{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104276918232904],
[262.8831784334145, 623.8706413110626, 0, 2, 0.2964556482081641, 0, 0.003205792783896682, 0.006910471748112719, 0.4949746549381946, 1, 0.002211572806349574],
[263.0084873207571, 623.8911061568602, 1, 0, 0.2965482104794703, 0.003802158668668477, 0, -0.008196010108219826, 1, 0.2965482104794703, 0.001104659514936712],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764821783046],
[262.9776341147061, 624.0318416472284, 1, 0, 0.2964766908367132, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964766908367132, 0.001104261658937674],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103695159402996],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906932670727],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103695117717448],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103977349762191],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103906941787454],
[263.1934625790293, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2968055583395963, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7031944416604037, 1, 0.001104436077887924],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104657987513792],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.001104764881055693],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001103377571714928],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103530517500664],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764881143696],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377610845133],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001106304303030306],
[262.929795224923, 624.0098039612757, 1, 0, 0.2964461113994361, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964461113994361, 0.001104764920479934],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001106978148857591],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377559792463],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104241039984757],
[262.8472869845914, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2963784473119156, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7036215526880845, 1, 0.001104435975732414],
[262.9767497758177, 624.0329469130493, 1, 0, 0.2964756200044801, 0.003802617535019653, 0, -0.008196999249804986, 1, 0.29647562000448, 0.001104564316209453],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.016537993179, 623.9381070900632, 0, 1, 0.2965388810478516, 0, 0.001602723072427525, 0.003454862262992658, 0.7034611189521485, 1, 0.001104448812990736],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104402525816475],
[262.8032642393057, 624.0963292383116, 1, 0, 0.2963168166633488, 0.003805127774552341, 0, -0.008202410372900268, 1, 0.2963168166633487, 0.001104723138781329],
[262.8665297321143, 624.033063745503, 0, 1, 0.2963881499836861, 0, 0.00160247919236508, 0.003454336550198644, 0.7036118500163139, 1, 0.001103993579425816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104315371918494],
[262.6382477586426, 624.2613457189748, 1, 0, 0.2961307567284061, 0.003807518548931886, 0, -0.008207563974495777, 1, 0.2961307567284062, 0.001105167791068938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104560385685162],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.0011047425097253],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104764872131664],
[262.9930607177316, 623.7966504755685, 0, 1, 0.296567559815097, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.703432440184903, 1, 0.001104657987513792],
[263.1934625790293, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2968055583395963, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7031944416604037, 1, 0.00110443606874749],
[262.8080854594594, 624.0515023095767, 0, 1, 0.2963356196222374, 0, 0.001602431844645932, 0.003454234486497848, 0.7036643803777626, 1, 0.00110332784006774],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104380445573457],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104395058729015],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742518899421],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764833628735],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104261699983829],
[262.9571692689086, 623.9424242087088, 0, 1, 0.296490348177778, 0, 0.001602711983029864, 0.003454838358462825, 0.7035096518222219, 1, 0.001106978081311019],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327790138114],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103671393457089],
[262.9695834422843, 623.7139276998051, 0, 2, 0.2965766027424681, 0, 0.003206598267535569, 0.006912208064932088, 0.4948044758093275, 1, 0.002232021177110777],
[262.7732961490973, 624.1262973285201, 0, 1, 0.2962830269419093, 0, 0.001602239809923651, 0.003453820532567436, 0.7037169730580908, 1, 0.001104996069888006],
[262.7732961490973, 624.2088055688516, 0, 1, 0.2962554663055157, 0, 0.001602028025043132, 0.003453364004796567, 0.7037445336944843, 1, 0.001107147746315578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001104376514282503],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110432763094647],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001103871287046036],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103977349762191],
[262.6468851232937, 624.3984820874639, 0, 1, 0.2960918289322288, 0, 0.001601541369314096, 0.003452314959866571, 0.7039081710677713, 1, 0.001106304154655173],
[262.9776341147061, 623.9219593629113, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001103513435379584],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103906941787454],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110337751283608],
[262.6623117263192, 624.2731732001212, 0, 1, 0.2961459048491036, 0, 0.001601862842950378, 0.00345300793493734, 0.7038540951508964, 1, 0.001104436107917847],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.8306356024814, 0, 1, 0.2965561946630376, 0, 0.001602999184280559, 0.003455457455286213, 0.7034438053369624, 1, 0.001104569517210274],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 1, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0.00160280418218486, -0.00474145376358604, 0.9120694747920897, 0.5051311080408115, 0.002208899568105868],
[262.9380091121068, 624.0675634897888, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312165, 1, 0.001103871376925371],
[262.9380091121068, 624.0675634897889, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312166, 1, 0.001104658027379631],
[263.016537993179, 623.9381070900632, 0, 1, 0.2965388810478516, 0, 0.001602723072427525, 0.003454862262992658, 0.7034611189521485, 1, 0.001104436071649861],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104764881143696],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001104658077750678],
[263.016537993179, 623.9381070900632, 0, 1, 0.2965388810478516, 0, 0.001602723072427525, 0.003454862262992658, 0.7034611189521485, 1, 0.0011044360807903],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103906971979479],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001103977400620721],
[262.9695834422843, 623.76897930543, 0, 1, 0.2965581903051865, 0, 0.00160315763235534, 0.003455799009160131, 0.7034418096948134, 1, 0.001103695117717448],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104659506042116],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8600386090008, 624.0395548686165, 1, 0, 0.2963808310908134, 0.003804305916151373, 0, -0.008200638758312648, 1, 0.2963808310908134, 0.001103934712278185],
[263.0963319191216, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966472573152231, 0.003800889175100358, 0, -0.00819327356221443, 1, 0.2966472573152231, 0.00110373080327648],
[262.929795224923, 624.0098039612757, 1, 0, 0.2964461113994361, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964461113994361, 0.001104742540443807],
[262.8831784334145, 624.016415044203, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7035930782168649, 1, 0.001104764920567936],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.00110426164924973],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104897984317757],
[263.1029430020488, 623.7966504755686, 0, 1, 0.2966547114655868, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.7033452885344132, 1, 0.001103327849693043],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906971979479],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377602452889],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103530517500664],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103906932840664],
[263.9105524774, 622.9890410002173, 0, 1, 0.2975653100060422, 0, 0.00160516467255104, 0.003460125425589596, 0.7024346899939578, 1, 0.001103943387236406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7046546541304, 623.8728773636808, 0, 1, 0.2963132328158894, 0, 0.00160289064693072, 0.003455223489980207, 0.7036867671841105, 1, 0.00110601706841329],
[262.9217445525011, 623.8168181952132, 0, 1, 0.296504241044612, 0, 0.001603034690364931, 0.003455533992919641, 0.703495758955388, 1, 0.001105679634186184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104692022681424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7019799838667, 624.0365827638475, 0, 1, 0.2962564063638315, 0, 0.001602470155789612, 0.00345431707077384, 0.7037435936361685, 1, 0.001105530367176464],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.00110496048554331],
[262.4329366276021, 624.144595390209, 1, 0, 0.2960067531040589, 0.003810497313525173, 0, -0.008213985059685559, 1, 0.2960067531040589, 0.001105322206842496],
[262.9962021204108, 623.5813298974005, 0, 1, 0.2966420788059484, 0, 0.001603640057928823, 0.00345683893548128, 0.7033579211940516, 1, 0.001105023842194655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9217445525011, 623.8168181952132, 0, 1, 0.296504241044612, 0, 0.001603034690364931, 0.003455533992919641, 0.703495758955388, 1, 0.001104774759853188],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104528969905395],
[263.9105524774, 622.9890410002173, 0, 3, 0.2975653100060422, 0, 0.004815494017653119, 0.01038037627676879, 0.3465914569255372, 1, 0.003326511920748391],
[262.9217445525011, 623.8168181952132, 0, 1, 0.296504241044612, 0, 0.001603034690364931, 0.003455533992919641, 0.703495758955388, 1, 0.001105669209486475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104225049814644],
[262.8280442370685, 624.0715492405488, 0, 1, 0.2963447566894182, 0, 0.001602380370034381, 0.003454123526784339, 0.7036552433105818, 1, 0.001104726430489778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9105524774, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2964377866568896, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7035622133431104, 1, 0.001104466008533213],
[263.6822705039282, 623.2173229736891, 0, 1, 0.2973079167507621, 0, 0.001604576707252757, 0.00345885799570359, 0.7026920832492378, 1, 0.001104859663326291],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.4105524774, 623.4890410002173, 0, 1, 0.2970015483314659, 0, 0.001603877428857088, 0.003457350617054037, 0.7029984516685341, 1, 0.001104930636688437],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104607193924111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110418256673705],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104521865177945],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104886192013396],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103340797131932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103793176323677],
[262.8472869845914, 623.8872900123628, 0, 1, 0.2964216055211911, 0, 0.001602853617967092, 0.003455143669597462, 0.703578394478809, 1, 0.001104603863215068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.8240245195542, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001104916156731857],
[262.6301970862207, 624.1083656614936, 0, 1, 0.2961754547726166, 0, 0.001602285844927103, 0.003453919766551735, 0.7038245452273835, 1, 0.001104753210756369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8478886175059, 624.0517048601115, 1, 0, 0.2963671316917109, 0.003804481767990124, 0, -0.008201017828092096, 1, 0.2963671316917109, 0.001103848287061868],
[262.9019151127489, 623.8519046317282, 0, 1, 0.296476777724516, 0, 0.001602944533110497, 0.003455339648118948, 0.7035232222754839, 1, 0.001104268883543941],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 1, 0, 0.2962020900487435, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2962020900487434, 0.001104772062485118],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 1, 0, 0.2962020900487435, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2962020900487434, 0.001103774304904617],
[262.7015132514512, 624.3591109560692, 1, 0, 0.2961483196102213, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2961483196102213, 0.001104659506042116],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 1, 0, 0.2962020900487435, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2962020900487434, 0.001103774314015716],
[262.468996750055, 624.3947052787394, 1, 0, 0.2959518989779709, 0.003809973796456745, 0, -0.008212856555707009, 1, 0.2959518989779708, 0.001104375834416633],
[262.7647787442598, 624.1348147333575, 1, 0, 0.2962734233690809, 0.003805685087548459, 0, -0.008203611728063919, 1, 0.2962734233690809, 0.001103774304904617],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.00110399895637501],
[262.1549357957156, 624.7446576819018, 0, 1, 0.2955858112052811, 0, 0.001600653943501451, 0.003450402006840525, 0.7044141887947188, 1, 0.001105314231940281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001104526502755764],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513444233523],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104301031020524],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104657087081682],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104456573088094],
[262.8831784334145, 624.016415044203, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7035930782168649, 1, 0.001104659514936712],
[262.555739518311, 624.3438539593063, 0, 1, 0.2960377267609348, 0, 0.0016016814991586, 0.003452617026592898, 0.7039622732390652, 1, 0.001104531194505054],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 0, 1, 0.2962020900487435, 0, 0.00160205555204154, 0.003453423342550948, 0.7037979099512566, 1, 0.001105264500955373],
[262.6860866484257, 624.2135068291916, 1, 0, 0.2961846961936341, 0.00380682514540019, 0, -0.008206069259821796, 1, 0.2961846961936341, 0.001104662853195814],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.0523064930259, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.00160242977967613, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104475846760152],
[262.7207559989741, 624.0523064930259, 0, 1, 0.2962660539785446, 0, 0.00160242977967613, 0.003454230035207187, 0.7037339460214554, 1, 0.001105179512624318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.001104198502428335],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104482077851135],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104755137495783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.4490379724459, 624.4505555051715, 1, 0, 0.2959174182765812, 0.003810263538115877, 0, -0.008213481128686195, 1, 0.2959174182765811, 0.001105168295535688],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001103980846561362],
[262.0123034652545, 624.8872900123629, 0, 1, 0.2954249899223422, 0, 0.001600288589611442, 0.003449614442607536, 0.7045750100776578, 1, 0.001104843622732237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.5755689580632, 624.3240245195542, 1, 0, 0.2960600849172559, 0.003808427432788743, 0, -0.008209523182915819, 1, 0.2960600849172559, 0.001103950179592414],
[262.8671164243436, 624.0324770532737, 1, 0, 0.2963888114928734, 0.003804203483503469, 0, -0.008200417952425574, 1, 0.2963888114928734, 0.001104104548692995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103599694950313],
[263.1190050111196, 623.7805884664976, 0, 1, 0.2966728217558485, 0, 0.001603127796038668, 0.003455734693392605, 0.7033271782441515, 1, 0.001104380115439526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104603817974755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.8872900123628, 0, 1, 0.2960876976018624, 0, 0.001600288589611442, 0.003449614442607537, 0.7039123023981376, 1, 0.001104339715149864],
[262.9930607177316, 624.3240245195541, 1, 0, 0.2963912958436974, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2963912958436974, 0.00110406077475552],
[262.8511031290889, 624.1035419541533, 1, 0, 0.2963523609534959, 0.003804435241456414, 0, -0.008200917534555234, 1, 0.2963523609534959, 0.00110416135216725],
[262.8665297321143, 624.033063745503, 1, 0, 0.2963881499836861, 0.003804211974111326, 0, -0.008200436254951555, 1, 0.2963881499836861, 0.001107147746315578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104676430615174],
[262.9776341147061, 623.9770109685361, 1, 0, 0.2964950187391208, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964950187391208, 0.001104739001699184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104939390896743],
[262.9622075116806, 624.0474891771863, 0, 1, 0.2964592252974196, 0, 0.001602442149584659, 0.003454256700032141, 0.7035407747025804, 1, 0.001104219246822255],
[262.9622075116806, 624.0474891771863, 1, 0, 0.2964592252974196, 0.003802827826335389, 0, -0.008197452558017409, 1, 0.2964592252974196, 0.001103485983221067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9776341147061, 623.9770109685361, 1, 0, 0.2964950187391208, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964950187391208, 0.001103973305476848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.9776341147061, 622.9770109685361, 1, 0, 0.297622472105021, 0.003788199721365298, 0, -0.008165919919154403, 1, 0.297622472105021, 0.001103350735449691],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103942052015045],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001104648076297666],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104063071746705],
[263.044832584466, 623.964864104401, 0, 1, 0.2965523754321855, 0, 0.001602654344063645, 0.003454714110741747, 0.7034476245678145, 1, 0.001104073126594629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001104243927854027],
[263.3315627349068, 623.557320569279, 0, 4, 0.2969160711022117, 0, 0.006414807216677666, 0.0138278881477042, 0.2443591938777009, 1, 0.004424728180738421],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103513444233523],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001104687768287334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104301335382486],
[262.9930607177316, 624.631413067973, 0, 1, 0.2962886541377913, 0, 0.001600944139341867, 0.003451027558862068, 0.7037113458622086, 1, 0.001105497508672618],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 624.2689729139294, 0, 1, 0.2964096859202598, 0, 0.001601873620808437, 0.003453031167906106, 0.7035903140797402, 1, 0.001104435621097081],
[263.0640753319889, 623.9456213568781, 0, 1, 0.2965740693861466, 0, 0.00160270377060316, 0.003454820655589762, 0.7034259306138534, 1, 0.001104330045450279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9653025320516, 623.9893425511905, 0, 1, 0.2964811154547501, 0, 0.001602591473616334, 0.003454578585934245, 0.7035188845452498, 1, 0.001104625823405492],
[262.8900070075617, 624.4270782297241, 0, 1, 0.2962751550504178, 0, 0.001601468025433875, 0.003452156858315308, 0.7037248449495821, 1, 0.001105018256895258],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104271290391374],
[263.3305989475184, 623.4424635444816, 1, 0, 0.2969537642556593, 0.003797507786777561, 0, -0.00818598457317201, 1, 0.2969537642556593, 0.001105032359241163],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.1934625790293, 623.6428654057794, 0, 1, 0.296777944558376, 0, 0.001603481825049566, 0.003456497845487185, 0.703222055441624, 1, 0.001104880463635683],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110386606710456],
[262.8819563351398, 624.0176371424775, 1, 0, 0.2964055438387955, 0.003803988732970063, 0, -0.008199955031833373, 1, 0.2964055438387955, 0.001104570770446358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001103900263501359],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104241070354078],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103377610757822],
[263.0289521665546, 623.8706413110626, 0, 1, 0.2965712850709438, 0, 0.001602896391948341, 0.003455235874056359, 0.7034287149290561, 1, 0.001104436162388572],
[263.0717528135658, 623.7727890584268, 2, 0, 0.2966379567023796, 0.007602488593358651, 0, -0.01638807813894166, 1, 0.08799407735656273, 0.002209318496072502],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7169398544767, 624.1826536231407, 1, 0, 0.2962194839038528, 0.003806378075787259, 0, -0.008205105547524136, 1, 0.2962194839038528, 0.001104746643775977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104185374631277],
[263.0084873207571, 623.8911061568602, 1, 0, 0.2965482104794702, 0.003802158668668478, 0, -0.008196010108219827, 1, 0.2965482104794702, 0.001104289658284768],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104764892989387],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103377530631239],
[263.1468851232937, 624.1702001139921, 0, 1, 0.2965646548470586, 0, 0.001602127111831629, 0.003453577598281447, 0.7034353451529414, 1, 0.001103530517500664],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513384877203],
[263.0084873207571, 623.8360545512354, 1, 0, 0.2965666189539675, 0.003802158668668478, 0, -0.008196010108219827, 1, 0.2965666189539675, 0.001104659514936712],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110466438550173],
[262.9930607177316, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103960055841668],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103327848991942],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103867048459323],
[262.8032642393057, 624.0963292383116, 1, 0, 0.2963168166633488, 0.003805127774552341, 0, -0.008202410372900268, 1, 0.2963168166633487, 0.001104853023927228],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001103381446869143],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104560462657513],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742428662415],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104659515488292],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001103960039710029],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104664292775718],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104742428662415],
[262.8392363121695, 623.8993264355447, 0, 1, 0.2964111941830028, 0, 0.00160282269531078, 0.003455077012094241, 0.7035888058169972, 1, 0.001106449642032703],
[262.7015132514512, 624.1980802261662, 1, 0, 0.2962020900487434, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376961, 1, 0.2962020900487434, 0.001104700758207777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001103936043771752],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104624859962176],
[262.9776341147061, 623.9219593629113, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001103513432480871],
[262.4930607177316, 624.4065327598857, 0, 1, 0.2959670549497846, 0, 0.001601520720130819, 0.00345227044806956, 0.7040329450502154, 1, 0.001104742518899421],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104239363318238],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104124942026567],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327790138114],
[262.9930607177316, 623.9824299172901, 0, 1, 0.2965054429288054, 0, 0.00160260922752673, 0.003454616856622488, 0.7034945570711946, 1, 0.001106449632288841],
[262.9930607177316, 624.2285942196919, 0, 1, 0.2964231759382392, 0, 0.00160197723920359, 0.003453254529813928, 0.7035768240617608, 1, 0.001104502832831747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 624.0675634897888, 1, 0, 0.2964769865111346, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2964769865111345, 0.001103789624554925],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104618530286086],
[262.8942879177943, 623.9502539541982, 0, 1, 0.2964378484676298, 0, 0.001602691871126967, 0.003454795004838265, 0.7035621515323702, 1, 0.001104659514936712],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742518899421],
[262.9930607177316, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103959688789373],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110466643405583],
[262.8897895163417, 624.0098039612757, 1, 0, 0.2964143759334987, 0.003803875387628314, 0, -0.008199710702322784, 1, 0.2964143759334987, 0.001104764920479934],
[263.2293540278524, 623.6702394497649, 1, 0, 0.2967972428487706, 0.003798968407961787, 0, -0.008189133117731407, 1, 0.2967972428487706, 0.001106304154655173],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.001103977349762191],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001103513444233523],
[263.2101506161023, 623.8352165946552, 1, 0, 0.2967268195579955, 0.003799245574911438, 0, -0.008189730584412564, 1, 0.2967268195579955, 0.001103906980926268],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104104997249423],
[262.9930607177316, 623.7415162792225, 1, 1, 0.2965859993961135, 0.003802381695056555, 0.001603228218582042, -0.004740539702153991, 0.9120367449622087, 0.5052087437544356, 0.002215540310608568],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104764923401595],
[262.9930607177316, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964940825370806, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035059174629194, 1, 0.001104261658937674],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104897974326302],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742518899421],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906930719708],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.00110443610962058],
[262.7759708193609, 623.9778489251163, 1, 0, 0.2963347492487613, 0.003805522996954034, 0, -0.008203262322301003, 1, 0.2963347492487614, 0.00110397734005048],
[262.9105524774001, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2964377866568896, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7035622133431103, 1, 0.0011047425097253],
[263.0482755381184, 623.6902872095959, 0, 1, 0.296646933593389, 0, 0.001603359905561496, 0.003456235033373413, 0.703353066406611, 1, 0.001103934877636977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103697840965954],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513394208515],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.0011047425097253],
[262.8472869845914, 624.016415044203, 0, 1, 0.2963784473119155, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7036215526880845, 1, 0.00110386606710456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.6221464137988, 623.2774470638186, 1, 0, 0.2972401254352947, 0.003793308011498903, 0, -0.00817693145265924, 1, 0.2972401254352947, 0.001104502795543818],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.001103789641563844],
[262.929795224923, 623.9697982526944, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104620227163172],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.00110474247951419],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.0011047425097253],
[263.2227822806981, 623.6768111969193, 0, 2, 0.2967898330504095, 0, 0.003206789099889304, 0.00691261942701255, 0.4945045389012709, 1, 0.002208899421822272],
[263.0643768829621, 623.9962473245583, 0, 1, 0.2965573825554231, 0, 0.001602573740287049, 0.003454540359611059, 0.7034426174445769, 1, 0.001103954872816513],
[263.222782280698, 623.6768111969194, 0, 1, 0.2967898330504094, 0, 0.001603394549944652, 0.003456309713506274, 0.7032101669495906, 1, 0.001104241070354078],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.00110443606874749],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001104657999347746],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110393424170696],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103726286812637],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001104742528609837],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001103906980926268],
[262.8392363121695, 624.0603571654478, 0, 1, 0.2963573760154202, 0, 0.00160240910757753, 0.003454185474013443, 0.7036426239845799, 1, 0.001104261699983829],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104436140849715],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.0011047425097253],
[262.9776341147061, 623.9219593629111, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001104241070354078],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103377551950597],
[262.8472869845914, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2963784473119156, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7036215526880845, 1, 0.001104436107917847],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.0011047425097253],
[262.7015132514512, 624.1262973285201, 0, 1, 0.2962260656661732, 0, 0.001602239809923651, 0.003453820532567436, 0.7037739343338267, 1, 0.001105390079794287],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.016415044203, 0, 1, 0.2963784473119155, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7036215526880845, 1, 0.001104386055510629],
[262.9930607177316, 623.8240245195542, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103823561109655],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001103906941787454],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001106978021076938],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104658039213587],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001103513444233523],
[263.2255772191278, 623.7099077073126, 1, 0, 0.2967809741437495, 0.003799022916255316, 0, -0.00818925061691113, 1, 0.2967809741437495, 0.001103906932670727],
[262.9930607177316, 623.8706413110627, 0, 1, 0.2965428172515204, 0, 0.001602896391948341, 0.003455235874056359, 0.7034571827484796, 1, 0.001103695117717448],
[262.9930607177316, 623.8240245195542, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103977349762191],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[262.8831784334145, 624.016415044203, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7035930782168649, 1, 0.0011047425097253],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104666375061818],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001103959688789373],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[262.9695834422843, 623.8749584297083, 0, 1, 0.2965227511996588, 0, 0.001602885300152129, 0.003455211964356162, 0.7034772488003411, 1, 0.001103867099734416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7666850661701, 624.1329084114473, 0, 1, 0.2962755727915456, 0, 0.001602222838313742, 0.00345378394822194, 0.7037244272084544, 1, 0.001105591979064473],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001103900309670774],
[262.8599186491871, 624.0396748284302, 0, 1, 0.2963806958333225, 0, 0.001602462215683537, 0.003454299954920631, 0.7036193041666774, 1, 0.001105092925304086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104315989403797],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104433247654805],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104764833628735],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103327848904796],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103327849693043],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104482266301267],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104722236067864],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906971979479],
[263.0563262105402, 623.8032615584957, 1, 0, 0.2966155294912906, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912906, 0.001103377571714928],
[262.7567674076109, 624.1428260700064, 1, 0, 0.2962643903999512, 0.003805801121189446, 0, -0.008203861852526705, 1, 0.2962643903999512, 0.001106978151528253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110630419158204],
[262.9776341147061, 624.0318416472284, 1, 0, 0.2964766908367132, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964766908367132, 0.001104261658937674],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513432480871],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513444233523],
[262.9930607177316, 623.9424242087088, 0, 1, 0.2965188169684557, 0, 0.001602711983029864, 0.003454838358462825, 0.7034811830315444, 1, 0.001103959871523567],
[262.9930607177316, 623.7966504755685, 0, 1, 0.296567559815097, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.703432440184903, 1, 0.001104646877249727],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513444233523],
[262.9850100453098, 623.8595318266828, 0, 1, 0.2965401461345061, 0, 0.00160292493579759, 0.003455297403754975, 0.7034598538654939, 1, 0.001106449602511775],
[262.7182445434725, 624.2873280584231, 0, 1, 0.2961855625921589, 0, 0.001601826522909042, 0.003452929642721821, 0.7038144374078411, 1, 0.001105072598963386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001103934477962144],
[262.9380091121068, 624.0675634897888, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312165, 1, 0.001104492632463387],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[263.1507982671462, 623.7487952104711, 0, 2, 0.296708669394364, 0, 0.003206419018933963, 0.006911821673021947, 0.4946186957050461, 1, 0.002208571303059892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104417038056193],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104764911650142],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.001103906932670727],
[263.3831784334145, 623.516415044203, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001104436098687273],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103377571714928],
[263.1934625790293, 623.6428654057794, 0, 1, 0.296777944558376, 0, 0.001603481825049566, 0.003456497845487185, 0.703222055441624, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906971809542],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104436140849715],
[263.1029430020488, 623.7966504755685, 0, 1, 0.2966547114655868, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.7033452885344132, 1, 0.001104261699983829],
[263.0643768829622, 624.2527083543237, 0, 1, 0.296471668651138, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7035283313488621, 1, 0.00110412175228776],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103993559751715],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103327838439266],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103871287046036],
[262.5635389263819, 624.3360545512354, 0, 1, 0.2960465207756443, 0, 0.001601701507882301, 0.003452660157802296, 0.7039534792243558, 1, 0.001104436098687273],
[263.2255772191278, 623.7099077073126, 1, 0, 0.2967809741437495, 0.003799022916255316, 0, -0.00818925061691113, 1, 0.2967809741437495, 0.001103377560804521],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327849693043],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103906941787454],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.00110426164924973],
[262.9930607177316, 624.2689729139294, 0, 1, 0.2964096859202598, 0, 0.001601873620808437, 0.003453031167906106, 0.7035903140797402, 1, 0.001104897974326302],
[263.2382088837235, 624.0788763535622, 0, 1, 0.2966675760709922, 0, 0.001602361556992462, 0.003454082973010767, 0.7033324239290077, 1, 0.001103513444233523],
[263.0563262105402, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966155294912905, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912904, 0.001103906941787454],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104742518899421],
[262.9996718006589, 623.8999216769585, 0, 1, 0.2965382707747246, 0, 0.001602821166112885, 0.003455073715724336, 0.7034617292252754, 1, 0.00110412505526696],
[262.9996718006589, 623.8999216769585, 0, 1, 0.2965382707747246, 0, 0.001602821166112885, 0.003455073715724336, 0.7034617292252754, 1, 0.001104239374978106],
[262.7633391547652, 624.1362543228521, 0, 1, 0.2962718001983125, 0, 0.001602214249010316, 0.003453765432945793, 0.7037281998016875, 1, 0.001104659505783791],
[262.5588809209901, 624.0491650903467, 1, 0, 0.2961386173994104, 0.00380866949345706, 0, -0.008210044973787063, 1, 0.2961386173994104, 0.001103993570564581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7759708193609, 623.9778489251162, 1, 0, 0.2963347492487613, 0.003805522996954034, 0, -0.008203262322301003, 1, 0.2963347492487614, 0.001104518121005437],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110378001123515],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103959854667591],
[262.9105524774001, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2964377866568896, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7035622133431103, 1, 0.001104646923340666],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.00110424103109902],
[262.9380091121068, 624.0675634897889, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312166, 1, 0.001104657999347746],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104436080880436],
[262.9930607177316, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965286062555428, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034713937444572, 1, 0.001103513393731142],
[263.0084873207571, 623.8911061568602, 1, 0, 0.2965482104794703, 0.003802158668668477, 0, -0.008196010108219826, 1, 0.2965482104794703, 0.001103871286715914],
[262.9930607177316, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964940825370806, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035059174629194, 1, 0.001104261640096843],
[262.9930607177316, 623.7607590267455, 0, 1, 0.296579563416501, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7034204365834991, 1, 0.001104436130893968],
[263.0963319191216, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966472573152231, 0.003800889175100358, 0, -0.00819327356221443, 1, 0.2966472573152231, 0.001103327840544207],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 2, 0.2965308166243609, 0, 0.003205608364369719, 0.006910074209651318, 0.4948688919591885, 1, 0.002208581591391335],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906822983696],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103906971809542],
[262.9930607177316, 623.9424242087088, 0, 1, 0.2965188169684557, 0, 0.001602711983029864, 0.003454838358462825, 0.7034811830315444, 1, 0.001106978132738603],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377560804521],
[262.9930607177316, 623.7607590267455, 0, 1, 0.296579563416501, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7034204365834991, 1, 0.001104764923401595],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103377560804521],
[263.5643768829622, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2970351650700831, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7029648349299169, 1, 0.001106304293996854],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110474245887352],
[262.9930607177316, 624.0675634897889, 1, 0, 0.2964769865111345, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2964769865111345, 0.001104241060675751],
[262.9930607177316, 623.6500717301203, 0, 1, 0.2966165879970876, 0, 0.001603463296694275, 0.003456457905389866, 0.7033834120029124, 1, 0.001114621431750752],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103977330875137],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104742419488294],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.00110424103109902],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104718632191401],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103913801007886],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104134344647348],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327849693043],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110424103109902],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104436038377257],
[263.222782280698, 623.6768111969193, 0, 1, 0.2967898330504094, 0, 0.001603394549944652, 0.003456309713506275, 0.7032101669495906, 1, 0.001104261658937674],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.0011047425097253],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.0011047425097253],
[263.2759708193609, 623.4778489251162, 0, 1, 0.2968986036002927, 0, 0.001603906220123157, 0.003457412680089354, 0.7031013963997073, 1, 0.001104482242271776],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104722416488535],
[262.9930607177316, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103866107568667],
[263.0084873207571, 623.8360545512354, 1, 0, 0.2965666189539675, 0.003802158668668477, 0, -0.008196010108219826, 1, 0.2965666189539675, 0.001104659505954404],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103906971809542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598856, 0, 2, 0.296530816624361, 0, 0.00320560836436972, 0.006910074209651319, 0.4948688919591885, 1, 0.002209414452280884],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104005465300166],
[263.0755689580632, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2966238465918323, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7033761534081677, 1, 0.001103473755044724],
