotide GTR":0.001151610894838757,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTA", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475937_Singapore_20200519_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476019_Missouri_20200619_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116270843542647,
"Nucleotide GTR":0.001149753868652902,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAG", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476019_Missouri_20200619_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476020_Missouri_20200619_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476020_Missouri_20200619_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476023_MP_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250502739603,
"Nucleotide GTR":0.00114930103812182,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "CTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476023_MP_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476048_Michigan_20200429_null_9":{
"Global MG94xREV":0.00116270843542647,
"Nucleotide GTR":0.001149753868652902,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "S", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476048_Michigan_20200429_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476065_Michigan_20200531_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTC", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476065_Michigan_20200531_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476096_Zurich_20200527_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116225049545305,
"Nucleotide GTR":0.001149301030916452,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAC", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476096_Zurich_20200527_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476204_S_o_Paulo_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163099993065851,
"Nucleotide GTR":0.001150141063668404,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "E", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GAA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476204_S_o_Paulo_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476257_S_o_Paulo_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163332897438315,
"Nucleotide GTR":0.001150371373086576,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "T", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "ACC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476257_S_o_Paulo_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476753_Minnesota_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162684802455385,
"Nucleotide GTR":0.00114973049899366,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "V", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "GTC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476753_Minnesota_20200514_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476756_Minnesota_20200518_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162275074734408,
"Nucleotide GTR":0.001149325336342445,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGC", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476756_Minnesota_20200518_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476762_Minnesota_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116227507528574,
"Nucleotide GTR":0.001149325336887635,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTC", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476762_Minnesota_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476962_Scherpenheuvel_Zchem_20200411_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001163618231348626,
"Nucleotide GTR":0.001150653527887592,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "I", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ATT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476962_Scherpenheuvel_Zchem_20200411_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477007_Heverlee_20200513_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161527324851597,
"Nucleotide GTR":0.001148585917676208,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "D", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "GAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477007_Heverlee_20200513_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477142_Dakar_20200617_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162855164909738,
"Nucleotide GTR":0.00114989896331799,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGT", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477142_Dakar_20200617_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477169_Tbilisi_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163999460661471,
"Nucleotide GTR":0.001151030509651835,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477169_Tbilisi_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477239_Karnataka_20200617_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163885592669352,
"Nucleotide GTR":0.001150917910344507,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATC", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477239_Karnataka_20200617_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477273_Minnesota_20200520_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477273_Minnesota_20200520_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477685_Washington_20200317_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "V", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "GTG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477685_Washington_20200317_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477762_England_20200613_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162206822158854,
"Nucleotide GTR":0.001149257844217681,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCC", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477762_England_20200613_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477767_England_20200429_null_23":{
"Global MG94xREV":0.001162902386023809,
"Nucleotide GTR":0.001149945658307836,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCT", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477767_England_20200429_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477830_Scotland_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162221189201936,
"Nucleotide GTR":0.001149272051187253,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "G", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GGT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477830_Scotland_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_477908_Scotland_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162872725241459,
"Nucleotide GTR":0.001149916327997488,
"amino-acid": [
["G", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["GGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_477908_Scotland_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478034_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162940546681273,
"Nucleotide GTR":0.001149983393790104,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "D", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GAT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478034_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478047_Scotland_20200423_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "I", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "ATA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478047_Scotland_20200423_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478091_Scotland_20200522_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478091_Scotland_20200522_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478103_Scotland_20200526_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250500278585,
"Nucleotide GTR":0.001149301035688222,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGC", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478103_Scotland_20200526_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478470_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162902385915667,
"Nucleotide GTR":0.001149945658200898,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAT", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478470_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478475_England_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163483216712097,
"Nucleotide GTR":0.001150520017545753,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478475_England_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478576_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164016873854823,
"Nucleotide GTR":0.001151047728832339,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478576_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478594_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162670638140968,
"Nucleotide GTR":0.001149716492494007,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTC", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478594_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478621_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162011029137531,
"Nucleotide GTR":0.001149064232666529,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "R", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AGG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478621_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478672_Egypt_20200602_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162055487038551,
"Nucleotide GTR":0.001149108195230256,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "CTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478672_Egypt_20200602_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478719_England_20200617_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "N", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "AAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478719_England_20200617_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478724_England_20200406_null_38":{
"Global MG94xREV":0.001162275072729934,
"Nucleotide GTR":0.001149325334360305,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "CTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478724_England_20200406_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478783_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116294052056464,
"Nucleotide GTR":0.001149983367964455,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "S", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "AGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478783_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478799_England_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162708390267054,
"Nucleotide GTR":0.00114975382399664,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "V", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "GTG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478799_England_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478906_England_20200421_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001164073921546616,
"Nucleotide GTR":0.00115110414091497,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478906_England_20200421_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_478960_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163614880266701,
"Nucleotide GTR":0.00115065021414247,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTT", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_478960_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479116_England_20200422_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001165494381077241,
"Nucleotide GTR":0.001152508774089411,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCT", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479116_England_20200422_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479122_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164127526809835,
"Nucleotide GTR":0.001151157148923591,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479122_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479180_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250501921172,
"Nucleotide GTR":0.001149301037312508,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCC", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479180_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479182_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164269889204738,
"Nucleotide GTR":0.001151297925157169,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "V", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GTA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479182_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479268_England_20200424_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001162250482527559,
"Nucleotide GTR":0.001149301018134972,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "A", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GCT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479268_England_20200424_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479662_South_Korea_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004682616602060087,
"Nucleotide GTR":0.004630444219373149,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "I", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTA", "ATC", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479662_South_Korea_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479702_Egypt_20200602_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162011031775572,
"Nucleotide GTR":0.001149064235275177,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACG", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479702_Egypt_20200602_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479863_Kansai_20200217_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001163749374624378,
"Nucleotide GTR":0.001150783210002257,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479863_Kansai_20200217_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_479874_Hokkaido_20200312_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001164014334566695,
"Nucleotide GTR":0.001151045217836236,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_479874_Hokkaido_20200312_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480221_Kanto_20200401_null_63":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480221_Kanto_20200401_null_63",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480246_Istanbul_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116317231396862,
"Nucleotide GTR":0.00115021257879224,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "S", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TCT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480246_Istanbul_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480277_Istanbul_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162011019141942,
