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]
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}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1046":{
"Global MG94xREV":0.001164416207425599,
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"Node109":{
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"Node148":{
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"Nucleotide GTR":0.001150301502218161,
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"Node209":{
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"Node267":{
"Global MG94xREV":0.001164822942578377,
"Nucleotide GTR":0.001150189499516845,
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"Node298":{
"Global MG94xREV":1.632593045461275e-05,
"Nucleotide GTR":1.61208309798331e-05,
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"Node300":{
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"Node302":{
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"Nucleotide GTR":6.759589748023522e-05,
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"Node304":{
"Global MG94xREV":6.836157826434977e-05,
"Nucleotide GTR":6.750276511210063e-05,
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"Node306":{
"Global MG94xREV":6.972791276388567e-05,
"Nucleotide GTR":6.885193461825332e-05,
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"Node308":{
"Global MG94xREV":6.937213741087378e-05,
"Nucleotide GTR":6.850062880149518e-05,
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"Node309":{
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"Node310":{
"Global MG94xREV":6.599317536329895e-05,
"Nucleotide GTR":6.516411599399173e-05,
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["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
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"Node359":{
"Global MG94xREV":0.001164985044302237,
"Nucleotide GTR":0.001150349564788418,
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"Node392":{
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"Node405":{
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"Node415":{
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"Nucleotide GTR":0.001152440270993741,
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"Node421":{
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"Node427":{
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"Node433":{
"Global MG94xREV":0.001164984289561229,
"Nucleotide GTR":0.001150348819529074,
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"Node439":{
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"Nucleotide GTR":0.001150227549315504,
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"Node445":{
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"Node453":{
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"Node459":{
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"Node467":{
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"Node475":{
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"Node481":{
"Global MG94xREV":0.001164862328373384,
"Nucleotide GTR":0.001150228390515804,
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"Node489":{
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"Node497":{
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"Node506":{
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"Node514":{
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"Node523":{
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"Nucleotide GTR":0.001150269217598741,
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"Node531":{
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"Nucleotide GTR":0.001150228677175997,
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"Node537":{
"Global MG94xREV":0.001164906062659238,
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"Node544":{
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"Node554":{
"Global MG94xREV":0.001164866406512317,
"Nucleotide GTR":0.001150232417421874,
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"Node56":{
"Global MG94xREV":0.001166865263050754,
"Nucleotide GTR":0.001152206162716125,
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"codon": [
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"Node566":{
"Global MG94xREV":0.001164936405788706,
"Nucleotide GTR":0.001150301537311029,
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"Node576":{
"Global MG94xREV":0.001164978761201394,
"Nucleotide GTR":0.001150343360620942,
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"Node582":{
"Global MG94xREV":0.001164937780476377,
"Nucleotide GTR":0.001150302894728769,
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"Node597":{
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"Node608":{
"Global MG94xREV":0.001164877116378657,
"Nucleotide GTR":0.001150242992742255,
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"Node616":{
"Global MG94xREV":0.001164936784491425,
"Nucleotide GTR":0.001150301911256179,
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"Node629":{
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"Nucleotide GTR":0.00114963234743827,
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"Node640":{
"Global MG94xREV":0.001164603335569681,
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"Node646":{
"Global MG94xREV":0.001164942315085277,
"Nucleotide GTR":0.001150307372370262,
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"codon": [
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"Node659":{
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"Nucleotide GTR":0.001152442239238066,
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"codon": [
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]
},
"Node664":{
"Global MG94xREV":0.001164984860306573,
"Nucleotide GTR":0.001150349383104256,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "L", "-", "-", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
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"Node670":{
"Global MG94xREV":0.001164978784967226,
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"Node680":{
"Global MG94xREV":0.001164252625194845,
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"Node691":{
"Global MG94xREV":0.001164246043022852,
"Nucleotide GTR":0.001149619847437729,
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"Node701":{
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"Node715":{
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"Node721":{
"Global MG94xREV":0.001164984526814335,
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"Node732":{
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"Node793":{
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"Node824":{
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"Nucleotide GTR":0.001149626506644509,
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"Node897":{
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"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":{
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"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
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"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
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"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
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"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
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"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":{
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"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
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"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_2":{
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"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":{
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"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
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"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":{
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"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":{