[262.7840214917828, 624.0437890881884, 0, 1, 0.2963191031638106, 0, 0.001602451650806643, 0.003454277181058369, 0.7036808968361894, 1, 0.001104284116323464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2963784473119156, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7036215526880845, 1, 0.001103928054682596],
[263.0755689580632, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2966238465918323, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7033761534081677, 1, 0.001103954572735611],
[263.0563262105402, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966155294912905, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912904, 0.001103906932670727],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104261640096843],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001104436130893968],
[262.9776341147061, 624.0318416472284, 1, 0, 0.2964766908367132, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964766908367132, 0.001103513432480871],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103959688789373],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104666384106925],
[262.9930607177316, 623.9131438428129, 1, 0, 0.2965286062555428, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2965286062555428, 0.001103513393731142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.4025018049782, 623.3513179394989, 0, 1, 0.2970412936939804, 0, 0.001604231789074452, 0.003458114483103973, 0.7029587063060196, 1, 0.001103934112665932],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103730790593287],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103327876691007],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513393731142],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103710269170429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104109177875056],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764920479934],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104436107917847],
[263.0563262105402, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966155294912905, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912904, 0.001103377601903899],
[262.9930607177316, 623.7607590267455, 0, 1, 0.296579563416501, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7034204365834991, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110424103109902],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001114621403701275],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103977390964655],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.0011047425097253],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001103871236683609],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104261649784784],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103530486301663],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.0011047425097253],
[263.0902432064918, 623.8093502711256, 0, 2, 0.2966403921495668, 0, 0.003206107762140375, 0.006911150721583882, 0.4947147379555151, 1, 0.002208899421822272],
[262.9930607177316, 624.0675634897889, 1, 0, 0.2964769865111345, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2964769865111345, 0.001103954863376945],
[262.9776341147061, 623.9219593629111, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001104241122460016],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001106304293996854],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103377571865312],
[262.9776341147061, 623.9219593629113, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.00110424103109902],
[263.016537993179, 624.3005472441068, 0, 1, 0.2964177545649797, 0, 0.001601792605203326, 0.003452856529029543, 0.7035822454350202, 1, 0.001104436140849715],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104261699983829],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513444233523],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.001103906941787454],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103377560804521],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001106978111982778]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1"],
["epi_isl_453654_England_20200513_null_1"],
["epi_isl_470723_Utah_20200408_null_4"],
["epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1"],
["epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3"],
["epi_isl_465925_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1"],
["epi_isl_440734_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_468229_St_Gallen_20200420_null_2"],
["epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_440259_England_20200322_null_2"],
["epi_isl_466189_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_475012_ISRAEL_20200411_null_8"],
["epi_isl_440915_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_475128_Orebro_20200312_null_1"],
["epi_isl_475567_Stockholm_20200528_null_8"],
["epi_isl_441017_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1"],
["epi_isl_475477_England_20200429_null_11"],
["epi_isl_442526_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1"],
["epi_isl_475278_England_20200427_null_3"],
["epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8"],
["epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1"],
["epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1"],
["Node793"],
["epi_isl_473028_Wales_20200516_null_23"],
["epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6"],
["epi_isl_453454_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_472022_England_20200511_null_18"],
["Node798"],
["epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1"],
["epi_isl_476766_Minnesota_20200603_null_205"],
["Node803"],
["epi_isl_470533_England_20200405_null_5"],
["epi_isl_475686_California_20200403_null_6"],
["epi_isl_437566_California_20200324_null_1"],
["epi_isl_453440_England_20200504_null_4"],
["epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_465177_England_20200418_null_19"],
["Node111"],
["epi_isl_474817_Castilla_La_Mancha_20200402_null_15"],
["epi_isl_474979_PARDESIA_20200315_null_15"],
["epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1"],
["epi_isl_476522_Connecticut_20200327_null_4"],
["epi_isl_465438_England_20200427_null_1"],
["epi_isl_466551_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_1"],
["epi_isl_474810_Castilla_La_Mancha_20200403_null_1"],
["epi_isl_474953_Castilla_La_Mancha_20200401_null_7"],
["Node129"],
["epi_isl_443412_England_20200416_null_6"],
["epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3"],
["epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2"],
["epi_isl_469128_Singapore_20200417_null_1"],
["epi_isl_468031_South_Australia_20200330_null_1"],
["epi_isl_474666_Wales_20200429_null_2"],
["epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1"],
["epi_isl_474753_Wales_20200430_null_20"],
["epi_isl_476126_Zurich_20200421_null_3"],
["epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1"],
["epi_isl_476129_Aargau_20200420_null_2"],
["epi_isl_453618_England_20200505_null_9"],
["epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1"],
["epi_isl_471938_England_20200420_null_7"],
["epi_isl_473641_Scotland_20200423_null_14"],
["epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4"],
["epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1"],
["epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2"],
["epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1"],
["epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3"],
["epi_isl_470120_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4"],
["epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1"],
["Node180"],
["epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4"],
["epi_isl_475678_California_20200328_null_3"],
["epi_isl_438598_England_20200421_null_5"],
["epi_isl_472179_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3"],
["epi_isl_474616_Wales_20200429_null_8"],
["epi_isl_432926_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1"],
["epi_isl_423766_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6"],
["epi_isl_473775_Scotland_20200510_null_4"],
["epi_isl_473776_Scotland_20200510_null_1"],
["Node219"],
["epi_isl_472793_Wales_20200513_null_10"],
["Node218"],
["epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1"],
["epi_isl_473698_Scotland_20200516_null_1"],
["Node215"],
["epi_isl_473867_Scotland_20200429_null_1"],
["epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1"],
["epi_isl_474289_Wales_20200404_null_354"],
["Node209"],
["epi_isl_473715_Scotland_20200517_null_4"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1"],
["epi_isl_472302_England_20200503_null_41"],
["Node225"],
["epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2"],
["epi_isl_471221_Wisconsin_20200328_null_37"],
["Node228"],
["epi_isl_466324_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_467788_Virginia_20200419_null_10"],
["Node274"],
["epi_isl_472418_England_20200426_null_2"],
["epi_isl_473202_Wales_20200527_null_4"],
["Node271"],
["epi_isl_475371_England_20200427_null_84"],
["epi_isl_475532_Vastmanland_20200602_null_33"],
["Node268"],
["epi_isl_453622_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_457132_England_20200326_null_1"],
["Node265"],
["epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1"],
["epi_isl_475129_Varmland_20200312_null_108"],
["Node262"],
["epi_isl_466361_England_20200409_null_4"],
["epi_isl_475826_Mayrhofen_20200401_null_1107"],
["epi_isl_472003_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1"],
["epi_isl_469693_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_465178_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466613_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_459423_England_20200426_null_1"],
["epi_isl_473506_England_20200613_null_6"],
["epi_isl_473991_Wales_20200425_null_1"],
["Node240"],
["epi_isl_473416_England_20200527_null_9"],
["epi_isl_474198_Wales_20200508_null_6"],
["Node259"],
["epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2"],
["epi_isl_457320_England_20200509_null_2"],
["epi_isl_476784_California_20200313_null_10"],
["Node278"],
["epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_473191_Wales_20200531_null_1"],
["epi_isl_473444_England_20200605_null_3"],
["epi_isl_457165_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1"],
["epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9"],
["Node283"],
["epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1"],
["epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12"],
["Node290"],
["epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1"],
["epi_isl_475384_England_20200426_null_11"],
["epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7"],
["epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1"],
["Node301"],
["epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_475794_Styria_20200401_null_50"],
["Node295"],
["epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1"],
["epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4"],
["Node298"],
["epi_isl_475591_California_20200411_null_1"],
["epi_isl_475634_California_20200325_null_3"],
["Node305"],
["epi_isl_448986_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_475623_California_20200408_null_1"],
["Node308"],
["epi_isl_442833_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1"],
["epi_isl_476234_S_o_Paulo_20200309_null_84"],
["Node325"],
["epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1"],
["epi_isl_476904_Unknown_20200301_null_15"],
["Node322"],
["epi_isl_472429_England_20200503_null_4"],
["epi_isl_440058_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_474697_Wales_20200502_null_109"],
["Node314"],
["epi_isl_423704_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_441703_England_20200406_null_1"],
["Node319"],
["epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17"],
["epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1"],
["Node338"],
["epi_isl_473144_Wales_20200419_null_2"],
["epi_isl_476494_Dakar_20200611_null_215"],
["Node334"],
["epi_isl_471418_Vrancea_20200409_null_1"],
["epi_isl_472438_Wales_20200505_null_1"],
["epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1"],
["epi_isl_476553_Connecticut_20200401_null_11"],
["Node342"],
["epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1"],
["epi_isl_476098_Ticino_20200528_null_4"],
["Node345"],
["epi_isl_420520_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_2"],
["Node353"],
["epi_isl_440996_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_476704_Venezuela_20200409_null_156"],
["Node349"],
["epi_isl_465264_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_476786_California_20200327_null_9"],
["Node356"],
["epi_isl_464535_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_466222_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_475332_England_20200421_null_64"],
["Node42"],
["epi_isl_474463_Wales_20200424_null_4"],
["epi_isl_432915_England_20200328_null_3"],
["epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1"],
["epi_isl_468158_Suceava_20200101_null_1"],
["epi_isl_476926_Unknown_20200312_null_47060"],
["epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1"],
["epi_isl_476132_Graub_nden_20200418_null_53"],
["Node38"],
["epi_isl_469836_England_20200504_null_18"],
["epi_isl_473429_England_20200516_null_7"],
["epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1"],
["epi_isl_476760_Minnesota_20200521_null_1"],
["epi_isl_465209_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1"],
["epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2"],
["epi_isl_465845_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_472491_Wales_20200420_null_2"],
["epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1"],
["epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1"],
["epi_isl_476502_Quebec_20200408_null_7"],
["Node387"],
["epi_isl_476109_Basel_Landschaft_20200430_null_5"],
["epi_isl_470499_England_20200408_null_7"],
["epi_isl_443341_England_20200413_null_2"],
["epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1"],
["epi_isl_473434_England_20200602_null_18"],
["epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1"],
["epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_1"],
["epi_isl_471635_Telangana_20200602_null_14"],
["Node404"],
["epi_isl_442675_England_20200405_null_4"],
["epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1"],
["epi_isl_476932_Unknown_20200312_null_5"],
["epi_isl_469193_Connecticut_20200402_null_1"],
["epi_isl_475865_Austria_20200421_null_1"],
["epi_isl_476557_Connecticut_20200401_null_15"],
["epi_isl_443011_England_20200410_null_2"],
["epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1"],
["epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2"],
["Node421"],
["epi_isl_464916_England_20200310_null_8"],
["epi_isl_468346_California_20200426_null_7"],
["epi_isl_472417_England_20200605_null_62"],
["epi_isl_443325_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1"],
["epi_isl_475603_California_20200409_null_2"],
["epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2"],
["epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2"],
["epi_isl_476879_Gujarat_20200612_null_19"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1"],
["epi_isl_475587_California_20200402_null_1"],
["epi_isl_444359_England_20200428_null_2"],
["epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1"],
["epi_isl_475589_California_20200322_null_1"],
["epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5"],
["epi_isl_447714_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1"],
["epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2"],
["epi_isl_470069_Northern_Ireland_20200406_null_46"],
["epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1"],
["Node466"],
["epi_isl_442984_England_20200407_null_7"],
["epi_isl_474653_Wales_20200429_null_7"],
["epi_isl_444416_England_20200420_null_3"],
["epi_isl_440327_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_469294_Kanto_20200511_null_1"],
["Node474"],
["epi_isl_472258_England_20200405_null_11"],
["epi_isl_469886_Northern_Ireland_20200429_null_10"],
["epi_isl_475736_Utah_20200512_null_3"],
["epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1"],
["epi_isl_471245_Wisconsin_20200410_null_1"],
["epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1"],
["epi_isl_443044_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2"],
["Node50"],
["epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2"],
["epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1"],
["epi_isl_475782_Tyrol_20200330_null_3"],
["epi_isl_467986_South_Australia_20200407_null_16"],
["epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1"],
["epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1"],
["epi_isl_475592_California_20200411_null_1"],
["epi_isl_471908_Michigan_20200518_null_5"],
["epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3"],
["epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6"],
["Node509"],
["epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3"],
["epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2"],
["epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_457652_England_20200424_null_1"],
["epi_isl_469644_England_20200418_null_3"],
["epi_isl_474683_Wales_20200430_null_2"],
["epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1"],
["epi_isl_461566_England_20200526_null_3"],
["epi_isl_470321_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_470199_England_20200418_null_8"],
["epi_isl_458863_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_469684_England_20200423_null_4"],
["epi_isl_472110_England_20200528_null_44"],
["epi_isl_442236_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1"],
["Node544"],
["epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1"],
["epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_17"],
["Node540"],
["epi_isl_472163_England_20200312_null_57"],
["epi_isl_453729_England_20200421_null_2"],
["epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30"],
["epi_isl_472164_England_20200313_null_11"],
["epi_isl_472539_Wales_20200401_null_8"],
["epi_isl_474786_Wales_20200430_null_22"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4"],
["epi_isl_475159_Halland_20200419_null_7"],
["epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_466186_England_20200403_null_4"],
["epi_isl_469927_England_20200413_null_3"],
["epi_isl_476496_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200422_null_31"],
["epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1"],
["epi_isl_432938_England_20200328_null_4"],
["epi_isl_472639_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_468160_Rawalpindi_20200602_null_1"],
["epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1"],
["epi_isl_470462_England_20200409_null_16"],
["Node573"],
["epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2"],
["epi_isl_475739_Utah_20200512_null_2"],
["epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5"],
["epi_isl_471458_Rabat_20200419_null_4"],
["Node583"],
["epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1"],
["epi_isl_457289_England_20200417_null_2"],
["epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9"],
["epi_isl_468528_California_20200331_null_4"],
["epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4"],
["epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3"],
["epi_isl_462042_England_20200418_null_5"],
["epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3"],
["epi_isl_470848_Western_Australia_20200322_null_108"],
["Node604"],
["epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1"],
["epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4"],
["epi_isl_423428_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_458972_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_469361_England_20200509_null_1"],
["epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1"],
["epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2"],
["epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1"],
["epi_isl_467825_California_20200315_null_1"],
["epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1"],
["epi_isl_476412_S_o_Paulo_20200428_null_2"],
["epi_isl_440906_England_20200421_null_2"],
["epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1"],
["epi_isl_476304_Bahia_20200331_null_1"],
["epi_isl_470588_Minas_Gerais_20200406_null_1"],
["epi_isl_474854_Galicia_20200321_null_6"],
["Node629"],
["epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1"],
["epi_isl_458273_California_20200414_null_3"],
["epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1"],
["epi_isl_424003_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_476837_Thessaloniki_20200415_null_12"],
["epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1"],
["epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5"],
["epi_isl_433359_Scotland_20200327_null_9"],
["epi_isl_449330_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1"],
["epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1"],
["epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_457683_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_473363_England_20200509_null_8"],
["epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_476531_Connecticut_20200328_null_2"],
["epi_isl_468334_Galicia_20200429_null_2"],
["epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1"],
["epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1"],
["epi_isl_468807_Aragon_20200327_null_6"],
["epi_isl_476567_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200518_null_23"],
["epi_isl_475284_England_20200330_null_18"],
["epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_12"],
["epi_isl_469035_Gujarat_20200605_null_1"],
["Node676"],
["epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2"],
["epi_isl_473490_England_20200604_null_6"],
["epi_isl_444012_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4"],
["epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3"],
["epi_isl_471416_Buzau_20200601_null_4"],
["epi_isl_471808_Michigan_20200422_null_2"],
["epi_isl_473616_Scotland_20200421_null_18"],
["epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2"],
["epi_isl_476838_Thessaloniki_20200330_null_3"],
["epi_isl_475277_England_20200428_null_1"],
["epi_isl_442976_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1"],
["Node699"],
["epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1"],
["epi_isl_442115_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_458525_England_20200507_null_12"],
["Node71"],
["epi_isl_433865_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1"],
["epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4"],
["epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7"],
["epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1"],
["epi_isl_444143_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_461985_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_474607_Wales_20200427_null_89"],
["epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2"],
["epi_isl_453275_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_465657_England_20200511_null_1"],
["Node719"],
["epi_isl_472744_Wales_20200514_null_1"],
["epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3"],
["epi_isl_447731_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_449109_England_20200408_null_1"],
["Node726"],
["epi_isl_472309_England_20200506_null_10"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_440142_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_453770_England_20200422_null_1"],
["epi_isl_475743_Utah_20200512_null_1"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1"],
["epi_isl_465243_England_20200414_null_5"],
["epi_isl_475741_Utah_20200512_null_2"],
["epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2"],
["epi_isl_437584_California_20200315_null_1"],
["epi_isl_457485_England_20200505_null_2"],
["epi_isl_475712_California_20200402_null_32"],
["epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1"],
["epi_isl_465876_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1"],
["epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1"],
["epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_467897_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104276918232904],
[262.8831784334145, 623.8706413110626, 0, 2, 0.2964556482081641, 0, 0.003205792783896682, 0.006910471748112719, 0.4949746549381946, 1, 0.002211572806349574],
[263.0084873207571, 623.8911061568602, 1, 0, 0.2965482104794703, 0.003802158668668477, 0, -0.008196010108219826, 1, 0.2965482104794703, 0.001104659514936712],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764821783046],
[262.9776341147061, 624.0318416472284, 1, 0, 0.2964766908367132, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964766908367132, 0.001104261658937674],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103695159402996],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906932670727],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103695117717448],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103977349762191],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103906941787454],
[263.1934625790293, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2968055583395963, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7031944416604037, 1, 0.001104436077887924],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104657987513792],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.001104764881055693],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001103377571714928],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103530517500664],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764881143696],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377610845133],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001106304303030306],
[262.929795224923, 624.0098039612757, 1, 0, 0.2964461113994361, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964461113994361, 0.001104764920479934],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001106978148857591],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377559792463],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104241039984757],
[262.8472869845914, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2963784473119156, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7036215526880845, 1, 0.001104435975732414],
[262.9767497758177, 624.0329469130493, 1, 0, 0.2964756200044801, 0.003802617535019653, 0, -0.008196999249804986, 1, 0.29647562000448, 0.001104564316209453],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.016537993179, 623.9381070900632, 0, 1, 0.2965388810478516, 0, 0.001602723072427525, 0.003454862262992658, 0.7034611189521485, 1, 0.001104448812990736],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104402525816475],
[262.8032642393057, 624.0963292383116, 1, 0, 0.2963168166633488, 0.003805127774552341, 0, -0.008202410372900268, 1, 0.2963168166633487, 0.001104723138781329],
[262.8665297321143, 624.033063745503, 0, 1, 0.2963881499836861, 0, 0.00160247919236508, 0.003454336550198644, 0.7036118500163139, 1, 0.001103993579425816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104315371918494],
[262.6382477586426, 624.2613457189748, 1, 0, 0.2961307567284061, 0.003807518548931886, 0, -0.008207563974495777, 1, 0.2961307567284062, 0.001105167791068938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104560385685162],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.0011047425097253],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104764872131664],
[262.9930607177316, 623.7966504755685, 0, 1, 0.296567559815097, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.703432440184903, 1, 0.001104657987513792],
[263.1934625790293, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2968055583395963, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7031944416604037, 1, 0.00110443606874749],
[262.8080854594594, 624.0515023095767, 0, 1, 0.2963356196222374, 0, 0.001602431844645932, 0.003454234486497848, 0.7036643803777626, 1, 0.00110332784006774],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104380445573457],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104395058729015],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742518899421],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764833628735],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104261699983829],
[262.9571692689086, 623.9424242087088, 0, 1, 0.296490348177778, 0, 0.001602711983029864, 0.003454838358462825, 0.7035096518222219, 1, 0.001106978081311019],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327790138114],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103671393457089],
[262.9695834422843, 623.7139276998051, 0, 2, 0.2965766027424681, 0, 0.003206598267535569, 0.006912208064932088, 0.4948044758093275, 1, 0.002232021177110777],
[262.7732961490973, 624.1262973285201, 0, 1, 0.2962830269419093, 0, 0.001602239809923651, 0.003453820532567436, 0.7037169730580908, 1, 0.001104996069888006],
[262.7732961490973, 624.2088055688516, 0, 1, 0.2962554663055157, 0, 0.001602028025043132, 0.003453364004796567, 0.7037445336944843, 1, 0.001107147746315578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001104376514282503],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110432763094647],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001103871287046036],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103977349762191],
[262.6468851232937, 624.3984820874639, 0, 1, 0.2960918289322288, 0, 0.001601541369314096, 0.003452314959866571, 0.7039081710677713, 1, 0.001106304154655173],
[262.9776341147061, 623.9219593629113, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001103513435379584],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103906941787454],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110337751283608],
[262.6623117263192, 624.2731732001212, 0, 1, 0.2961459048491036, 0, 0.001601862842950378, 0.00345300793493734, 0.7038540951508964, 1, 0.001104436107917847],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.8306356024814, 0, 1, 0.2965561946630376, 0, 0.001602999184280559, 0.003455457455286213, 0.7034438053369624, 1, 0.001104569517210274],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 1, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0.00160280418218486, -0.00474145376358604, 0.9120694747920897, 0.5051311080408115, 0.002208899568105868],
[262.9380091121068, 624.0675634897888, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312165, 1, 0.001103871376925371],
[262.9380091121068, 624.0675634897889, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312166, 1, 0.001104658027379631],
[263.016537993179, 623.9381070900632, 0, 1, 0.2965388810478516, 0, 0.001602723072427525, 0.003454862262992658, 0.7034611189521485, 1, 0.001104436071649861],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104764881143696],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001104658077750678],
[263.016537993179, 623.9381070900632, 0, 1, 0.2965388810478516, 0, 0.001602723072427525, 0.003454862262992658, 0.7034611189521485, 1, 0.0011044360807903],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103906971979479],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001103977400620721],
[262.9695834422843, 623.76897930543, 0, 1, 0.2965581903051865, 0, 0.00160315763235534, 0.003455799009160131, 0.7034418096948134, 1, 0.001103695117717448],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104659506042116],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8600386090008, 624.0395548686165, 1, 0, 0.2963808310908134, 0.003804305916151373, 0, -0.008200638758312648, 1, 0.2963808310908134, 0.001103934712278185],
[263.0963319191216, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966472573152231, 0.003800889175100358, 0, -0.00819327356221443, 1, 0.2966472573152231, 0.00110373080327648],
[262.929795224923, 624.0098039612757, 1, 0, 0.2964461113994361, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964461113994361, 0.001104742540443807],
[262.8831784334145, 624.016415044203, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7035930782168649, 1, 0.001104764920567936],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.00110426164924973],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104897984317757],
[263.1029430020488, 623.7966504755686, 0, 1, 0.2966547114655868, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.7033452885344132, 1, 0.001103327849693043],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906971979479],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377602452889],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103530517500664],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103906932840664],
[263.9105524774, 622.9890410002173, 0, 1, 0.2975653100060422, 0, 0.00160516467255104, 0.003460125425589596, 0.7024346899939578, 1, 0.001103943387236406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7046546541304, 623.8728773636808, 0, 1, 0.2963132328158894, 0, 0.00160289064693072, 0.003455223489980207, 0.7036867671841105, 1, 0.00110601706841329],
[262.9217445525011, 623.8168181952132, 0, 1, 0.296504241044612, 0, 0.001603034690364931, 0.003455533992919641, 0.703495758955388, 1, 0.001105679634186184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104692022681424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7019799838667, 624.0365827638475, 0, 1, 0.2962564063638315, 0, 0.001602470155789612, 0.00345431707077384, 0.7037435936361685, 1, 0.001105530367176464],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.00110496048554331],
[262.4329366276021, 624.144595390209, 1, 0, 0.2960067531040589, 0.003810497313525173, 0, -0.008213985059685559, 1, 0.2960067531040589, 0.001105322206842496],
[262.9962021204108, 623.5813298974005, 0, 1, 0.2966420788059484, 0, 0.001603640057928823, 0.00345683893548128, 0.7033579211940516, 1, 0.001105023842194655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9217445525011, 623.8168181952132, 0, 1, 0.296504241044612, 0, 0.001603034690364931, 0.003455533992919641, 0.703495758955388, 1, 0.001104774759853188],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104528969905395],
[263.9105524774, 622.9890410002173, 0, 3, 0.2975653100060422, 0, 0.004815494017653119, 0.01038037627676879, 0.3465914569255372, 1, 0.003326511920748391],
[262.9217445525011, 623.8168181952132, 0, 1, 0.296504241044612, 0, 0.001603034690364931, 0.003455533992919641, 0.703495758955388, 1, 0.001105669209486475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104225049814644],
[262.8280442370685, 624.0715492405488, 0, 1, 0.2963447566894182, 0, 0.001602380370034381, 0.003454123526784339, 0.7036552433105818, 1, 0.001104726430489778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9105524774, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2964377866568896, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7035622133431104, 1, 0.001104466008533213],
[263.6822705039282, 623.2173229736891, 0, 1, 0.2973079167507621, 0, 0.001604576707252757, 0.00345885799570359, 0.7026920832492378, 1, 0.001104859663326291],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.4105524774, 623.4890410002173, 0, 1, 0.2970015483314659, 0, 0.001603877428857088, 0.003457350617054037, 0.7029984516685341, 1, 0.001104930636688437],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104607193924111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110418256673705],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104521865177945],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104886192013396],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103340797131932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103793176323677],
[262.8472869845914, 623.8872900123628, 0, 1, 0.2964216055211911, 0, 0.001602853617967092, 0.003455143669597462, 0.703578394478809, 1, 0.001104603863215068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.8240245195542, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001104916156731857],
[262.6301970862207, 624.1083656614936, 0, 1, 0.2961754547726166, 0, 0.001602285844927103, 0.003453919766551735, 0.7038245452273835, 1, 0.001104753210756369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8478886175059, 624.0517048601115, 1, 0, 0.2963671316917109, 0.003804481767990124, 0, -0.008201017828092096, 1, 0.2963671316917109, 0.001103848287061868],
[262.9019151127489, 623.8519046317282, 0, 1, 0.296476777724516, 0, 0.001602944533110497, 0.003455339648118948, 0.7035232222754839, 1, 0.001104268883543941],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 1, 0, 0.2962020900487435, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2962020900487434, 0.001104772062485118],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 1, 0, 0.2962020900487435, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2962020900487434, 0.001103774304904617],
[262.7015132514512, 624.3591109560692, 1, 0, 0.2961483196102213, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2961483196102213, 0.001104659506042116],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 1, 0, 0.2962020900487435, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376959, 1, 0.2962020900487434, 0.001103774314015716],
[262.468996750055, 624.3947052787394, 1, 0, 0.2959518989779709, 0.003809973796456745, 0, -0.008212856555707009, 1, 0.2959518989779708, 0.001104375834416633],
[262.7647787442598, 624.1348147333575, 1, 0, 0.2962734233690809, 0.003805685087548459, 0, -0.008203611728063919, 1, 0.2962734233690809, 0.001103774304904617],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.00110399895637501],
[262.1549357957156, 624.7446576819018, 0, 1, 0.2955858112052811, 0, 0.001600653943501451, 0.003450402006840525, 0.7044141887947188, 1, 0.001105314231940281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001104526502755764],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513444233523],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104301031020524],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104657087081682],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104456573088094],
[262.8831784334145, 624.016415044203, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7035930782168649, 1, 0.001104659514936712],
[262.555739518311, 624.3438539593063, 0, 1, 0.2960377267609348, 0, 0.0016016814991586, 0.003452617026592898, 0.7039622732390652, 1, 0.001104531194505054],
[262.7015132514512, 624.1980802261661, 0, 1, 0.2962020900487435, 0, 0.00160205555204154, 0.003453423342550948, 0.7037979099512566, 1, 0.001105264500955373],
[262.6860866484257, 624.2135068291916, 1, 0, 0.2961846961936341, 0.00380682514540019, 0, -0.008206069259821796, 1, 0.2961846961936341, 0.001104662853195814],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.0523064930259, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.00160242977967613, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104475846760152],
[262.7207559989741, 624.0523064930259, 0, 1, 0.2962660539785446, 0, 0.00160242977967613, 0.003454230035207187, 0.7037339460214554, 1, 0.001105179512624318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.001104198502428335],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104482077851135],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104755137495783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.4490379724459, 624.4505555051715, 1, 0, 0.2959174182765812, 0.003810263538115877, 0, -0.008213481128686195, 1, 0.2959174182765811, 0.001105168295535688],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001103980846561362],
[262.0123034652545, 624.8872900123629, 0, 1, 0.2954249899223422, 0, 0.001600288589611442, 0.003449614442607536, 0.7045750100776578, 1, 0.001104843622732237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.5755689580632, 624.3240245195542, 1, 0, 0.2960600849172559, 0.003808427432788743, 0, -0.008209523182915819, 1, 0.2960600849172559, 0.001103950179592414],
[262.8671164243436, 624.0324770532737, 1, 0, 0.2963888114928734, 0.003804203483503469, 0, -0.008200417952425574, 1, 0.2963888114928734, 0.001104104548692995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103599694950313],
[263.1190050111196, 623.7805884664976, 0, 1, 0.2966728217558485, 0, 0.001603127796038668, 0.003455734693392605, 0.7033271782441515, 1, 0.001104380115439526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104603817974755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.8872900123628, 0, 1, 0.2960876976018624, 0, 0.001600288589611442, 0.003449614442607537, 0.7039123023981376, 1, 0.001104339715149864],
[262.9930607177316, 624.3240245195541, 1, 0, 0.2963912958436974, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2963912958436974, 0.00110406077475552],
[262.8511031290889, 624.1035419541533, 1, 0, 0.2963523609534959, 0.003804435241456414, 0, -0.008200917534555234, 1, 0.2963523609534959, 0.00110416135216725],
[262.8665297321143, 624.033063745503, 1, 0, 0.2963881499836861, 0.003804211974111326, 0, -0.008200436254951555, 1, 0.2963881499836861, 0.001107147746315578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104676430615174],