"Nucleotide GTR":0.001149064222782309,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAG", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480277_Istanbul_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480300_Smolyan_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480300_Smolyan_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480432_Montevideo_20200507_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001162034574737871,
"Nucleotide GTR":0.001149087515928484,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTG", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480432_Montevideo_20200507_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480661_Victoria_20200515_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162250501121763,
"Nucleotide GTR":0.001149301036522006,
"amino-acid": [
["S", "A", "A", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GCG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480661_Victoria_20200515_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480704_Victoria_20200615_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116395366087686,
"Nucleotide GTR":0.001150985220155401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAT", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480704_Victoria_20200615_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480806_Florida_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163242602878548,
"Nucleotide GTR":0.001150282084563119,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "I", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "ATC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480806_Florida_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480882_Florida_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708387565756,
"Nucleotide GTR":0.001149753821325439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "A", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "GCT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480882_Florida_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480935_Florida_20200514_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162250514190548,
"Nucleotide GTR":0.001149301049445182,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCC", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480935_Florida_20200514_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_480995_Catalunya_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "V", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GTT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_480995_Catalunya_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481017_Catalunya_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116309550783279,
"Nucleotide GTR":0.001150136628408534,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "I", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "ATA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481017_Catalunya_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481090_Madrid_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163673001762567,
"Nucleotide GTR":0.001150707688065154,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481090_Madrid_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481093_Madrid_20200603_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162275086140076,
"Nucleotide GTR":0.001149325347621035,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTC", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481093_Madrid_20200603_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481262_Bavaria_20200327_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001162708394899607,
"Nucleotide GTR":0.001149753828577579,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCG", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481262_Bavaria_20200327_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481275_Maryland_20200406_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481275_Maryland_20200406_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481550_Uusimaa_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163522865427762,
"Nucleotide GTR":0.001150559224506703,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "I", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATT", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481550_Uusimaa_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481625_Uusimaa_20200428_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481625_Uusimaa_20200428_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481655_Uusimaa_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162250501121763,
"Nucleotide GTR":0.001149301036522006,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACC", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481655_Uusimaa_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481887_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116227510871249,
"Nucleotide GTR":0.001149325369941954,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "A", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GCA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481887_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_481970_England_20200605_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116334517308493,
"Nucleotide GTR":0.001150383511961428,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "F", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTT", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_481970_England_20200605_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482005_England_20200602_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162244727199698,
"Nucleotide GTR":0.001149295326931338,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "Q", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAG", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482005_England_20200602_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482191_England_20200420_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "T", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ACT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482191_England_20200420_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482348_Oregon_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250502739603,
"Nucleotide GTR":0.00114930103812182,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "T", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ACG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482348_Oregon_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482361_Oregon_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164114085031248,
"Nucleotide GTR":0.001151143856909477,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482361_Oregon_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482384_Oregon_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163672967840879,
"Nucleotide GTR":0.001150707654521412,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482384_Oregon_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482417_Oregon_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162250510016,
"Nucleotide GTR":0.001149301045317146,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "R", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "CGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482417_Oregon_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482688_Singapore_20200602_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "V", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "GTG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482688_Singapore_20200602_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482696_Singapore_20200518_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162826217009187,
"Nucleotide GTR":0.001149870337946716,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTC", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482696_Singapore_20200518_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482701_Dhaka_20200521_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001163091899710135,
"Nucleotide GTR":0.001150133060486556,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "F", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "TTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482701_Dhaka_20200521_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482744_Serbia_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164614157663481,
"Nucleotide GTR":0.001151638357874637,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCA", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482744_Serbia_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482949_Minnesota_20200518_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164269934047486,
"Nucleotide GTR":0.001151297969500291,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAT", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482949_Minnesota_20200518_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_482995_Minnesota_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162925979697191,
"Nucleotide GTR":0.001149968989107217,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCT", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_482995_Minnesota_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483073_South_Australia_20200303_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162962093227513,
"Nucleotide GTR":0.001150004700270852,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAA", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483073_South_Australia_20200303_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483236_California_20200516_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163091853433264,
"Nucleotide GTR":0.001150133014725287,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "L", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "TTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483236_California_20200516_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483444_California_20200402_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483444_California_20200402_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483508_California_20200623_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162855149194584,
"Nucleotide GTR":0.00114989894777793,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "F", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TTT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483508_California_20200623_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483525_California_20200617_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163091935879356,
"Nucleotide GTR":0.00115013309625279,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "H", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAT", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483525_California_20200617_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483542_Bahrain_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163772458434332,
"Nucleotide GTR":0.001150806036618963,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483542_Bahrain_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483705_Sylhet_20200624_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163522868077797,
"Nucleotide GTR":0.00115055922712721,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "L", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "TTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483705_Sylhet_20200624_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_483927_England_20200315_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_483927_England_20200315_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484203_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163618631908142,
"Nucleotide GTR":0.001150653923984187,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTA", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484203_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484425_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163463285608498,
"Nucleotide GTR":0.001150500308508842,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "TTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484425_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484426_England_20200412_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001163862274322881,
"Nucleotide GTR":0.001150894851804421,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484426_England_20200412_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484494_England_20200619_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATT", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484494_England_20200619_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484513_England_20200608_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162227001135313,
"Nucleotide GTR":0.001149277798365723,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484513_England_20200608_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484551_Scotland_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163627498169742,
"Nucleotide GTR":0.001150662691460423,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATT", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484551_Scotland_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484637_Scotland_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001165171728423999,
"Nucleotide GTR":0.001152189716340286,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACA", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484637_Scotland_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484671_Scotland_20200601_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "V", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "GTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484671_Scotland_20200601_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484854_Wisconsin_20200610_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484854_Wisconsin_20200610_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_484987_Wisconsin_20200622_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162912502495273,
"Nucleotide GTR":0.00114995566206445,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "I", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "ATA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_484987_Wisconsin_20200622_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485102_Louisiana_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162912484128694,