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"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":{
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"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":{
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"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
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"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":{
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"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":{
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"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164985711782454,
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"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":{
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"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1":{
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"epi_isl_432822_England_20200406_null_1":{
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"epi_isl_433038_England_20200403_null_2":{
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"epi_isl_433999_England_20200413_null_1":{
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"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":{
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"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":{
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"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2":{
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"epi_isl_439498_England_20200401_null_1":{
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"epi_isl_439717_England_20200408_null_1":{
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"epi_isl_440086_England_20200323_null_2":{
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"epi_isl_440451_England_20200311_null_2":{
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"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":{
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"epi_isl_440892_England_20200421_null_1":{
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"epi_isl_440938_England_20200426_null_1":{
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"epi_isl_442426_England_20200408_null_1":{
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"epi_isl_442797_England_20200407_null_2":{
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"epi_isl_443056_England_20200411_null_2":{
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["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TCA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
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"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":{
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"epi_isl_443642_England_20200415_null_3":{
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"epi_isl_444410_England_20200420_null_1":{
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"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1":{
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"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":{
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"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1":{
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"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1":{
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"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1":{
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"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1":{
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"epi_isl_448292_England_20200413_null_1":{
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"epi_isl_448528_England_20200405_null_1":{
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"epi_isl_449373_England_20200328_null_1":{
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"epi_isl_449538_England_20200330_null_3":{
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"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1":{
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"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1":{
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"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2":{
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"epi_isl_451547_New_South_Wales_20200401_null_4":{
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"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4":{
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"epi_isl_452914_England_20200507_null_1":{
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"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1":{
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"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1":{
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"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3":{
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"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1":{
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"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4":{
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"epi_isl_457264_England_20200507_null_4":{
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"epi_isl_458750_England_20200418_null_4":{
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"epi_isl_459069_England_20200410_null_1":{
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"epi_isl_459207_England_20200507_null_10":{
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"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2":{
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"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1":{
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"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1":{
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"epi_isl_461522_England_20200101_null_1":{
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"epi_isl_461579_England_20200526_null_9":{
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"epi_isl_462343_Singapore_20200420_null_1":{
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"epi_isl_463259_British_Columbia_20200301_null_3":{
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"epi_isl_463333_Washington_20200422_null_2":{
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"epi_isl_463666_Washington_20200505_null_3":{
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"epi_isl_463913_Quebec_20200411_null_2":{
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"epi_isl_464093_Taoyuan_20200402_null_1":{
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"epi_isl_464846_England_20200311_null_1":{
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"epi_isl_464970_England_20200312_null_1":{
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"epi_isl_465196_England_20200416_null_4":{
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"epi_isl_465469_England_20200428_null_1":{
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"epi_isl_466039_England_20200401_null_6":{
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"epi_isl_466295_England_20200408_null_2":{
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"epi_isl_466449_England_20200414_null_1":{
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"epi_isl_466897_Bavaria_20200424_null_2":{
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"epi_isl_467089_Canary_Islands_20200318_null_4":{
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"epi_isl_467543_New_Mexico_20200401_null_1":{
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"epi_isl_467664_New_Mexico_20200404_null_2":{
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"epi_isl_467695_England_20200520_null_1":{
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"epi_isl_468091_Oregon_20200422_null_1":{
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"epi_isl_468122_Oregon_20200506_null_1":{
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"epi_isl_468403_California_20200324_null_8":{
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"epi_isl_469188_Connecticut_20200401_null_1":{