[262.9776341147061, 623.9770109685361, 1, 0, 0.2964950187391208, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964950187391208, 0.001104739001699184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104939390896743],
[262.9622075116806, 624.0474891771863, 0, 1, 0.2964592252974196, 0, 0.001602442149584659, 0.003454256700032141, 0.7035407747025804, 1, 0.001104219246822255],
[262.9622075116806, 624.0474891771863, 1, 0, 0.2964592252974196, 0.003802827826335389, 0, -0.008197452558017409, 1, 0.2964592252974196, 0.001103485983221067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9776341147061, 623.9770109685361, 1, 0, 0.2964950187391208, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964950187391208, 0.001103973305476848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.9776341147061, 622.9770109685361, 1, 0, 0.297622472105021, 0.003788199721365298, 0, -0.008165919919154403, 1, 0.297622472105021, 0.001103350735449691],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103942052015045],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001104648076297666],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104063071746705],
[263.044832584466, 623.964864104401, 0, 1, 0.2965523754321855, 0, 0.001602654344063645, 0.003454714110741747, 0.7034476245678145, 1, 0.001104073126594629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001104243927854027],
[263.3315627349068, 623.557320569279, 0, 4, 0.2969160711022117, 0, 0.006414807216677666, 0.0138278881477042, 0.2443591938777009, 1, 0.004424728180738421],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103513444233523],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001104687768287334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104301335382486],
[262.9930607177316, 624.631413067973, 0, 1, 0.2962886541377913, 0, 0.001600944139341867, 0.003451027558862068, 0.7037113458622086, 1, 0.001105497508672618],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 624.2689729139294, 0, 1, 0.2964096859202598, 0, 0.001601873620808437, 0.003453031167906106, 0.7035903140797402, 1, 0.001104435621097081],
[263.0640753319889, 623.9456213568781, 0, 1, 0.2965740693861466, 0, 0.00160270377060316, 0.003454820655589762, 0.7034259306138534, 1, 0.001104330045450279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9653025320516, 623.9893425511905, 0, 1, 0.2964811154547501, 0, 0.001602591473616334, 0.003454578585934245, 0.7035188845452498, 1, 0.001104625823405492],
[262.8900070075617, 624.4270782297241, 0, 1, 0.2962751550504178, 0, 0.001601468025433875, 0.003452156858315308, 0.7037248449495821, 1, 0.001105018256895258],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104271290391374],
[263.3305989475184, 623.4424635444816, 1, 0, 0.2969537642556593, 0.003797507786777561, 0, -0.00818598457317201, 1, 0.2969537642556593, 0.001105032359241163],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.1934625790293, 623.6428654057794, 0, 1, 0.296777944558376, 0, 0.001603481825049566, 0.003456497845487185, 0.703222055441624, 1, 0.001104880463635683],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110386606710456],
[262.8819563351398, 624.0176371424775, 1, 0, 0.2964055438387955, 0.003803988732970063, 0, -0.008199955031833373, 1, 0.2964055438387955, 0.001104570770446358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001103900263501359],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104241070354078],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103377610757822],
[263.0289521665546, 623.8706413110626, 0, 1, 0.2965712850709438, 0, 0.001602896391948341, 0.003455235874056359, 0.7034287149290561, 1, 0.001104436162388572],
[263.0717528135658, 623.7727890584268, 2, 0, 0.2966379567023796, 0.007602488593358651, 0, -0.01638807813894166, 1, 0.08799407735656273, 0.002209318496072502],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7169398544767, 624.1826536231407, 1, 0, 0.2962194839038528, 0.003806378075787259, 0, -0.008205105547524136, 1, 0.2962194839038528, 0.001104746643775977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104185374631277],
[263.0084873207571, 623.8911061568602, 1, 0, 0.2965482104794702, 0.003802158668668478, 0, -0.008196010108219827, 1, 0.2965482104794702, 0.001104289658284768],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104764892989387],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103377530631239],
[263.1468851232937, 624.1702001139921, 0, 1, 0.2965646548470586, 0, 0.001602127111831629, 0.003453577598281447, 0.7034353451529414, 1, 0.001103530517500664],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513384877203],
[263.0084873207571, 623.8360545512354, 1, 0, 0.2965666189539675, 0.003802158668668478, 0, -0.008196010108219827, 1, 0.2965666189539675, 0.001104659514936712],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110466438550173],
[262.9930607177316, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103960055841668],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103327848991942],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103867048459323],
[262.8032642393057, 624.0963292383116, 1, 0, 0.2963168166633488, 0.003805127774552341, 0, -0.008202410372900268, 1, 0.2963168166633487, 0.001104853023927228],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001103381446869143],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104560462657513],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742428662415],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104659515488292],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001103960039710029],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104664292775718],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104742428662415],
[262.8392363121695, 623.8993264355447, 0, 1, 0.2964111941830028, 0, 0.00160282269531078, 0.003455077012094241, 0.7035888058169972, 1, 0.001106449642032703],
[262.7015132514512, 624.1980802261662, 1, 0, 0.2962020900487434, 0.003806601597467105, 0, -0.008205587375376961, 1, 0.2962020900487434, 0.001104700758207777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001103936043771752],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104624859962176],
[262.9776341147061, 623.9219593629113, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001103513432480871],
[262.4930607177316, 624.4065327598857, 0, 1, 0.2959670549497846, 0, 0.001601520720130819, 0.00345227044806956, 0.7040329450502154, 1, 0.001104742518899421],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104239363318238],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104124942026567],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327790138114],
[262.9930607177316, 623.9824299172901, 0, 1, 0.2965054429288054, 0, 0.00160260922752673, 0.003454616856622488, 0.7034945570711946, 1, 0.001106449632288841],
[262.9930607177316, 624.2285942196919, 0, 1, 0.2964231759382392, 0, 0.00160197723920359, 0.003453254529813928, 0.7035768240617608, 1, 0.001104502832831747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 624.0675634897888, 1, 0, 0.2964769865111346, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2964769865111345, 0.001103789624554925],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104618530286086],
[262.8942879177943, 623.9502539541982, 0, 1, 0.2964378484676298, 0, 0.001602691871126967, 0.003454795004838265, 0.7035621515323702, 1, 0.001104659514936712],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742518899421],
[262.9930607177316, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103959688789373],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110466643405583],
[262.8897895163417, 624.0098039612757, 1, 0, 0.2964143759334987, 0.003803875387628314, 0, -0.008199710702322784, 1, 0.2964143759334987, 0.001104764920479934],
[263.2293540278524, 623.6702394497649, 1, 0, 0.2967972428487706, 0.003798968407961787, 0, -0.008189133117731407, 1, 0.2967972428487706, 0.001106304154655173],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.001103977349762191],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001103513444233523],
[263.2101506161023, 623.8352165946552, 1, 0, 0.2967268195579955, 0.003799245574911438, 0, -0.008189730584412564, 1, 0.2967268195579955, 0.001103906980926268],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104104997249423],
[262.9930607177316, 623.7415162792225, 1, 1, 0.2965859993961135, 0.003802381695056555, 0.001603228218582042, -0.004740539702153991, 0.9120367449622087, 0.5052087437544356, 0.002215540310608568],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104764923401595],
[262.9930607177316, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964940825370806, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035059174629194, 1, 0.001104261658937674],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104897974326302],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104742518899421],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906930719708],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.00110443610962058],
[262.7759708193609, 623.9778489251163, 1, 0, 0.2963347492487613, 0.003805522996954034, 0, -0.008203262322301003, 1, 0.2963347492487614, 0.00110397734005048],
[262.9105524774001, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2964377866568896, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7035622133431103, 1, 0.0011047425097253],
[263.0482755381184, 623.6902872095959, 0, 1, 0.296646933593389, 0, 0.001603359905561496, 0.003456235033373413, 0.703353066406611, 1, 0.001103934877636977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103697840965954],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513394208515],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.0011047425097253],
[262.8472869845914, 624.016415044203, 0, 1, 0.2963784473119155, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7036215526880845, 1, 0.00110386606710456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.6221464137988, 623.2774470638186, 1, 0, 0.2972401254352947, 0.003793308011498903, 0, -0.00817693145265924, 1, 0.2972401254352947, 0.001104502795543818],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.001103789641563844],
[262.929795224923, 623.9697982526944, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104620227163172],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.00110474247951419],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.0011047425097253],
[263.2227822806981, 623.6768111969193, 0, 2, 0.2967898330504095, 0, 0.003206789099889304, 0.00691261942701255, 0.4945045389012709, 1, 0.002208899421822272],
[263.0643768829621, 623.9962473245583, 0, 1, 0.2965573825554231, 0, 0.001602573740287049, 0.003454540359611059, 0.7034426174445769, 1, 0.001103954872816513],
[263.222782280698, 623.6768111969194, 0, 1, 0.2967898330504094, 0, 0.001603394549944652, 0.003456309713506274, 0.7032101669495906, 1, 0.001104241070354078],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.00110443606874749],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001104657999347746],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110393424170696],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103726286812637],
[262.6468851232937, 624.2527083543237, 0, 1, 0.2961404955587254, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7038595044412745, 1, 0.001104742528609837],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001103906980926268],
[262.8392363121695, 624.0603571654478, 0, 1, 0.2963573760154202, 0, 0.00160240910757753, 0.003454185474013443, 0.7036426239845799, 1, 0.001104261699983829],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104436140849715],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.0011047425097253],
[262.9776341147061, 623.9219593629111, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001104241070354078],
[263.4930607177316, 623.4065327598857, 0, 1, 0.2970945782989373, 0, 0.001604089703027166, 0.003457808199547373, 0.7029054217010627, 1, 0.001103377551950597],
[262.8472869845914, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2963784473119156, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7036215526880845, 1, 0.001104436107917847],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.0011047425097253],
[262.7015132514512, 624.1262973285201, 0, 1, 0.2962260656661732, 0, 0.001602239809923651, 0.003453820532567436, 0.7037739343338267, 1, 0.001105390079794287],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.016415044203, 0, 1, 0.2963784473119155, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7036215526880845, 1, 0.001104386055510629],
[262.9930607177316, 623.8240245195542, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103823561109655],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001103906941787454],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001106978021076938],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104658039213587],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.001103513444233523],
[263.2255772191278, 623.7099077073126, 1, 0, 0.2967809741437495, 0.003799022916255316, 0, -0.00818925061691113, 1, 0.2967809741437495, 0.001103906932670727],
[262.9930607177316, 623.8706413110627, 0, 1, 0.2965428172515204, 0, 0.001602896391948341, 0.003455235874056359, 0.7034571827484796, 1, 0.001103695117717448],
[262.9930607177316, 623.8240245195542, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103977349762191],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[262.8831784334145, 624.016415044203, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584189, 0.7035930782168649, 1, 0.0011047425097253],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104666375061818],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001103959688789373],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[262.9695834422843, 623.8749584297083, 0, 1, 0.2965227511996588, 0, 0.001602885300152129, 0.003455211964356162, 0.7034772488003411, 1, 0.001103867099734416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7666850661701, 624.1329084114473, 0, 1, 0.2962755727915456, 0, 0.001602222838313742, 0.00345378394822194, 0.7037244272084544, 1, 0.001105591979064473],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001103900309670774],
[262.8599186491871, 624.0396748284302, 0, 1, 0.2963806958333225, 0, 0.001602462215683537, 0.003454299954920631, 0.7036193041666774, 1, 0.001105092925304086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104315989403797],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104433247654805],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104764833628735],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103327848904796],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103327849693043],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104482266301267],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104722236067864],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906971979479],
[263.0563262105402, 623.8032615584957, 1, 0, 0.2966155294912906, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912906, 0.001103377571714928],
[262.7567674076109, 624.1428260700064, 1, 0, 0.2962643903999512, 0.003805801121189446, 0, -0.008203861852526705, 1, 0.2962643903999512, 0.001106978151528253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110630419158204],
[262.9776341147061, 624.0318416472284, 1, 0, 0.2964766908367132, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964766908367132, 0.001104261658937674],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513432480871],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513444233523],
[262.9930607177316, 623.9424242087088, 0, 1, 0.2965188169684557, 0, 0.001602711983029864, 0.003454838358462825, 0.7034811830315444, 1, 0.001103959871523567],
[262.9930607177316, 623.7966504755685, 0, 1, 0.296567559815097, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.703432440184903, 1, 0.001104646877249727],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513444233523],
[262.9850100453098, 623.8595318266828, 0, 1, 0.2965401461345061, 0, 0.00160292493579759, 0.003455297403754975, 0.7034598538654939, 1, 0.001106449602511775],
[262.7182445434725, 624.2873280584231, 0, 1, 0.2961855625921589, 0, 0.001601826522909042, 0.003452929642721821, 0.7038144374078411, 1, 0.001105072598963386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001103934477962144],
[262.9380091121068, 624.0675634897888, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312165, 1, 0.001104492632463387],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[263.1507982671462, 623.7487952104711, 0, 2, 0.296708669394364, 0, 0.003206419018933963, 0.006911821673021947, 0.4946186957050461, 1, 0.002208571303059892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104417038056193],
[262.9864496348044, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965233624739973, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034766375260026, 1, 0.001104764911650142],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.001103906932670727],
[263.3831784334145, 623.516415044203, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001104436098687273],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103377571714928],
[263.1934625790293, 623.6428654057794, 0, 1, 0.296777944558376, 0, 0.001603481825049566, 0.003456497845487185, 0.703222055441624, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906971809542],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104436140849715],
[263.1029430020488, 623.7966504755685, 0, 1, 0.2966547114655868, 0, 0.001603086517437409, 0.003455645712405051, 0.7033452885344132, 1, 0.001104261699983829],
[263.0643768829622, 624.2527083543237, 0, 1, 0.296471668651138, 0, 0.001601915356741077, 0.003453121134726433, 0.7035283313488621, 1, 0.00110412175228776],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103993559751715],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103327838439266],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103871287046036],
[262.5635389263819, 624.3360545512354, 0, 1, 0.2960465207756443, 0, 0.001601701507882301, 0.003452660157802296, 0.7039534792243558, 1, 0.001104436098687273],
[263.2255772191278, 623.7099077073126, 1, 0, 0.2967809741437495, 0.003799022916255316, 0, -0.00818925061691113, 1, 0.2967809741437495, 0.001103377560804521],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327849693043],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103906941787454],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.00110426164924973],
[262.9930607177316, 624.2689729139294, 0, 1, 0.2964096859202598, 0, 0.001601873620808437, 0.003453031167906106, 0.7035903140797402, 1, 0.001104897974326302],
[263.2382088837235, 624.0788763535622, 0, 1, 0.2966675760709922, 0, 0.001602361556992462, 0.003454082973010767, 0.7033324239290077, 1, 0.001103513444233523],
[263.0563262105402, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966155294912905, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912904, 0.001103906941787454],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104742518899421],
[262.9996718006589, 623.8999216769585, 0, 1, 0.2965382707747246, 0, 0.001602821166112885, 0.003455073715724336, 0.7034617292252754, 1, 0.00110412505526696],
[262.9996718006589, 623.8999216769585, 0, 1, 0.2965382707747246, 0, 0.001602821166112885, 0.003455073715724336, 0.7034617292252754, 1, 0.001104239374978106],
[262.7633391547652, 624.1362543228521, 0, 1, 0.2962718001983125, 0, 0.001602214249010316, 0.003453765432945793, 0.7037281998016875, 1, 0.001104659505783791],
[262.5588809209901, 624.0491650903467, 1, 0, 0.2961386173994104, 0.00380866949345706, 0, -0.008210044973787063, 1, 0.2961386173994104, 0.001103993570564581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.7759708193609, 623.9778489251162, 1, 0, 0.2963347492487613, 0.003805522996954034, 0, -0.008203262322301003, 1, 0.2963347492487614, 0.001104518121005437],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110378001123515],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103959854667591],
[262.9105524774001, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2964377866568896, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7035622133431103, 1, 0.001104646923340666],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.00110424103109902],
[262.9380091121068, 624.0675634897889, 0, 1, 0.2964333226687835, 0, 0.001602390604004469, 0.003454145587337198, 0.7035666773312166, 1, 0.001104657999347746],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104436080880436],
[262.9930607177316, 623.9131438428129, 0, 1, 0.2965286062555428, 0, 0.001602787198616763, 0.003455000494702853, 0.7034713937444572, 1, 0.001103513393731142],
[263.0084873207571, 623.8911061568602, 1, 0, 0.2965482104794703, 0.003802158668668477, 0, -0.008196010108219826, 1, 0.2965482104794703, 0.001103871286715914],
[262.9930607177316, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964940825370806, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035059174629194, 1, 0.001104261640096843],
[262.9930607177316, 623.7607590267455, 0, 1, 0.296579563416501, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7034204365834991, 1, 0.001104436130893968],
[263.0963319191216, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966472573152231, 0.003800889175100358, 0, -0.00819327356221443, 1, 0.2966472573152231, 0.001103327840544207],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 2, 0.2965308166243609, 0, 0.003205608364369719, 0.006910074209651318, 0.4948688919591885, 1, 0.002208581591391335],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103906822983696],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103906971809542],
[262.9930607177316, 623.9424242087088, 0, 1, 0.2965188169684557, 0, 0.001602711983029864, 0.003454838358462825, 0.7034811830315444, 1, 0.001106978132738603],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103377560804521],
[262.9930607177316, 623.7607590267455, 0, 1, 0.296579563416501, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7034204365834991, 1, 0.001104764923401595],
[263.0563262105402, 623.9065327598857, 1, 0, 0.296580993837659, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2965809938376589, 0.001103377560804521],
[263.5643768829622, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2970351650700831, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7029648349299169, 1, 0.001106304293996854],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110474245887352],
[262.9930607177316, 624.0675634897889, 1, 0, 0.2964769865111345, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2964769865111345, 0.001104241060675751],
[262.9930607177316, 623.6500717301203, 0, 1, 0.2966165879970876, 0, 0.001603463296694275, 0.003456457905389866, 0.7033834120029124, 1, 0.001114621431750752],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103977330875137],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104742419488294],
[263.0918335176689, 623.8628115655732, 0, 1, 0.296623773240375, 0, 0.00160291650898459, 0.003455279238746477, 0.7033762267596251, 1, 0.00110424103109902],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104718632191401],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103913801007886],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104134344647348],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327849693043],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.00110424103109902],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104436038377257],
[263.222782280698, 623.6768111969193, 0, 1, 0.2967898330504094, 0, 0.001603394549944652, 0.003456309713506275, 0.7032101669495906, 1, 0.001104261658937674],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.0011047425097253],
[262.929795224923, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2964806322519378, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964806322519378, 0.0011047425097253],
[263.2759708193609, 623.4778489251162, 0, 1, 0.2968986036002927, 0, 0.001603906220123157, 0.003457412680089354, 0.7031013963997073, 1, 0.001104482242271776],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.001104722416488535],
[262.9930607177316, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2965584054431727, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7034415945568273, 1, 0.001103866107568667],
[263.0084873207571, 623.8360545512354, 1, 0, 0.2965666189539675, 0.003802158668668477, 0, -0.008196010108219826, 1, 0.2965666189539675, 0.001104659505954404],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103906971809542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598856, 0, 2, 0.296530816624361, 0, 0.00320560836436972, 0.006910074209651319, 0.4948688919591885, 1, 0.002209414452280884],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104005465300166],
[263.0755689580632, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2966238465918323, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7033761534081677, 1, 0.001103473755044724],
[262.7840214917828, 624.0437890881884, 0, 1, 0.2963191031638106, 0, 0.001602451650806643, 0.003454277181058369, 0.7036808968361894, 1, 0.001104284116323464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.8472869845914, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2963784473119156, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7036215526880845, 1, 0.001103928054682596],
[263.0755689580632, 623.8240245195541, 0, 1, 0.2966238465918323, 0, 0.001603016172341491, 0.003455494075093868, 0.7033761534081677, 1, 0.001103954572735611],
[263.0563262105402, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966155294912905, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912904, 0.001103906932670727],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104261640096843],
[263.3831784334145, 623.5164150442029, 0, 1, 0.2969706834577114, 0, 0.001603807014333547, 0.003457198830083267, 0.7030293165422885, 1, 0.001104436130893968],
[262.9776341147061, 624.0318416472284, 1, 0, 0.2964766908367132, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2964766908367132, 0.001103513432480871],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103327848904796],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103959688789373],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104666384106925],
[262.9930607177316, 623.9131438428129, 1, 0, 0.2965286062555428, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2965286062555428, 0.001103513393731142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[263.4025018049782, 623.3513179394989, 0, 1, 0.2970412936939804, 0, 0.001604231789074452, 0.003458114483103973, 0.7029587063060196, 1, 0.001103934112665932],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103730790593287],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103327876691007],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001103513393731142],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103710269170429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001104109177875056],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001104764920479934],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.001104436107917847],
[263.0563262105402, 623.8032615584958, 1, 0, 0.2966155294912905, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966155294912904, 0.001103377601903899],
[262.9930607177316, 623.7607590267455, 0, 1, 0.296579563416501, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7034204365834991, 1, 0.0011047425097253],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.00110424103109902],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 0, 1, 0.2965308166243609, 0, 0.00160280418218486, 0.003455037104825659, 0.703469183375639, 1, 0.001114621403701275],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103977390964655],
[262.8472869845914, 624.052306493026, 0, 1, 0.2963664533365522, 0, 0.001602429779676129, 0.003454230035207187, 0.7036335466634478, 1, 0.0011047425097253],
[262.8831784334145, 624.0164150442029, 0, 1, 0.2964069217831351, 0, 0.001602521946364446, 0.003454428711584191, 0.7035930782168649, 1, 0.001103871236683609],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001104261649784784],
[263.1388344508719, 623.7607590267455, 0, 1, 0.2966951799121697, 0, 0.001603178759690335, 0.003455844551670655, 0.7033048200878302, 1, 0.001103530486301663],
[262.929795224923, 623.9697982526943, 1, 0, 0.2964594833040236, 0.003803296614385415, 0, -0.008198463087017233, 1, 0.2964594833040235, 0.0011047425097253],
[263.0902432064918, 623.8093502711256, 0, 2, 0.2966403921495668, 0, 0.003206107762140375, 0.006911150721583882, 0.4947147379555151, 1, 0.002208899421822272],
[262.9930607177316, 624.0675634897889, 1, 0, 0.2964769865111345, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.2964769865111345, 0.001103954863376945],
[262.9776341147061, 623.9219593629111, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.001104241122460016],
[262.9930607177316, 623.9890410002173, 0, 1, 0.2965032329382455, 0, 0.001602592248089902, 0.003454580255405127, 0.7034967670617545, 1, 0.001106304293996854],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103377571865312],
[262.9776341147061, 623.9219593629113, 1, 0, 0.2965134227692516, 0.003802604747610658, 0, -0.008196971685007586, 1, 0.2965134227692516, 0.00110424103109902],
[263.016537993179, 624.3005472441068, 0, 1, 0.2964177545649797, 0, 0.001601792605203326, 0.003452856529029543, 0.7035822454350202, 1, 0.001104436140849715],
[263.1468851232937, 623.7527083543237, 0, 1, 0.2967042572333017, 0, 0.001603199451651837, 0.003455889155681274, 0.7032957427666983, 1, 0.001104261699983829],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001103513444233523],
[263.3392363121695, 623.5603571654478, 0, 1, 0.2969211376899965, 0, 0.001603693994508814, 0.00345695520226374, 0.7030788623100035, 1, 0.001103906941787454],
[263.0563262105402, 623.8432672670771, 1, 0, 0.2966021499446983, 0.003801467215806998, 0, -0.008194519598450009, 1, 0.2966021499446982, 0.001103377560804521],
[262.9930607177316, 623.9065327598857, 1, 0, 0.2965308166243609, 0.003802381695056555, 0, -0.008196490868411699, 1, 0.296530816624361, 0.001106978111982778]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7098429284750979, 2.2901570715249, 0, 1, 0.2366143094916994, 0, 0.4366512727156091, 0.9412543128289502, 0.7633856905083005, 1, 0.4639036090079087],
[0.8898967887503799, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3079337615843297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 2.197545599874553, 0, 0, 0.2395764414739549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.002183339256825195, 2.997816660743174, 0, 1, 0.0007277797522750651, 0, 0.3335761032671341, 0.7190633933211052, 0.9992722202477249, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.999803653604252, 1, 3, 0.3333551510274695, 0.9999999999999996, 1.500147274255196, 1.078127577676744, 0.5925538055808365, 0.8024949925409972, 0.4639036090079087],
[0.8358991756402964, 2.163753759804661, 1, 3, 0.2786652968291821, 1.196316528526306, 1.38647939323319, 0.4099189163748078, 0.6890998956476526, 0.7292631910248751, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -4.31124044125706, 1, 0.1111111111111109, 0.4639036090079087],
[1, 1.999605951907116, 1, 0, 0.3333771222064056, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333771222064057, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 2.197545599874553, 0, 0, 0.2395764414739549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997385321202007, 2.000261467879801, 1, 2, 0.3332461773734001, 1.000261536263132, 0.9998692831492285, -0.0008455487439338287, 0.740856941089833, 0.7035874805641413, 0.4639036090079087],
[0.6616081731745249, 2.016330367019331, 3, 0, 0.2470587592822915, 4.534405894058738, 0, -9.774457033770208, 1, 0.01507998009377887, 0.4639036090079087],
[0.9895895750598768, 2.010410424940124, 0, 12, 0.3298631916866255, 0, 5.968930448795001, 12.86674717094784, 0.008202791538292445, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.002118572807608638, 2.99788142719239, 0, 2, 0.0007061909358695463, 0, 0.667137793329292, 1.43809571724612, 0.9985881168338988, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.000477105677549, 1.999175844273773, 0, 1, 0.3335309525369542, 0, 0.5002061238706408, 1.078254435097773, 0.6664690474630458, 1, 0.4639036090079087],
[0.9992150122608999, 2.000784987739102, 1, 1, 0.3330716707536331, 1.000785604428944, 0.4998038300607232, -1.079926442994498, 0.8890632621413832, 0.5552066036486498, 0.4639036090079087],
[0.7086030805460063, 2.219518824059507, 1, 0, 0.2419991734058189, 1.411227282880934, 0, -3.042070066880801, 1, 0.2419991734058189, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997383257465701, 2.000261674253431, 1, 1, 0.3332461085821899, 1.000261742744767, 0.4999345899946993, -1.078515327397546, 0.8889470311148275, 0.555439248279207, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.8345316103075177, 2.165468389692482, 3, 0, 0.2781772034358392, 3.59483087632178, 0, -7.749090126739011, 1, 0.02152606316505246, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0, 1.677004034350293, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.708799299201659, 2.290853650733004, 0, 2, 0.2362937683231314, 0, 0.8730370005783915, 1.881936211803663, 0.5832472083020829, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.16516714144256, 1, 0, 0.2782776195191468, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2782776195191468, 0.4639036090079087],
[1.000477033451214, 1.999175969038057, 1, 1, 0.3335309226170377, 0.9995231940011975, 0.5002060926538496, -1.076338040169968, 0.8887571236582277, 0.555818968892303, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.8348328555065193, 2.000015726151761, 1, 1, 0.294489399154495, 1.197844566614797, 0.4999960684929735, -1.504296333486654, 0.9132759937856245, 0.5022547920946145, 0.4639036090079087],
[0.7086030083536777, 2.219518941902397, 1, 0, 0.2419991449781345, 1.411227426656479, 0, -3.042070376806273, 1, 0.2419991449781345, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8898967887503799, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3079337615843297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.70929735105196, 2.290702648948038, 1, 1, 0.2364324503506535, 1.409845953205519, 0.4365472753345926, -2.098062310729583, 0.9440996964211859, 0.4169645971224927, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.9865633699373051, 2.013436630062693, 1, 2, 0.3288544566457686, 1.013619632019734, 0.9933265195129212, -0.04374424365917581, 0.7466923362922323, 0.6976916575997461, 0.4639036090079087],
[0.8348328555011427, 2.013468101428939, 1, 0, 0.2930985412443674, 1.197844566622511, 0, -2.582097968981505, 1, 0.2930985412443674, 0.4639036090079087],
[0.9999527563041316, 2.000047243695871, 1, 3, 0.3333175854347103, 1.000047245927941, 1.499964568065065, 1.077631888241252, 0.5926205888567957, 0.8024504709649894, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.985587351318034, 0, 0, 0.2585388643107938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345123731950229, 2.165104143657969, 2, 1, 0.2782063535476663, 2.396609162717119, 0.4618715468857254, -4.170559526296787, 0.9784671689952694, 0.1891306634534065, 0.4639036090079087],
[0.001294662695905977, 2.998705337304093, 0, 2, 0.0004315542319686594, 0, 0.6669544937009541, 1.437700592860841, 0.999137077775118, 1, 0.4639036090079087],
[0.9961808132164048, 2.003819186783597, 0, 5, 0.3320602710721348, 0, 2.495235115512434, 5.378779270220972, 0.132949399457309, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328555077363, 2.165167144492264, 1, 0, 0.2782776185025788, 1.197844566613051, 0, -2.582097968961111, 1, 0.2782776185025788, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083536777, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2616119845426795, 1.411227426656479, 0, -3.042070376806273, 1, 0.2616119845426794, 0.4639036090079087],
[0.6923144685548152, 1.985624071639045, 1, 0, 0.2585251521510638, 1.444430306486977, 0, -3.113643175951993, 1, 0.2585251521510638, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -4.31124044125706, 1, 0.1111111111111109, 0.4639036090079087],
[0.7803954019781441, 2.219604598021858, 1, 1, 0.2601318006593812, 1.281401706705604, 0.4505306940214549, -1.791042355676058, 0.9323314462857082, 0.4525950476044702, 0.4639036090079087],
[0.9989591049941396, 2.000784612690603, 0, 1, 0.3330148169341461, 0, 0.4998039237493064, 1.077387444383485, 0.666985183065854, 1, 0.4639036090079087],
[0.6617330941202385, 2.22829473530449, 0, 1, 0.2289711840774762, 0, 0.4487736672156849, 0.9673855915357497, 0.7710288159225238, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7089152728297287, 2.291084727170269, 0, 2, 0.236305090943243, 0, 0.8729489469689802, 1.881746401662717, 0.5832299141192083, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291200319940817, 0, 1, 0.23617817403606, 0, 0.4364524530207078, 0.9408257330743617, 0.76382182596394, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345314995891019, 2.165468500410898, 1, 0, 0.2781771665297006, 1.198277117750941, 0, -2.583030384940405, 1, 0.2781771665297006, 0.4639036090079087],
[1.36916308760082, 1.559139463133472, 0, 1, 0.4675620308623825, 0, 0.6413794427281416, 1.382570495840241, 0.5324379691376175, 1, 0.4639036090079087],
[1.000477105673601, 1.999175844280594, 1, 1, 0.3335309525353185, 0.9995231218476714, 0.5002061238689341, -1.076337817346501, 0.8887571037008831, 0.5558190087715201, 0.4639036090079087],
[0.6621370238729031, 1.504866509142578, 0, 2, 0.3055541967444373, 0, 1.329021536361741, 2.864865697432166, 0.4822549736592637, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 1.499999999999999, 1.077810110314265, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4639036090079087],
[0.9989587334531708, 2.001041266546831, 0, 1, 0.3329862444843901, 0, 0.4997398188222706, 1.077249258506525, 0.6670137555156099, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9998035144397958, 2.000196485560205, 1, 1, 0.3332678381465985, 1.000196524174367, 0.4999508834352965, -1.078339618458415, 0.8889325480570924, 0.5554682243502898, 0.4639036090079087],
[0.8590803169332999, 2.140788592731787, 1, 0, 0.2863726192052871, 1.164035515991971, 0, -2.509218495802059, 1, 0.2863726192052871, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.7796715824828822, 2.22032841751712, 1, 0, 0.2598905274942939, 1.282591314685956, 0, -2.764779772739579, 1, 0.259890527494294, 0.4639036090079087],
[1, 1.679088481330862, 1, 0, 0.3732612815770986, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3732612815770986, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.290852517550065, 0, 1, 0.2362055614915436, 0, 0.4365187162154998, 0.9409685713569388, 0.7637944385084564, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996528536603854, 2.000347146339616, 0, 1, 0.333217617886795, 0, 0.4999132284763045, 1.077623063863213, 0.666782382113205, 1, 0.4639036090079087],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6936769132710857, 1.474925480684059, 1, 2, 0.3198727969703761, 1.441593313642838, 1.35600071067483, -0.1845051456940678, 0.7585020587963011, 0.6853915109468015, 0.4639036090079087],
[0.7083966691143883, 2.291472334585825, 0, 2, 0.2361425343042015, 0, 0.8728012857992861, 1.881428100259523, 0.5834782278992081, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9988087942959366, 2.00080713368997, 1, 2, 0.3329788940568092, 1.001192626367395, 0.9995965959555126, -0.003440435428591997, 0.7412132007265178, 0.7032308667027429, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6619568662454629, 2.228595960897, 0, 2, 0.2290070120945892, 0, 0.897426018485203, 1.934509671964857, 0.594430187399313, 1, 0.4639036090079087],
[0.998958350935803, 2.001041649064199, 1, 1, 0.3329861169786008, 1.001042735228372, 0.4997397232924448, -1.080618909191071, 0.8891202458995136, 0.5550924798567152, 0.4639036090079087],
[0.6650493191196803, 2.225399749393305, 0, 7, 0.2300851194246507, 0, 3.145502286458135, 6.780508332722434, 0.1603610882935668, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7097751237425788, 2.289841677171102, 1, 3, 0.2366219323502862, 1.408896940099974, 1.310134246358131, -0.2128948596736608, 0.7606433272403795, 0.6604070130410716, 0.4639036090079087],
[0.9975261547464932, 2.002473845253508, 1, 1, 0.3325087182488309, 1.002479980341102, 0.4993823027303522, -1.084487526808987, 0.8894379522885196, 0.5544553887861814, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.7086030805513438, 2.291396919448654, 1, 0, 0.2362010268504481, 1.411227282870304, 0, -3.042070066857887, 1, 0.2362010268504481, 0.4639036090079087],
[0.9996529354966243, 2.000347064503377, 0, 2, 0.3332176451655412, 0, 0.9998264978565289, 2.155246215899743, 0.4445987087185861, 1, 0.4639036090079087],
[0.6614979828248543, 2.228398805925522, 0, 0, 0.2289002103465755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6616656766493718, 2.228624335510329, 0, 1, 0.2289270882387881, 0, 0.4487072962752206, 0.9672425209944226, 0.7710729117612118, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.000261560356962, 0, 1, 0.2615457036491318, 0, 0.4999346184613687, 1.077669172547536, 0.7384542963508682, 1, 0.4639036090079087],