"Nucleotide GTR":0.001149955643902507,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "M", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "ATG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485102_Louisiana_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485222_Louisiana_20200423_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001168205461896278,
"Nucleotide GTR":0.001155189648816853,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTC", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485222_Louisiana_20200423_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485325_Louisiana_20200410_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "R", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CGG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485325_Louisiana_20200410_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485603_Vienna_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163679675548638,
"Nucleotide GTR":0.0011507142874938,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "I", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATA", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485603_Vienna_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485716_Keur_Massar_20200612_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164137981327308,
"Nucleotide GTR":0.001151167486959802,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485716_Keur_Massar_20200612_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485816_Virginia_20200524_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162011039117806,
"Nucleotide GTR":0.001149064242535606,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "G", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GGC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485816_Virginia_20200524_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485877_Louisiana_20200424_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001162275119197415,
"Nucleotide GTR":0.001149325380310059,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "L", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "CTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485877_Louisiana_20200424_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485902_Louisiana_20200410_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485902_Louisiana_20200410_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_485968_USA_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001163614884833542,
"Nucleotide GTR":0.001150650218658428,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "F", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "TTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_485968_USA_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_486090_Washington_20200328_null_61":{
"Global MG94xREV":0.001162250501121763,
"Nucleotide GTR":0.001149301036522006,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAC", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_486090_Washington_20200328_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_486427_Brazil_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162902392598734,
"Nucleotide GTR":0.001149945664809506,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "I", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ATA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_486427_Brazil_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_486431_Latvia_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162529429393066,
"Nucleotide GTR":0.001149576857053822,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_486431_Latvia_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_486829_Moscow_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162940542803645,
"Nucleotide GTR":0.001149983389955681,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTA", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_486829_Moscow_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_486838_Karnataka_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164065673747403,
"Nucleotide GTR":0.001151095985010392,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTT", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_486838_Karnataka_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487110_Osun_State_20200511_null_302":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487110_Osun_State_20200511_null_302",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487246_Utah_20200512_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162275074816716,
"Nucleotide GTR":0.001149325336423837,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAC", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487246_Utah_20200512_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487252_Utah_20200513_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATA", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487252_Utah_20200513_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487372_Barishal_20200706_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162708439933345,
"Nucleotide GTR":0.001149753873109563,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "E", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487372_Barishal_20200706_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487376_Barishal_20200706_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162912502495273,
"Nucleotide GTR":0.00114995566206445,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAA", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487376_Barishal_20200706_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487384_Barishal_20200706_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001163125376872804,
"Nucleotide GTR":0.001150166164656199,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "T", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "ACC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487384_Barishal_20200706_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487386_Barishal_20200706_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162250495626295,
"Nucleotide GTR":0.001149301031087767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGC", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487386_Barishal_20200706_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487449_Bamako_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116227510871249,
"Nucleotide GTR":0.001149325369941954,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAC", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487449_Bamako_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487458_Bamako_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162912502445591,
"Nucleotide GTR":0.001149955662015323,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "I", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATA", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487458_Bamako_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487459_Bamako_20200412_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487459_Bamako_20200412_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487462_Bamako_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116291249469699,
"Nucleotide GTR":0.001149955654353052,
"amino-acid": [
["N", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487462_Bamako_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487465_Bamako_20200414_null_87":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487465_Bamako_20200414_null_87",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487589_England_20200420_null_22":{
"Global MG94xREV":0.001163514626215639,
"Nucleotide GTR":0.001150551077093537,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "H"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_487589_England_20200420_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487608_England_20200502_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001164056762602736,
"Nucleotide GTR":0.001151087173151165,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "F", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTT", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487608_England_20200502_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487625_England_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163331277703475,
"Nucleotide GTR":0.001150369771398361,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "CTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487625_England_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487626_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162939670764562,
"Nucleotide GTR":0.001149982527632608,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTC", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487626_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487704_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162882278263817,
"Nucleotide GTR":0.001149925774582787,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "V", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "GTT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487704_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487729_Scotland_20200417_null_59":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487729_Scotland_20200417_null_59",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487873_Scotland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163456830630466,
"Nucleotide GTR":0.00115049392545034,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "I", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "ATT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487873_Scotland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487912_Scotland_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162511873481214,
"Nucleotide GTR":0.001149559496744948,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "C", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TGT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487912_Scotland_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487924_Scotland_20200408_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001162878781996917,
"Nucleotide GTR":0.001149922317270298,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTT", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487924_Scotland_20200408_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_487973_Scotland_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116071832759543,
"Nucleotide GTR":0.001147785934037433,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_487973_Scotland_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488033_England_20200428_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001164141027776408,
"Nucleotide GTR":0.001151170499466233,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTT", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488033_England_20200428_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488126_England_20200510_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116270840686716,
"Nucleotide GTR":0.001149753840411793,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTG", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488126_England_20200510_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488135_England_20200505_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162708431617583,
"Nucleotide GTR":0.001149753864886452,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "E", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "GAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488135_England_20200505_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488250_England_20200326_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488250_England_20200326_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488348_England_20200423_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488348_England_20200423_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488355_England_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116291249469699,
"Nucleotide GTR":0.001149955654353052,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "T", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "ACA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488355_England_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488367_England_20200310_null_44":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488367_England_20200310_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488438_England_20200422_null_68":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488438_England_20200422_null_68",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488446_England_20200413_null_86":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488446_England_20200413_null_86",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488447_England_20200310_null_65":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488447_England_20200310_null_65",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488554_England_20200319_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001168870219989064,
"Nucleotide GTR":0.001155847000363991,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "F", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488554_England_20200319_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488649_England_20200331_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCT", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488649_England_20200331_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488698_England_20200403_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00116270843542647,
"Nucleotide GTR":0.001149753868652902,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "V", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "GTA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488698_England_20200403_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488726_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163424235681879,
"Nucleotide GTR":0.001150461693665402,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "V", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "GTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488726_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488790_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163673416239711,
"Nucleotide GTR":0.001150708097924312,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTT", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488790_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488869_England_20200528_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162275074816716,
"Nucleotide GTR":0.001149325336423837,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "S", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TCG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488869_England_20200528_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_488992_Scotland_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162902380355511,