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"epi_isl_469336_England_20200515_null_5":{
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"epi_isl_470026_Northern_Ireland_20200407_null_2":{
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"epi_isl_470392_England_20200409_null_1":{
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"epi_isl_471587_Telangana_20200418_null_8":{
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"epi_isl_471891_Michigan_20200421_null_4":{
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"epi_isl_472124_England_20200527_null_6":{
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"epi_isl_472313_England_20200505_null_3":{
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"epi_isl_473234_Wales_20200521_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001165672190132889,
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"epi_isl_473433_England_20200526_null_1":{
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"epi_isl_473490_England_20200604_null_1":{
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"epi_isl_473820_Scotland_20200411_null_1":{
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"epi_isl_474341_Wales_20200413_null_2":{
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"epi_isl_474647_Wales_20200430_null_1":{
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"epi_isl_474658_Wales_20200429_null_2":{
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"epi_isl_474781_Wales_20200502_null_5":{
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"epi_isl_474846_Andalusia_20200401_null_2":{
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"epi_isl_475003_Elkana_20200315_null_2":{
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"epi_isl_475118_Uppsala_20200401_null_1":{
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"epi_isl_475507_England_20200523_null_1":{
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"epi_isl_475607_California_20200328_null_3":{
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"epi_isl_475656_California_20200331_null_1":{
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"epi_isl_475684_California_20200327_null_2":{
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"epi_isl_475704_California_20200326_null_2":{
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"epi_isl_475937_Singapore_20200519_null_1":{
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"epi_isl_476019_Missouri_20200619_null_2":{
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"epi_isl_476023_MP_20200331_null_1":{
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"epi_isl_476762_Minnesota_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164246956011151,
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"epi_isl_477142_Dakar_20200617_null_1":{
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"epi_isl_477685_Washington_20200317_null_24":{
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"epi_isl_477767_England_20200429_null_23":{
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"epi_isl_478034_Scotland_20200420_null_1":{
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"epi_isl_478091_Scotland_20200522_null_19":{
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"epi_isl_478110_Scotland_20200527_null_1":{
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"epi_isl_478452_England_20200403_null_4":{
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"epi_isl_478475_England_20200323_null_4":{
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"epi_isl_478594_England_20200327_null_1":{
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"epi_isl_478672_Egypt_20200602_null_2":{
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"epi_isl_478724_England_20200406_null_38":{
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"epi_isl_478799_England_20200416_null_5":{
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"epi_isl_478960_England_20200418_null_2":{
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"epi_isl_479116_England_20200422_null_5":{
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"epi_isl_479180_England_20200326_null_1":{
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"epi_isl_479268_England_20200424_null_7":{
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"epi_isl_479637_New_Brunswick_20200326_null_29":{
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"epi_isl_479702_Egypt_20200602_null_1":{
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"epi_isl_479874_Hokkaido_20200312_null_4":{
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"epi_isl_480246_Istanbul_20200426_null_1":{
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"epi_isl_480661_Victoria_20200515_null_3":{
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"epi_isl_480806_Florida_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165452421328228,
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"epi_isl_480935_Florida_20200514_null_3":{
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"epi_isl_481090_Madrid_20200412_null_1":{
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"epi_isl_481262_Bavaria_20200327_null_13":{
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"epi_isl_481550_Uusimaa_20200513_null_1":{
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"epi_isl_481970_England_20200605_null_1":{
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"epi_isl_482200_England_20200424_null_20":{
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"epi_isl_482384_Oregon_20200427_null_1":{
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"epi_isl_482995_Minnesota_20200311_null_2":{
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"epi_isl_483022_Utah_20200511_null_4":{
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"epi_isl_483236_California_20200516_null_3":{
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"epi_isl_483525_California_20200617_null_3":{
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["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "---", "---", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAT", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
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"epi_isl_483553_Bahrein_20200330_null_30":{
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"epi_isl_483629_Rajshahi_20200620_null_84":{
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"epi_isl_483915_England_20200623_null_65":{
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"epi_isl_484203_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001165549438114155,
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"epi_isl_484322_England_20200513_null_95":{
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"epi_isl_484426_England_20200412_null_13":{
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"epi_isl_484499_England_20200602_null_2":{
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"epi_isl_484513_England_20200608_null_2":{
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"epi_isl_484854_Wisconsin_20200610_null_16":{
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"epi_isl_484964_Wisconsin_20200619_null_49":{
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"epi_isl_484987_Wisconsin_20200622_null_2":{
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"epi_isl_485114_Louisiana_20200420_null_5":{
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"epi_isl_485222_Louisiana_20200423_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001169491686587129,
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"epi_isl_485325_Louisiana_20200410_null_13":{
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"epi_isl_485968_unknown_20200415_null_7":{
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"epi_isl_486036_WA_20200415_null_19":{
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"epi_isl_486155_California_20200424_null_27":{
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"epi_isl_486431_Latvia_20200316_null_1":{
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"epi_isl_486537_Basel_Landschaft_20200623_null_10":{
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