[0.6615347170590451, 2.228362071691332, 1, 0, 0.2289129216082142, 1.511636463231521, 0, -3.258514126381264, 1, 0.2289129216082142, 0.4639036090079087],
[0.7087997684630726, 2.291200231536926, 0, 1, 0.236266589487691, 0, 0.4364524698608314, 0.9408257693752727, 0.763733410512309, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499418852, 2.000347050058116, 0, 2, 0.3332176499806282, 0, 0.9998265050766536, 2.155246231463589, 0.4445987022973559, 1, 0.4639036090079087],
[0.9998035314404491, 2.000196468559552, 1, 2, 0.3332678438134829, 1.000196507167031, 0.9999017753692497, -0.0006353298229592828, 0.7408280558111027, 0.7036163757658678, 0.4639036090079087],
[0.7802354313656604, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2600784771218866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923144927533431, 1.472701987909804, 1, 0, 0.3197733130148213, 1.44443025599968, 0, -3.113643067120556, 1, 0.3197733130148213, 0.4639036090079087],
[1.003976922377395, 1.995433639376102, 0, 3, 0.3347247406471945, 0, 1.503432607730312, 3.240829729575742, 0.2944449558793231, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.677938540193857, 0, 0, 0.3734215647561537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6615539056878968, 1.504457040221001, 0, 1, 0.3054250057865228, 0, 0.6646916284516189, 1.432822714772816, 0.6945749942134771, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.709492793498547, 2.290507206501451, 0, 1, 0.2364975978328491, 0, 0.4365845246684084, 0.9411104293887168, 0.7635024021671508, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.835180402519857, 0, 1, 0.3527112416237141, 0, 0.5449055573102873, 1.174609437670914, 0.6472887583762859, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[1.400767026472911, 1.307946890375352, 1, 0, 0.5171336174559106, 0.7138945885369461, 0, -1.538885610447526, 1, 0.5171336174559106, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.83453149199462, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2944160240771824, 1.198277128655616, 0, -2.583030408446741, 1, 0.2944160240771824, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499834225, 2.000261601646419, 0, 1, 0.3332271412331779, 0, 0.4999346081417043, 1.077669150302259, 0.6667728587668221, 1, 0.4639036090079087],
[1.000477238053132, 1.834552533851314, 0, 2, 0.3528983180240313, 0, 1.090184098354141, 2.35002288661987, 0.4187405868161277, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.9997383457640759, 2.000261654235925, 0, 1, 0.3332461152546919, 0, 0.4999345949977667, 1.077669121968921, 0.6667538847453081, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2944910335850492, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2944910335850492, 0.4639036090079087],
[0.6936147564479574, 1.472395382648321, 0, 2, 0.320226920423075, 0, 1.358330801338635, 2.928045341668118, 0.4620914397174964, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8590803169335985, 2.140788592730422, 1, 0, 0.2863726192054885, 1.164035515991567, 0, -2.509218495801187, 1, 0.2863726192054885, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585684953, 2.16498642784169, 1, 1, 0.2782943833818471, 1.197844562221377, 0.461896660015978, -1.586424179323107, 0.9225522361781173, 0.4791410029418118, 0.4639036090079087],
[0.9992147743087655, 2.000785225691236, 0, 1, 0.333071591436255, 0, 0.4998037706193664, 1.07738711429349, 0.666928408563745, 1, 0.4639036090079087],
[0.7804969917323445, 2.219503008267657, 0, 1, 0.2601656639107814, 0, 0.4505513154408875, 0.9712175259951608, 0.7398343360892186, 1, 0.4639036090079087],
[0.6615346908473846, 2.228362097902992, 1, 0, 0.2289129125381116, 1.511636523126342, 0, -3.258514255491751, 1, 0.2289129125381116, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.834983519336855, 0, 0, 0.3527357366204074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8349835193368508, 2.165016480663149, 0, 0, 0.2783278397789503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7093539649588844, 2.290646035041114, 1, 3, 0.2364513216529616, 1.409733432670616, 1.309674194138927, -0.2156897178396017, 0.7609255956700253, 0.6601033227730246, 0.4639036090079087],
[0.9986118125466553, 2.001388187453346, 1, 2, 0.3328706041822183, 1.001390117196596, 0.9993063877052695, -0.004491729425822957, 0.7413574986258027, 0.7030863031666036, 0.4639036090079087],
[1, 1.834999245488615, 1, 0, 0.3527337799441458, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3527337799441458, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.708753832568532, 2.291246167431466, 1, 0, 0.2362512775228441, 1.410927114673918, 0, -3.041423018224168, 1, 0.2362512775228441, 0.4639036090079087],
[0.9991291569351003, 2.000870843064901, 0, 2, 0.3330430523116999, 0, 0.9995647679769437, 2.154682025678966, 0.4448315700696939, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499418855, 2.000261601677729, 0, 2, 0.3332271412204678, 0, 0.9998692162677576, 2.15533830057078, 0.4445860452050299, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8337783269526072, 2.166221673047393, 2, 1, 0.2779261089842024, 2.39871910236602, 0.4616332725511061, -4.175621383842025, 0.9785321752266561, 0.1887931166186092, 0.4639036090079087],
[0.308472836687721, 2.691527163312276, 0, 1, 0.1028242788959071, 0, 0.3715362837985886, 0.8008911260534181, 0.8971757211040929, 1, 0.4639036090079087],
[0.708743673055716, 2.29087321108369, 0, 3, 0.2362780649766396, 0, 1.309544319382415, 2.822880214669962, 0.4454570049524268, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030805472495, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2616120042232553, 1.411227282878458, 0, -3.042070066875464, 1, 0.2616120042232553, 0.4639036090079087],
[0.8348328555007444, 2.165167144499256, 1, 0, 0.2782776185002481, 1.197844566623083, 0, -2.582097968982737, 1, 0.278277618500248, 0.4639036090079087],
[0.7086030083577948, 2.219342701828954, 1, 2, 0.242013711488045, 1.411227426648279, 0.9011677188709099, -1.099495019812777, 0.8526378846258476, 0.5645041219547307, 0.4639036090079087],
[0.9999685227755447, 2.000031477224457, 1, 2, 0.3333228409251814, 1.000031478215302, 0.9999842616354716, -0.0001017810142316193, 0.7407547305081839, 0.7036897136059854, 0.4639036090079087],
[0.9996528536603854, 2.000347146339616, 0, 2, 0.333217617886795, 0, 0.999826456952609, 2.155246127726425, 0.4445987450965601, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083536983, 2.2913969916463, 1, 0, 0.2362010027845662, 1.411227426656438, 0, -3.042070376806185, 1, 0.2362010027845662, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.21958855945383, 0, 2, 0.2419544368319465, 0, 0.9010678990398727, 1.942360183329617, 0.5746330758387713, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2944910335850492, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2944910335850492, 0.4639036090079087],
[0.002484041038322391, 2.997515958961677, 0, 3, 0.0008280136794407973, 0, 1.000828699854257, 2.157406582791198, 0.9975180152139461, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.16516714144256, 1, 1, 0.2782776195191468, 1.197844562237239, 0.4618581082538238, -1.586507282315339, 0.9225615664747571, 0.4791168055130505, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.007507825514510185, 2.992492174485489, 0, 2, 0.002502608504836729, 0, 0.6683392581783001, 1.440685619169016, 0.995001046039655, 1, 0.4639036090079087],
[0.6934542169809497, 1.985639025681759, 0, 1, 0.2588391497310248, 0, 0.5036162097270702, 1.085605285123972, 0.7411608502689752, 1, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.999803650528417, 0, 1, 0.3333551513692737, 0, 0.5000490921875083, 1.077915934426333, 0.6666448486307264, 1, 0.4639036090079087],
[0.9992145523780999, 2.000785447621901, 1, 1, 0.3330715174593665, 1.000786065034812, 0.4998037151802471, -1.079927683524498, 0.8890633642573149, 0.5552063991760479, 0.4639036090079087],
[0.9998690031926402, 1.678705167857863, 1, 1, 0.3732840456684102, 1.000131013969772, 0.5956972189917452, -0.8718056663601674, 0.8606590212494243, 0.6072271125862447, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0.4999999999999998, -3.233430330942795, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.834229726928854, 2.165770273071146, 1, 0, 0.2780765756429513, 1.198710580215614, 0, -2.583964765394136, 1, 0.2780765756429513, 0.4639036090079087],
[1.399978172867108, 1.308821997912144, 0, 1, 0.516825932000872, 0, 0.7640458378566511, 1.646992657570865, 0.483174067999128, 1, 0.4639036090079087],
[0.6927173476990954, 1.984604993451181, 0, 2, 0.2587351313855912, 0, 1.007757214458101, 2.172341828970165, 0.5494736054419367, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345315247372301, 2.16546847526277, 1, 1, 0.27817717491241, 1.198277081641549, 0.4617938388037047, -1.587578170415329, 0.9226174593577503, 0.4789718091825705, 0.4639036090079087],
[0.7087994797318465, 2.291200520268152, 0, 1, 0.236266493243949, 0, 0.4364524148602081, 0.9408256508148171, 0.763733506756051, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083521898, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2616119845422739, 1.411227426659442, 0, -3.042070376812661, 1, 0.2616119845422739, 0.4639036090079087],
[1, 1.677938540193857, 0, 0, 0.3734215647561537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 1.499999999999999, 1.077810110314265, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499413503, 2.000347050058651, 0, 1, 0.3332176499804499, 0, 0.4999132525381931, 1.077623115731506, 0.66678235001955, 1, 0.4639036090079087],
[0.8350291184655856, 2.164970881534415, 1, 1, 0.2783430394885285, 1.19756302850559, 0.4618999768215145, -1.585810149779486, 0.9225251523682875, 0.4792112313453444, 0.4639036090079087],
[0.8592301476700935, 2.140376581385319, 2, 1, 0.2864475997294046, 2.327665067878777, 0.4672075039023127, -4.010439944528966, 0.9764963364114718, 0.1991493549951558, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.473528530150295, 0, 1, 0.3196628062001239, 0, 0.6786431206038498, 1.462896833364105, 0.6803371937998761, 1, 0.4639036090079087],
[0.9991761865493504, 2.000823813450651, 1, 2, 0.3330587288497833, 1.000824492678808, 0.9995882628719667, -0.002664841968971633, 0.741106804603104, 0.7033374135563515, 0.4639036090079087],
[0.9988969718948763, 1.999948325636276, 1, 5, 0.3330938654012043, 1.001104246119629, 2.500064594623598, 3.231189237155545, 0.3516391737414754, 0.9120191255785882, 0.4639036090079087],
[0.692314468556548, 1.472702012106599, 1, 0, 0.3197733018385576, 1.444430306483361, 0, -3.1136431759442, 1, 0.3197733018385576, 0.4639036090079087],
[1, 1.999028896240027, 1, 5, 0.3334412686899184, 0.9999999999999996, 2.50121446938786, 3.236048265712603, 0.3509528096753378, 0.9122937525469623, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9988092973438368, 2.001190702656165, 2, 2, 0.3329364324479455, 2.002384244238274, 0.9994050029042288, -2.162042333490331, 0.889241374615349, 0.4067018060835548, 0.4639036090079087],
[0.8348328555129872, 2.165167144487013, 1, 0, 0.2782776185043291, 1.197844566605516, 0, -2.582097968944871, 1, 0.2782776185043291, 0.4639036090079087],
[0.9991756155931616, 2.000824384406839, 0, 1, 0.3330585385310538, 0, 0.4997939888144946, 1.077366028437114, 0.6669414614689462, 1, 0.4639036090079087],
[0.9986904558751771, 2.001309544124824, 0, 1, 0.3328968186250589, 0, 0.4996728281917536, 1.07710485214879, 0.6671031813749411, 1, 0.4639036090079087],
[0.7802354313656604, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2600784771218866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1.401320310631456, 1.307479106877167, 1, 0, 0.5173215490131415, 0.7136127210982797, 0, -1.5382780112972, 1, 0.5173215490131415, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0, 1.677004034350293, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.370503548435476, 1.55779892040079, 1, 0, 0.4680198043134959, 0.7296588185718808, 0, -1.572867303473471, 1, 0.4680198043134959, 0.4639036090079087],
[0.8348329629071828, 2.000196336949074, 1, 1, 0.2944706648885466, 1.19784441251295, 0.4999509205807832, -1.504393323054034, 0.9132870275200971, 0.5022283572971906, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.9996529499315371, 2.000347050068464, 0, 1, 0.3332176499771789, 0, 0.4999132525357406, 1.07762311572622, 0.6667823500228212, 1, 0.4639036090079087],
[0.3092965821678178, 2.69070341783218, 0, 2, 0.103098860722606, 0, 0.743300055571097, 1.602272629783368, 0.8044316536370874, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997377901112202, 1.678705526902035, 0, 2, 0.373253293717648, 0, 1.191394183166179, 2.568193391972226, 0.3928114338357768, 1, 0.4639036090079087],
[0.834079764469844, 2.165723889199689, 2, 2, 0.2780447858477502, 2.397852202146681, 0.9234787545974155, -3.178189216294995, 0.9319486499749183, 0.3098207181525401, 0.4639036090079087],
[0.8580210009338682, 2.14197899906613, 0, 1, 0.2860070003112896, 0, 0.4668579852724908, 1.006368513215278, 0.7139929996887104, 1, 0.4639036090079087],
[0, 1.677004034350293, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083521898, 2.291396991647809, 1, 0, 0.2362010027840634, 1.411227426659442, 0, -3.042070376812661, 1, 0.2362010027840634, 0.4639036090079087],
[0.9994105982164926, 2.000589401783509, 0, 1, 0.333136866072164, 0, 0.4998526929656372, 1.077492572292352, 0.6668631339278359, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030015726729, 2.291396998427325, 1, 0, 0.2362010005242245, 1.411227440161276, 0, -3.042070405917487, 1, 0.2362010005242244, 0.4639036090079087],
[1.151247295765765, 1.016750497632782, 1, 1, 0.5310186658267181, 0.8686231044172299, 0.9835254591251438, 0.247685839206211, 0.7180191765436122, 0.7800565081970485, 0.4639036090079087],
[0.7099240900212217, 2.289729017664038, 1, 2, 0.2366687295282115, 1.408601305486206, 0.8734658051547004, -1.15354890529076, 0.8584763565814786, 0.5552262355706272, 0.4639036090079087],
[0.9999842560128788, 2.000015743987123, 0, 1, 0.333328085337626, 0, 0.4999960640342032, 1.077801625866806, 0.666671914662374, 1, 0.4639036090079087],
[0.9991756156072537, 2.000824384392748, 0, 2, 0.3330585385357511, 0, 0.9995879776360294, 2.154732056889405, 0.4448109130200682, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084333321804356, 2.291435365053259, 0, 1, 0.2361547799854413, 0, 0.4364076836951312, 0.9407292274108849, 0.7638452200145587, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.16516714144256, 1, 0, 0.2782776195191468, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2782776195191468, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291462075229221, 0, 1, 0.2361575664874734, 0, 0.4364025967569056, 0.9407182619039848, 0.7638424335125266, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345316924723861, 2.165468307527614, 1, 0, 0.2781772308241287, 1.19827684079606, 0, -2.583029787930862, 1, 0.2781772308241287, 0.4639036090079087],
[0.9996528536575026, 2.000347146342499, 0, 1, 0.333217617885834, 0, 0.499913228475584, 1.07762306386166, 0.666782382114166, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4639036090079087],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6617888326051063, 2.2283699742976, 0, 2, 0.2289800930746518, 0, 0.8975170295185907, 1.934705857188728, 0.5944716968751725, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.000393100289616, 1, 2, 0.294450202796861, 1.197844562237239, 0.9998034884795596, -0.4269013431070399, 0.7909554423068885, 0.6487769466533584, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030015726611, 2.0002615603525, 1, 1, 0.2615867221759749, 1.4112274401613, 0.499934618462484, -1.964401233367598, 0.9315723867812293, 0.4547458311331791, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.985587351318034, 0, 0, 0.2585388643107938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529354374072, 2.000347064562594, 1, 3, 0.3332176451458022, 1.000347185058223, 1.499739746740396, 1.076500703993572, 0.5927982604753429, 0.8023319881823593, 0.4639036090079087],
[1.833433388195933, 1.165525713978031, 1, 0, 0.6113565826445801, 0.5454247786902054, 0, -1.175728681776448, 1, 0.6113565826445801, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6928980109080092, 1.472118469755137, 0, 1, 0.3200428343602141, 0, 0.6792931550993538, 1.46429806086672, 0.6799571656397858, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345316987034678, 2.165271971610088, 1, 1, 0.2781954389089197, 1.198276831849053, 0.4618357477081292, -1.587487292275773, 0.9226072977702737, 0.4789981755881128, 0.4639036090079087],
[0.7086030624587122, 2.291049784158559, 1, 1, 0.2362283566439392, 1.411227318902911, 0.4364811305779954, -2.101182593533773, 0.9441961635173037, 0.4166528768051824, 0.4639036090079087],
[0.9996529499503813, 2.00034705004962, 0, 1, 0.3332176499834603, 0, 0.49991325254045, 1.077623115736372, 0.6667823500165397, 1, 0.4639036090079087],
[0.8331334915332266, 2.162635251784498, 1, 5, 0.2781034061429441, 1.200287841219403, 2.311994126551969, 2.396416548062712, 0.468669622985051, 0.8584695276669817, 0.4639036090079087],
[0.3090360775734645, 2.690963922426533, 1, 1, 0.1030120258578216, 3.23586814799084, 0.3716140493991708, -6.174244051942349, 0.9893885225286676, 0.1954125742443106, 0.4639036090079087],
[1.834466898375298, 1.165186195726504, 1, 0, 0.6115596840122606, 0.5451174948349591, 0, -1.175066294484607, 1, 0.6115596840122606, 0.4639036090079087],
[0.9998689098405521, 1.678321990300707, 0, 1, 0.3733374307962194, 0, 0.5958332225753823, 1.284390142705754, 0.6266625692037806, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9989588406386084, 2.001041159361393, 0, 1, 0.3329862802128693, 0, 0.4997398455907511, 1.077249316209203, 0.6670137197871306, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997383204382376, 2.000261679561764, 1, 1, 0.3332461068127457, 1.000261748055879, 0.4999345886679634, -1.078515341706225, 0.8889470322941482, 0.5554392459196394, 0.4639036090079087],
[1, 1.678321746217647, 1, 0, 0.3733681367491454, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3733681367491455, 0.4639036090079087],
[0.7804259279806817, 2.21957407201932, 2, 1, 0.2601419759935604, 2.562703170530115, 0.4505368902107519, -4.553028343186169, 0.9823951915430418, 0.1678119261075854, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4639036090079087],
[0.9997383454050871, 2.000261654594914, 1, 2, 0.3332461151350289, 1.000261723075958, 0.9998691898160856, -0.0008461526322507218, 0.7408570240634722, 0.7035873975579394, 0.4639036090079087],
[1.400767001591465, 1.307947092485064, 1, 0, 0.5171335744347071, 0.7138946012176628, 0, -1.538885637782335, 1, 0.5171335744347071, 0.4639036090079087],
[0.7091464742336572, 2.290853525766341, 0, 2, 0.2363821580778859, 0, 0.8730370482027898, 1.881936314463779, 0.5831122085017869, 1, 0.4639036090079087],
[0.002118955087813604, 2.997881044912185, 0, 2, 0.0007063183626045349, 0, 0.6671378784005703, 1.438095900627487, 0.9985878621604204, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030805472497, 2.219518824057478, 1, 0, 0.2419991734063085, 1.411227282878458, 0, -3.042070066875463, 1, 0.2419991734063085, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.834983519336855, 0, 0, 0.3527357366204074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923144927532467, 2.197582295997132, 1, 0, 0.2395637434001962, 1.444430255999881, 0, -3.113643067120989, 1, 0.2395637434001961, 0.4639036090079087],
[0.6923144685578533, 1.985624071636006, 1, 0, 0.2585251521521983, 1.444430306480638, 0, -3.113643175938329, 1, 0.2585251521521983, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.828464884891086, 1.171449671391789, 5, 0, 0.6095056544399367, 2.734534330582908, 0, -5.894617497007421, 1, 0.08411795284004198, 0.4639036090079087],
[0.6927171052484901, 1.473292501763866, 0, 1, 0.3198125728555637, 0, 0.6787518424228539, 1.463131196315574, 0.6801874271444364, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 2, 0.2361508445731888, 0, 0.8727726697480709, 1.881366414920889, 0.5834655322462527, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.005123766785835462, 2.994876233214164, 0, 3, 0.001707922261945155, 0, 1.001710844250928, 2.159308151090178, 0.9948849792275165, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084900900961241, 2.291245035160064, 1, 1, 0.2361842164433156, 1.411452346304979, 0.4364439353515679, -2.101747845934065, 0.944217015903057, 0.4165854487896884, 0.4639036090079087],
[0.9998689098438786, 1.678705295659887, 1, 1, 0.3732840060168618, 1.000131107343003, 0.595697173640539, -0.8718059653973712, 0.8606590508520034, 0.6072270628857271, 0.4639036090079087],
[0.9986113934423756, 2.001132117674508, 0, 2, 0.3328989261053744, 0, 0.999434261404078, 2.154400703071571, 0.4450238427913627, 1, 0.4639036090079087],
[0.9999842563321281, 2.000015743667873, 0, 1, 0.3333280854440425, 0, 0.4999960641140143, 1.077801626038849, 0.6666719145559574, 1, 0.4639036090079087],
[0.309754736666376, 2.690245263333622, 0, 2, 0.1032515788887921, 0, 0.7434266411537871, 1.602545500225054, 0.8041577307654443, 1, 0.4639036090079087],
[1.370063876787055, 1.558143485196712, 1, 1, 0.4678848549369402, 0.7298929757531497, 0.6417894176631316, -0.1899178113281635, 0.7810837625206385, 0.7168534723945188, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7085379821041679, 2.29146201789583, 0, 1, 0.2361793273680561, 0, 0.4364026076758912, 0.940718285441171, 0.7638206726319439, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1.400767001591465, 1.307947092485064, 1, 0, 0.5171335744347071, 0.7138946012176628, 0, -1.538885637782335, 1, 0.5171335744347071, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6925209004852807, 1.985800845735645, 0, 1, 0.258565238273713, 0, 0.5035751707667077, 1.08551682071118, 0.7414347617262871, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030805460294, 2.291396919453969, 1, 0, 0.2362010268486766, 1.411227282880888, 0, -3.042070066880702, 1, 0.2362010268486766, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.985587351318034, 0, 0, 0.2585388643107938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8896031024708883, 2.001341739516442, 4, 0, 0.307720538126679, 4.496387196593548, 0, -9.692503160752286, 0.9999999999999999, 0.008966561528525596, 0.4639036090079087],
[0.692898000712698, 1.472118479950449, 0, 1, 0.3200428296510993, 0, 0.6792931503948376, 1.46429805072557, 0.6799571703489007, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585532511, 2.013649117633724, 1, 1, 0.2930799160859611, 1.19784456224325, 0.4966108500447777, -1.511593569401434, 0.9141041627870461, 0.5002639949589681, 0.4639036090079087],
[1.001432024178508, 1.83329565774641, 0, 2, 0.3532727431153059, 0, 1.09093150990087, 2.351634022063131, 0.4182561447976011, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996531290674101, 2.000261466655311, 1, 1, 0.3332271960317523, 1.000346991293783, 0.4999346418806567, -1.078698979047166, 0.8889596358248162, 0.5554140278883207, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.9997383257465701, 2.000261674253431, 0, 1, 0.3332461085821899, 0, 0.4999345899946993, 1.077669111184208, 0.6667538914178102, 1, 0.4639036090079087],
[0.8346822471458338, 2.165317752854166, 2, 0, 0.2782274157152779, 2.396121406486035, 0, -5.165127754902174, 1, 0.07741049485560214, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087]
],
"RESOLVED": [
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7098429284750979, 2.2901570715249, 0, 1, 0.2366143094916994, 0, 0.4366512727156091, 0.9412543128289502, 0.7633856905083005, 1, 0.4639036090079087],
[0.8898967887503799, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3079337615843297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 2.197545599874553, 0, 0, 0.2395764414739549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.002183339256825195, 2.997816660743174, 0, 1, 0.0007277797522750651, 0, 0.3335761032671341, 0.7190633933211052, 0.9992722202477249, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.999803653604252, 1, 3, 0.3333551510274695, 0.9999999999999996, 1.500147274255196, 1.078127577676744, 0.5925538055808365, 0.8024949925409972, 0.4639036090079087],
[0.8358991756402964, 2.163753759804661, 1, 3, 0.2786652968291821, 1.196316528526306, 1.38647939323319, 0.4099189163748078, 0.6890998956476526, 0.7292631910248751, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -4.31124044125706, 1, 0.1111111111111109, 0.4639036090079087],
[1, 1.999605951907116, 1, 0, 0.3333771222064056, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333771222064057, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 2.197545599874553, 0, 0, 0.2395764414739549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997385321202007, 2.000261467879801, 1, 2, 0.3332461773734001, 1.000261536263132, 0.9998692831492285, -0.0008455487439338287, 0.740856941089833, 0.7035874805641413, 0.4639036090079087],
[0.6616081731745249, 2.016330367019331, 3, 0, 0.2470587592822915, 4.534405894058738, 0, -9.774457033770208, 1, 0.01507998009377887, 0.4639036090079087],
[0.9895895750598768, 2.010410424940124, 0, 12, 0.3298631916866255, 0, 5.968930448795001, 12.86674717094784, 0.008202791538292445, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.002118572807608638, 2.99788142719239, 0, 2, 0.0007061909358695463, 0, 0.667137793329292, 1.43809571724612, 0.9985881168338988, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.000477105677549, 1.999175844273773, 0, 1, 0.3335309525369542, 0, 0.5002061238706408, 1.078254435097773, 0.6664690474630458, 1, 0.4639036090079087],
[0.9992150122608999, 2.000784987739102, 1, 1, 0.3330716707536331, 1.000785604428944, 0.4998038300607232, -1.079926442994498, 0.8890632621413832, 0.5552066036486498, 0.4639036090079087],
[0.7086030805460063, 2.219518824059507, 1, 0, 0.2419991734058189, 1.411227282880934, 0, -3.042070066880801, 1, 0.2419991734058189, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997383257465701, 2.000261674253431, 1, 1, 0.3332461085821899, 1.000261742744767, 0.4999345899946993, -1.078515327397546, 0.8889470311148275, 0.555439248279207, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.8345316103075177, 2.165468389692482, 3, 0, 0.2781772034358392, 3.59483087632178, 0, -7.749090126739011, 1, 0.02152606316505246, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0, 1.677004034350293, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.708799299201659, 2.290853650733004, 0, 2, 0.2362937683231314, 0, 0.8730370005783915, 1.881936211803663, 0.5832472083020829, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.16516714144256, 1, 0, 0.2782776195191468, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2782776195191468, 0.4639036090079087],
[1.000477033451214, 1.999175969038057, 1, 1, 0.3335309226170377, 0.9995231940011975, 0.5002060926538496, -1.076338040169968, 0.8887571236582277, 0.555818968892303, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.8348328555065193, 2.000015726151761, 1, 1, 0.294489399154495, 1.197844566614797, 0.4999960684929735, -1.504296333486654, 0.9132759937856245, 0.5022547920946145, 0.4639036090079087],
[0.7086030083536777, 2.219518941902397, 1, 0, 0.2419991449781345, 1.411227426656479, 0, -3.042070376806273, 1, 0.2419991449781345, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8898967887503799, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3079337615843297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.70929735105196, 2.290702648948038, 1, 1, 0.2364324503506535, 1.409845953205519, 0.4365472753345926, -2.098062310729583, 0.9440996964211859, 0.4169645971224927, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.9865633699373051, 2.013436630062693, 1, 2, 0.3288544566457686, 1.013619632019734, 0.9933265195129212, -0.04374424365917581, 0.7466923362922323, 0.6976916575997461, 0.4639036090079087],
[0.8348328555011427, 2.013468101428939, 1, 0, 0.2930985412443674, 1.197844566622511, 0, -2.582097968981505, 1, 0.2930985412443674, 0.4639036090079087],
[0.9999527563041316, 2.000047243695871, 1, 3, 0.3333175854347103, 1.000047245927941, 1.499964568065065, 1.077631888241252, 0.5926205888567957, 0.8024504709649894, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.985587351318034, 0, 0, 0.2585388643107938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345123731950229, 2.165104143657969, 2, 1, 0.2782063535476663, 2.396609162717119, 0.4618715468857254, -4.170559526296787, 0.9784671689952694, 0.1891306634534065, 0.4639036090079087],
[0.001294662695905977, 2.998705337304093, 0, 2, 0.0004315542319686594, 0, 0.6669544937009541, 1.437700592860841, 0.999137077775118, 1, 0.4639036090079087],
[0.9961808132164048, 2.003819186783597, 0, 5, 0.3320602710721348, 0, 2.495235115512434, 5.378779270220972, 0.132949399457309, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328555077363, 2.165167144492264, 1, 0, 0.2782776185025788, 1.197844566613051, 0, -2.582097968961111, 1, 0.2782776185025788, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083536777, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2616119845426795, 1.411227426656479, 0, -3.042070376806273, 1, 0.2616119845426794, 0.4639036090079087],
[0.6923144685548152, 1.985624071639045, 1, 0, 0.2585251521510638, 1.444430306486977, 0, -3.113643175951993, 1, 0.2585251521510638, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -4.31124044125706, 1, 0.1111111111111109, 0.4639036090079087],
[0.7803954019781441, 2.219604598021858, 1, 1, 0.2601318006593812, 1.281401706705604, 0.4505306940214549, -1.791042355676058, 0.9323314462857082, 0.4525950476044702, 0.4639036090079087],
[0.9989591049941396, 2.000784612690603, 0, 1, 0.3330148169341461, 0, 0.4998039237493064, 1.077387444383485, 0.666985183065854, 1, 0.4639036090079087],
[0.6617330941202385, 2.22829473530449, 0, 1, 0.2289711840774762, 0, 0.4487736672156849, 0.9673855915357497, 0.7710288159225238, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7089152728297287, 2.291084727170269, 0, 2, 0.236305090943243, 0, 0.8729489469689802, 1.881746401662717, 0.5832299141192083, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291200319940817, 0, 1, 0.23617817403606, 0, 0.4364524530207078, 0.9408257330743617, 0.76382182596394, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345314995891019, 2.165468500410898, 1, 0, 0.2781771665297006, 1.198277117750941, 0, -2.583030384940405, 1, 0.2781771665297006, 0.4639036090079087],
[1.36916308760082, 1.559139463133472, 0, 1, 0.4675620308623825, 0, 0.6413794427281416, 1.382570495840241, 0.5324379691376175, 1, 0.4639036090079087],
[1.000477105673601, 1.999175844280594, 1, 1, 0.3335309525353185, 0.9995231218476714, 0.5002061238689341, -1.076337817346501, 0.8887571037008831, 0.5558190087715201, 0.4639036090079087],
[0.6621370238729031, 1.504866509142578, 0, 2, 0.3055541967444373, 0, 1.329021536361741, 2.864865697432166, 0.4822549736592637, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 1.499999999999999, 1.077810110314265, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4639036090079087],
[0.9989587334531708, 2.001041266546831, 0, 1, 0.3329862444843901, 0, 0.4997398188222706, 1.077249258506525, 0.6670137555156099, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9998035144397958, 2.000196485560205, 1, 1, 0.3332678381465985, 1.000196524174367, 0.4999508834352965, -1.078339618458415, 0.8889325480570924, 0.5554682243502898, 0.4639036090079087],
[0.8590803169332999, 2.140788592731787, 1, 0, 0.2863726192052871, 1.164035515991971, 0, -2.509218495802059, 1, 0.2863726192052871, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.7796715824828822, 2.22032841751712, 1, 0, 0.2598905274942939, 1.282591314685956, 0, -2.764779772739579, 1, 0.259890527494294, 0.4639036090079087],
[1, 1.679088481330862, 1, 0, 0.3732612815770986, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3732612815770986, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.290852517550065, 0, 1, 0.2362055614915436, 0, 0.4365187162154998, 0.9409685713569388, 0.7637944385084564, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996528536603854, 2.000347146339616, 0, 1, 0.333217617886795, 0, 0.4999132284763045, 1.077623063863213, 0.666782382113205, 1, 0.4639036090079087],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6936769132710857, 1.474925480684059, 1, 2, 0.3198727969703761, 1.441593313642838, 1.35600071067483, -0.1845051456940678, 0.7585020587963011, 0.6853915109468015, 0.4639036090079087],
[0.7083966691143883, 2.291472334585825, 0, 2, 0.2361425343042015, 0, 0.8728012857992861, 1.881428100259523, 0.5834782278992081, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9988087942959366, 2.00080713368997, 1, 2, 0.3329788940568092, 1.001192626367395, 0.9995965959555126, -0.003440435428591997, 0.7412132007265178, 0.7032308667027429, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6619568662454629, 2.228595960897, 0, 2, 0.2290070120945892, 0, 0.897426018485203, 1.934509671964857, 0.594430187399313, 1, 0.4639036090079087],
[0.998958350935803, 2.001041649064199, 1, 1, 0.3329861169786008, 1.001042735228372, 0.4997397232924448, -1.080618909191071, 0.8891202458995136, 0.5550924798567152, 0.4639036090079087],
[0.6650493191196803, 2.225399749393305, 0, 7, 0.2300851194246507, 0, 3.145502286458135, 6.780508332722434, 0.1603610882935668, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7097751237425788, 2.289841677171102, 1, 3, 0.2366219323502862, 1.408896940099974, 1.310134246358131, -0.2128948596736608, 0.7606433272403795, 0.6604070130410716, 0.4639036090079087],
[0.9975261547464932, 2.002473845253508, 1, 1, 0.3325087182488309, 1.002479980341102, 0.4993823027303522, -1.084487526808987, 0.8894379522885196, 0.5544553887861814, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.7086030805513438, 2.291396919448654, 1, 0, 0.2362010268504481, 1.411227282870304, 0, -3.042070066857887, 1, 0.2362010268504481, 0.4639036090079087],
[0.9996529354966243, 2.000347064503377, 0, 2, 0.3332176451655412, 0, 0.9998264978565289, 2.155246215899743, 0.4445987087185861, 1, 0.4639036090079087],
[0.6614979828248543, 2.228398805925522, 0, 0, 0.2289002103465755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6616656766493718, 2.228624335510329, 0, 1, 0.2289270882387881, 0, 0.4487072962752206, 0.9672425209944226, 0.7710729117612118, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.000261560356962, 0, 1, 0.2615457036491318, 0, 0.4999346184613687, 1.077669172547536, 0.7384542963508682, 1, 0.4639036090079087],
[0.6615347170590451, 2.228362071691332, 1, 0, 0.2289129216082142, 1.511636463231521, 0, -3.258514126381264, 1, 0.2289129216082142, 0.4639036090079087],
[0.7087997684630726, 2.291200231536926, 0, 1, 0.236266589487691, 0, 0.4364524698608314, 0.9408257693752727, 0.763733410512309, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499418852, 2.000347050058116, 0, 2, 0.3332176499806282, 0, 0.9998265050766536, 2.155246231463589, 0.4445987022973559, 1, 0.4639036090079087],
[0.9998035314404491, 2.000196468559552, 1, 2, 0.3332678438134829, 1.000196507167031, 0.9999017753692497, -0.0006353298229592828, 0.7408280558111027, 0.7036163757658678, 0.4639036090079087],
[0.7802354313656604, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2600784771218866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923144927533431, 1.472701987909804, 1, 0, 0.3197733130148213, 1.44443025599968, 0, -3.113643067120556, 1, 0.3197733130148213, 0.4639036090079087],
[1.003976922377395, 1.995433639376102, 0, 3, 0.3347247406471945, 0, 1.503432607730312, 3.240829729575742, 0.2944449558793231, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.677938540193857, 0, 0, 0.3734215647561537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6615539056878968, 1.504457040221001, 0, 1, 0.3054250057865228, 0, 0.6646916284516189, 1.432822714772816, 0.6945749942134771, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.709492793498547, 2.290507206501451, 0, 1, 0.2364975978328491, 0, 0.4365845246684084, 0.9411104293887168, 0.7635024021671508, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.835180402519857, 0, 1, 0.3527112416237141, 0, 0.5449055573102873, 1.174609437670914, 0.6472887583762859, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[1.400767026472911, 1.307946890375352, 1, 0, 0.5171336174559106, 0.7138945885369461, 0, -1.538885610447526, 1, 0.5171336174559106, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.83453149199462, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2944160240771824, 1.198277128655616, 0, -2.583030408446741, 1, 0.2944160240771824, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499834225, 2.000261601646419, 0, 1, 0.3332271412331779, 0, 0.4999346081417043, 1.077669150302259, 0.6667728587668221, 1, 0.4639036090079087],
[1.000477238053132, 1.834552533851314, 0, 2, 0.3528983180240313, 0, 1.090184098354141, 2.35002288661987, 0.4187405868161277, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.9997383457640759, 2.000261654235925, 0, 1, 0.3332461152546919, 0, 0.4999345949977667, 1.077669121968921, 0.6667538847453081, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2944910335850492, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2944910335850492, 0.4639036090079087],
[0.6936147564479574, 1.472395382648321, 0, 2, 0.320226920423075, 0, 1.358330801338635, 2.928045341668118, 0.4620914397174964, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8590803169335985, 2.140788592730422, 1, 0, 0.2863726192054885, 1.164035515991567, 0, -2.509218495801187, 1, 0.2863726192054885, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585684953, 2.16498642784169, 1, 1, 0.2782943833818471, 1.197844562221377, 0.461896660015978, -1.586424179323107, 0.9225522361781173, 0.4791410029418118, 0.4639036090079087],
[0.9992147743087655, 2.000785225691236, 0, 1, 0.333071591436255, 0, 0.4998037706193664, 1.07738711429349, 0.666928408563745, 1, 0.4639036090079087],
[0.7804969917323445, 2.219503008267657, 0, 1, 0.2601656639107814, 0, 0.4505513154408875, 0.9712175259951608, 0.7398343360892186, 1, 0.4639036090079087],
[0.6615346908473846, 2.228362097902992, 1, 0, 0.2289129125381116, 1.511636523126342, 0, -3.258514255491751, 1, 0.2289129125381116, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.834983519336855, 0, 0, 0.3527357366204074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8349835193368508, 2.165016480663149, 0, 0, 0.2783278397789503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7093539649588844, 2.290646035041114, 1, 3, 0.2364513216529616, 1.409733432670616, 1.309674194138927, -0.2156897178396017, 0.7609255956700253, 0.6601033227730246, 0.4639036090079087],
[0.9986118125466553, 2.001388187453346, 1, 2, 0.3328706041822183, 1.001390117196596, 0.9993063877052695, -0.004491729425822957, 0.7413574986258027, 0.7030863031666036, 0.4639036090079087],
[1, 1.834999245488615, 1, 0, 0.3527337799441458, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3527337799441458, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2419398934423482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.708753832568532, 2.291246167431466, 1, 0, 0.2362512775228441, 1.410927114673918, 0, -3.041423018224168, 1, 0.2362512775228441, 0.4639036090079087],
[0.9991291569351003, 2.000870843064901, 0, 2, 0.3330430523116999, 0, 0.9995647679769437, 2.154682025678966, 0.4448315700696939, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499418855, 2.000261601677729, 0, 2, 0.3332271412204678, 0, 0.9998692162677576, 2.15533830057078, 0.4445860452050299, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8337783269526072, 2.166221673047393, 2, 1, 0.2779261089842024, 2.39871910236602, 0.4616332725511061, -4.175621383842025, 0.9785321752266561, 0.1887931166186092, 0.4639036090079087],
[0.308472836687721, 2.691527163312276, 0, 1, 0.1028242788959071, 0, 0.3715362837985886, 0.8008911260534181, 0.8971757211040929, 1, 0.4639036090079087],
[0.708743673055716, 2.29087321108369, 0, 3, 0.2362780649766396, 0, 1.309544319382415, 2.822880214669962, 0.4454570049524268, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030805472495, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2616120042232553, 1.411227282878458, 0, -3.042070066875464, 1, 0.2616120042232553, 0.4639036090079087],
[0.8348328555007444, 2.165167144499256, 1, 0, 0.2782776185002481, 1.197844566623083, 0, -2.582097968982737, 1, 0.278277618500248, 0.4639036090079087],
[0.7086030083577948, 2.219342701828954, 1, 2, 0.242013711488045, 1.411227426648279, 0.9011677188709099, -1.099495019812777, 0.8526378846258476, 0.5645041219547307, 0.4639036090079087],
[0.9999685227755447, 2.000031477224457, 1, 2, 0.3333228409251814, 1.000031478215302, 0.9999842616354716, -0.0001017810142316193, 0.7407547305081839, 0.7036897136059854, 0.4639036090079087],
[0.9996528536603854, 2.000347146339616, 0, 2, 0.333217617886795, 0, 0.999826456952609, 2.155246127726425, 0.4445987450965601, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083536983, 2.2913969916463, 1, 0, 0.2362010027845662, 1.411227426656438, 0, -3.042070376806185, 1, 0.2362010027845662, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.21958855945383, 0, 2, 0.2419544368319465, 0, 0.9010678990398727, 1.942360183329617, 0.5746330758387713, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2944910335850492, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2944910335850492, 0.4639036090079087],