"Nucleotide GTR":0.001149945652702691,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "V", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GTC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_488992_Scotland_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489116_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708439032879,
"Nucleotide GTR":0.001149753872219129,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "V", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "GTG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489116_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489263_Northern_Ireland_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163614884894196,
"Nucleotide GTR":0.001150650218718406,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCT", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489263_Northern_Ireland_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489282_Northern_Ireland_20200505_null_42":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489282_Northern_Ireland_20200505_null_42",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489341_Northern_Ireland_20200417_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489341_Northern_Ireland_20200417_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489353_Northern_Ireland_20200504_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162878739899246,
"Nucleotide GTR":0.001149922275641669,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "I", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ATA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489353_Northern_Ireland_20200504_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489372_Northern_Ireland_20200424_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489372_Northern_Ireland_20200424_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489375_Northern_Ireland_20200417_null_107":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489375_Northern_Ireland_20200417_null_107",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489414_England_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162958031778573,
"Nucleotide GTR":0.001150000684073423,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "A", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "GCA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489414_England_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489437_England_20200422_null_26":{
"Global MG94xREV":0.001162878783922663,
"Nucleotide GTR":0.001149922319174588,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAT", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489437_England_20200422_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489482_England_20200423_null_27":{
"Global MG94xREV":0.001162708380408153,
"Nucleotide GTR":0.001149753814247582,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "V", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "GTT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489482_England_20200423_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489543_Scotland_20200327_null_53":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489543_Scotland_20200327_null_53",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489569_England_20200421_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163522260622199,
"Nucleotide GTR":0.00115055862643971,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "N", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAT", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489569_England_20200421_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489572_England_20200423_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001162878783022754,
"Nucleotide GTR":0.001149922318284707,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "TTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489572_England_20200423_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489712_Florida_20200530_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708406723757,
"Nucleotide GTR":0.001149753840269987,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACG", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489712_Florida_20200530_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489744_Florida_20200421_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489744_Florida_20200421_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489828_Florida_20200516_null_45":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489828_Florida_20200516_null_45",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489903_Minnesota_20200705_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489903_Minnesota_20200705_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489942_Wisconsin_20200704_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001163126803697783,
"Nucleotide GTR":0.001150167575583898,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTT", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489942_Wisconsin_20200704_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_489986_Vaud_20200630_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001163099096672428,
"Nucleotide GTR":0.001150140177262342,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_489986_Vaud_20200630_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_490042_New_South_Wales_20200701_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490042_New_South_Wales_20200701_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490045_New_South_Wales_20200705_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490045_New_South_Wales_20200705_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490054_Singapore_20200628_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162867979778848,
"Nucleotide GTR":0.001149911635407472,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "V", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "GTG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490054_Singapore_20200628_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490064_Singapore_20200509_null_112":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490064_Singapore_20200509_null_112",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490164_Jashore_20200707_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163947850830472,
"Nucleotide GTR":0.001150979474842899,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "I", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "ATT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490164_Jashore_20200707_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490222_California_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162313709423474,
"Nucleotide GTR":0.001149363540574792,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "V", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "GTG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490222_California_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490223_California_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163989853317,
"Nucleotide GTR":0.001151021009349664,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "S", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "TCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490223_California_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490226_England_20200618_null_107":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490226_England_20200618_null_107",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490230_England_20200615_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163477963577921,
"Nucleotide GTR":0.001150514822940502,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "F", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "TTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490230_England_20200615_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490247_England_20200528_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00116305081028297,
"Nucleotide GTR":0.001150092428866105,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "S", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "AGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490247_England_20200528_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490256_WC_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162708390267054,
"Nucleotide GTR":0.00114975382399664,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGG", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490256_WC_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490292_FS_20200612_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAG", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490292_FS_20200612_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490295_GP_20200615_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTT", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490295_GP_20200615_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490309_GP_20200618_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490309_GP_20200618_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490311_GP_20200619_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163091904455215,
"Nucleotide GTR":0.001150133065178769,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "V", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GTT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490311_GP_20200619_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490344_England_20200608_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162011033971122,
"Nucleotide GTR":0.001149064237446264,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "S", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AGT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490344_England_20200608_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490367_England_20200615_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490367_England_20200615_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490371_England_20200518_null_9":{
"Global MG94xREV":0.00116309189610358,
"Nucleotide GTR":0.001150133056920184,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "I", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATT", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490371_England_20200518_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490405_England_20200627_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162011030115199,
"Nucleotide GTR":0.001149064233633304,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACG", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490405_England_20200627_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490429_England_20200101_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001164046845027386,
"Nucleotide GTR":0.001151077366074619,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490429_England_20200101_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490442_England_20200607_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "T", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ACC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490442_England_20200607_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490520_England_20200423_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001162250492990255,
"Nucleotide GTR":0.001149301028481095,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "A", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GCT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490520_England_20200423_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490581_England_20200503_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001163026822586162,
"Nucleotide GTR":0.001150068708433393,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "F", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TTT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490581_England_20200503_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490621_England_20200419_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001163351977304274,
"Nucleotide GTR":0.001150390240370094,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "F", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "TTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490621_England_20200419_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490622_England_20200426_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001163344246822758,
"Nucleotide GTR":0.001150382596019403,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "F", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "TTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490622_England_20200426_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490645_England_20200507_null_154":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490645_England_20200507_null_154",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490656_Scotland_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163822401377239,
"Nucleotide GTR":0.001150855423111802,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490656_Scotland_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490659_Scotland_20200409_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490659_Scotland_20200409_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490709_Scotland_20200703_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001162226077233438,
"Nucleotide GTR":0.0011492768847577,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "T", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ACC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490709_Scotland_20200703_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490809_Wales_20200619_null_40":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490809_Wales_20200619_null_40",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490859_Wales_20200613_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "H", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CAC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490859_Wales_20200613_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_490867_Wales_20200615_null_397":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_490867_Wales_20200615_null_397",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491059_Suceava_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491059_Suceava_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491334_Wisconsin_20200627_null_30":{
"Global MG94xREV":0.001162855151248508,