[0.002484041038322391, 2.997515958961677, 0, 3, 0.0008280136794407973, 0, 1.000828699854257, 2.157406582791198, 0.9975180152139461, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.16516714144256, 1, 1, 0.2782776195191468, 1.197844562237239, 0.4618581082538238, -1.586507282315339, 0.9225615664747571, 0.4791168055130505, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.007507825514510185, 2.992492174485489, 0, 2, 0.002502608504836729, 0, 0.6683392581783001, 1.440685619169016, 0.995001046039655, 1, 0.4639036090079087],
[0.6934542169809497, 1.985639025681759, 0, 1, 0.2588391497310248, 0, 0.5036162097270702, 1.085605285123972, 0.7411608502689752, 1, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.999803650528417, 0, 1, 0.3333551513692737, 0, 0.5000490921875083, 1.077915934426333, 0.6666448486307264, 1, 0.4639036090079087],
[0.9992145523780999, 2.000785447621901, 1, 1, 0.3330715174593665, 1.000786065034812, 0.4998037151802471, -1.079927683524498, 0.8890633642573149, 0.5552063991760479, 0.4639036090079087],
[0.9998690031926402, 1.678705167857863, 1, 1, 0.3732840456684102, 1.000131013969772, 0.5956972189917452, -0.8718056663601674, 0.8606590212494243, 0.6072271125862447, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0.4999999999999998, -3.233430330942795, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.834229726928854, 2.165770273071146, 1, 0, 0.2780765756429513, 1.198710580215614, 0, -2.583964765394136, 1, 0.2780765756429513, 0.4639036090079087],
[1.399978172867108, 1.308821997912144, 0, 1, 0.516825932000872, 0, 0.7640458378566511, 1.646992657570865, 0.483174067999128, 1, 0.4639036090079087],
[0.6927173476990954, 1.984604993451181, 0, 2, 0.2587351313855912, 0, 1.007757214458101, 2.172341828970165, 0.5494736054419367, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345315247372301, 2.16546847526277, 1, 1, 0.27817717491241, 1.198277081641549, 0.4617938388037047, -1.587578170415329, 0.9226174593577503, 0.4789718091825705, 0.4639036090079087],
[0.7087994797318465, 2.291200520268152, 0, 1, 0.236266493243949, 0, 0.4364524148602081, 0.9408256508148171, 0.763733506756051, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083521898, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2616119845422739, 1.411227426659442, 0, -3.042070376812661, 1, 0.2616119845422739, 0.4639036090079087],
[1, 1.677938540193857, 0, 0, 0.3734215647561537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 1.499999999999999, 1.077810110314265, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529499413503, 2.000347050058651, 0, 1, 0.3332176499804499, 0, 0.4999132525381931, 1.077623115731506, 0.66678235001955, 1, 0.4639036090079087],
[0.8350291184655856, 2.164970881534415, 1, 1, 0.2783430394885285, 1.19756302850559, 0.4618999768215145, -1.585810149779486, 0.9225251523682875, 0.4792112313453444, 0.4639036090079087],
[0.8592301476700935, 2.140376581385319, 2, 1, 0.2864475997294046, 2.327665067878777, 0.4672075039023127, -4.010439944528966, 0.9764963364114718, 0.1991493549951558, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.473528530150295, 0, 1, 0.3196628062001239, 0, 0.6786431206038498, 1.462896833364105, 0.6803371937998761, 1, 0.4639036090079087],
[0.9991761865493504, 2.000823813450651, 1, 2, 0.3330587288497833, 1.000824492678808, 0.9995882628719667, -0.002664841968971633, 0.741106804603104, 0.7033374135563515, 0.4639036090079087],
[0.9988969718948763, 1.999948325636276, 1, 5, 0.3330938654012043, 1.001104246119629, 2.500064594623598, 3.231189237155545, 0.3516391737414754, 0.9120191255785882, 0.4639036090079087],
[0.692314468556548, 1.472702012106599, 1, 0, 0.3197733018385576, 1.444430306483361, 0, -3.1136431759442, 1, 0.3197733018385576, 0.4639036090079087],
[1, 1.999028896240027, 1, 5, 0.3334412686899184, 0.9999999999999996, 2.50121446938786, 3.236048265712603, 0.3509528096753378, 0.9122937525469623, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9988092973438368, 2.001190702656165, 2, 2, 0.3329364324479455, 2.002384244238274, 0.9994050029042288, -2.162042333490331, 0.889241374615349, 0.4067018060835548, 0.4639036090079087],
[0.8348328555129872, 2.165167144487013, 1, 0, 0.2782776185043291, 1.197844566605516, 0, -2.582097968944871, 1, 0.2782776185043291, 0.4639036090079087],
[0.9991756155931616, 2.000824384406839, 0, 1, 0.3330585385310538, 0, 0.4997939888144946, 1.077366028437114, 0.6669414614689462, 1, 0.4639036090079087],
[0.9986904558751771, 2.001309544124824, 0, 1, 0.3328968186250589, 0, 0.4996728281917536, 1.07710485214879, 0.6671031813749411, 1, 0.4639036090079087],
[0.7802354313656604, 2.219764568634341, 0, 0, 0.2600784771218866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1.401320310631456, 1.307479106877167, 1, 0, 0.5173215490131415, 0.7136127210982797, 0, -1.5382780112972, 1, 0.5173215490131415, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0, 1.677004034350293, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.370503548435476, 1.55779892040079, 1, 0, 0.4680198043134959, 0.7296588185718808, 0, -1.572867303473471, 1, 0.4680198043134959, 0.4639036090079087],
[0.8348329629071828, 2.000196336949074, 1, 1, 0.2944706648885466, 1.19784441251295, 0.4999509205807832, -1.504393323054034, 0.9132870275200971, 0.5022283572971906, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.9996529499315371, 2.000347050068464, 0, 1, 0.3332176499771789, 0, 0.4999132525357406, 1.07762311572622, 0.6667823500228212, 1, 0.4639036090079087],
[0.3092965821678178, 2.69070341783218, 0, 2, 0.103098860722606, 0, 0.743300055571097, 1.602272629783368, 0.8044316536370874, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997377901112202, 1.678705526902035, 0, 2, 0.373253293717648, 0, 1.191394183166179, 2.568193391972226, 0.3928114338357768, 1, 0.4639036090079087],
[0.834079764469844, 2.165723889199689, 2, 2, 0.2780447858477502, 2.397852202146681, 0.9234787545974155, -3.178189216294995, 0.9319486499749183, 0.3098207181525401, 0.4639036090079087],
[0.8580210009338682, 2.14197899906613, 0, 1, 0.2860070003112896, 0, 0.4668579852724908, 1.006368513215278, 0.7139929996887104, 1, 0.4639036090079087],
[0, 1.677004034350293, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030083521898, 2.291396991647809, 1, 0, 0.2362010027840634, 1.411227426659442, 0, -3.042070376812661, 1, 0.2362010027840634, 0.4639036090079087],
[0.9994105982164926, 2.000589401783509, 0, 1, 0.333136866072164, 0, 0.4998526929656372, 1.077492572292352, 0.6668631339278359, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030015726729, 2.291396998427325, 1, 0, 0.2362010005242245, 1.411227440161276, 0, -3.042070405917487, 1, 0.2362010005242244, 0.4639036090079087],
[1.151247295765765, 1.016750497632782, 1, 1, 0.5310186658267181, 0.8686231044172299, 0.9835254591251438, 0.247685839206211, 0.7180191765436122, 0.7800565081970485, 0.4639036090079087],
[0.7099240900212217, 2.289729017664038, 1, 2, 0.2366687295282115, 1.408601305486206, 0.8734658051547004, -1.15354890529076, 0.8584763565814786, 0.5552262355706272, 0.4639036090079087],
[0.9999842560128788, 2.000015743987123, 0, 1, 0.333328085337626, 0, 0.4999960640342032, 1.077801625866806, 0.666671914662374, 1, 0.4639036090079087],
[0.9991756156072537, 2.000824384392748, 0, 2, 0.3330585385357511, 0, 0.9995879776360294, 2.154732056889405, 0.4448109130200682, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084333321804356, 2.291435365053259, 0, 1, 0.2361547799854413, 0, 0.4364076836951312, 0.9407292274108849, 0.7638452200145587, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.16516714144256, 1, 0, 0.2782776195191468, 1.197844562237239, 0, -2.582097959528523, 1, 0.2782776195191468, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291462075229221, 0, 1, 0.2361575664874734, 0, 0.4364025967569056, 0.9407182619039848, 0.7638424335125266, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345316924723861, 2.165468307527614, 1, 0, 0.2781772308241287, 1.19827684079606, 0, -2.583029787930862, 1, 0.2781772308241287, 0.4639036090079087],
[0.9996528536575026, 2.000347146342499, 0, 1, 0.333217617885834, 0, 0.499913228475584, 1.07762306386166, 0.666782382114166, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4639036090079087],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6617888326051063, 2.2283699742976, 0, 2, 0.2289800930746518, 0, 0.8975170295185907, 1.934705857188728, 0.5944716968751725, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585574404, 2.000393100289616, 1, 2, 0.294450202796861, 1.197844562237239, 0.9998034884795596, -0.4269013431070399, 0.7909554423068885, 0.6487769466533584, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030015726611, 2.0002615603525, 1, 1, 0.2615867221759749, 1.4112274401613, 0.499934618462484, -1.964401233367598, 0.9315723867812293, 0.4547458311331791, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.985587351318034, 0, 0, 0.2585388643107938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996529354374072, 2.000347064562594, 1, 3, 0.3332176451458022, 1.000347185058223, 1.499739746740396, 1.076500703993572, 0.5927982604753429, 0.8023319881823593, 0.4639036090079087],
[1.833433388195933, 1.165525713978031, 1, 0, 0.6113565826445801, 0.5454247786902054, 0, -1.175728681776448, 1, 0.6113565826445801, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6928980109080092, 1.472118469755137, 0, 1, 0.3200428343602141, 0, 0.6792931550993538, 1.46429806086672, 0.6799571656397858, 1, 0.4639036090079087],
[0.8345316987034678, 2.165271971610088, 1, 1, 0.2781954389089197, 1.198276831849053, 0.4618357477081292, -1.587487292275773, 0.9226072977702737, 0.4789981755881128, 0.4639036090079087],
[0.7086030624587122, 2.291049784158559, 1, 1, 0.2362283566439392, 1.411227318902911, 0.4364811305779954, -2.101182593533773, 0.9441961635173037, 0.4166528768051824, 0.4639036090079087],
[0.9996529499503813, 2.00034705004962, 0, 1, 0.3332176499834603, 0, 0.49991325254045, 1.077623115736372, 0.6667823500165397, 1, 0.4639036090079087],
[0.8331334915332266, 2.162635251784498, 1, 5, 0.2781034061429441, 1.200287841219403, 2.311994126551969, 2.396416548062712, 0.468669622985051, 0.8584695276669817, 0.4639036090079087],
[0.3090360775734645, 2.690963922426533, 1, 1, 0.1030120258578216, 3.23586814799084, 0.3716140493991708, -6.174244051942349, 0.9893885225286676, 0.1954125742443106, 0.4639036090079087],
[1.834466898375298, 1.165186195726504, 1, 0, 0.6115596840122606, 0.5451174948349591, 0, -1.175066294484607, 1, 0.6115596840122606, 0.4639036090079087],
[0.9998689098405521, 1.678321990300707, 0, 1, 0.3733374307962194, 0, 0.5958332225753823, 1.284390142705754, 0.6266625692037806, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9989588406386084, 2.001041159361393, 0, 1, 0.3329862802128693, 0, 0.4997398455907511, 1.077249316209203, 0.6670137197871306, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.9997383204382376, 2.000261679561764, 1, 1, 0.3332461068127457, 1.000261748055879, 0.4999345886679634, -1.078515341706225, 0.8889470322941482, 0.5554392459196394, 0.4639036090079087],
[1, 1.678321746217647, 1, 0, 0.3733681367491454, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3733681367491455, 0.4639036090079087],
[0.7804259279806817, 2.21957407201932, 2, 1, 0.2601419759935604, 2.562703170530115, 0.4505368902107519, -4.553028343186169, 0.9823951915430418, 0.1678119261075854, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4639036090079087],
[0.9997383454050871, 2.000261654594914, 1, 2, 0.3332461151350289, 1.000261723075958, 0.9998691898160856, -0.0008461526322507218, 0.7408570240634722, 0.7035873975579394, 0.4639036090079087],
[1.400767001591465, 1.307947092485064, 1, 0, 0.5171335744347071, 0.7138946012176628, 0, -1.538885637782335, 1, 0.5171335744347071, 0.4639036090079087],
[0.7091464742336572, 2.290853525766341, 0, 2, 0.2363821580778859, 0, 0.8730370482027898, 1.881936314463779, 0.5831122085017869, 1, 0.4639036090079087],
[0.002118955087813604, 2.997881044912185, 0, 2, 0.0007063183626045349, 0, 0.6671378784005703, 1.438095900627487, 0.9985878621604204, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030805472497, 2.219518824057478, 1, 0, 0.2419991734063085, 1.411227282878458, 0, -3.042070066875463, 1, 0.2419991734063085, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 1.834983519336855, 0, 0, 0.3527357366204074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6923144927532467, 2.197582295997132, 1, 0, 0.2395637434001962, 1.444430255999881, 0, -3.113643067120989, 1, 0.2395637434001961, 0.4639036090079087],
[0.6923144685578533, 1.985624071636006, 1, 0, 0.2585251521521983, 1.444430306480638, 0, -3.113643175938329, 1, 0.2585251521521983, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1.828464884891086, 1.171449671391789, 5, 0, 0.6095056544399367, 2.734534330582908, 0, -5.894617497007421, 1, 0.08411795284004198, 0.4639036090079087],
[0.6927171052484901, 1.473292501763866, 0, 1, 0.3198125728555637, 0, 0.6787518424228539, 1.463131196315574, 0.6801874271444364, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 2, 0.2361508445731888, 0, 0.8727726697480709, 1.881366414920889, 0.5834655322462527, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.005123766785835462, 2.994876233214164, 0, 3, 0.001707922261945155, 0, 1.001710844250928, 2.159308151090178, 0.9948849792275165, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084900900961241, 2.291245035160064, 1, 1, 0.2361842164433156, 1.411452346304979, 0.4364439353515679, -2.101747845934065, 0.944217015903057, 0.4165854487896884, 0.4639036090079087],
[0.9998689098438786, 1.678705295659887, 1, 1, 0.3732840060168618, 1.000131107343003, 0.595697173640539, -0.8718059653973712, 0.8606590508520034, 0.6072270628857271, 0.4639036090079087],
[0.9986113934423756, 2.001132117674508, 0, 2, 0.3328989261053744, 0, 0.999434261404078, 2.154400703071571, 0.4450238427913627, 1, 0.4639036090079087],
[0.9999842563321281, 2.000015743667873, 0, 1, 0.3333280854440425, 0, 0.4999960641140143, 1.077801626038849, 0.6666719145559574, 1, 0.4639036090079087],
[0.309754736666376, 2.690245263333622, 0, 2, 0.1032515788887921, 0, 0.7434266411537871, 1.602545500225054, 0.8041577307654443, 1, 0.4639036090079087],
[1.370063876787055, 1.558143485196712, 1, 1, 0.4678848549369402, 0.7298929757531497, 0.6417894176631316, -0.1899178113281635, 0.7810837625206385, 0.7168534723945188, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7085379821041679, 2.29146201789583, 0, 1, 0.2361793273680561, 0, 0.4364026076758912, 0.940718285441171, 0.7638206726319439, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1.400767001591465, 1.307947092485064, 1, 0, 0.5171335744347071, 0.7138946012176628, 0, -1.538885637782335, 1, 0.5171335744347071, 0.4639036090079087],
[1.400803722595393, 1.307648811124174, 0, 0, 0.5171970729247537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.6925209004852807, 1.985800845735645, 0, 1, 0.258565238273713, 0, 0.5035751707667077, 1.08551682071118, 0.7414347617262871, 1, 0.4639036090079087],
[0.7086030805460294, 2.291396919453969, 1, 0, 0.2362010268486766, 1.411227282880888, 0, -3.042070066880702, 1, 0.2362010268486766, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.985587351318034, 0, 0, 0.2585388643107938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -2.15562022062853, 1, 0.3333333333333333, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.7084525337195661, 2.291547466280432, 0, 0, 0.2361508445731888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 1.077810110314265, 0.6666666666666667, 1, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087],
[0.8896031024708883, 2.001341739516442, 4, 0, 0.307720538126679, 4.496387196593548, 0, -9.692503160752286, 0.9999999999999999, 0.008966561528525596, 0.4639036090079087],
[0.692898000712698, 1.472118479950449, 0, 1, 0.3200428296510993, 0, 0.6792931503948376, 1.46429805072557, 0.6799571703489007, 1, 0.4639036090079087],
[0.8348328585532511, 2.013649117633724, 1, 1, 0.2930799160859611, 1.19784456224325, 0.4966108500447777, -1.511593569401434, 0.9141041627870461, 0.5002639949589681, 0.4639036090079087],
[1.001432024178508, 1.83329565774641, 0, 2, 0.3532727431153059, 0, 1.09093150990087, 2.351634022063131, 0.4182561447976011, 1, 0.4639036090079087],
[0.9996531290674101, 2.000261466655311, 1, 1, 0.3332271960317523, 1.000346991293783, 0.4999346418806567, -1.078698979047166, 0.8889596358248162, 0.5554140278883207, 0.4639036090079087],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -1.077810110314265, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4639036090079087],
[0.9997383257465701, 2.000261674253431, 0, 1, 0.3332461085821899, 0, 0.4999345899946993, 1.077669111184208, 0.6667538914178102, 1, 0.4639036090079087],
[0.8346822471458338, 2.165317752854166, 2, 0, 0.2782274157152779, 2.396121406486035, 0, -5.165127754902174, 1, 0.07741049485560214, 0.4639036090079087],
[0.6923511888758255, 1.472665291787322, 0, 0, 0.3197902625959492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4639036090079087]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node111":{
"Global MG94xREV":0.001104395058729015,
"Nucleotide GTR":0.001090235461393612,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node129":{
"Global MG94xREV":0.001104376514282503,
"Nucleotide GTR":0.001090217154707939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "I", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ATT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node180":{
"Global MG94xREV":0.00110373080327648,
"Nucleotide GTR":0.001089579722449424,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATC", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node209":{
"Global MG94xREV":0.001104774759853188,
"Nucleotide GTR":0.00109061029431869,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node215":{
"Global MG94xREV":0.00110496048554331,
"Nucleotide GTR":0.001090793638794803,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "I", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ATT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node218":{
"Global MG94xREV":0.001104692022681424,
"Nucleotide GTR":0.001090528617931314,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node219":{
"Global MG94xREV":0.001105679634186184,
"Nucleotide GTR":0.001091503567136366,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node225":{
"Global MG94xREV":0.001104225049814644,
"Nucleotide GTR":0.00109006763218636,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.001104466008533213,
"Nucleotide GTR":0.001090305501540844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node240":{
"Global MG94xREV":0.00110399895637501,
"Nucleotide GTR":0.001089844437521072,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node259":{
"Global MG94xREV":0.001104526502755764,
"Nucleotide GTR":0.001090365220158845,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "I", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node262":{
"Global MG94xREV":0.001104916156731857,
"Nucleotide GTR":0.001090749878328992,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node265":{
"Global MG94xREV":0.001103793176323677,
"Nucleotide GTR":0.001089641295803407,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "L", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "CTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node268":{
"Global MG94xREV":0.001104886192013396,
"Nucleotide GTR":0.001090720297792209,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node271":{
"Global MG94xREV":0.00110418256673705,
"Nucleotide GTR":0.001090025693790008,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACT", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.001104930636688437,
"Nucleotide GTR":0.001090764172636106,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node278":{
"Global MG94xREV":0.001104657087081682,
"Nucleotide GTR":0.001090494130245588,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACT", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.001104475846760152,
"Nucleotide GTR":0.001090315213630554,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node290":{
"Global MG94xREV":0.001104198502428335,
"Nucleotide GTR":0.001090041425167655,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.001103950179592414,
"Nucleotide GTR":0.001089796286112156,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node298":{
"Global MG94xREV":0.001103599694950313,
"Nucleotide GTR":0.001089450295080711,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "G", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GGT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.001103980846561362,
"Nucleotide GTR":0.001089826559895777,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAT", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node305":{
"Global MG94xREV":0.001104603817974755,
"Nucleotide GTR":0.001090441544109033,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "S", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "AGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node308":{
"Global MG94xREV":0.00110406077475552,
"Nucleotide GTR":0.001089905463319825,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGG", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node314":{
"Global MG94xREV":0.001103973305476848,
"Nucleotide GTR":0.001089819115496519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node319":{
"Global MG94xREV":0.001103942052015045,
"Nucleotide GTR":0.00108978826273955,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.001104939390896743,
"Nucleotide GTR":0.00109077281460553,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.001104676430615174,
"Nucleotide GTR":0.00109051322577304,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.001104243927854027,
"Nucleotide GTR":0.001090086268187865,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node338":{
"Global MG94xREV":0.001104063071746705,
"Nucleotide GTR":0.001089907730860979,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node342":{
"Global MG94xREV":0.001104301335382486,
"Nucleotide GTR":0.001090142939686693,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node345":{
"Global MG94xREV":0.001104435621097081,
"Nucleotide GTR":0.001090275503706111,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node349":{
"Global MG94xREV":0.001104271290391374,
"Nucleotide GTR":0.001090113279906445,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node353":{
"Global MG94xREV":0.001104625823405492,
"Nucleotide GTR":0.001090463267405189,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node356":{
"Global MG94xREV":0.001104880463635683,
"Nucleotide GTR":0.001090714642858797,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node38":{
"Global MG94xREV":0.001104185374631277,
"Nucleotide GTR":0.001090028465683847,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node387":{
"Global MG94xREV":0.001103381446869143,
"Nucleotide GTR":0.001089234845187493,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node404":{
"Global MG94xREV":0.001103936043771752,
"Nucleotide GTR":0.001089782331528749,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "F", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TTT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node42":{
"Global MG94xREV":0.001103900263501359,
"Nucleotide GTR":0.001089747010002007,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node421":{
"Global MG94xREV":0.001103789624554925,
"Nucleotide GTR":0.00108963778957236,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGG", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node464":{
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node466":{
"Global MG94xREV":0.001103697840965954,
"Nucleotide GTR":0.001089547182753109,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAC", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node474":{
"Global MG94xREV":0.001103789641563844,
"Nucleotide GTR":0.001089637806363205,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "V", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "GTA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.001103726286812637,
"Nucleotide GTR":0.001089575263891769,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCC", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node509":{
"Global MG94xREV":0.001104386055510629,
"Nucleotide GTR":0.001090226573606698,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.001104315989403797,
"Nucleotide GTR":0.00109015740582683,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTT", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node544":{
"Global MG94xREV":0.001103900309670774,
"Nucleotide GTR":0.001089747055579476,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.001103934477962144,
"Nucleotide GTR":0.001089780785794597,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "I", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ATT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node583":{
"Global MG94xREV":0.001104417038056193,
"Nucleotide GTR":0.001090257158920885,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "S", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AGT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node604":{
"Global MG94xREV":0.001103993559751715,
"Nucleotide GTR":0.001089839110088609,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node629":{
"Global MG94xREV":0.001104518121005437,
"Nucleotide GTR":0.001090356945872065,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "TTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node676":{
"Global MG94xREV":0.001103913801007886,
"Nucleotide GTR":0.001089760373942344,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTT", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.001104005465300166,
"Nucleotide GTR":0.001089850862994426,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "R", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CGT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node71":{
"Global MG94xREV":0.001103928054682596,
"Nucleotide GTR":0.001089774444868777,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node719":{
"Global MG94xREV":0.001103730790593287,
"Nucleotide GTR":0.001089579709928844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTC", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node726":{
"Global MG94xREV":0.001104109177875056,
"Nucleotide GTR":0.001089953245856467,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCG", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node793":{
"Global MG94xREV":0.001104448812990736,
"Nucleotide GTR":0.001090288526464725,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "N", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAT", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.001104315371918494,
"Nucleotide GTR":0.001090156796258389,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node803":{
"Global MG94xREV":0.001104560385685162,
"Nucleotide GTR":0.001090398668670657,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110443606874749,
"Nucleotide GTR":0.001090275945617132,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "I", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATT", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906980926268,
"Nucleotide GTR":0.001089753641301909,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "H", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "CAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106304293996854,
"Nucleotide GTR":0.001092120218099728,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "F", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TTC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106978132738603,
"Nucleotide GTR":0.001092785417464492,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "S", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "AGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436038377257,
"Nucleotide GTR":0.00109027591563628,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "V", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106978021076938,
"Nucleotide GTR":0.001092785307234458,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACA", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104764920479934,
"Nucleotide GTR":0.001090600581097361,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "V", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GTT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104241070354078,
"Nucleotide GTR":0.001090083447324305,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAG", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104764821783046,
"Nucleotide GTR":0.001090600483665878,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "L", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CTT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104276918232904,
"Nucleotide GTR":0.001090118835592664,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "F", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "TTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110424103109902,
"Nucleotide GTR":0.001090083408572544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "D", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "GAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104330045450279,
"Nucleotide GTR":0.001090171281658853,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "A", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GCT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420520_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906980926268,
"Nucleotide GTR":0.001089753641301909,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "CTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATC", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906941787454,
"Nucleotide GTR":0.001089753602664898,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAC", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906971979479,
"Nucleotide GTR":0.001089753632469827,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCC", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436098687273,
"Nucleotide GTR":0.001090275975173054,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "M", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "ATG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423704_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906932840664,
"Nucleotide GTR":0.001089753593832815,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAC", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423766_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104657999347746,
"Nucleotide GTR":0.001090495030815364,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "R", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "AGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424003_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104261658937674,
"Nucleotide GTR":0.001090103771938907,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "C", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TGT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104456573088094,
"Nucleotide GTR":0.001090296187068832,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACA", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103960039710029,
"Nucleotide GTR":0.00108980601981188,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "I", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATT", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104843622732237,
"Nucleotide GTR":0.001090678274297521,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104726430489778,
"Nucleotide GTR":0.001090562584592538,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436140849715,
"Nucleotide GTR":0.001090276016794927,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "H", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAT", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377560804521,
"Nucleotide GTR":0.001089231008946627,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAC", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001105390079794287,
"Nucleotide GTR":0.001091217725160203,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "T", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "ACA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377530631239,
"Nucleotide GTR":0.001089230979160201,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "A", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436098687273,
"Nucleotide GTR":0.001090275975173054,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "I", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATT", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104261699983829,
"Nucleotide GTR":0.001090103812458804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "M", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATG", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104658027379631,
"Nucleotide GTR":0.001090495058487851,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "R", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "AGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103977349762191,
"Nucleotide GTR":0.001089823107929538,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "S", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "TCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104261640096843,
"Nucleotide GTR":0.001090103753339637,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACG", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103934877636977,
"Nucleotide GTR":0.001089781180345144,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "E", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAA", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110630419158204,
"Nucleotide GTR":0.001092120116997989,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTT", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106304154655173,
"Nucleotide GTR":0.001092120080544566,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATT", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104658077750678,
"Nucleotide GTR":0.001090495108213082,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "I", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "ATA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103959854667591,
"Nucleotide GTR":0.001089805837141895,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "L", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CTC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104268883543941,
"Nucleotide GTR":0.001090110903917526,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "L", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "TTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103959871523567,
"Nucleotide GTR":0.001089805853781758,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "F", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110426164924973,
"Nucleotide GTR":0.001090103762375174,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "V", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "GTA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432915_England_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103377610757822,
"Nucleotide GTR":0.001089231058259471,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "A", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GCT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432915_England_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432926_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377602452889,
"Nucleotide GTR":0.001089231050061017,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTC", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432926_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432938_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104646877249727,
"Nucleotide GTR":0.001090484051315259,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "Y", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432938_England_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433359_Scotland_20200327_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001104261640096843,
"Nucleotide GTR":0.001090103753339637,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "C", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TGT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433359_Scotland_20200327_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433865_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103954572735611,
"Nucleotide GTR":0.001089800622930273,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "L", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "CTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433865_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377560804521,
"Nucleotide GTR":0.001089231008946627,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTC", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377551950597,
"Nucleotide GTR":0.001089231000206221,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "T", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ACG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208581591391335,
"Nucleotide GTR":0.002180265070261232,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "G", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "A", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GGT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GCT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001114621431750752,
"Nucleotide GTR":0.00110033072071374,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "Q", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "CAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104436140849715,
"Nucleotide GTR":0.001090276016794927,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTT", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105179512624318,
"Nucleotide GTR":0.001091009857700194,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103695117717448,
"Nucleotide GTR":0.001089544494419736,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "C", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TGT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110337751283608,
"Nucleotide GTR":0.001089230961593196,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGC", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103977400620721,
"Nucleotide GTR":0.001089823158136003,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "I", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ATA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105092925304086,
"Nucleotide GTR":0.001090924380527622,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTT", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104261658937674,
"Nucleotide GTR":0.001090103771938907,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTG", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106449642032703,
"Nucleotide GTR":0.001092263702608894,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "E", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GAA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103934712278185,
"Nucleotide GTR":0.001089781017106439,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATA", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001103943387236406,
"Nucleotide GTR":0.001089789580841856,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "L", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "CTG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104603863215068,
"Nucleotide GTR":0.001090441588769313,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104657987513792,
"Nucleotide GTR":0.001090495019133135,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "Y", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TAT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437566_California_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437584_California_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104261649784784,
"Nucleotide GTR":0.001090103762903368,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "G", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GGT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437584_California_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001114621403701275,
"Nucleotide GTR":0.001100330693023889,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "P", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "CCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104134344647348,
"Nucleotide GTR":0.001089978089962192,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGT", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104739001699184,
"Nucleotide GTR":0.001090574994624779,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110443610962058,
"Nucleotide GTR":0.001090275985966185,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "F", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "TTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438598_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00110426164924973,
"Nucleotide GTR":0.001090103762375174,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "V", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "GTG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438598_England_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104261699983829,
"Nucleotide GTR":0.001090103812458804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "S", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AGT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103377571714928,
"Nucleotide GTR":0.001089231019717151,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGC", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107147746315578,
"Nucleotide GTR":0.001092952856403022,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTA", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110466438550173,
"Nucleotide GTR":0.00109050133509161,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "T", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "ACA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440058_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103485983221067,
"Nucleotide GTR":0.001089338041264814,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGC", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440058_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440142_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436107917847,
"Nucleotide GTR":0.001090275984285283,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "F", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "TTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440142_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440259_England_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104436077887924,
"Nucleotide GTR":0.001090275954640378,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "L", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "TTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440259_England_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440327_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "V", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "GTA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440327_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440734_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103695117717448,
"Nucleotide GTR":0.001089544494419736,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACG", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440734_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440906_England_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110412505526696,
"Nucleotide GTR":0.001089968919682199,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "L", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "CTC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440906_England_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440915_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377571714928,
"Nucleotide GTR":0.001089231019717151,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "P", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "CCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440915_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440996_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001105018256895258,
"Nucleotide GTR":0.001090850669452489,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "H", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAT", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440996_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441017_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377610845133,
"Nucleotide GTR":0.001089231058345663,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTC", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441017_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441703_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103350735449691,
"Nucleotide GTR":0.001089204527523274,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441703_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442115_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104284116323464,
"Nucleotide GTR":0.001090125941395539,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "L", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "CTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442115_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442236_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103867099734416,
"Nucleotide GTR":0.001089714271432173,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "K", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAG", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442236_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442526_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106978148857591,
"Nucleotide GTR":0.001092785433376818,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "T", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "ACA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442526_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442675_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104624859962176,
"Nucleotide GTR":0.001090462316314308,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTT", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442675_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442833_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110416135216725,
"Nucleotide GTR":0.001090004751215055,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442833_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442976_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "R", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CGT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442976_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001103513394208515,
"Nucleotide GTR":0.00108936510081231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTG", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442984_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443011_England_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106449632288841,
"Nucleotide GTR":0.001092263692989959,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "S", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "AGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443011_England_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443044_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110393424170696,
"Nucleotide GTR":0.001089780552568472,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCA", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443044_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103959688789373,
"Nucleotide GTR":0.001089805673390424,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "Y", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "TAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443325_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443341_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104659515488292,
"Nucleotide GTR":0.00109049652751727,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "N", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443341_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443412_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00110432763094647,
"Nucleotide GTR":0.00109016889811172,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "V", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GTA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443412_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444012_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110424103109902,
"Nucleotide GTR":0.001090083408572544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACG", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444012_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444143_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103327848904796,
"Nucleotide GTR":0.001089181934409844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCC", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444143_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444359_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104764923401595,
"Nucleotide GTR":0.001090600583981563,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAT", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444359_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444416_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00110386606710456,
"Nucleotide GTR":0.001089713252041802,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "C", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "TGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444416_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103871287046036,
"Nucleotide GTR":0.001089718405057708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "T", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "ACT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104742540443807,
"Nucleotide GTR":0.001090578487998682,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGT", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104564316209453,
"Nucleotide GTR":0.001090402548801168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "N", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAT", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906941787454,
"Nucleotide GTR":0.001089753602664898,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAC", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103871287046036,
"Nucleotide GTR":0.001089718405057708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "H", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CAT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104241122460016,
"Nucleotide GTR":0.001090083498762188,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAG", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906932670727,
"Nucleotide GTR":0.001089753593665058,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGC", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106978111982778,
"Nucleotide GTR":0.001092785396974781,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTA", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104662853195814,
"Nucleotide GTR":0.001090499822431595,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAG", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208899421822272,
"Nucleotide GTR":0.002180578825745536,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "R", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "A", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CGA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "GCA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002208571303059892,
"Nucleotide GTR":0.002180254913837865,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "L", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "CTT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104241060675751,
"Nucleotide GTR":0.001090083437770066,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGG", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906971979479,
"Nucleotide GTR":0.001089753632469827,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "P", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002209414452280884,
"Nucleotide GTR":0.002181087252929482,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "P", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "H", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CCT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CAT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447714_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906930719708,
"Nucleotide GTR":0.001089753591739053,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCC", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447714_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447731_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103710269170429,
"Nucleotide GTR":0.001089559451613904,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCT", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447731_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448986_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGG", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448986_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449109_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCG", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449109_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449330_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436130893968,
"Nucleotide GTR":0.001090276006966824,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "Y", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "TAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449330_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104764911650142,
"Nucleotide GTR":0.001090600572380776,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "I", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ATC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104104548692995,
"Nucleotide GTR":0.001089948676025771,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "G", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GGT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104104997249423,
"Nucleotide GTR":0.001089949118831196,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "L", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "CTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104502832831747,
"Nucleotide GTR":0.001090341853710101,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "L", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGG", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGG", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "I", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ATT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105591979064473,
"Nucleotide GTR":0.001091417035852739,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103906971809542,
"Nucleotide GTR":0.00108975363230207,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTC", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906941787454,
"Nucleotide GTR":0.001089753602664898,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "T", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ACA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCC", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001103871286715914,
"Nucleotide GTR":0.00108971840473182,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAA", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104897974326302,
"Nucleotide GTR":0.0010907319290425,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "K", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "AAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103866107568667,
"Nucleotide GTR":0.001089713291987113,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "Y", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "TAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906932670727,
"Nucleotide GTR":0.001089753593665058,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGC", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453275_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTC", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453275_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453440_England_20200504_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00110443606874749,
"Nucleotide GTR":0.001090275945617132,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "L", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "TTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453440_England_20200504_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453454_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103993579425816,
"Nucleotide GTR":0.001089839129510466,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "A", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GCT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453454_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453618_England_20200505_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001103871376925371,
"Nucleotide GTR":0.001089718493784687,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "R", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "AGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453618_England_20200505_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453622_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103340797131932,
"Nucleotide GTR":0.001089194716626021,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "L", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "CTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453622_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453654_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002211572806349574,
"Nucleotide GTR":0.002183217934450855,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "Y", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "I", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "TAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "ATT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453654_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453729_England_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104764833628735,
"Nucleotide GTR":0.001090600495359693,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAT", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453729_England_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453770_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377601903899,
"Nucleotide GTR":0.001089231049519065,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGC", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453770_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110466643405583,
"Nucleotide GTR":0.001090503357380925,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "N", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "AAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104482077851135,
"Nucleotide GTR":0.001090321364831885,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "H", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CAT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106304303030306,
"Nucleotide GTR":0.001092120227017361,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCT", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104664292775718,
"Nucleotide GTR":0.001090501243554452,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "I", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATA", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103473755044724,
"Nucleotide GTR":0.001089325969867563,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "G", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GGC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103871236683609,
"Nucleotide GTR":0.001089718355340984,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "I", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "ATT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436162388572,
"Nucleotide GTR":0.001090276038057631,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "I", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "ATT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103530517500664,
"Nucleotide GTR":0.001089382004564433,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACC", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110378001123515,
"Nucleotide GTR":0.00108962829950625,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "A", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "GCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00110412175228776,
"Nucleotide GTR":0.001089965659050938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "H", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAC", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103867048459323,
"Nucleotide GTR":0.001089714220814484,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "G", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GGT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104659514936712,
"Nucleotide GTR":0.001090496526972762,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGA", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906941787454,
"Nucleotide GTR":0.001089753602664898,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGC", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104435975732414,
"Nucleotide GTR":0.001090275853794618,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "C", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "TGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104241070354078,
"Nucleotide GTR":0.001090083447324305,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "R", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CGA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103906971809542,
"Nucleotide GTR":0.00108975363230207,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAC", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103906941787454,
"Nucleotide GTR":0.001089753602664898,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "H", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "CAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "G", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GGT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110424103109902,
"Nucleotide GTR":0.001090083408572544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "V", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "GTA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "N", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAT", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110424103109902,
"Nucleotide GTR":0.001090083408572544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAG", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105669209486475,
"Nucleotide GTR":0.001091493276093131,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104648076297666,
"Nucleotide GTR":0.001090485234990043,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105023842194655,
"Nucleotide GTR":0.001090856183142013,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "L", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "CTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457132_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "L", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "CTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457132_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457165_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105264500955373,
"Nucleotide GTR":0.001091093756384446,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457165_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457289_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103906932670727,
"Nucleotide GTR":0.001089753593665058,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "T", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ACA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457289_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457320_England_20200509_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104301031020524,
"Nucleotide GTR":0.001090142639226996,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACT", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457320_England_20200509_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457485_England_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103530486301663,
"Nucleotide GTR":0.001089381973765436,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "A", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GCT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457485_England_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457652_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104658039213587,
"Nucleotide GTR":0.00109049507017008,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "I", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATA", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457652_England_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457683_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377560804521,
"Nucleotide GTR":0.001089231008946627,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTC", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457683_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105072598963386,
"Nucleotide GTR":0.001090904314793665,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "I", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "R", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ATT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "AGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377571865312,
"Nucleotide GTR":0.001089231019865607,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTC", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208899421822272,
"Nucleotide GTR":0.002180578825745536,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "G", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "GGT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906822983696,
"Nucleotide GTR":0.001089753485384339,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCC", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104746643775977,
"Nucleotide GTR":0.00109058253872148,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAA", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458273_California_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104646923340666,
"Nucleotide GTR":0.00109048409681526,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "H", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CAC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458273_California_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458525_England_20200507_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458525_England_20200507_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458863_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104666375061818,
"Nucleotide GTR":0.001090503299143282,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "I", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATA", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458863_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458972_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377560804521,
"Nucleotide GTR":0.001089231008946627,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "CTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458972_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAT", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105168295535688,
"Nucleotide GTR":0.001090998784427364,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAT", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459423_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103774314015716,
"Nucleotide GTR":0.001089622675331631,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCC", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459423_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104657999347746,
"Nucleotide GTR":0.001090495030815364,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "I", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "ATT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACG", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103823561109655,
"Nucleotide GTR":0.001089671291021967,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "S", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "TCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001103377571714928,
"Nucleotide GTR":0.001089231019717151,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAC", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103977349762191,
"Nucleotide GTR":0.001089823107929538,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAT", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103513393731142,
"Nucleotide GTR":0.001089365100341059,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "A", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "GCA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103327840544207,
"Nucleotide GTR":0.001089181926156446,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATC", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "F", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TTT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104261699983829,
"Nucleotide GTR":0.001090103812458804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "G", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GGA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103327838439266,
"Nucleotide GTR":0.001089181924078494,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "A", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GCT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAC", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461566_England_20200526_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103977349762191,
"Nucleotide GTR":0.001089823107929538,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "S", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "TCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461566_England_20200526_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461985_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103959688789373,
"Nucleotide GTR":0.001089805673390424,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "S", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "TCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461985_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462042_England_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104261699983829,
"Nucleotide GTR":0.001090103812458804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "V", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "GTT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462042_England_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110397734005048,
"Nucleotide GTR":0.001089823098342343,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "TTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104659506042116,
"Nucleotide GTR":0.001090496518192205,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "D", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GAT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011044360807903,
"Nucleotide GTR":0.001090275957505541,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "N", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAT", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104239374978106,
"Nucleotide GTR":0.001090081773684978,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "V", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "GTC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104436130893968,
"Nucleotide GTR":0.001090276006966824,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "I", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATT", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105167791068938,
"Nucleotide GTR":0.001090998286428449,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001104723138781329,
"Nucleotide GTR":0.001090559335087525,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104742518899421,
"Nucleotide GTR":0.001090578466730519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "V", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GTA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106978081311019,
"Nucleotide GTR":0.00109278536669627,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "N", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "AAT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110332784006774,
"Nucleotide GTR":0.001089181925686091,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "S", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TCG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513432480871,
"Nucleotide GTR":0.001089365138593971,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAG", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105497508672618,
"Nucleotide GTR":0.001091323776678461,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "I", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ATT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103327849693043,
"Nucleotide GTR":0.001089181935187985,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "T", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ACT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513393731142,
"Nucleotide GTR":0.001089365100341059,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "C", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TGC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104261658937674,
"Nucleotide GTR":0.001090103771938907,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "R", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CGA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003326511920748391,
"Nucleotide GTR":0.003283862264760777,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "L", "V", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "E", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "CTG", "GTA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GAA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104853023927228,
"Nucleotide GTR":0.001090687554958529,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAT", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104687768287334,
"Nucleotide GTR":0.001090524418083382,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464535_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110386606710456,
"Nucleotide GTR":0.001089713252041802,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "V", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GTT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464535_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464916_England_20200310_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104618530286086,
"Nucleotide GTR":0.001090456067791845,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "L", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464916_England_20200310_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465177_England_20200418_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001104380445573457,
"Nucleotide GTR":0.001090221035595281,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "L", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "CTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465177_England_20200418_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465178_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103774304904617,
"Nucleotide GTR":0.001089622666337348,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGC", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465178_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465209_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513384877203,
"Nucleotide GTR":0.001089365091600637,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "D", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "GAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465209_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465243_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001103977390964655,
"Nucleotide GTR":0.001089823148603739,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTT", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465243_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465264_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105032359241163,
"Nucleotide GTR":0.001090864590990323,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465264_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465438_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103671393457089,
"Nucleotide GTR":0.001089521074331305,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAC", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465438_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465657_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103934112665932,
"Nucleotide GTR":0.001089780425181897,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "L", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTA", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465657_England_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465845_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103960055841668,
"Nucleotide GTR":0.001089806035736691,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "S", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "TCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465845_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465876_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103954863376945,
"Nucleotide GTR":0.001089800909845257,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGC", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465876_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465925_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103695159402996,
"Nucleotide GTR":0.001089544535570827,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTG", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465925_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466186_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104261658937674,
"Nucleotide GTR":0.001090103771938907,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTG", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466186_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466189_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104657987513792,
"Nucleotide GTR":0.001090495019133135,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "N", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "AAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466189_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466222_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104570770446358,
"Nucleotide GTR":0.001090408920287434,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAA", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466222_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466324_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104859663326291,
"Nucleotide GTR":0.001090694109232962,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466324_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466361_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104753210756369,
"Nucleotide GTR":0.001090589021505735,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "E", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466361_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466551_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002232021177110777,
"Nucleotide GTR":0.002203404133904922,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "G", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "K", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GGA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAG", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466551_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466613_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104659506042116,
"Nucleotide GTR":0.001090496518192205,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGG", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466613_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104492632463387,
"Nucleotide GTR":0.001090331784122034,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "R", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "AGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104569517210274,
"Nucleotide GTR":0.001090407683119258,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "C", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TGC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103377559792463,
"Nucleotide GTR":0.001089231007947546,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTC", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103513393731142,
"Nucleotide GTR":0.001089365100341059,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCG", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513432480871,
"Nucleotide GTR":0.001089365138593971,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTG", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30":{
"Global MG94xREV":0.001103327848904796,
"Nucleotide GTR":0.001089181934409844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAC", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467788_Virginia_20200419_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467788_Virginia_20200419_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467825_California_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "R", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CGG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467825_California_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467897_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTG", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467897_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467986_South_Australia_20200407_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAT", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467986_South_Australia_20200407_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468031_South_Australia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513435379584,