"Nucleotide GTR":0.00114989894980897,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491334_Wisconsin_20200627_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491412_Wisconsin_20200629_null_60":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491412_Wisconsin_20200629_null_60",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491461_Lambayeque_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162902392433793,
"Nucleotide GTR":0.001149945664646401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "V", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GTA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491461_Lambayeque_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491576_Scotland_20200406_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491576_Scotland_20200406_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491679_Scotland_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162644245985743,
"Nucleotide GTR":0.001149690394392672,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "G", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491679_Scotland_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491720_England_20200630_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491720_England_20200630_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491973_Muscat_20200515_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162562989097011,
"Nucleotide GTR":0.001149610042845087,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491973_Muscat_20200515_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_491992_Muscat_20200521_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_491992_Muscat_20200521_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492002_Muscat_20200527_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492002_Muscat_20200527_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492073_Mazowieckie_20200418_null_57":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTT", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492073_Mazowieckie_20200418_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492077_North_Macedonia_20200627_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163091895677444,
"Nucleotide GTR":0.001150133056498795,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "F", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "TTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492077_North_Macedonia_20200627_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492080_North_Macedonia_20200626_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164227596124811,
"Nucleotide GTR":0.001151256103294713,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492080_North_Macedonia_20200626_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492132_South_Australia_20200420_null_196":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492132_South_Australia_20200420_null_196",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492154_South_Australia_20200322_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001162878778392717,
"Nucleotide GTR":0.001149922313706256,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "V", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GTA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492154_South_Australia_20200322_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492165_South_Australia_20200320_null_6353":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492165_South_Australia_20200320_null_6353",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_492174_South_Australia_20200314_null_52816":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_492174_South_Australia_20200314_null_52816",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":13402.37820297071,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01643832301204794],
[0.01048775151148772],
[0.01335877409939403],
[0.0306748056413725],
[0.01387259000235633],
[0.008850798019897056],
[0.01127370449401471],
[0.02588700816700356],
[0.01129278322256886],
[0.007204865376145488],
[0.009177197693046793],
[0.02107294827146092],
[0.02871024119199413],
[0.0183173110320212],
[0.02333167599528663],
[0.0535748730473224],
[0.007273223178250812],
[0.004640361265877347],
[0.005910660433033101],
[0.01357223040426032],
[0.006138001003725154],
[0.00391608251383982],
[0.004988110330385994],
[0.0114538440251979],
[0.004996551814996674],
[0.003187830888318189],
[0.004060499779906816],
[0.009323837698634886],
[0.01270299844684509],
[0.008104591390720466],
[0.01032322375658291],
[0.0237044866519559],
[0.01381377968245098],
[0.008813276672918634],
[0.01122591167611273],
[0.02577726490843142],
[0.01165769171083153],
[0.007437679243261162],
[0.009473744369862886],
[0.02175388737614578],
[0.009489776987829764],
[0.006054536273246873],
[0.007711965931143491],
[0.01770844048193342],
[0.02412636290000888],
[0.01539276839771419],
[0.01960653964428131],
[0.04502110660853792],
[0.01227319619056751],
[0.03589691339766371],
[0.01623427276892761],
[0.01035756619732057],
[0.01319295054788132],
[0.03029403677923228],
[0.00843142843260565],
[0.01073953245774502],
[0.02466042680035164],
[0.03359789964911862],
[0.02143566728610948],
[0.02730368245579141],
[0.06269550981202274]
],
"Log Likelihood":-5993.19646088121,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6412527759744328, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":705
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":14420.67602329573,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2413557510102624],
[0.1653374005059852],
[0.1973101199052333],
[0.3959967285785191]
],
"Log Likelihood":-6058.69489932234,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2731670567876409,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1136695941566285,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1107744167244437,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.089354646725453,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6170977223604117
},
"display order":0,
"estimated parameters":1149
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-07-20/sequences.nsp6.compressed.fas",
"number of sequences":572,
"number of sites":292,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_463457_Washington_20200501_null_2,epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1,epi_isl_466897_Bavaria_20200424_null_2,epi_isl_464959_England_20200312_null_1,(epi_isl_441065_England_20200401_null_1,epi_isl_491576_Scotland_20200406_null_13)Node1136,epi_isl_463913_Quebec_20200411_null_2,epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2,epi_isl_440892_England_20200421_null_1,epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1,epi_isl_478621_England_20200329_null_5,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1,epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1,epi_isl_476756_Minnesota_20200518_null_2,epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1,epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1,epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1,epi_isl_475581_California_20200402_null_1,epi_isl_424010_England_20200320_null_6,epi_isl_440980_England_20200331_null_1,epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1,epi_isl_471957_England_20200401_null_10,epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1,epi_isl_487458_Bamako_20200412_null_1,epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1,epi_isl_469336_England_20200515_null_5,epi_isl_490520_England_20200423_null_16,epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1,epi_isl_478783_England_20200415_null_1,epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1,epi_isl_463027_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_481017_Catalunya_20200408_null_1,epi_isl_483705_Sylhet_20200624_null_2,epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1,epi_isl_459205_England_20200503_null_3,epi_isl_471243_Wisconsin_20200403_null_1,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1,epi_isl_463285_Louisiana_20200404_null_3,epi_isl_485968_USA_20200415_null_7,epi_isl_490164_Jashore_20200707_null_2,epi_isl_443642_England_20200415_null_3,epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1,epi_isl_474861_Andalusia_20200316_null_3,epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1,epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_444916_Denmark_20200328_null_4,epi_isl_480277_Istanbul_20200504_null_1,epi_isl_479268_England_20200424_null_7,epi_isl_473820_Scotland_20200411_null_1,epi_isl_478672_Egypt_20200602_null_2,epi_isl_476753_Minnesota_20200514_null_1,epi_isl_433999_England_20200413_null_1,epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1,epi_isl_478470_England_20200411_null_1,epi_isl_486090_Washington_20200328_null_61,epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1,epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1,epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1,epi_isl_474204_Wales_20200510_null_4,epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1,epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_2,epi_isl_480661_Victoria_20200515_null_3,epi_isl_475631_California_20200325_null_1,epi_isl_481550_Uusimaa_20200513_null_1,epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4,epi_isl_489437_England_20200422_null_26,epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1,epi_isl_466999_Vaud_20200505_null_2,(epi_isl_465801_England_20200311_null_1,epi_isl_470289_England_20200418_null_2)Node1017,epi_isl_490256_WC_20200423_null_1,epi_isl_477142_Dakar_20200617_null_1,epi_isl_475118_Uppsala_20200401_null_1,epi_isl_469070_Stockholm_20200526_null_1,epi_isl_485877_Louisiana_20200424_null_12,epi_isl_488355_England_20200307_null_1,epi_isl_480806_Florida_20200401_null_1,epi_isl_486829_Moscow_20200401_null_1,epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1,epi_isl_440194_England_20200318_null_1,epi_isl_481887_England_20200418_null_2,epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3,epi_isl_480935_Florida_20200514_null_3,epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1,epi_isl_467405_New_York_20200508_null_2,epi_isl_420241_England_20200326_null_1,epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5,epi_isl_477830_Scotland_20200408_null_2,epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2,(epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1)Node237,(epi_isl_477007_Heverlee_20200513_null_2,epi_isl_487729_Scotland_20200417_null_59)Node240,epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2,(epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1,epi_isl_465574_England_20200501_null_1)Node247,epi_isl_481655_Uusimaa_20200402_null_2,epi_isl_476048_Michigan_20200429_null_9,epi_isl_464972_England_20200312_null_7,epi_isl_481093_Madrid_20200603_null_2,epi_isl_423168_England_20200325_null_2,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_442949_England_20200411_null_1,epi_isl_479702_Egypt_20200602_null_1,epi_isl_444935_Denmark_20200328_null_1,epi_isl_482417_Oregon_20200507_null_1,epi_isl_467543_New_Mexico_20200401_null_1,epi_isl_476204_S_o_Paulo_20200325_null_1,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2,epi_isl_467629_New_Mexico_20200401_null_1,epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1,epi_isl_487376_Barishal_20200706_null_5,epi_isl_457264_England_20200507_null_4,epi_isl_470374_England_20200406_null_1,epi_isl_485102_Louisiana_20200427_null_1,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_489263_Northern_Ireland_20200502_null_2,epi_isl_489482_England_20200423_null_27,epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_474846_Andalusia_20200401_null_2,(epi_isl_474658_Wales_20200429_null_2,epi_isl_490867_Wales_20200615_null_397)Node307,(epi_isl_435645_California_20200313_null_1,epi_isl_474781_Wales_20200502_null_5)Node310,(epi_isl_453312_England_20200403_null_1,epi_isl_472124_England_20200527_null_6)Node314,epi_isl_475656_California_20200331_null_1,epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1,(epi_isl_444415_England_20200420_null_5,epi_isl_479122_England_20200423_null_1,epi_isl_489828_Florida_20200516_null_45)Node320,(epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2,epi_isl_490292_FS_20200612_null_8)Node325,(epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1,epi_isl_453757_England_20200422_null_1,epi_isl_466451_England_20200414_null_54)Node772,((epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_2,epi_isl_483927_England_20200315_null_4)Node689,epi_isl_483444_California_20200402_null_5)Node688,(epi_isl_462050_England_20200419_null_2,epi_isl_491679_Scotland_20200422_null_3)Node674,(epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1,epi_isl_490042_New_South_Wales_20200701_null_32)Node671,(epi_isl_473885_Scotland_20200514_null_5,epi_isl_484425_England_20200412_null_1)Node632,(epi_isl_465196_England_20200416_null_4,epi_isl_484854_Wisconsin_20200610_null_16)Node601,(epi_isl_473033_Wales_20200523_null_1,epi_isl_490859_Wales_20200613_null_22)Node576,(epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2,epi_isl_480300_Smolyan_20200414_null_3)Node566,(epi_isl_486838_Karnataka_20200101_null_1,epi_isl_492073_Mazowieckie_20200418_null_57)Node563,(epi_isl_473690_Scotland_20200516_null_2,epi_isl_478047_Scotland_20200423_null_27)Node560,(epi_isl_477273_Minnesota_20200520_null_3,epi_isl_490429_England_20200101_null_7)Node557,(epi_isl_475731_Utah_20200512_null_7,epi_isl_485716_Keur_Massar_20200612_null_1)Node554,(epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1,epi_isl_481970_England_20200605_null_1)Node551,(epi_isl_433038_England_20200403_null_2,epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_4)Node548,(epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3,epi_isl_491973_Muscat_20200515_null_4)Node545,(epi_isl_459037_England_20200409_null_1,epi_isl_480246_Istanbul_20200426_null_1)Node542,(epi_isl_476065_Michigan_20200531_null_2,epi_isl_478594_England_20200327_null_1)Node539,epi_isl_471587_Telangana_20200418_null_8,((epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1,epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1)Node529,epi_isl_442215_England_20200405_null_2,epi_isl_464970_England_20200312_null_1,epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1,epi_isl_439605_England_20200328_null_2,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,epi_isl_469146_Singapore_20200606_null_1,epi_isl_490223_California_20200401_null_4,epi_isl_480704_Victoria_20200615_null_2,epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1,epi_isl_476020_Missouri_20200619_null_1,epi_isl_492165_South_Australia_20200320_null_6353,epi_isl_440451_England_20200311_null_2,epi_isl_463038_Odisha_20200511_null_1,epi_isl_465469_England_20200428_null_1,epi_isl_465638_England_20200507_null_1,epi_isl_422000_England_20200402_null_1,epi_isl_490230_England_20200615_null_1,epi_isl_487704_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_487626_England_20200423_null_1,((((((((((((((epi_isl_462343_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_468776_Aragon_20200324_null_1)Node424,epi_isl_482696_Singapore_20200518_null_4)Node423,epi_isl_463333_Washington_20200422_null_2)Node422,epi_isl_443056_England_20200411_null_2)Node421,epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1)Node420,epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1)Node419,epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9,epi_isl_459069_England_20200410_null_1)Node418,epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1,epi_isl_487625_England_20200422_null_2)Node417,epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1,epi_isl_467991_South_Australia_20200325_null_10)Node416,epi_isl_466387_England_20200413_null_1,epi_isl_489414_England_20200422_null_3)Node415,epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1,epi_isl_462936_Wyoming_20200325_null_1)Node414,epi_isl_439717_England_20200408_null_1,epi_isl_476962_Scherpenheuvel_Zchem_20200411_null_5)Node413,epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2,epi_isl_468333_Galicia_20200429_null_1,epi_isl_421929_England_20200329_null_1,epi_isl_470120_England_20200421_null_1)Node412,epi_isl_440751_England_20200403_null_1)Node411,(epi_isl_473148_Wales_20200516_null_1,epi_isl_475280_England_20200331_null_2)Node459,epi_isl_490226_England_20200618_null_107,epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1,(epi_isl_423110_England_20200324_null_1,epi_isl_443445_England_20200416_null_1)Node470,epi_isl_466449_England_20200414_null_1,epi_isl_433005_England_20200402_null_1,epi_isl_439498_England_20200401_null_1,(epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1,epi_isl_474023_Wales_20200423_null_1)Node481,epi_isl_488726_England_20200328_null_1,epi_isl_416589_Japan_20200216_null_1,epi_isl_484203_England_20200331_null_2,epi_isl_487608_England_20200502_null_4,(epi_isl_463013_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_452914_England_20200507_null_1,epi_isl_463067_Odisha_20200514_null_17)Node515,(epi_isl_470878_NW_20200428_null_1,epi_isl_490064_Singapore_20200509_null_112,epi_isl_466295_England_20200408_null_2,epi_isl_479182_England_20200101_null_1,epi_isl_482949_Minnesota_20200518_null_2,epi_isl_488554_England_20200319_null_11)Node501,(epi_isl_482688_Singapore_20200602_null_2,epi_isl_490054_Singapore_20200628_null_1)Node512,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_440938_England_20200426_null_1,(epi_isl_470392_England_20200409_null_1,epi_isl_472298_England_20200504_null_12)Node525,epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1,epi_isl_439926_England_20200324_null_4,epi_isl_482744_Serbia_20200403_null_1,epi_isl_475937_Singapore_20200519_null_1,epi_isl_488033_England_20200428_null_6)Node379,(epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1,epi_isl_479863_Kansai_20200217_null_9)Node367,(epi_isl_470880_GP_20200428_null_1,epi_isl_442797_England_20200407_null_2,epi_isl_492132_South_Australia_20200420_null_196,epi_isl_440918_England_20200419_null_1,epi_isl_473318_England_20200506_null_2)Node370,epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_439428_England_20200331_null_3,epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1,epi_isl_477767_England_20200429_null_23,epi_isl_471891_Michigan_20200421_null_4,epi_isl_465623_England_20200505_null_1,epi_isl_466064_England_20200401_null_1,epi_isl_429053_California_20200408_null_1,epi_isl_481262_Bavaria_20200327_null_13,epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3,epi_isl_477762_England_20200613_null_1,(epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1,epi_isl_488649_England_20200331_null_8)Node198,epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1,epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1,epi_isl_487462_Bamako_20200413_null_1,epi_isl_457247_England_20200513_null_1,epi_isl_474341_Wales_20200413_null_2,epi_isl_488698_England_20200403_null_6,epi_isl_466751_British_Columbia_20200401_null_3,epi_isl_485222_Louisiana_20200423_null_3,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_484987_Wisconsin_20200622_null_2,(epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1,epi_isl_475856_Austria_20200321_null_1)Node143,epi_isl_476257_S_o_Paulo_20200328_null_1,epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3,epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3,epi_isl_475593_California_20200404_null_1,epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1,epi_isl_492154_South_Australia_20200322_null_10,epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_482995_Minnesota_20200311_null_2,epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6,epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1,epi_isl_474748_Wales_20200502_null_3,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_492174_South_Australia_20200314_null_52816,epi_isl_488126_England_20200510_null_3,epi_isl_461522_England_20200101_null_1,epi_isl_482701_Dhaka_20200521_null_11,epi_isl_483508_California_20200623_null_2,epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_476762_Minnesota_20200601_null_1,epi_isl_489712_Florida_20200530_null_1,epi_isl_467394_New_York_20200426_null_1,epi_isl_475696_California_20200326_null_2,epi_isl_448528_England_20200405_null_1,epi_isl_472230_England_20200329_null_1,epi_isl_484637_Scotland_20200417_null_3,epi_isl_488992_Scotland_20200403_null_3,epi_isl_441093_England_20200401_null_2,epi_isl_475607_California_20200328_null_3,(epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3,epi_isl_475923_Innsbruck_20200401_null_2)Node131,epi_isl_475918_Innsbruck_20200319_null_5,epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1,epi_isl_487924_Scotland_20200408_null_20,epi_isl_490371_England_20200518_null_9,epi_isl_490405_England_20200627_null_9,(epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1,epi_isl_489903_Minnesota_20200705_null_5)Node570,(epi_isl_461579_England_20200526_null_9,epi_isl_487912_Scotland_20200410_null_1)Node573,epi_isl_487372_Barishal_20200706_null_2,(epi_isl_467850_Massachusetts_20200314_null_1,epi_isl_468095_Oregon_20200423_null_1)Node587,epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1,epi_isl_475666_California_20200401_null_1,(epi_isl_458431_England_20200501_null_1,epi_isl_488446_England_20200413_null_86)Node581,(epi_isl_489372_Northern_Ireland_20200424_null_30,epi_isl_492080_North_Macedonia_20200626_null_2)Node584,(epi_isl_484494_England_20200619_null_2,epi_isl_484551_Scotland_20200410_null_1)Node598,(epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3,epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24)Node592,(epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2,epi_isl_485902_Louisiana_20200410_null_13)Node595,(epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1,epi_isl_488250_England_20200326_null_10)Node616,(epi_isl_464846_England_20200311_null_1,epi_isl_472236_England_20200330_null_3)Node613,(epi_isl_440617_England_20200401_null_1,epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1)Node607,(epi_isl_484513_England_20200608_null_2,epi_isl_491720_England_20200630_null_31)Node610,(epi_isl_440086_England_20200323_null_2,epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1)Node629,(epi_isl_490656_Scotland_20200409_null_2,epi_isl_441893_England_20200430_null_1,epi_isl_475759_Rangpur_20200607_null_11)Node621,(epi_isl_458750_England_20200418_null_4,epi_isl_464058_Ontario_20200415_null_1)Node626,epi_isl_474647_Wales_20200430_null_1,(epi_isl_444410_England_20200420_null_1,epi_isl_484671_Scotland_20200601_null_9)Node651,(epi_isl_440722_England_20200405_null_2,epi_isl_492002_Muscat_20200527_null_27)Node648,(epi_isl_488790_England_20200323_null_1,epi_isl_490295_GP_20200615_null_5)Node638,((epi_isl_478091_Scotland_20200522_null_4,epi_isl_490659_Scotland_20200409_null_16)Node645,epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1,epi_isl_491059_Suceava_20200416_null_5)Node641,epi_isl_471721_Michigan_20200427_null_1,epi_isl_487246_Utah_20200512_null_5,(epi_isl_468091_Oregon_20200422_null_1,epi_isl_478719_England_20200617_null_5)Node668,(epi_isl_442599_England_20200407_null_1,epi_isl_480995_Catalunya_20200404_null_1)Node665,(epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8,epi_isl_489543_Scotland_20200327_null_53)Node657,(epi_isl_478576_England_20200325_null_1,epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1,epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5)Node660,(epi_isl_479874_Hokkaido_20200312_null_4,epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2,epi_isl_480221_Kanto_20200401_null_63)Node678,(epi_isl_478475_England_20200323_null_4,epi_isl_467300_Sarajevo_20200408_null_1,epi_isl_487459_Bamako_20200412_null_29)Node683,(epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1,epi_isl_468210_Basel_Stadt_20200417_null_1)Node69,epi_isl_489942_Wisconsin_20200704_null_5,(epi_isl_483542_Bahrain_20200311_null_4,epi_isl_473234_Wales_20200521_null_4,epi_isl_487110_Osun_State_20200511_null_302)Node695,(epi_isl_484426_England_20200412_null_13,epi_isl_481090_Madrid_20200412_null_1,epi_isl_490809_Wales_20200619_null_40)Node700,(epi_isl_482361_Oregon_20200420_null_2,epi_isl_468122_Oregon_20200506_null_1,epi_isl_489282_Northern_Ireland_20200505_null_42)Node706,(epi_isl_478906_England_20200421_null_10,epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2,epi_isl_482384_Oregon_20200427_null_1)Node711,(epi_isl_465973_England_20200331_null_4,epi_isl_442367_England_20200417_null_1,epi_isl_488438_England_20200422_null_68)Node724,(epi_isl_463259_British_Columbia_20200301_null_3,epi_isl_475418_England_20200523_null_3,epi_isl_490645_England_20200507_null_154)Node718,epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1,(epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2,epi_isl_487465_Bamako_20200414_null_87,epi_isl_487973_Scotland_20200412_null_1)Node730,(epi_isl_486431_Latvia_20200316_null_1,epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1,epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2,epi_isl_488447_England_20200310_null_65)Node735,epi_isl_475514_Uppsala_20200504_null_21,(epi_isl_449538_England_20200330_null_3,epi_isl_490442_England_20200607_null_12,epi_isl_490709_Scotland_20200703_null_12)Node752,(epi_isl_470026_Northern_Ireland_20200407_null_2,epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1,epi_isl_489375_Northern_Ireland_20200417_null_107)Node744,(epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1,epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5)Node749,epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1,(epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_491992_Muscat_20200521_null_6)Node758,epi_isl_483073_South_Australia_20200303_null_3,epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_478034_Scotland_20200420_null_1,(epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1,epi_isl_463666_Washington_20200505_null_3)Node763,epi_isl_475507_England_20200523_null_1,(epi_isl_432822_England_20200406_null_1,epi_isl_490367_England_20200615_null_7)Node768,epi_isl_467653_New_Mexico_20200403_null_1,(epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1,epi_isl_456685_England_20200101_null_4)Node778,epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1,(epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1,epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2)Node783,(epi_isl_477685_Washington_20200317_null_24,epi_isl_490222_California_20200401_null_1)Node786,(epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1,epi_isl_477169_Tbilisi_20200501_null_1,epi_isl_449373_England_20200328_null_1,epi_isl_490309_GP_20200618_null_20)Node797,(epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1,epi_isl_474128_Wales_20200511_null_1)Node791,(epi_isl_443052_England_20200412_null_1,epi_isl_453430_England_20200405_null_20)Node794,(epi_isl_477239_Karnataka_20200617_null_1,epi_isl_487252_Utah_20200513_null_2)Node812,(epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1,epi_isl_489744_Florida_20200421_null_21)Node806,(epi_isl_472829_Wales_20200517_null_1,epi_isl_485325_Louisiana_20200410_null_13)Node809,epi_isl_488135_England_20200505_null_3,epi_isl_487384_Barishal_20200706_null_8,epi_isl_490621_England_20200419_null_17,((epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3,epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1)Node819,epi_isl_489341_Northern_Ireland_20200417_null_24)Node818,(epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1,epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1,epi_isl_490045_New_South_Wales_20200705_null_31)Node823,epi_isl_467570_New_Mexico_20200403_null_2,epi_isl_485816_Virginia_20200524_null_3,epi_isl_490622_England_20200426_null_6,((epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2,epi_isl_469041_Gujarat_20200608_null_1)Node840,epi_isl_488348_England_20200423_null_15)Node839,(epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1,epi_isl_481625_Uusimaa_20200428_null_22)Node833,(epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1,epi_isl_481275_Maryland_20200406_null_11)Node836,epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1,(epi_isl_448342_England_20200423_null_1,epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_479662_South_Korea_20200311_null_1)Node848,epi_isl_487873_Scotland_20200427_null_1,epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1,epi_isl_485603_Vienna_20200414_null_1,epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1,epi_isl_478103_Scotland_20200526_null_1,epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3,epi_isl_467089_Canary_Islands_20200318_null_4,epi_isl_472313_England_20200505_null_3,epi_isl_448409_England_20200429_null_6,epi_isl_487386_Barishal_20200706_null_3,epi_isl_491461_Lambayeque_20200401_null_3,epi_isl_492077_North_Macedonia_20200627_null_4,epi_isl_449717_England_20200415_null_2,epi_isl_482348_Oregon_20200416_null_1,epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2,epi_isl_489569_England_20200421_null_4,epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1,epi_isl_478724_England_20200406_null_38,epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1,epi_isl_480882_Florida_20200423_null_1,epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1,epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1,epi_isl_442426_England_20200408_null_1,epi_isl_458337_England_20200501_null_3,epi_isl_468817_Aragon_20200323_null_2,epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_464093_Taoyuan_20200402_null_1,epi_isl_487589_England_20200420_null_22,epi_isl_489986_Vaud_20200630_null_15,epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1,epi_isl_479116_England_20200422_null_5,epi_isl_444848_Denmark_20200331_null_2,epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5,epi_isl_490581_England_20200503_null_11,(epi_isl_453