"Nucleotide GTR":0.00108936514145552,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAG", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468031_South_Australia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468158_Suceava_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002209318496072502,
"Nucleotide GTR":0.002180992526988534,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGC", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGA", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468158_Suceava_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468160_Rawalpindi_20200602_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106449602511775,
"Nucleotide GTR":0.001092263663594671,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "K", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAA", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468160_Rawalpindi_20200602_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468229_St_Gallen_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103977349762191,
"Nucleotide GTR":0.001089823107929538,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "V", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GTT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468229_St_Gallen_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468334_Galicia_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110474245887352,
"Nucleotide GTR":0.001090578407474219,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "V", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GTT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468334_Galicia_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468346_California_20200426_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104659514936712,
"Nucleotide GTR":0.001090496526972762,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "K", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AAG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468346_California_20200426_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468528_California_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "L", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TTA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468528_California_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468807_Aragon_20200327_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001103977330875137,
"Nucleotide GTR":0.001089823089284638,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCT", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468807_Aragon_20200327_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTT", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469035_Gujarat_20200605_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104718632191401,
"Nucleotide GTR":0.001090554886277192,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "G", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GGT", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469035_Gujarat_20200605_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469128_Singapore_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106304154655173,
"Nucleotide GTR":0.001092120080544566,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "F", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTT", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469128_Singapore_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469193_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104239363318238,
"Nucleotide GTR":0.001090081762174603,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "G", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GGT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469193_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469294_Kanto_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104502795543818,
"Nucleotide GTR":0.001090341816900245,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "V", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "GTA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTT", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469294_Kanto_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_469361_England_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103327849693043,
"Nucleotide GTR":0.001089181935187985,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACC", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469361_England_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469644_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "R", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AGG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469644_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469684_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103959688789373,
"Nucleotide GTR":0.001089805673390424,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "I", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATT", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469684_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469693_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104772062485118,
"Nucleotide GTR":0.001090607631533938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTT", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469693_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469836_England_20200504_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001104289658284768,
"Nucleotide GTR":0.001090131412302614,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAA", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469836_England_20200504_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469886_Northern_Ireland_20200429_null_10":{
"Global MG94xREV":0.00110474247951419,
"Nucleotide GTR":0.001090578427850254,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAT", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469886_Northern_Ireland_20200429_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469927_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103513432480871,
"Nucleotide GTR":0.001089365138593971,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCG", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469927_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470069_Northern_Ireland_20200406_null_46":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "F", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "TTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470069_Northern_Ireland_20200406_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470120_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103695117717448,
"Nucleotide GTR":0.001089544494419736,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "E", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAG", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470120_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470199_England_20200418_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "I", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ATT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470199_England_20200418_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470321_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103327848904796,
"Nucleotide GTR":0.001089181934409844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCC", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470321_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470462_England_20200409_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "I", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ATT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470462_England_20200409_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470499_England_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104742428662415,
"Nucleotide GTR":0.001090578377650455,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "V", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GTT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470499_England_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470533_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "L", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CTC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470533_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470588_Minas_Gerais_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103993570564581,
"Nucleotide GTR":0.001089839120762843,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTC", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "TTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470588_Minas_Gerais_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470723_Utah_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104659514936712,
"Nucleotide GTR":0.001090496526972762,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAA", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470723_Utah_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470848_Western_Australia_20200322_null_108":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470848_Western_Australia_20200322_null_108",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471221_Wisconsin_20200328_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471221_Wisconsin_20200328_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471245_Wisconsin_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103954872816513,
"Nucleotide GTR":0.001089800919163797,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "D", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAC", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471245_Wisconsin_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471416_Buzau_20200601_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAT", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471416_Buzau_20200601_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471418_Vrancea_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004424728180738421,
"Nucleotide GTR":0.004367998146623669,
"amino-acid": [
["S", "G", "L", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "N", "L", "P", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "CTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAT", "CTT", "CCG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471418_Vrancea_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471458_Rabat_20200419_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "S", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AGT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471458_Rabat_20200419_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104700758207777,
"Nucleotide GTR":0.001090537241458311,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "F", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTT", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TTT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471635_Telangana_20200602_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "F", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TTT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471635_Telangana_20200602_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104742528609837,
"Nucleotide GTR":0.001090578476316437,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "I", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ATA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471808_Michigan_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104482242271776,
"Nucleotide GTR":0.001090321527144465,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "L", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTA", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471808_Michigan_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471908_Michigan_20200518_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAT", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471908_Michigan_20200518_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471938_England_20200420_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104436071649861,
"Nucleotide GTR":0.001090275948482294,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "N", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAT", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471938_England_20200420_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472003_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103848287061868,
"Nucleotide GTR":0.001089695699959424,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "CGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472003_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472022_England_20200511_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472022_England_20200511_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472110_England_20200528_null_44":{
"Global MG94xREV":0.001103327848904796,
"Nucleotide GTR":0.001089181934409844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACC", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472110_England_20200528_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472163_England_20200312_null_57":{
"Global MG94xREV":0.001104433247654805,
"Nucleotide GTR":0.001090273160694058,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472163_England_20200312_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472164_England_20200313_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001103327849693043,
"Nucleotide GTR":0.001089181935187985,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAC", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472164_England_20200313_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472179_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104897984317757,
"Nucleotide GTR":0.001090731938905851,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "T", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "ACT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472179_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472258_England_20200405_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001104620227163172,
"Nucleotide GTR":0.001090457742913042,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTT", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472258_England_20200405_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_472302_England_20200503_null_41":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472302_England_20200503_null_41",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472309_England_20200506_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAT", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472309_England_20200506_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472417_England_20200605_null_62":{
"Global MG94xREV":0.001104742518899421,
"Nucleotide GTR":0.001090578466730519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "V", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GTT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472417_England_20200605_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472418_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104607193924111,
"Nucleotide GTR":0.001090444876774889,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACT", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472418_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472429_England_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104219246822255,
"Nucleotide GTR":0.001090061903594915,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472429_England_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472438_Wales_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "V", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "GTG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472438_Wales_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472491_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103327848991942,
"Nucleotide GTR":0.001089181934495872,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAC", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472491_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472539_Wales_20200401_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104482266301267,
"Nucleotide GTR":0.001090321550865871,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "H", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CAT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472539_Wales_20200401_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472639_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "A", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "GCA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472639_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472744_Wales_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103327876691007,
"Nucleotide GTR":0.001089181961839805,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "S", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TCT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472744_Wales_20200514_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472793_Wales_20200513_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472793_Wales_20200513_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473028_Wales_20200516_null_23":{
"Global MG94xREV":0.001104402525816475,
"Nucleotide GTR":0.001090242832744542,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473028_Wales_20200516_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473144_Wales_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104073126594629,
"Nucleotide GTR":0.001089917656794346,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473144_Wales_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473191_Wales_20200531_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104659514936712,
"Nucleotide GTR":0.001090496526972762,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "I", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "ATT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473191_Wales_20200531_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473202_Wales_20200527_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACT", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473202_Wales_20200527_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473363_England_20200509_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104764923401595,
"Nucleotide GTR":0.001090600583981563,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "Y", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473363_England_20200509_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473416_England_20200527_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001105314231940281,
"Nucleotide GTR":0.00109114284976172,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "I", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473416_England_20200527_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473429_England_20200516_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104764892989387,
"Nucleotide GTR":0.001090600553959274,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCT", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473429_England_20200516_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473434_England_20200602_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001104742428662415,
"Nucleotide GTR":0.001090578377650455,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTT", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473434_England_20200602_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473444_England_20200605_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104531194505054,
"Nucleotide GTR":0.001090369851754587,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473444_England_20200605_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473490_England_20200604_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001103327849693043,
"Nucleotide GTR":0.001089181935187985,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCC", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473490_England_20200604_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473506_England_20200613_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001104375834416633,
"Nucleotide GTR":0.00109021648355872,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "TTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473506_England_20200613_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473616_Scotland_20200421_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001104722416488535,
"Nucleotide GTR":0.001090558622055343,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTT", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473616_Scotland_20200421_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473641_Scotland_20200423_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001104764881143696,
"Nucleotide GTR":0.001090600542265459,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473641_Scotland_20200423_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473698_Scotland_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105530367176464,
"Nucleotide GTR":0.001091356213899018,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "I", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ATT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473698_Scotland_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473715_Scotland_20200517_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104528969905395,
"Nucleotide GTR":0.00109036765567682,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAT", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473715_Scotland_20200517_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473775_Scotland_20200510_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473775_Scotland_20200510_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473776_Scotland_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110601706841329,
"Nucleotide GTR":0.001091836675073937,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473776_Scotland_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473867_Scotland_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105322206842496,
"Nucleotide GTR":0.001091150722416642,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473867_Scotland_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473991_Wales_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103774304904617,
"Nucleotide GTR":0.001089622666337348,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAC", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473991_Wales_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474198_Wales_20200508_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "I", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474198_Wales_20200508_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474289_Wales_20200404_null_354":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474289_Wales_20200404_null_354",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474463_Wales_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104241070354078,
"Nucleotide GTR":0.001090083447324305,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "D", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "GAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474463_Wales_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474607_Wales_20200427_null_89":{
"Global MG94xREV":0.001104666384106925,
"Nucleotide GTR":0.001090503308072422,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "T", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "ACT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474607_Wales_20200427_null_89",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474616_Wales_20200429_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001103906971979479,
"Nucleotide GTR":0.001089753632469827,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACC", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474616_Wales_20200429_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474653_Wales_20200429_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAT", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474653_Wales_20200429_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474666_Wales_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103906941787454,
"Nucleotide GTR":0.001089753602664898,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "T", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ACG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474666_Wales_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474683_Wales_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103906932670727,
"Nucleotide GTR":0.001089753593665058,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "CTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474683_Wales_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474697_Wales_20200502_null_109":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474697_Wales_20200502_null_109",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474753_Wales_20200430_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001104436107917847,
"Nucleotide GTR":0.001090275984285283,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "F", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTT", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474753_Wales_20200430_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474786_Wales_20200430_null_22":{
"Global MG94xREV":0.001104722236067864,
"Nucleotide GTR":0.00109055844394787,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "L", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CTT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474786_Wales_20200430_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474810_Castilla_La_Mancha_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107147746315578,
"Nucleotide GTR":0.001092952856403022,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "T", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "I", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "ACA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ATT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474810_Castilla_La_Mancha_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474817_Castilla_La_Mancha_20200402_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001104742518899421,
"Nucleotide GTR":0.001090578466730519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "V", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GTC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474817_Castilla_La_Mancha_20200402_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104996069888006,
"Nucleotide GTR":0.001090828766907838,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "V", "A", "G", "T", "D", "T", "I", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GTA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ATT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474854_Galicia_20200321_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "TTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474854_Galicia_20200321_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474953_Castilla_La_Mancha_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "I", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ATT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474953_Castilla_La_Mancha_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474979_PARDESIA_20200315_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001104764833628735,
"Nucleotide GTR":0.001090600495359693,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "V", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GTT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474979_PARDESIA_20200315_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTT", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475012_ISRAEL_20200411_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104764881055693,
"Nucleotide GTR":0.001090600542178585,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAT", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475012_ISRAEL_20200411_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475128_Orebro_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103530517500664,
"Nucleotide GTR":0.001089382004564433,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCC", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475128_Orebro_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475129_Varmland_20200312_null_108":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475129_Varmland_20200312_null_108",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475159_Halland_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001106978151528253,
"Nucleotide GTR":0.00109278543601324,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATA", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475159_Halland_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475277_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103906971809542,
"Nucleotide GTR":0.00108975363230207,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "A", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GCT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475277_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475278_England_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104241039984757,
"Nucleotide GTR":0.001090083417344354,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "A", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "GCA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475278_England_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475284_England_20200330_null_18":{
"Global MG94xREV":0.00110424103109902,
"Nucleotide GTR":0.001090083408572544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "R", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AGG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475284_England_20200330_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475332_England_20200421_null_64":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475332_England_20200421_null_64",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475371_England_20200427_null_84":{
"Global MG94xREV":0.001104521865177945,
"Nucleotide GTR":0.001090360642040035,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475371_England_20200427_null_84",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475384_England_20200426_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001104755137495783,
"Nucleotide GTR":0.001090590923542162,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "L", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CTT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475384_England_20200426_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475477_England_20200429_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001104764920479934,
"Nucleotide GTR":0.001090600581097361,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGT", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475477_England_20200429_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475532_Vastmanland_20200602_null_33":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475532_Vastmanland_20200602_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475567_Stockholm_20200528_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104764881143696,
"Nucleotide GTR":0.001090600542265459,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "V", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GTT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475567_Stockholm_20200528_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475587_California_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002215540310608568,
"Nucleotide GTR":0.002187134570805029,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "Y", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCA", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "TAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475587_California_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475589_California_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104897974326302,
"Nucleotide GTR":0.0010907319290425,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "N", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "AAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475589_California_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475591_California_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104380115439526,
"Nucleotide GTR":0.001090220709694044,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "S", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "AGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475591_California_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475592_California_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104436107917847,
"Nucleotide GTR":0.001090275984285283,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "C", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "TGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475592_California_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475603_California_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104764920479934,
"Nucleotide GTR":0.001090600581097361,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATT", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475603_California_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475623_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104339715149864,
"Nucleotide GTR":0.001090180827381922,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "S", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "AGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGG", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475623_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475634_California_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "S", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "AGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475634_California_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475678_California_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104764920567936,
"Nucleotide GTR":0.001090600581184235,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "I", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ATT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475678_California_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475686_California_20200403_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001104764872131664,
"Nucleotide GTR":0.001090600533368971,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAT", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475686_California_20200403_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475712_California_20200402_null_32":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAT", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475712_California_20200402_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475736_Utah_20200512_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "I", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ATA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475736_Utah_20200512_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475739_Utah_20200512_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103327848904796,
"Nucleotide GTR":0.001089181934409844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCC", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475739_Utah_20200512_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475741_Utah_20200512_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "F", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TTT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475741_Utah_20200512_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475743_Utah_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "Y", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "TAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475743_Utah_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475782_Tyrol_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104436140849715,
"Nucleotide GTR":0.001090276016794927,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "F", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "TTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475782_Tyrol_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475794_Styria_20200401_null_50":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475794_Styria_20200401_null_50",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475826_Mayrhofen_20200401_null_1107":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475826_Mayrhofen_20200401_null_1107",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475865_Austria_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104124942026567,
"Nucleotide GTR":0.001089968807893674,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "A", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GCT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475865_Austria_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476098_Ticino_20200528_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476098_Ticino_20200528_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476109_Basel_Landschaft_20200430_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104560462657513,
"Nucleotide GTR":0.001090398744656133,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAT", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476109_Basel_Landschaft_20200430_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476126_Zurich_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0011047425097253,
"Nucleotide GTR":0.00109057845767402,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "I", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ATC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476126_Zurich_20200421_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476129_Aargau_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002208899568105868,
"Nucleotide GTR":0.002180578970153609,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "A", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTG", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "GCG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476129_Aargau_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476132_Graub_nden_20200418_null_53":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476132_Graub_nden_20200418_null_53",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476234_S_o_Paulo_20200309_null_84":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476234_S_o_Paulo_20200309_null_84",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476304_Bahia_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104659505783791,
"Nucleotide GTR":0.001090496517937193,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "Q", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CAA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476304_Bahia_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476412_S_o_Paulo_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104742518899421,
"Nucleotide GTR":0.001090578466730519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "F", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "TTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476412_S_o_Paulo_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476494_Dakar_20200611_null_215":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476494_Dakar_20200611_null_215",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476496_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200422_null_31":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "D", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "GAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476496_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200422_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476502_Quebec_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476502_Quebec_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476522_Connecticut_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103327790138114,
"Nucleotide GTR":0.001089181876396617,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTC", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476522_Connecticut_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476531_Connecticut_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106304293996854,