410_England_20200409_null_5,epi_isl_473490_England_20200604_null_1)Node913,epi_isl_490247_England_20200528_null_6,epi_isl_438405_England_20200330_null_1,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,(epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1,epi_isl_488367_England_20200310_null_44)Node920,(epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1,epi_isl_459207_England_20200507_null_10,epi_isl_491412_Wisconsin_20200629_null_60)Node923,epi_isl_476096_Zurich_20200527_null_3,epi_isl_438715_England_20200425_null_3,epi_isl_475704_California_20200326_null_2,epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1,(epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1,epi_isl_469188_Connecticut_20200401_null_1)Node933,epi_isl_478799_England_20200416_null_5,epi_isl_476019_Missouri_20200619_null_2,epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1,epi_isl_473433_England_20200526_null_1,epi_isl_449465_England_20200402_null_3,epi_isl_491334_Wisconsin_20200627_null_30,epi_isl_476023_MP_20200331_null_1,epi_isl_490311_GP_20200619_null_1,epi_isl_490344_England_20200608_null_9,epi_isl_475032_Gujarat_20200611_null_1,epi_isl_482191_England_20200420_null_12,epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_477908_Scotland_20200413_null_3,epi_isl_453245_England_20200405_null_3,epi_isl_469183_Connecticut_20200401_null_3,epi_isl_483525_California_20200617_null_3,epi_isl_486427_Brazil_20200313_null_2,epi_isl_483236_California_20200516_null_3,epi_isl_488869_England_20200528_null_5,epi_isl_479180_England_20200326_null_1,epi_isl_448292_England_20200413_null_1,epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1,epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1,epi_isl_469307_England_20200418_null_2,epi_isl_482005_England_20200602_null_5,epi_isl_487449_Bamako_20200406_null_1,epi_isl_489572_England_20200423_null_19,epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_442943_England_20200408_null_1,epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4,epi_isl_467695_England_20200520_null_1,epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1,epi_isl_468076_Dhaka_20200516_null_2,epi_isl_489353_Northern_Ireland_20200504_null_3,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_448295_England_20200415_null_1,epi_isl_489116_England_20200507_null_1,epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_478960_England_20200418_null_2,epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2,epi_isl_467664_New_Mexico_20200404_null_2,epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1,epi_isl_480432_Montevideo_20200507_null_17)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1017":"test",
"Node1136":"test",
"Node131":"test",
"Node143":"test",
"Node198":"test",
"Node237":"test",
"Node240":"test",
"Node247":"test",
"Node307":"test",
"Node310":"test",
"Node314":"test",
"Node320":"test",
"Node325":"test",
"Node367":"test",
"Node370":"test",
"Node379":"test",
"Node411":"test",
"Node412":"test",
"Node413":"test",
"Node414":"test",
"Node415":"test",
"Node416":"test",
"Node417":"test",
"Node418":"test",
"Node419":"test",
"Node420":"test",
"Node421":"test",
"Node422":"test",
"Node423":"test",
"Node424":"test",
"Node459":"test",
"Node470":"test",
"Node481":"test",
"Node501":"test",
"Node512":"test",
"Node515":"test",
"Node525":"test",
"Node529":"test",
"Node539":"test",
"Node542":"test",
"Node545":"test",
"Node548":"test",
"Node551":"test",
"Node554":"test",
"Node557":"test",
"Node560":"test",
"Node563":"test",
"Node566":"test",
"Node570":"test",
"Node573":"test",
"Node576":"test",
"Node581":"test",
"Node584":"test",
"Node587":"test",
"Node592":"test",
"Node595":"test",
"Node598":"test",
"Node601":"test",
"Node607":"test",
"Node610":"test",
"Node613":"test",
"Node616":"test",
"Node621":"test",
"Node626":"test",
"Node629":"test",
"Node632":"test",
"Node638":"test",
"Node641":"test",
"Node645":"test",
"Node648":"test",
"Node651":"test",
"Node657":"test",
"Node660":"test",
"Node665":"test",
"Node668":"test",
"Node671":"test",
"Node674":"test",
"Node678":"test",
"Node683":"test",
"Node688":"test",
"Node689":"test",
"Node69":"test",
"Node695":"test",
"Node700":"test",
"Node706":"test",
"Node711":"test",
"Node718":"test",
"Node724":"test",
"Node730":"test",
"Node735":"test",
"Node744":"test",
"Node749":"test",
"Node752":"test",
"Node758":"test",
"Node763":"test",
"Node768":"test",
"Node772":"test",
"Node778":"test",
"Node783":"test",
"Node786":"test",
"Node791":"test",
"Node794":"test",
"Node797":"test",
"Node806":"test",
"Node809":"test",
"Node812":"test",
"Node818":"test",
"Node819":"test",
"Node823":"test",
"Node833":"test",
"Node836":"test",
"Node839":"test",
"Node840":"test",
"Node848":"test",
"Node913":"test",
"Node920":"test",
"Node923":"test",
"Node933":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":"test",
"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416589_Japan_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420241_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_2":"test",
"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_423110_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_429053_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24":"test",
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3":"test",
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432822_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_433005_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433038_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433999_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_435645_California_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_438405_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":"test",
"epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_439428_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_439498_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_439605_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_439717_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_439926_England_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_440086_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_440194_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_440451_England_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_440617_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_440751_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_440892_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_440918_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_440938_England_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_440980_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_441065_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_441093_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_441893_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_442215_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_442367_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_442426_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442599_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_442797_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_442943_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442949_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443052_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443056_England_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_443642_England_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_444410_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_444415_England_20200420_null_5":"test",
"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_444848_Denmark_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_444916_Denmark_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_444935_Denmark_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_448292_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_448295_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_448342_England_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_448409_England_20200429_null_6":"test",
"epi_isl_448528_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_449373_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_449465_England_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_449538_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_449717_England_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_452914_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_453245_England_20200405_null_3":"test",
"epi_isl_453312_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453410_England_20200409_null_5":"test",
"epi_isl_453430_England_20200405_null_20":"test",
"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_453757_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3":"test",
"epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2":"test",
"epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9":"test",
"epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2":"test",
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4":"test",
"epi_isl_456685_England_20200101_null_4":"test",
"epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2":"test",
"epi_isl_457247_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_457264_England_20200507_null_4":"test",
"epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_458337_England_20200501_null_3":"test",
"epi_isl_458431_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458750_England_20200418_null_4":"test",
"epi_isl_459037_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_459069_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459205_England_20200503_null_3":"test",
"epi_isl_459207_England_20200507_null_10":"test",
"epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5":"test",
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3":"test",
"epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8":"test",
"epi_isl_461522_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_461579_England_20200526_null_9":"test",
"epi_isl_462050_England_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_2":"test",
"epi_isl_462343_Singapore_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_462936_Wyoming_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_463013_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463027_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463038_Odisha_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_463067_Odisha_20200514_null_17":"test",
"epi_isl_463259_British_Columbia_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_463285_Louisiana_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_463333_Washington_20200422_null_2":"test",
"epi_isl_463457_Washington_20200501_null_2":"test",
"epi_isl_463666_Washington_20200505_null_3":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_463913_Quebec_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_464058_Ontario_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_464093_Taoyuan_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_464846_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_464959_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_464970_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_464972_England_20200312_null_7":"test",
"epi_isl_465196_England_20200416_null_4":"test",
"epi_isl_465469_England_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465623_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_465638_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_465801_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_465973_England_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_466064_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466295_England_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466449_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_466451_England_20200414_null_54":"test",
"epi_isl_466751_British_Columbia_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_466897_Bavaria_20200424_null_2":"test",
"epi_isl_466999_Vaud_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_467089_Canary_Islands_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_467300_Sarajevo_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_467394_New_York_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_467405_New_York_20200508_null_2":"test",
"epi_isl_467543_New_Mexico_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_467570_New_Mexico_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_467629_New_Mexico_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_467653_New_Mexico_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_467664_New_Mexico_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_467695_England_20200520_null_1":"test",
"epi_isl_467850_Massachusetts_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_467991_South_Australia_20200325_null_10":"test",
"epi_isl_468076_Dhaka_20200516_null_2":"test",
"epi_isl_468091_Oregon_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_468095_Oregon_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_468122_Oregon_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_468210_Basel_Stadt_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_468333_Galicia_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_468776_Aragon_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_468817_Aragon_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_469041_Gujarat_20200608_null_1":"test",
"epi_isl_469070_Stockholm_20200526_null_1":"test",
"epi_isl_469146_Singapore_20200606_null_1":"test",
"epi_isl_469183_Connecticut_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_469188_Connecticut_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_469307_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_469336_England_20200515_null_5":"test",
"epi_isl_470026_Northern_Ireland_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_470120_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_470289_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_470374_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_470392_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_470878_NW_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_470880_GP_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_471243_Wisconsin_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_471587_Telangana_20200418_null_8":"test",
"epi_isl_471721_Michigan_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_471891_Michigan_20200421_null_4":"test",
"epi_isl_471957_England_20200401_null_10":"test",
"epi_isl_472124_England_20200527_null_6":"test",
"epi_isl_472230_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_472236_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_472298_England_20200504_null_12":"test",
"epi_isl_472313_England_20200505_null_3":"test",
"epi_isl_472829_Wales_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_473033_Wales_20200523_null_1":"test",
"epi_isl_473148_Wales_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_473234_Wales_20200521_null_4":"test",
"epi_isl_473318_England_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_473433_England_20200526_null_1":"test",
"epi_isl_473490_England_20200604_null_1":"test",
"epi_isl_473690_Scotland_20200516_null_2":"test",
"epi_isl_473820_Scotland_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_473885_Scotland_20200514_null_5":"test",
"epi_isl_474023_Wales_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_474128_Wales_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_474204_Wales_20200510_null_4":"test",
"epi_isl_474341_Wales_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_474647_Wales_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_474658_Wales_20200429_null_2":"test",
"epi_isl_474748_Wales_20200502_null_3":"test",
"epi_isl_474781_Wales_20200502_null_5":"test",
"epi_isl_474846_Andalusia_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_474861_Andalusia_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_475032_Gujarat_20200611_null_1":"test",
"epi_isl_475118_Uppsala_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_475280_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_475418_England_20200523_null_3":"test",
"epi_isl_475507_England_20200523_null_1":"test",
"epi_isl_475514_Uppsala_20200504_null_21":"test",
"epi_isl_475581_California_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_475593_California_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_475607_California_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_475631_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_475656_California_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_475666_California_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_475696_California_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_475704_California_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_475731_Utah_20200512_null_7":"test",
"epi_isl_475759_Rangpur_20200607_null_11":"test",
"epi_isl_475856_Austria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_475918_Innsbruck_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_475923_Innsbruck_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_475937_Singapore_20200519_null_1":"test",
"epi_isl_476019_Missouri_20200619_null_2":"test",
"epi_isl_476020_Missouri_20200619_null_1":"test",
"epi_isl_476023_MP_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_476048_Michigan_20200429_null_9":"test",
"epi_isl_476065_Michigan_20200531_null_2":"test",
"epi_isl_476096_Zurich_20200527_null_3":"test",
"epi_isl_476204_S_o_Paulo_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_476257_S_o_Paulo_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_476753_Minnesota_20200514_null_1":"test",
"epi_isl_476756_Minnesota_20200518_null_2":"test",
"epi_isl_476762_Minnesota_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_476962_Scherpenheuvel_Zchem_20200411_null_5":"test",
"epi_isl_477007_Heverlee_20200513_null_2":"test",
"epi_isl_477142_Dakar_20200617_null_1":"test",
"epi_isl_477169_Tbilisi_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_477239_Karnataka_20200617_null_1":"test",
"epi_isl_477273_Minnesota_20200520_null_3":"test",
"epi_isl_477685_Washington_20200317_null_24":"test",
"epi_isl_477762_England_20200613_null_1":"test",
"epi_isl_477767_England_20200429_null_23":"test",
"epi_isl_477830_Scotland_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_477908_Scotland_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_478034_Scotland_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_478047_Scotland_20200423_null_27":"test",
"epi_isl_478091_Scotland_20200522_null_4":"test",
"epi_isl_478103_Scotland_20200526_null_1":"test",
"epi_isl_478470_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_478475_England_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_478576_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_478594_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_478621_England_20200329_null_5":"test",
"epi_isl_478672_Egypt_20200602_null_2":"test",
"epi_isl_478719_England_20200617_null_5":"test",
"epi_isl_478724_England_20200406_null_38":"test",
"epi_isl_478783_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_478799_England_20200416_null_5":"test",
"epi_isl_478906_England_20200421_null_10":"test",
"epi_isl_478960_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_479116_England_20200422_null_5":"test",
"epi_isl_479122_England_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_479180_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_479182_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_479268_England_20200424_null_7":"test",
"epi_isl_479662_South_Korea_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_479702_Egypt_20200602_null_1":"test",
"epi_isl_479863_Kansai_20200217_null_9":"test",
"epi_isl_479874_Hokkaido_20200312_null_4":"test",
"epi_isl_480221_Kanto_20200401_null_63":"test",
"epi_isl_480246_Istanbul_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_480277_Istanbul_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_480300_Smolyan_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_480432_Montevideo_20200507_null_17":"test",
"epi_isl_480661_Victoria_20200515_null_3":"test",
"epi_isl_480704_Victoria_20200615_null_2":"test",
"epi_isl_480806_Florida_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_480882_Florida_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_480935_Florida_20200514_null_3":"test",
"epi_isl_480995_Catalunya_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_481017_Catalunya_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_481090_Madrid_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_481093_Madrid_20200603_null_2":"test",
"epi_isl_481262_Bavaria_20200327_null_13":"test",
"epi_isl_481275_Maryland_20200406_null_11":"test",
"epi_isl_481550_Uusimaa_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_481625_Uusimaa_20200428_null_22":"test",
"epi_isl_481655_Uusimaa_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_481887_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_481970_England_20200605_null_1":"test",
"epi_isl_482005_England_20200602_null_5":"test",
"epi_isl_482191_England_20200420_null_12":"test",
"epi_isl_482348_Oregon_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_482361_Oregon_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_482384_Oregon_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_482417_Oregon_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_482688_Singapore_20200602_null_2":"test",
"epi_isl_482696_Singapore_20200518_null_4":"test",
"epi_isl_482701_Dhaka_20200521_null_11":"test",
"epi_isl_482744_Serbia_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_482949_Minnesota_20200518_null_2":"test",
"epi_isl_482995_Minnesota_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_483073_South_Australia_20200303_null_3":"test",
"epi_isl_483236_California_20200516_null_3":"test",
"epi_isl_483444_California_20200402_null_5":"test",
"epi_isl_483508_California_20200623_null_2":"test",
"epi_isl_483525_California_20200617_null_3":"test",
"epi_isl_483542_Bahrain_20200311_null_4":"test",
"epi_isl_483705_Sylhet_20200624_null_2":"test",
"epi_isl_483927_England_20200315_null_4":"test",
"epi_isl_484203_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_484425_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_484426_England_20200412_null_13":"test",
"epi_isl_484494_England_20200619_null_2":"test",
"epi_isl_484513_England_20200608_null_2":"test",
"epi_isl_484551_Scotland_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_484637_Scotland_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_484671_Scotland_20200601_null_9":"test",
"epi_isl_484854_Wisconsin_20200610_null_16":"test",
"epi_isl_484987_Wisconsin_20200622_null_2":"test",
"epi_isl_485102_Louisiana_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_485222_Louisiana_20200423_null_3":"test",
"epi_isl_485325_Louisiana_20200410_null_13":"test",
"epi_isl_485603_Vienna_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_485716_Keur_Massar_20200612_null_1":"test",
"epi_isl_485816_Virginia_20200524_null_3":"test",
"epi_isl_485877_Louisiana_20200424_null_12":"test",
"epi_isl_485902_Louisiana_20200410_null_13":"test",
"epi_isl_485968_USA_20200415_null_7":"test",
"epi_isl_486090_Washington_20200328_null_61":"test",
"epi_isl_486427_Brazil_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_486431_Latvia_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_486829_Moscow_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_486838_Karnataka_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_487110_Osun_State_20200511_null_302":"test",
"epi_isl_487246_Utah_20200512_null_5":"test",
"epi_isl_487252_Utah_20200513_null_2":"test",
"epi_isl_487372_Barishal_20200706_null_2":"test",
"epi_isl_487376_Barishal_20200706_null_5":"test",
"epi_isl_487384_Barishal_20200706_null_8":"test",
"epi_isl_487386_Barishal_20200706_null_3":"test",
"epi_isl_487449_Bamako_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_487458_Bamako_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_487459_Bamako_20200412_null_29":"test",
"epi_isl_487462_Bamako_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_487465_Bamako_20200414_null_87":"test",
"epi_isl_487589_England_20200420_null_22":"test",
"epi_isl_487608_England_20200502_null_4":"test",
"epi_isl_487625_England_20200422_null_2":"test",
"epi_isl_487626_England_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_487704_Scotland_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_487729_Scotland_20200417_null_59":"test",
"epi_isl_487873_Scotland_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_487912_Scotland_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_487924_Scotland_20200408_null_20":"test",
"epi_isl_487973_Scotland_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_488033_England_20200428_null_6":"test",
"epi_isl_488126_England_20200510_null_3":"test",
"epi_isl_488135_England_20200505_null_3":"test",
"epi_isl_488250_England_20200326_null_10":"test",
"epi_isl_488348_England_20200423_null_15":"test",
"epi_isl_488355_England_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_488367_England_20200310_null_44":"test",
"epi_isl_488438_England_20200422_null_68":"test",
"epi_isl_488446_England_20200413_null_86":"test",
"epi_isl_488447_England_20200310_null_65":"test",
"epi_isl_488554_England_20200319_null_11":"test",
"epi_isl_488649_England_20200331_null_8":"test",
"epi_isl_488698_England_20200403_null_6":"test",
"epi_isl_488726_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_488790_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_488869_England_20200528_null_5":"test",
"epi_isl_488992_Scotland_20200403_null_3":"test",
"epi_isl_489116_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_489263_Northern_Ireland_20200502_null_2":"test",
"epi_isl_489282_Northern_Ireland_20200505_null_42":"test",
"epi_isl_489341_Northern_Ireland_20200417_null_24":"test",
"epi_isl_489353_Northern_Ireland_20200504_null_3":"test",
"epi_isl_489372_Northern_Ireland_20200424_null_30":"test",
"epi_isl_489375_Northern_Ireland_20200417_null_107":"test",
"epi_isl_489414_England_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_489437_England_20200422_null_26":"test",
"epi_isl_489482_England_20200423_null_27":"test",
"epi_isl_489543_Scotland_20200327_null_53":"test",
"epi_isl_489569_England_20200421_null_4":"test",
"epi_isl_489572_England_20200423_null_19":"test",
"epi_isl_489712_Florida_20200530_null_1":"test",
"epi_isl_489744_Florida_20200421_null_21":"test",
"epi_isl_489828_Florida_20200516_null_45":"test",
"epi_isl_489903_Minnesota_20200705_null_5":"test",
"epi_isl_489942_Wisconsin_20200704_null_5":"test",
"epi_isl_489986_Vaud_20200630_null_15":"test",
"epi_isl_490042_New_South_Wales_20200701_null_32":"test",
"epi_isl_490045_New_South_Wales_20200705_null_31":"test",
"epi_isl_490054_Singapore_20200628_null_1":"test",
"epi_isl_490064_Singapore_20200509_null_112":"test",
"epi_isl_490164_Jashore_20200707_null_2":"test",
"epi_isl_490222_California_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_490223_California_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_490226_England_20200618_null_107":"test",
"epi_isl_490230_England_20200615_null_1":"test",
"epi_isl_490247_England_20200528_null_6":"test",
"epi_isl_490256_WC_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_490292_FS_20200612_null_8":"test",
"epi_isl_490295_GP_20200615_null_5":"test",
"epi_isl_490309_GP_20200618_null_20":"test",
"epi_isl_490311_GP_20200619_null_1":"test",
"epi_isl_490344_England_20200608_null_9":"test",
"epi_isl_490367_England_20200615_null_7":"test",
"epi_isl_490371_England_20200518_null_9":"test",
"epi_isl_490405_England_20200627_null_9":"test",
"epi_isl_490429_England_20200101_null_7":"test",
"epi_isl_490442_England_20200607_null_12":"test",
"epi_isl_490520_England_20200423_null_16":"test",
"epi_isl_490581_England_20200503_null_11":"test",
"epi_isl_490621_England_20200419_null_17":"test",
"epi_isl_490622_England_20200426_null_6":"test",
"epi_isl_490645_England_20200507_null_154":"test",
"epi_isl_490656_Scotland_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_490659_Scotland_20200409_null_16":"test",
"epi_isl_490709_Scotland_20200703_null_12":"test",
"epi_isl_490809_Wales_20200619_null_40":"test",
"epi_isl_490859_Wales_20200613_null_22":"test",
"epi_isl_490867_Wales_20200615_null_397":"test",
"epi_isl_491059_Suceava_20200416_null_5":"test",
"epi_isl_491334_Wisconsin_20200627_null_30":"test",
"epi_isl_491412_Wisconsin_20200629_null_60":"test",
"epi_isl_491461_Lambayeque_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_491576_Scotland_20200406_null_13":"test",
"epi_isl_491679_Scotland_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_491720_England_20200630_null_31":"test",
"epi_isl_491973_Muscat_20200515_null_4":"test",
"epi_isl_491992_Muscat_20200521_null_6":"test",
"epi_isl_492002_Muscat_20200527_null_27":"test",
"epi_isl_492073_Mazowieckie_20200418_null_57":"test",
"epi_isl_492077_North_Macedonia_20200627_null_4":"test",
"epi_isl_492080_North_Macedonia_20200626_null_2":"test",
"epi_isl_492132_South_Australia_20200420_null_196":"test",
"epi_isl_492154_South_Australia_20200322_null_10":"test",
"epi_isl_492165_South_Australia_20200320_null_6353":"test",
"epi_isl_492174_South_Australia_20200314_null_52816":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":26
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":11
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":39
}
}
}