"Nucleotide GTR":0.001092120218099728,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "L", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CTA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476531_Connecticut_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476553_Connecticut_20200401_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476553_Connecticut_20200401_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476557_Connecticut_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001103327790138114,
"Nucleotide GTR":0.001089181876396617,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGC", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476557_Connecticut_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476567_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200518_null_23":{
"Global MG94xREV":0.001104742419488294,
"Nucleotide GTR":0.001090578368593956,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCT", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476567_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200518_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476704_Venezuela_20200409_null_156":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476704_Venezuela_20200409_null_156",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476760_Minnesota_20200521_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103530517500664,
"Nucleotide GTR":0.001089382004564433,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "P", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CCA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476760_Minnesota_20200521_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476766_Minnesota_20200603_null_205":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476766_Minnesota_20200603_null_205",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476784_California_20200313_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACT", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476784_California_20200313_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476786_California_20200327_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476786_California_20200327_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476837_Thessaloniki_20200415_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001104436080880436,
"Nucleotide GTR":0.001090275957594522,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "F", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "TTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476837_Thessaloniki_20200415_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476838_Thessaloniki_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104659505954404,
"Nucleotide GTR":0.001090496518105617,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGA", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476838_Thessaloniki_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476879_Gujarat_20200612_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001103513444233523,
"Nucleotide GTR":0.001089365150195942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "R", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AGG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476879_Gujarat_20200612_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476904_Unknown_20200301_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476904_Unknown_20200301_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476926_Unknown_20200312_null_47060":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476926_Unknown_20200312_null_47060",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_476932_Unknown_20200312_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104742518899421,
"Nucleotide GTR":0.001090578466730519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "M", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_476932_Unknown_20200312_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10354.05742471962,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02589651346205587],
[0.01165924405163277],
[0.01089805887668199],
[0.04085759623512994],
[0.01716550162665336],
[0.007728328874351966],
[0.007223777349377503],
[0.02708245400149674],
[0.01529221337500325],
[0.006884928663854627],
[0.006435439348225634],
[0.02412691888167924],
[0.02416620764884298],
[0.01088021803371853],
[0.01016989233585831],
[0.03812764819084453],
[0.01604915190902094],
[0.007225720914252677],
[0.006753982642551375],
[0.02532116030120549],
[0.01063817890405835],
[0.00478956846021313],
[0.004476876789108132],
[0.01678412883556516],
[0.009477223868000376],
[0.004266878094260775],
[0.003988310775977504],
[0.01495246017561607],
[0.01497680906696212],
[0.006742925926390524],
[0.006302707398651504],
[0.02362929738187206],
[0.02849833710341276],
[0.01283064872193079],
[0.01199298724500449],
[0.04496256040219185],
[0.01889012019406847],
[0.008504794355040413],
[0.007949550520157719],
[0.02980342913161608],
[0.0168286226042246],
[0.007576657694981529],
[0.007082008171602779],
[0.0265509512917344],
[0.02659418740275183],
[0.01197335393190515],
[0.01119166178556669],
[0.04195833437945558],
[0.01132493973833885],
[0.03968609055330896],
[0.01667331695256719],
[0.007506735290256092],
[0.007016650719599681],
[0.02630592156532935],
[0.006687517807811588],
[0.00625091665339861],
[0.02343513020199136],
[0.02347329244634893],
[0.01056825065383158],
[0.009878292052121552],
[0.03703441803033791]
],
"Log Likelihood":-4696.170863043411,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6068935984148935, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":479
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":11165.41752701037,
"Equilibrium frequencies": [
[0.28103233630617],
[0.1773506337400861],
[0.2036393101301823],
[0.3379777198235616]
],
"Log Likelihood":-4763.911710613203,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3276195358983923,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.09581799718564069,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.03938325086771156,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.498512639404234,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.404835375420939
},
"display order":0,
"estimated parameters":817
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-27/sequences.3C.compressed.fas",
"number of sequences":406,
"number of sites":306,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1,epi_isl_453654_England_20200513_null_1,epi_isl_470723_Utah_20200408_null_4,epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1,epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3,epi_isl_465925_England_20200328_null_1,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1,epi_isl_440734_England_20200403_null_1,epi_isl_468229_St_Gallen_20200420_null_2,epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_440259_England_20200322_null_2,epi_isl_466189_England_20200403_null_1,epi_isl_475012_ISRAEL_20200411_null_8,epi_isl_440915_England_20200419_null_1,epi_isl_475128_Orebro_20200312_null_1,epi_isl_475567_Stockholm_20200528_null_8,epi_isl_441017_England_20200406_null_1,epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1,epi_isl_475477_England_20200429_null_11,epi_isl_442526_England_20200413_null_1,epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1,epi_isl_475278_England_20200427_null_3,epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8,(epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1,epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1)Node793,epi_isl_473028_Wales_20200516_null_23,(epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6,epi_isl_453454_England_20200501_null_1,epi_isl_472022_England_20200511_null_18)Node798,(epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1,epi_isl_476766_Minnesota_20200603_null_205)Node803,epi_isl_470533_England_20200405_null_5,epi_isl_475686_California_20200403_null_6,epi_isl_437566_California_20200324_null_1,epi_isl_453440_England_20200504_null_4,epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1,(epi_isl_421871_England_20200327_null_2,epi_isl_465177_England_20200418_null_19)Node111,epi_isl_474817_Castilla_La_Mancha_20200402_null_15,epi_isl_474979_PARDESIA_20200315_null_15,epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1,epi_isl_476522_Connecticut_20200327_null_4,epi_isl_465438_England_20200427_null_1,epi_isl_466551_England_20200414_null_1,(epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_1,epi_isl_474810_Castilla_La_Mancha_20200403_null_1,epi_isl_474953_Castilla_La_Mancha_20200401_null_7)Node129,epi_isl_443412_England_20200416_null_6,epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2,epi_isl_469128_Singapore_20200417_null_1,epi_isl_468031_South_Australia_20200330_null_1,epi_isl_474666_Wales_20200429_null_2,epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1,epi_isl_474753_Wales_20200430_null_20,epi_isl_476126_Zurich_20200421_null_3,epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1,epi_isl_476129_Aargau_20200420_null_2,epi_isl_453618_England_20200505_null_9,epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1,epi_isl_471938_England_20200420_null_7,epi_isl_473641_Scotland_20200423_null_14,epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4,epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1,epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2,epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1,epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3,epi_isl_470120_England_20200421_null_1,epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4,(epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1,epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1)Node180,epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4,epi_isl_475678_California_20200328_null_3,epi_isl_438598_England_20200421_null_5,epi_isl_472179_England_20200323_null_1,epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3,epi_isl_474616_Wales_20200429_null_8,epi_isl_432926_England_20200328_null_1,epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1,epi_isl_423766_England_20200323_null_1,epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6,((epi_isl_473775_Scotland_20200510_null_4,epi_isl_473776_Scotland_20200510_null_1)Node219,epi_isl_472793_Wales_20200513_null_10)Node218,(epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1,epi_isl_473698_Scotland_20200516_null_1)Node215,(epi_isl_473867_Scotland_20200429_null_1,epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1,epi_isl_474289_Wales_20200404_null_354)Node209,epi_isl_473715_Scotland_20200517_null_4,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,(epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1,epi_isl_472302_England_20200503_null_41)Node225,(epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2,epi_isl_471221_Wisconsin_20200328_null_37)Node228,(epi_isl_466324_England_20200409_null_2,epi_isl_467788_Virginia_20200419_null_10)Node274,(epi_isl_472418_England_20200426_null_2,epi_isl_473202_Wales_20200527_null_4)Node271,(epi_isl_475371_England_20200427_null_84,epi_isl_475532_Vastmanland_20200602_null_33)Node268,(epi_isl_453622_England_20200507_null_1,epi_isl_457132_England_20200326_null_1)Node265,(epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1,epi_isl_475129_Varmland_20200312_null_108)Node262,(epi_isl_466361_England_20200409_null_4,epi_isl_475826_Mayrhofen_20200401_null_1107,epi_isl_472003_England_20200421_null_1,epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1,epi_isl_469693_England_20200402_null_1,epi_isl_465178_England_20200416_null_1,epi_isl_466613_England_20200410_null_1,epi_isl_459423_England_20200426_null_1,epi_isl_473506_England_20200613_null_6,epi_isl_473991_Wales_20200425_null_1)Node240,(epi_isl_473416_England_20200527_null_9,epi_isl_474198_Wales_20200508_null_6)Node259,epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2,(epi_isl_457320_England_20200509_null_2,epi_isl_476784_California_20200313_null_10)Node278,epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_473191_Wales_20200531_null_1,(epi_isl_473444_England_20200605_null_3,epi_isl_457165_England_20200406_null_1,epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1,epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9)Node283,(epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1,epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12)Node290,epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1,epi_isl_475384_England_20200426_null_11,(epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7,epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1)Node301,(epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_475794_Styria_20200401_null_50)Node295,(epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1,epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4)Node298,(epi_isl_475591_California_20200411_null_1,epi_isl_475634_California_20200325_null_3)Node305,(epi_isl_448986_England_20200419_null_1,epi_isl_475623_California_20200408_null_1)Node308,(epi_isl_442833_England_20200408_null_1,epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_476234_S_o_Paulo_20200309_null_84)Node325,(epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1,epi_isl_476904_Unknown_20200301_null_15)Node322,(epi_isl_472429_England_20200503_null_4,epi_isl_440058_England_20200330_null_1,epi_isl_474697_Wales_20200502_null_109)Node314,(epi_isl_423704_England_20200323_null_1,epi_isl_441703_England_20200406_null_1)Node319,(epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17,epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1)Node338,(epi_isl_473144_Wales_20200419_null_2,epi_isl_476494_Dakar_20200611_null_215)Node334,epi_isl_471418_Vrancea_20200409_null_1,epi_isl_472438_Wales_20200505_null_1,(epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1,epi_isl_476553_Connecticut_20200401_null_11)Node342,(epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1,epi_isl_476098_Ticino_20200528_null_4)Node345,((epi_isl_420520_England_20200324_null_1,epi_isl_423505_England_20200330_null_2)Node353,epi_isl_440996_England_20200402_null_2,epi_isl_476704_Venezuela_20200409_null_156)Node349,(epi_isl_465264_England_20200419_null_1,epi_isl_476786_California_20200327_null_9)Node356,epi_isl_464535_England_20200305_null_1,(epi_isl_466222_England_20200404_null_1,epi_isl_475332_England_20200421_null_64)Node42,epi_isl_474463_Wales_20200424_null_4,epi_isl_432915_England_20200328_null_3,epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1,epi_isl_468158_Suceava_20200101_null_1,epi_isl_476926_Unknown_20200312_null_47060,(epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1,epi_isl_476132_Graub_nden_20200418_null_53)Node38,epi_isl_469836_England_20200504_null_18,epi_isl_473429_England_20200516_null_7,epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1,epi_isl_476760_Minnesota_20200521_null_1,epi_isl_465209_England_20200418_null_1,epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1,epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2,epi_isl_465845_England_20200327_null_1,epi_isl_472491_Wales_20200420_null_2,epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1,(epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1,epi_isl_476502_Quebec_20200408_null_7)Node387,epi_isl_476109_Basel_Landschaft_20200430_null_5,epi_isl_470499_England_20200408_null_7,epi_isl_443341_England_20200413_null_2,epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1,epi_isl_473434_England_20200602_null_18,epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1,(epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_1,epi_isl_471635_Telangana_20200602_null_14)Node404,epi_isl_442675_England_20200405_null_4,epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1,epi_isl_476932_Unknown_20200312_null_5,epi_isl_469193_Connecticut_20200402_null_1,epi_isl_475865_Austria_20200421_null_1,epi_isl_476557_Connecticut_20200401_null_15,epi_isl_443011_England_20200410_null_2,(epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1,epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2)Node421,epi_isl_464916_England_20200310_null_8,epi_isl_468346_California_20200426_null_7,epi_isl_472417_England_20200605_null_62,epi_isl_443325_England_20200415_null_1,epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1,epi_isl_475603_California_20200409_null_2,epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2,epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2,epi_isl_476879_Gujarat_20200612_null_19,epi_isl_421670_India_20200312_null_1,epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1,epi_isl_475587_California_20200402_null_1,epi_isl_444359_England_20200428_null_2,epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1,epi_isl_475589_California_20200322_null_1,epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5,epi_isl_447714_France_20200301_null_1,epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1,epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2,epi_isl_470069_Northern_Ireland_20200406_null_46,(epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1)Node466,epi_isl_442984_England_20200407_null_7,epi_isl_474653_Wales_20200429_null_7,epi_isl_444416_England_20200420_null_3,(epi_isl_440327_England_20200320_null_1,epi_isl_469294_Kanto_20200511_null_1)Node474,epi_isl_472258_England_20200405_null_11,epi_isl_469886_Northern_Ireland_20200429_null_10,epi_isl_475736_Utah_20200512_null_3,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_471245_Wisconsin_20200410_null_1,epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1,(epi_isl_443044_England_20200408_null_1,epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2)Node50,epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2,epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1,epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1,epi_isl_475782_Tyrol_20200330_null_3,epi_isl_467986_South_Australia_20200407_null_16,epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1,epi_isl_475592_California_20200411_null_1,epi_isl_471908_Michigan_20200518_null_5,(epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3,epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6)Node509,epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3,epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2,epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1,epi_isl_457652_England_20200424_null_1,epi_isl_469644_England_20200418_null_3,epi_isl_474683_Wales_20200430_null_2,epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1,epi_isl_461566_England_20200526_null_3,epi_isl_470321_England_20200420_null_1,epi_isl_470199_England_20200418_null_8,epi_isl_458863_England_20200419_null_1,epi_isl_469684_England_20200423_null_4,epi_isl_472110_England_20200528_null_44,epi_isl_442236_England_20200407_null_1,(epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1)Node544,(epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1,epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_17)Node540,epi_isl_472163_England_20200312_null_57,epi_isl_453729_England_20200421_null_2,epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30,epi_isl_472164_England_20200313_null_11,epi_isl_472539_Wales_20200401_null_8,epi_isl_474786_Wales_20200430_null_22,epi_isl_423089_England_20200323_null_1,epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4,epi_isl_475159_Halland_20200419_null_7,epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_466186_England_20200403_null_4,epi_isl_469927_England_20200413_null_3,epi_isl_476496_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200422_null_31,epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1,epi_isl_432938_England_20200328_null_4,epi_isl_472639_Wales_20200406_null_1,epi_isl_468160_Rawalpindi_20200602_null_1,(epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1,epi_isl_470462_England_20200409_null_16)Node573,epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2,epi_isl_475739_Utah_20200512_null_2,(epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5,epi_isl_471458_Rabat_20200419_null_4)Node583,epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_457289_England_20200417_null_2,epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1,epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9,epi_isl_468528_California_20200331_null_4,epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4,epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3,epi_isl_462042_England_20200418_null_5,(epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3,epi_isl_470848_Western_Australia_20200322_null_108)Node604,epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1,epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4,epi_isl_423428_England_20200330_null_1,epi_isl_458972_England_20200409_null_1,epi_isl_469361_England_20200509_null_1,epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1,epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2,epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1,epi_isl_467825_California_20200315_null_1,epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1,epi_isl_476412_S_o_Paulo_20200428_null_2,epi_isl_440906_England_20200421_null_2,epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1,epi_isl_476304_Bahia_20200331_null_1,(epi_isl_470588_Minas_Gerais_20200406_null_1,epi_isl_474854_Galicia_20200321_null_6)Node629,epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_458273_California_20200414_null_3,epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1,epi_isl_424003_England_20200320_null_1,epi_isl_476837_Thessaloniki_20200415_null_12,epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1,epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5,epi_isl_433359_Scotland_20200327_null_9,epi_isl_449330_England_20200414_null_1,epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1,epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1,epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1,epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_457683_England_20200414_null_1,epi_isl_473363_England_20200509_null_8,epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_476531_Connecticut_20200328_null_2,epi_isl_468334_Galicia_20200429_null_2,epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1,epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1,epi_isl_468807_Aragon_20200327_null_6,epi_isl_476567_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200518_null_23,epi_isl_475284_England_20200330_null_18,(epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_12,epi_isl_469035_Gujarat_20200605_null_1)Node676,epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2,epi_isl_473490_England_20200604_null_6,epi_isl_444012_England_20200326_null_1,epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1,epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4,epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3,epi_isl_471416_Buzau_20200601_null_4,epi_isl_471808_Michigan_20200422_null_2,epi_isl_473616_Scotland_20200421_null_18,epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2,epi_isl_476838_Thessaloniki_20200330_null_3,epi_isl_475277_England_20200428_null_1,(epi_isl_442976_England_20200411_null_1,epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1)Node699,epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1,(epi_isl_442115_England_20200406_null_1,epi_isl_458525_England_20200507_null_12)Node71,epi_isl_433865_England_20200408_null_1,epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1,epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4,epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7,epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1,epi_isl_444143_England_20200408_null_1,epi_isl_461985_England_20200507_null_1,epi_isl_474607_Wales_20200427_null_89,epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2,(epi_isl_453275_England_20200403_null_1,epi_isl_465657_England_20200511_null_1)Node719,epi_isl_472744_Wales_20200514_null_1,epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3,(epi_isl_447731_France_20200301_null_1,epi_isl_449109_England_20200408_null_1)Node726,epi_isl_472309_England_20200506_null_10,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_440142_England_20200313_null_1,epi_isl_453770_England_20200422_null_1,epi_isl_475743_Utah_20200512_null_1,epi_isl_420510_England_20200323_null_2,epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1,epi_isl_465243_England_20200414_null_5,epi_isl_475741_Utah_20200512_null_2,epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2,epi_isl_437584_California_20200315_null_1,epi_isl_457485_England_20200505_null_2,epi_isl_475712_California_20200402_null_32,epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1,epi_isl_465876_England_20200329_null_3,epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1,epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1,epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1,epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_467897_New_York_20200316_null_1,epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1,epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node111":"test",
"Node129":"test",
"Node180":"test",
"Node209":"test",
"Node215":"test",
"Node218":"test",
"Node219":"test",
"Node225":"test",
"Node228":"test",
"Node240":"test",
"Node259":"test",
"Node262":"test",
"Node265":"test",
"Node268":"test",
"Node271":"test",
"Node274":"test",
"Node278":"test",
"Node283":"test",
"Node290":"test",
"Node295":"test",
"Node298":"test",
"Node301":"test",
"Node305":"test",
"Node308":"test",
"Node314":"test",
"Node319":"test",
"Node322":"test",
"Node325":"test",
"Node334":"test",
"Node338":"test",
"Node342":"test",
"Node345":"test",
"Node349":"test",
"Node353":"test",
"Node356":"test",
"Node38":"test",
"Node387":"test",
"Node404":"test",
"Node42":"test",
"Node421":"test",
"Node466":"test",
"Node474":"test",
"Node50":"test",
"Node509":"test",
"Node540":"test",
"Node544":"test",
"Node573":"test",
"Node583":"test",
"Node604":"test",
"Node629":"test",
"Node676":"test",
"Node699":"test",
"Node71":"test",
"Node719":"test",
"Node726":"test",
"Node793":"test",
"Node798":"test",
"Node803":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_432915_England_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_432926_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_432938_England_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_433359_Scotland_20200327_null_9":"test",
"epi_isl_433865_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6":"test",
"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_437584_California_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_438598_England_20200421_null_5":"test",
"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4":"test",
"epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2":"test",
"epi_isl_440058_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_440142_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_440259_England_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_440327_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_440734_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_440906_England_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_440915_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_440996_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_441017_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_441703_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442115_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442236_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_442526_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_442675_England_20200405_null_4":"test",
"epi_isl_442833_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442976_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":"test",
"epi_isl_443011_England_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_443044_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443341_England_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_443412_England_20200416_null_6":"test",
"epi_isl_444012_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_444143_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_444359_England_20200428_null_2":"test",
"epi_isl_444416_England_20200420_null_3":"test",
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5":"test",
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_447714_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_447731_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_448986_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_449109_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_449330_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5":"test",
"epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_453275_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453440_England_20200504_null_4":"test",
"epi_isl_453454_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_453618_England_20200505_null_9":"test",
"epi_isl_453622_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_453654_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_453729_England_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_453770_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8":"test",
"epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4":"test",
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17":"test",
"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_457132_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_457165_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_457289_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_457320_England_20200509_null_2":"test",
"epi_isl_457485_England_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_457652_England_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_457683_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_458273_California_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_458525_England_20200507_null_12":"test",
"epi_isl_458863_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458972_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7":"test",
"epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_459423_England_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9":"test",
"epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3":"test",
"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12":"test",
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3":"test",
"epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_461566_England_20200526_null_3":"test",
"epi_isl_461985_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_462042_England_20200418_null_5":"test",
"epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7":"test",
"epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6":"test",
"epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5":"test",
"epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9":"test",
"epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1":"test",
"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3":"test",
"epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_464535_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_464916_England_20200310_null_8":"test",
"epi_isl_465177_England_20200418_null_19":"test",
"epi_isl_465178_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465209_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465243_England_20200414_null_5":"test",
"epi_isl_465264_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465438_England_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_465657_England_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_465845_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_465876_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_465925_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_466186_England_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_466189_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_466222_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_466324_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_466361_England_20200409_null_4":"test",
"epi_isl_466551_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_466613_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30":"test",
"epi_isl_467788_Virginia_20200419_null_10":"test",
"epi_isl_467825_California_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_467897_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_467986_South_Australia_20200407_null_16":"test",
"epi_isl_468031_South_Australia_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_468158_Suceava_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_468160_Rawalpindi_20200602_null_1":"test",
"epi_isl_468229_St_Gallen_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_468334_Galicia_20200429_null_2":"test",
"epi_isl_468346_California_20200426_null_7":"test",
"epi_isl_468528_California_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_468807_Aragon_20200327_null_6":"test",
"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_12":"test",
"epi_isl_469035_Gujarat_20200605_null_1":"test",
"epi_isl_469128_Singapore_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_469193_Connecticut_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_469294_Kanto_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_469361_England_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_469644_England_20200418_null_3":"test",
"epi_isl_469684_England_20200423_null_4":"test",
"epi_isl_469693_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_469836_England_20200504_null_18":"test",
"epi_isl_469886_Northern_Ireland_20200429_null_10":"test",
"epi_isl_469927_England_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_470069_Northern_Ireland_20200406_null_46":"test",
"epi_isl_470120_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_470199_England_20200418_null_8":"test",
"epi_isl_470321_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_470462_England_20200409_null_16":"test",
"epi_isl_470499_England_20200408_null_7":"test",
"epi_isl_470533_England_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_470588_Minas_Gerais_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_470723_Utah_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_470848_Western_Australia_20200322_null_108":"test",
"epi_isl_471221_Wisconsin_20200328_null_37":"test",
"epi_isl_471245_Wisconsin_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_471416_Buzau_20200601_null_4":"test",
"epi_isl_471418_Vrancea_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_471458_Rabat_20200419_null_4":"test",
"epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_471635_Telangana_20200602_null_14":"test",
"epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_471808_Michigan_20200422_null_2":"test",
"epi_isl_471908_Michigan_20200518_null_5":"test",
"epi_isl_471938_England_20200420_null_7":"test",
"epi_isl_472003_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_472022_England_20200511_null_18":"test",
"epi_isl_472110_England_20200528_null_44":"test",
"epi_isl_472163_England_20200312_null_57":"test",
"epi_isl_472164_England_20200313_null_11":"test",
"epi_isl_472179_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_472258_England_20200405_null_11":"test",
"epi_isl_472302_England_20200503_null_41":"test",
"epi_isl_472309_England_20200506_null_10":"test",
"epi_isl_472417_England_20200605_null_62":"test",
"epi_isl_472418_England_20200426_null_2":"test",
"epi_isl_472429_England_20200503_null_4":"test",
"epi_isl_472438_Wales_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_472491_Wales_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_472539_Wales_20200401_null_8":"test",
"epi_isl_472639_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_472744_Wales_20200514_null_1":"test",
"epi_isl_472793_Wales_20200513_null_10":"test",
"epi_isl_473028_Wales_20200516_null_23":"test",
"epi_isl_473144_Wales_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_473191_Wales_20200531_null_1":"test",
"epi_isl_473202_Wales_20200527_null_4":"test",
"epi_isl_473363_England_20200509_null_8":"test",
"epi_isl_473416_England_20200527_null_9":"test",
"epi_isl_473429_England_20200516_null_7":"test",
"epi_isl_473434_England_20200602_null_18":"test",
"epi_isl_473444_England_20200605_null_3":"test",
"epi_isl_473490_England_20200604_null_6":"test",
"epi_isl_473506_England_20200613_null_6":"test",
"epi_isl_473616_Scotland_20200421_null_18":"test",
"epi_isl_473641_Scotland_20200423_null_14":"test",
"epi_isl_473698_Scotland_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_473715_Scotland_20200517_null_4":"test",
"epi_isl_473775_Scotland_20200510_null_4":"test",
"epi_isl_473776_Scotland_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_473867_Scotland_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_473991_Wales_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_474198_Wales_20200508_null_6":"test",
"epi_isl_474289_Wales_20200404_null_354":"test",
"epi_isl_474463_Wales_20200424_null_4":"test",
"epi_isl_474607_Wales_20200427_null_89":"test",
"epi_isl_474616_Wales_20200429_null_8":"test",
"epi_isl_474653_Wales_20200429_null_7":"test",
"epi_isl_474666_Wales_20200429_null_2":"test",
"epi_isl_474683_Wales_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_474697_Wales_20200502_null_109":"test",
"epi_isl_474753_Wales_20200430_null_20":"test",
"epi_isl_474786_Wales_20200430_null_22":"test",
"epi_isl_474810_Castilla_La_Mancha_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_474817_Castilla_La_Mancha_20200402_null_15":"test",
"epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_1":"test",
"epi_isl_474854_Galicia_20200321_null_6":"test",
"epi_isl_474953_Castilla_La_Mancha_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_474979_PARDESIA_20200315_null_15":"test",
"epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_17":"test",
"epi_isl_475012_ISRAEL_20200411_null_8":"test",
"epi_isl_475128_Orebro_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_475129_Varmland_20200312_null_108":"test",
"epi_isl_475159_Halland_20200419_null_7":"test",
"epi_isl_475277_England_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_475278_England_20200427_null_3":"test",
"epi_isl_475284_England_20200330_null_18":"test",
"epi_isl_475332_England_20200421_null_64":"test",
"epi_isl_475371_England_20200427_null_84":"test",
"epi_isl_475384_England_20200426_null_11":"test",
"epi_isl_475477_England_20200429_null_11":"test",
"epi_isl_475532_Vastmanland_20200602_null_33":"test",
"epi_isl_475567_Stockholm_20200528_null_8":"test",
"epi_isl_475587_California_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_475589_California_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_475591_California_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_475592_California_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_475603_California_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_475623_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_475634_California_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_475678_California_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_475686_California_20200403_null_6":"test",
"epi_isl_475712_California_20200402_null_32":"test",
"epi_isl_475736_Utah_20200512_null_3":"test",
"epi_isl_475739_Utah_20200512_null_2":"test",
"epi_isl_475741_Utah_20200512_null_2":"test",
"epi_isl_475743_Utah_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_475782_Tyrol_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_475794_Styria_20200401_null_50":"test",
"epi_isl_475826_Mayrhofen_20200401_null_1107":"test",
"epi_isl_475865_Austria_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_476098_Ticino_20200528_null_4":"test",
"epi_isl_476109_Basel_Landschaft_20200430_null_5":"test",
"epi_isl_476126_Zurich_20200421_null_3":"test",
"epi_isl_476129_Aargau_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_476132_Graub_nden_20200418_null_53":"test",
"epi_isl_476234_S_o_Paulo_20200309_null_84":"test",
"epi_isl_476304_Bahia_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_476412_S_o_Paulo_20200428_null_2":"test",
"epi_isl_476494_Dakar_20200611_null_215":"test",
"epi_isl_476496_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200422_null_31":"test",
"epi_isl_476502_Quebec_20200408_null_7":"test",
"epi_isl_476522_Connecticut_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_476531_Connecticut_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_476553_Connecticut_20200401_null_11":"test",
"epi_isl_476557_Connecticut_20200401_null_15":"test",
"epi_isl_476567_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200518_null_23":"test",
"epi_isl_476704_Venezuela_20200409_null_156":"test",
"epi_isl_476760_Minnesota_20200521_null_1":"test",
"epi_isl_476766_Minnesota_20200603_null_205":"test",
"epi_isl_476784_California_20200313_null_10":"test",
"epi_isl_476786_California_20200327_null_9":"test",
"epi_isl_476837_Thessaloniki_20200415_null_12":"test",
"epi_isl_476838_Thessaloniki_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_476879_Gujarat_20200612_null_19":"test",
"epi_isl_476904_Unknown_20200301_null_15":"test",
"epi_isl_476926_Unknown_20200312_null_47060":"test",
"epi_isl_476932_Unknown_20200312_null_5":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":14
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":10
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":24
}
}
}